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方法論記事

ゼブラフィッシュ幼虫の脊髄運動ニューロンにおけるTDP-43の光遺伝学的相転移

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DOI:

10.3791/62932

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2022年2月25日

この記事について

サマリー

我々は、ゼブラフィッシュをモデルとして用いた脊髄運動ニューロンにおける光によるTARDNA結合タンパク質43(TDP-43)の相転移を誘導するプロトコルを記述する。

要約

異常なタンパク質凝集と選択的神経の脆弱性は、神経変性疾患の2つの主要な特徴である。これらの特徴間の因果関係は、この実験的アプローチはこれまで限られているが、脆弱な細胞型における疾患関連タンパク質の相転移を制御することによって問い合われる可能性がある。ここでは、筋萎縮性側索硬化症(ALS)で変性運動ニューロンで発生するTDP-43の細胞質凝集をモデル化するためのゼブラフィッシュ幼虫の脊椎運動ニューロンにおけるRNA/DNA結合タンパク質TDP-43の相転移を誘導するプロトコルについて説明する。ゼブラフィッシュの脊椎運動ニューロンに光遺伝学的TDP-43変異体を選択的に送達する細菌人工染色体(BAC)ベースの遺伝的方法について述べた。ゼブラフィッシュ幼虫の高い半透明性は、拘束されていない魚に対して発光ダイオード(LED)を使用した単純な外部照明によって脊髄運動ニューロンにおける光遺伝学的TDP-43の相転移を可能にする。また、光遺伝学的TDP-43の光照明への応答を特徴付ける、自由に利用できるフィジー/ImageJソフトウェアを用いて、ゼブラフィッシュ脊椎運動ニューロンのライブイメージングと画像解析の基本的なワークフローを提示する。このプロトコルは、ALSに脆弱な細胞環境におけるTDP-43相転移および凝集形成の特徴付けを可能にし、細胞および行動の結果の調査を容易にするべきである。

概要

リボヌクレオプロテイン(RNP)顆粒は、均質な流体が2つの異なる液体相に分解する現象である液液相分離(LLPS)を介して膜のないパーティションを組み立てることによって、核および細胞質における無数の細胞活動を制御する。RNP顆粒成分として通常機能するRNA結合タンパク質の調節不変LLPSは、異常な相転移を促進し、タンパク質凝集をもたらす。このプロセスは、神経発達および神経変性疾患に関与している3,4,5.RNA結合タンパク質の異常なLLPSと疾患の病態との因果関係の正確な評価は、LLPSが効果的な治療標的として利用できるかどうかを決定する上で極めて重要である。RNA結合タンパク質のLLPSは、インビトロや単細胞モデルでは比較的容易に研究できますが、多細胞生物、特に脊椎動物では困難です。組織環境内の個々の細胞におけるこのようなLLPSを分析するための重要な要件は、疾患に脆弱な細胞タイプの目的でLLPSのイメージングおよび操作のためのプローブを安定的に発現させることである。

筋萎縮性側索硬化症(ALS)は、脳と脊髄の運動ニューロンが変性のために選択的かつ徐々に失わ....

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プロトコル

すべての魚の作業は、国立衛生研究所動物福祉局(NIH)の動物福祉局(保証番号A5561-01)を申請している国立遺伝学研究所(日本)の施設動物の世話・使用委員会(承認識別番号24-2)の実験動物のケアと使用に関するガイドに従って行われました。 米国)。

1. mnr2b プロモーターからの光遺伝学的TDP-43遺伝子発現に関するバチの構築

  1. BAC製剤
    1. ゼブラフィッシュのsnr2b遺伝子座(CH211-172N16、BACPACゲノミクス)を含むゼブラフィッシュBACクローンを購入します。温暖化et al.18に記載されているようにCH211-172N16を収容するDH10B大腸菌(大腸菌)の5mLの一晩LB培養からBAC DNAを精製する。
    2. Ch211-172N16をエレクトロポレーションによりSW102 大腸菌 細胞に変換し、その後、ウォーミングら18に記載されている。
      注:エレクトロポレーションの同じ日に 大腸菌 からのBAC DNAの精製は、通常、BAC変換18のより高い成功率を与えます。それ以外の場合は、精製されたBAC D....

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結果

ゼブラフィッシュ幼虫のmnr2b+脊髄運動ニューロンにおける光遺伝学的および非光遺伝学的TDP-43タンパク質の生画像化
ゼブラフィッシュの脊髄運動ニューロンにおけるTDP-43相転移を誘導するために、N-およびC末語でmRFP1およびCRY2olig22でタグ付けされたヒトTDP-43hをそれぞれ、opTDP-43h14と呼び出した(図1A)。opTDP-43h遺伝子断片をmnr2b遺伝子座を含むBACに導入した(図1B)。得られたBACは、mnr2b-hs:opTDP-43hと指定され、Tol2トランスポゾン媒介BACトランスジェネシス19によってゼブラフィッシュゲノムに導入された。脊髄運動ニューロンにおける非光.......

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ディスカッション

ゼブラフィッシュのopTDP-43hおよびEGFP-TDP-43zの mnr2b-BAC媒介発現は、脊髄運動ニューロンにおけるTDP-43相転移の生画像化のためのユニークな機会を提供する。ゼブラフィッシュ幼虫の体組織の光学的透明性は、opTDP-43hの単純で非侵襲的な光遺伝学的刺激を可能にする。時間の経過に伴う単一の脊髄運動ニューロン間の比較は、opTDP-43hの光依存性オリゴマー化がALS病理を連想させる細胞質クラスタリングを引き起こすことを示した。

本質的に障害を起たたタンパク質の相挙動を定義する重要なパラメータの1つは、細胞内濃度である。高レベルのopTDP-43h発現は、光に依存しないopTDP-43hオリゴマー化、相転移、および凝集につながる可能性がある。したがって、脊髄運動ニューロンにおける安定した無毒性レベルのopTDP-43h発現の誘導は、脊髄運動ニューロンにおけるopTDP-43相転移の生理学的および病理学的影響の評価に成功するための鍵となる。opTDP-43 hのmnr2b-BAC媒介発現は、Tg[mnr2b-hs:opT.......

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開示事項

KAとKKは、本稿に記載されている知的財産の発明者であり、原学研究所が仮特許を提出した。

謝辞

この作品は、セリクヤファンド(KA)、カケンヒグラント番号JP19K06933(KA)、JP20H05345(KA)によって支援されました。

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材料

この記事で使用された材料の一覧
名前会社カタログ番号コメント
共焦点顕微鏡オリンパスFV1200
落射蛍光顕微鏡ZEISSAxioimager Z1
蛍光実体顕微鏡ライカMZ16FA
ガラスベースディッシュ岩城3910-035
インキュベーターMEECN-25C
LEDパネルナノリーフリミテッドNanoleaf AURORA smarter kit
Mupid-2plusTAKARAAD110
NucleoBond BAC100MACHEREY-NAGEL740579
NuSieve GTG AgaroseLONZA50181
対物レンズOlympusXLUMPlanFL N 20×/1.00
対物レンズZEISSPlan-Neofluar 5x/0.15
光パワーメーターHIOKI3664
光センサーHIOKI9742-10
フェノールレッド溶液 0.5%メルクP0290-100ML
PrimeSTAR GXL DNA ポリメラーゼタカラR050A
QIAquick ゲル抽出キットキアゲン28704
6ウェルディッシュファルコン353046
分光器プローブ BLUE-WaveStellerNet Inc.VIS-50
シリンジ針テルモNN-2725R
タカラ Ex タカラRR001A
トリケーンSigma-AldrichA5040
ゼブラフィッシュ BAC クローン CH211-172N16BACPAC ゲノミクスCH211-172N16

参考文献

  1. Brangwynne, C. P. Phase transitions and size scaling of membrane-less organelles. Journal of Cell Biology. 203 (6), 875-881 (2013).
  2. Hyman, A. A., Weber, C. A., Julicher, F. Liquid-liquid phase separation in biology. Annual Review of Cell and Developmental Biol....

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再版と許可

タグ

TDP-43相転移光遺伝学的TDP-43タンパク質凝集BACトランスジェニック共焦点顕微鏡法青色光刺激細胞質凝集筋萎縮性側索硬化症