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暗室のLEDマウントホルダーが取り付けられた小さな窓の上に置かれた糸状シアノバクテリア培養物を含む皿から始めます。
LEDが皿を下から照らし、小さなライトゾーンを作り出します。
インキュベーション中、糸状シアノバクテリアは照らされた中心に向かって移動し、走光性を示します。
時間が経つにつれて、シアノバクテリアは移動して照明された中心に蓄積し、目に見えて密度の高い細菌ゾーンを形成します。
インキュベーション後、コントラストを高めるために皿の下に白い紙を置きます。
照らされた領域の画像をキャプチャし、ソフトウェアを使用して分析します。
細菌ゾーンの中心を通る皿を横切って線を引き、ピクセル強度プロファイルを生成します。
細菌ゾーンの外側と内側の平均ピクセル強度を比較します。
次に、中央領域内の最大強度で線を引き、シアノバクテリアの走光性を表す細菌ゾーンの直径を決定します。
5ミリLEDを搭載したLEDホルダーを用意し、下から上に20ミリ角の面積を照射します。LEDの強度を測定して調整します。設定全体が暗い部屋または密閉された暗い容器にあることを確認してください。
P . lacuna を含む培地8ミリリットルを6センチメートルのペトリ皿に入れ、ペトリ皿を蓋で閉じ、LEDがペトリ皿の中央になるようにLEDホルダーに置きます。通常2日後、スマートフォンのカメラで光処理の位置に直接向けたペトリ皿の画像をキャプチャします。ホルダーと白いシートを背景として使用して、すべての写真で同じ距離と光の状態を確保します。
ImageJソフトウェアを開き、[ファイル]、[開く]をクリックして、ファイルを選択します。次に、Enter をクリックします。直線ボタンを選択し、マウスの左ボタンを押して、シャーレの一方の端から反対側の端まで線を引きます。
線がフィラメントの円の中心を通過することを確認します。[分析と測定]をクリックして、ペトリ皿の長さを確認します。次に、ImageJメニューの「分析とプロットプロファイル」をクリックします。
円の外側のピクセル強度の平均値と、円の内側のピクセル強度の別の平均値を推定します。これらの値の間の Y 位置にマウスを合わせると、円の両側の X 値が推定されます。両方の値をメモし、差を計算します。
次に、直線ボタンを選択し、ピクセル強度の最大値の中間値に線を引きます。最後に、[分析]、[測定]の順にクリックして、内側のセル円の長さを取得します。