0 閲覧数 • 2:47 分 • September 26th, 2025
群れの運動性をサポートする群れ寒天プレート、つまり巻きひげのようなパターンを形成する半固体表面を横切る協調的な細菌の動きを考えてみましょう。
プレートの中心に 緑膿菌 培養物を接種し、同じ培養物と抗生物質の混合物を等間隔のサテライト位置に置きます。
光の反射を最小限に抑えるために、プレートを黒く塗られた蓋で覆います。
最適な湿度に保たれたインキュベーター内のフラットベッドスキャナーにプレートを置きます。
孵化中、中央個体群は増殖し始め、群がり始めます。
群れが抗生物質で処理されたコロニーに近づくと、細菌によって分泌されるストレスシグナルを検出し、これらの領域を避けるようにリダイレクトします。
自動ソフトウェアによって制御されるスキャナーは、一定の間隔で高解像度の画像をキャプチャします。
これらの画像をビデオにまとめて、時間の経過に伴う群れの進行と回避を視覚化します。
後期画像で各衛星コロニーから中央群れの端までの距離を測定することにより、群れ回避を定量化します。
プレートをスキャナーにセットした後、ファイルと保存設定を開き、画像の保存パスを設定し、30分間隔で[スキャン]と[OK]をクリックします。画像取得を自動化するには、スクリプト ソフトウェアを使用します。
アイドルスキャンとシングルスキャンの両方を選択し、アイドルスキャンを右クリックし、有効を左クリックします。インキュベーションの最後に、スキャンしたすべての画像をImageJにインポートします。シーケンスオプションウィンドウでは、画像数は選択した画像の数を示します。
画像を1つから開始すると、フォルダー内の最初の画像から開始され、画像の元のサイズを保持するために画像を100%で拡大縮小します。[RGB に変換] をクリックして、画像をカラーのままにします。[仮想スタックの使用] をオフのままにして、[OK] をクリックしてイメージをロードします。
[ファイル]、[名前を付けて保存]、[AVI] をクリックして、画像を AVI ファイルに結合します。圧縮をJPEGに、フレームレートを毎秒5フレームに調整します。次に、AVI タイムラプスを適切なストレージ フォルダーに保存します。