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無傷の細胞構造を欠いているが、 in vitro での転写と翻訳に必要な分子成分を保持している細菌の無細胞システムを考えてみましょう。
膜タンパク質抗原と足場タンパク質をコードするプラスミドを、合成リン脂質とポリマーとともに導入します。
混合物にATP、GTP、およびアミノ酸ミックスを補充して、タンパク質合成を開始します。
同時に、アミノ酸混合物を豊富に含む飼料溶液を調製します。
混合物を内チャンバーに、給餌溶液をデュアルコンパートメント透析装置の外チャンバーにロードします。
インキュベーション中、基質は半透膜を通って外側のチャンバーから内側のチャンバーに拡散し、プラスミドの転写とタンパク質の翻訳を促進します。
足場タンパク質は、リン脂質とポリマーを脂質ナノディスクに組み立て、MPAの折り畳みとこれらの構造への取り込みを促進します。
反応中に生成された副生成物は外側のチャンバーに拡散し、ナノディスク安定化MPA形成に最適な条件を維持します。
無細胞法を使用してMOMP-tNLPを調製します。
反応を設定する2時間前に無細胞タンパク質発現キットから再構成バッファーを解凍し、EDTAフリープロテアーゼ阻害剤をバッファーに加えます。1ミリリットルの反応を5回実行するように設計されたキットを使用してください。1ミリリットルの反応ごとに、525マイクロリットルの再構成バッファーを大 腸菌 溶解物ボトルに加え、転がして溶解させます。
添加剤の入った反応ボトルに250マイクロリットルの再構成バッファーを加え、ローリングして溶解します。次に、反応フィードボトルに8.1ミリリットルの再構成バッファーを加え、転がして溶解させます。アミノ酸混合物のボトルに、3ミリリットルの再構成バッファーを加えて溶解します。
メチオニンの別のボトルに、1.8ミリリットルの再構成バッファーを加え、溶解し、氷の上に保存します。225マイクロリットルの再構成混合物、270マイクロリットルのメチオニンを含まない再構成アミノ酸混合物、および30マイクロリットルの再構成メチオニンを大 腸菌 ライセートボトルに加えます。さらに、400マイクロリットルのDMPC/テロデンドリマー混合物、15マイクログラムのMOMPプラスミド、および0.6マイクログラムのデルタ-49 ApoA1を混合物に加え、混合する。
1.5ミリリットルのチューブに20マイクロリットルの全溶液をアリコートします。GFP発現対照反応用。メチオニンを含まない再構成アミノ酸混合物2.65ミリリットルと再構成メチオニン300マイクロリットルを加えて、飼料溶液を調製します。1ミリリットルの反応液を無細胞反応キットの内部反応チャンバーに移し、密封します。
反応容器の外側のチャンバーに10ミリリットルの供給溶液を入れ、閉じます。0.5マイクロリットルのGFPコントロールプラスミドを、反応混合物の20マイクロリットルのアリコートに加えます。反応を毎分300回転のシェーカーに30°Cで18時間入れます。
15分後にUV光下で反応を監視し、GFP合成による蛍光を確認します。