検出のマーカーの抗真菌薬剤耐性のカンジダ glabrataの全ゲノム シーケンス
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2017年12月28日
DOI :10.3791/56714-v
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Chayanika Biswas*1 , Sharon C-A. Chen*1,2,3 , Catriona Halliday1,2 , Elena Martinez1 , Rebecca J. Rockett1 , Qinning Wang1 , Verlaine J. Timms1 , Rajat Dhakal1 , Rosemarie Sadsad1 , Karina J. Kennedy4 , Geoffrey Playford4,5 , Deborah J. Marriott6 , Monica A. Slavin7 , Tania C. Sorrell1,3 , Vitali Sintchenko1,2,3
1Centre for Infectious Diseases and Microbiology-Public Health, Westmead Hospital, 2Centre for Infectious Diseases and Microbiology Laboratory Services, ICPMR, 3Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, The University of Sydney, 4Department of Microbiology and Infectious Diseases, Canberra Hospital and Health Services, Australian National University Medical School, 5Infection Management Services, Australian National University Medical School, 6Department of Microbiology and Infectious Diseases, St. Vincent's Hospital, 7Department of Infectious Diseases, Peter MacCallum Cancer Centre
* These authors contributed equally
本研究は、カンジダ glabrataで抗真菌薬耐性遺伝子で突然変異の分析の全ゲノム配列を実装します。カプソファンギン、アゾールと 5-フルシトシン、耐性菌のC. glabrataは、方法論を説明するために配列されました。菌株の感受性プロファイルは、遺伝子に特定の変異パターンの有無と相関。
Chapters in this video
0:05
タイトル
1:11
タグメンテーションおよびPCR増幅
3:35
PCRクリーンアップ
5:15
ライブラリの標準化
7:19
結果：Candida glabrata分離株の感受性プロファイルは、特定の遺伝子変異の有無と相関する
8:11
結論
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