ナノポア技術を用いた狂犬病ウイルスの迅速な特性評価のための全ゲノムシーケンシング

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2023年8月18日

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2023年8月18日

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Criselda Bautista¹^,² , Gurdeep Jaswant¹^,³^,⁴^,⁵ , Hollie French¹^,⁶ , Kathryn Campbell¹ , Rowan Durrant¹ , Robert Gifford¹^,⁶ , Grace S. N. Kia⁷^,⁸ , Brian Ogoti³^,⁹ , Katie Hampson¹ , Kirstyn Brunker¹^,⁶

¹School of Biodiversity, One Health & Veterinary Medicine, University of Glasgow, ²Research Institute for Tropical Medicine, ³University of Nairobi, Institute of Tropical and Infectious Diseases, ⁴Tanzania Industrial Research Development Organization, ⁵Ifakara Health Institute, ⁶MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research, ⁷Department of Veterinary Public health, Ahmadu Bello University, ⁸African Centre of Excellence for Neglected Tropical Diseases and Forensic Biotechnology, Ahmadu Bello University, ⁹University of Nairobi, Kenya and Center for Epidemiological Modelling and Analysis, University of Nairobi

ここでは、ナノポア技術を用いて狂犬病ウイルス(RABV)ゲノムを特徴付けるための迅速で費用対効果の高いワークフローを紹介します。このワークフローは、地域レベルでのゲノミクス情報に基づくサーベイランスを支援することを目的としており、狂犬病対策の指針となるために、循環するRABV系統と地域系統学内でのRABV系統の位置に関する情報を提供します。