이 프로토콜에서는 맞춤형 다양성 합성 항 체 살 균 소 전시 도서관의 건설에 대 한 자세한 절차를 설명합니다. 합성 항 체는 질병 진단 및 치료제를 기초 연구에서 광범위 한 응용 프로그램 있다.
방법 논문
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이 프로토콜에서는 맞춤형 다양성 합성 항 체 살 균 소 전시 도서관의 건설에 대 한 자세한 절차를 설명합니다. 합성 항 체는 질병 진단 및 치료제를 기초 연구에서 광범위 한 응용 프로그램 있다.
단일 클론 항 체 (mAbs) 기초 연구와 의학에 대 한 수요는 매년 증가 하 고 있다. Hybridoma 기술 mAb 개발 이후 1975 년에 그것의 첫 번째 보고서에 대 한 지배적인 방법 되었습니다. 대체 기술, mAb 개발에 대 한 파지 디스플레이 방법으로 점점 더 매력적인 Humira, 첫 번째 페이지에서 파생 된 항 체와 베스트 셀러 mAbs 중은 2002 년에 류 마티스 관절염의 임상 치료에 대 한 승인 이후입니다. 비 동물 mAb 개발 기술을 기반으로, 살 균 소 전시 항 원 immunogenicity, 인간 화, 그리고 전통적인 hybridoma 기술 기반 항 체 개발에서 필요한 동물 유지 보수를 무시 합니다. 이 프로토콜에서 우리는 합성 살 균 소 표시 팹 라이브러리의 109-1010 단일 electroporation에 얻을 수의 다양성을 건설 하는 방법을 설명합니다. 이 프로토콜의 구성: 1) 고효율 전기 유능한 세포 준비; 2) 추출 uracil 포함 하는 단일 가닥 DNA (뒤-ssDNA); 3) Kunkel 메서드 기반 oligonucleotide 감독 mutagenesis; 4) electroporation 그리고 계산 라이브러리 크기; 5) 단백질 A/L 기반 효소 연결 된 immunosorbent 분석 결과 (ELISA) 폴딩에 대 한 기능적 다양성 평가; 그리고 6) 다양성의 DNA 순서 분석.
mAbs 기초 연구에서 질병 진단 및 치료에 이르기까지 광범위 한 응용 프로그램 있다. 2016, 현재 60 mAbs 자가 면역 질환, 암, 그리고 전염병1,2의 임상 치료에 대 한 미국 식품의 약 청 (USFDA)에 의해 승인 되었습니다.
1975 년 Kohler와 Milstein 보고 'hybridomas' 그리고이 기법은 라고도 셀룰러 소스에서 단일 클론 특이성의 항 체의 지속적인 세대를 위한 기술 의학 및 산업3 초석 이후 되고있다. ,4. 이 메서드에서 mAbs의 세대 항 원 생산, 마우스 면역, B 림프 톨의 추출, 치료 응용 프로그램에 대 한 불멸의 hybridoma 세포, 클론 선택, 형성 하기 위하여 myeloma 세포와 B 세포의 융해를 포함 하 여 다양 한 단계 필요 인간 화 인간 안티 마우스 항 체 (하 마)4,5을 피하기 위해 필요 합니다. 그러나,이이 기술에 대 한 항 독 소, 균, 그리고 높은 보존된 단....
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참고: 필터 멸 균 팁 사용 해야 전체 페이지를 다룰 때 피 펫 총 및 주변 지역에 오염을 피하기 위하여. 박테리아와 살 균 소 처리 실험 때 무 균 영역이 나 후드를 사용 해야 합니다. 살 균 소 실험 영역 2% 나트륨 라우릴 황산 염 (SDS) 뒤에 70% 에탄올을 사용 하 여 살 균 소 오염 방지 청소 되어야 한다. 이 프로토콜에서 직렬 희석을 만들기 위한 각 희석에 대 한 새로운 팁을 사용 해야 합니다.
1. 대장균 SS320 전기 유능한 세포 준비
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팹 도서관 건축의 흐름 차트를 다음 ( 그림 1참조) 우리는 M13KO7 도우미 페이지 미리 감염 대장균 SS320 전기 유능한 세포 준비. 도서관 건축을 위한 팹 phagemid 백본 사용 되었다 때 이러한 전기 유능한 세포의 효율성 2 X 109 cfu / µ g로 추정 된다 (그림 4).
Uracil 관 효율 비교 하 여 CJ236 대장균 과 대장균 SS320 세포에서 titer의 되었다 검사. CJ236 대장균 및 대장균 SS320 셀 뒤 ssDNA를 은닉 하는 살 균 소 감염 했다. E. 콜라이 SS320는 효소 (dUTPase 및 u.......
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높은 다양성, 팹 라이브러리 페이지 표시, 품질 관리 구성 하 체크 포인트 전기 유능한 세포, 뒤 ssDNA 서식 파일의 효율성의 품질 역량을 포함 하 여 건설 과정의 다양 한 단계를 모니터링 하는 데 필요한 CCC dsDNA 합성, electroporation, 팹 접는 성과 아미노산 Cdr의 팹 파지 클론의 시퀀스 분석 후 titer.
고수익 뒤 ssDNA의 순도 높은 mutagenesis 속도 대 한 필수적입니다. 우리의 경험에서는, 25 ° C에서 살 균 소 유도 하룻밤 37 ° C에서 살 균 소 유도 하룻밤에서 그 보다 더 뒤 ssDNA를 얻을 수 있습니다. 이것은 이전 보고서19일치 하 여 이다. SsDNA 추출에 관한 초기 플라스 미드 스핀 키트 (QIAprep)는 살 균 소 세포와 바인딩 MLB를 포함. 나중에, MLB 알 수 없는 이유로 단종 되었고 PB로 대체. 우리는 뒤 ssDNA의 수익률은 MLB 치료에서 PB 치료.......
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저자는 공개 없다.
저자에 대 한 중요 한 의견 Kunkel의 방식 합성 팹 페이지 라이브러리 건설 Sidhu 연구소에서 박사 프레드릭 Fellouse 주셔서 감사합니다. 저자 감사 부인 Alevtina Pavlenco 및 높은 효율 전기 유능한 준비의 귀중 한 도움 Sidhu 실험실에서 다른 멤버 대장균 세포 및 고품질 뒤 ssDNA. 이 작품은 중국의 국가 자연과학 기초에 의해 지원 되었다 (허가 번호: 81572698, 31771006) DW 및 ShanghaiTech 대학으로 (부여 번호: F-0301-13-005) 항 체 공학의 실험실에.
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| 시약 | |||
| 1.0 M H3PO4 | Fisher | AC29570 | |
| 1.0 M Tris, pH 8.0 | Invitrogen | 15568-025 | |
| 10 mM ATP | Invitrogen | 18330-019 | |
| 100 mM dithiothreitol | Fisher | BP172 | |
| 100 mM dNTP | dATP, dCTP, dGTP 및 dTTP를 각각 25mM씩 함유하는 | GE 헬스케어 | 28-4065-60 |
| 3,3',5,5'-테트라메틸벤지딘 (TMB) | 키르케고르 & Perry Laboratories Inc | 50-76-02 | |
| 50X TAE | Invitrogen | 24710030 | |
| Agarose | Fisher | BP160 | |
| Carbenicillin, carb | Sigma | C1389 | 100 mg/mL in water, 0.22 μ M 필터 살균, 작업 농도 : 100 Μ g/mL입니다. |
| 클로람페니콜, cmp | 시그마 | C0378 | 에탄올 중 100mg/mL, 0.22 &μ; M 필터 살균, 작업 농도 : 10 Μ g/mL입니다. |
| EDTA 0.5 M, pH 8.0 | Invitrogen | AM9620G | |
| 과립 한천 | VWR | J637-500G | |
| H2O2 과산화효소 기질 | Kirkegaard & Perry Laboratories Inc | 50-65-02 | |
| K2HPO4 | Sigma | 795488 | |
| Kanamycin, kan | Fisher | AC61129 | 물에서 50 mg/mL, 0.22 μ M 필터 살균, 작업 농도 : 50 Μ g/mL입니다. |
| KH2PO4 | Sigma | P2222 | |
| Na2HPO4 | Sigma | 94046 | |
| NaCl | 알파 Aesar | U19C015 | |
| Nanodrop | Fisher | ND2000C | |
| NaOH | Fisher | SS256 | ! 주의 NaOH는 화상을 유발합니다. |
| 무지방 분유 | , Sangon Biotech | A600669 | |
| PEG-8000 | Fisher | BP233 | |
| 단백질 A-HRP 접합체 | Invitrogen | 101123 | |
| QIAprep, Spin M13 키트 | Qiagen | 22704 | |
| QIAquick 젤 추출 키트, | Qiagen | 28706 | |
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| 트립톤 | 피셔 | 0123-07-5 | |
| Tween-20 | Sigma | P2287 | |
| 초순수 글리세롤 | Invitrogen | 15514-011 | |
| Uridine | Sigma | U3750 | 25 mg/mL in ethanol, 작업 농도: 0.25 μ g/mL입니다. |
| 효모 추출물 | VWR DF0127-08 | ||
| Name | Company | 카탈로그 번호 | Comments |
| Strains | |||
| E.coli CJ236 | New England Biolabs | E4141 | 유전자형: dut- 웅<섭>- thi-1 relA1 spoT1 mcrA/pCJ105(F' camr). dU-ssDNA의 제조에 사용됩니다. |
| E.coli SS320 | Lucigen | 60512 | 유전자형: [F'proAB+lacIq lacZΔ M15 Tn10 (tetr)] hsdR mcrB araD139 Δ (araABC-leu)7679 &델타; lacX74 galUgalK rpsL thi. 고효율 전기천공법(electroporation) 및 사상(filamentous) 박테리오파지 생산에 최적화되어 있습니다. |
| M13KO7 | New England Biolabs | N0315S | |
| Name | Company | 카탈로그 번호 | Comments |
| Equipment | |||
| 0.2-cm 갭 전기천공법 큐벳 | BTX | ||
| 96-well 2mL 딥웰 플레이트 | Fisher | 278743 | |
| 96웰 맥시소프 면역플레이트 | Nunc | 151759 | |
| 배플 플라스크, | Corning | ||
| 벤치탑 원심분리기 | Eppendorf | 5811000096 | |
| 원심분리기 병, | Nalgene | ||
| ECM-630 electroporator | , BTX | ||
| Magnetic 교반 막대 | Nalgene | ||
| Thermo Fisher 원심분리기 | Fisher | ||
| 고속 쉐이커 | TAITEK | MBR-034P | |
| 마이크로플레이트 쉐이커 | QILINBEIER | QB-9002 | |
| 96 및 384웰용 리퀴드 핸들러 | RAININ | ||
| Mutil-channel 피펫 | RAININ | E4XLS | |
| Amicon 농축기 | Merck | UFC803096 |
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