우리는 생성, 재배 및 organotypic 조각 murine 폐 종양에서 파생 된의 체계적인 분석에 대 한 메서드를 제공 합니다. 우리는 또한 슬라이스 두께 대 한 최적화 하는 방법과 종양 조각 치료 약물 농도 선택 하는 방법을 설명 합니다.
방법 논문
우리는 생성, 재배 및 organotypic 조각 murine 폐 종양에서 파생 된의 체계적인 분석에 대 한 메서드를 제공 합니다. 우리는 또한 슬라이스 두께 대 한 최적화 하는 방법과 종양 조각 치료 약물 농도 선택 하는 방법을 설명 합니다.
Organotypic 기본 조직 explant 문화, 정밀 컷 슬라이스를 포함 하는 기본 조직의 다세포 상호 작용 뿐만 아니라 3 차원 (3 차원) 조직 아키텍처를 나타냅니다. 바로 갓 절제 종양에서 잘라 조직 조각 intratumor이, 그들에 게 비보에 생물학의 유용한 대리 모 알선 함으로써의 공간 측면 유지 합니다. 주의 조직 슬라이스 준비와 재배 조건 최적화는 기본 종양의 진단 예측 가능성에 대 한 슬라이스 explants. 이와 관련, murine 모델은 복제와 재현 실험을 수행 하기 위해 종양 자료의 일관 된 흐름을 제공 하는 이러한 가치. 이 프로토콜 murine 폐 종양 파생 조직 조각 회전 외피 단위, 산소와 영양분을 조직의 간헐적인 노출 수 있도록 시스템을 사용 하 여 경작을 설명 합니다. 우리의 이전 작품 외피 단위 회전의 사용 특히 조각 떠 다른 문화 방법에 비해 조직의 생존 능력 향상과 정체 필터 지원 보여주었다. 자, 우리 더 슬라이스 두께 영향 가능성 보여 교양 조각, 슬라이스 두께의 그 최적화를 제안 할 수 다른 조직 종류에 대 한. ITH 관련 종양 기능 활동, stromal 세포 침투 식이나 분화 마커의 신호에 인접 한 조직 조각 마커 약물 치료에 의해 변경의 표현에 대 한 평가 필요로 발음 또는 자체 재배입니다. 요약 하자면,이 프로토콜 회전 외피 단위에 murine 폐 종양 조각 생성 및 그들의 문화를 설명 하 고 어떻게 조각 해야 체계적으로 분석 전제 조건으로 다른 유형의 조직 마커, 표현에 대 한 설명 이전에 약물 반응 연구.
단단한 종양 조직, 폐암을 포함 한 유전 그리고 phenotypic이 전시 및 항구의 복잡 한 microenvironments1,2. 종양 세포와 약물 및 저항 메커니즘3에 그들의 주변 microenvironment 영향 사이 상호 작용. 이 전 임상 모델을 정확 하 게 모델 수 생물학적 복잡성 및 네이티브 종양에 행동 하는 기능에 대 한 필요성을 강조 한다. 정밀 컷 슬라이스 즉시 신선한 종양에서 파생 된 대표 비보 생물학, 적어도 시간, 공간적으로 개별 종양에서 배포 하는 고기를 포함 하 여의 짧은 창 주 능력가지고 고유 자원의 제공 한다. 절제 임상 종양 암 환자에 게 서 얻을 수 있는 몇 가지 개인된 표본 중 하나 이며 그들의 진단 사용 가치가 감시.
Organotypic 문화 거슬러초기 19 세기 때 인간 intracranial 종양 했다 손을-조직 조각으로 잘라내기와 소위를 사용 하 여 교양 의 역사 걸려 놓기 방법. 조직 파편은 coverslip에 연결 되었고 heparinized 인간의 플라즈마, 후는 coverslips 반전, 봉인 되었고 몇 주4에 대 한 교양에 수 있습니다. 수동으로 종양 조각부터 플라즈마 병5, 액체6와 같은 다양 한 다른 메서드를 사용 하 여 양식 또는 0.45 μ m에 기 공 크기 필터6컷. 기간 "organotypic" 병아리 태아 눈7의 망막 차별화에 관한 연구에서 1954 년에 처음 사용 되었다. 이것은 폐와 심장 조직 explants 병아리 태아8및9성인 쥐 뇌 explants에서 파생 된을 사용 하는 연구에 선행 되었다.
다양 한 조각화 방법 설명, 즉 수동 헬기10,11, Krumdieck 조직 절단기12,13및 vibratomes11,,1415, 되었습니다. 16. Krumdieck 조직 슬라이서는 톰을 사용 하 여 원형 휴지 조각으로 썬 다음 원통형 조직 코어를 생성 합니다. Vibratome, 다른 한편으로, 진동 블레이드 톰을 사용합니다. 간 분할 영역에 대 한 연구에서 그것은 Leica vibratome Krumdieck 슬라이서15에 비해 더 재현 하 고 일관 된 분할 영역 생성을 표시 했다. 슬라이스 두께 250에서 500 µ m에 이르기까지 사용 되었습니다, 그리고 연구는 16 일14,10,,1718까지 생존 기능과 형태학의 유지 보수를 보고. 그러나, 종양 변수 신진 대사 프로필 영양소 요구 사항에 영향을 미칠 수 있습니다. 있고 조직 강성 매트릭스 구성 등 폭 기 및 영양소의 흐름에 영향을 미칠 수 있습니다. 따라서 각 조직 유형에 자국과 문화 조건의 최적화 해야 가능성이 높습니다.
다른 경작 방법 슬라이스 문화를 지원 하기 위해 사용 되었습니다: 나) 고정 interphase 문화, 라고도 정체 지원 문화, 조각 반 다공성 막 삽입 문화 매체에 위에 배치 됩니다. 이 조각의 상단은 공기에 노출 되는, 하단의 다공성 삽입14,19;를 통해 영양분을 보충 하는 동안 ii) 흙 메서드는 원래 문화 전체 기관 또는 배아 조직 조각을 개발. 이 조각 목화 시트 또는 금속 그리드에서 지 원하는 필터 위에 배치 하 고 필터 문화 매체에 배어. 조직 촉촉한 유지, 매체의 얇은 층은 조각20,,2122위에 추가 됩니다. 이러한 처음 두는 소위 공기 액체 interphase 문화; 3) 롤러 튜브 문화, 조각, 매체를 포함 하는 플라스틱 튜브의 편평한 측 내부 배치 및 느린 튜브 회전 하면 조직 한 사이클의 첫 번째 부분 중 중간 덮여 또는 두 번째23; 중 화난 4) 외피 단위, 어떤 슬라이스는 간헐적으로 노출 보통 영양분과 통 기 통풍으로 회전 합니다. 다른 롤러 튜브,이 방법 슬라이스 배양246 잘 플레이트에 배치 하는 다공성 티타늄 격자 위에 배치 됩니다.
조직 조각 논리적으로 현재 절제 단단한 종양에서 파생 된 항 암 제의 치료 응답을 테스트 하는 매력적인 ex vivo 모델 그들은 생존 능력의 평가 허용, 통로, 활동과 분자 프로 파일 대상 기본 종양 microenvironment의 특정 종양. 그러나, 여부를 평가 마약 종양 조각에서 측정은 제자리에 응답의 예언, 그것은 어떤 정도 조직 조각을 보존 등 세포 증식, 종양 관련 생물 학적 기능을 평가 하는 것이 중요 histopathology 특정 세포 분화 또는 종양 신호 활동. 조각 준비, 슬라이스 처리, 또는 문화 유도 adaptions 품질 및 조직 조각의 생물학 기능에 동안 elicited 기계적 스트레스의 영향은 근본적인 질문, 종양에서 파생 된 구현 하는 기능을 긴밀 하 게 연결 기능 진단에 대 한 조각입니다.
우리의 IMI 투자 컨소시엄 프로젝트 PREDECT (http://www.predect.eu) 설정 합니다 체계적으로 주소를 근본적인 질문, 다양 한 소스에서에서 슬라이스 explants 공부 하 여. 유 방, 전립선, 폐 암 모델에서 파생 된 분할 영역을 사용 하 여,이 공동 노력 활용 양적 되며 오신 (H & E)-기반 정보 대기 산소와 정체 필터에 대 한 요구 사항을 설명 하 고 질적 지요 72 h까지 교양된 조각의 생존 능력을 유지 하기 위해 지원 합니다. 또한, 교양 슬라이스에 immunohistochemistry (IHC) 분석 밝혀 내-슬라이스 생존 그라디언트, 괴 그라디언트 murine 비 작은 세포 폐암 (NSCLC), 에스트로겐 수용 체 (ER), HIF1α에서에서 파생 된 조각에서으로 입증 및 γH2AX 유 방 암 조각, 그라디언트 또는 안 드로 겐 수용 체 (아칸소 주) 식 그라디언트 전립선 암 조각25에. 흥미롭게도, murine NSCLC의 24 시간 문화에 내부 슬라이스 생존 그라디언트 회전 외피 단위에 경작에 의해 구출 되었다 그리고 우리의 최근 학문 보여주었다 생존 72 h26에 확장 되었다. 특히 위쪽 남아 가장 가능한26, 지지 하는 조각에 약 응답 분석 조직의이 측면에 밖으로 잘 수행 됩니다.
어떻게 질문까지 남아 비록 조직 조각 종양 기능 제자리에 정리 수 있습니다, 그리고 그들은 광범위 하 게 항 암 에이전트, 단일 클론 항 체 타겟 약과 화학요법 대리인 를 포함 하 여 응답을 테스트 하는 데 사용 되었습니다. 10,11,,1314,,1827. 우리는 최근에 murine NSCLC 슬라이스 확산에 동적인 변화 표시 및 종양 신호 활동 재배 갓 0 h 절단에 비해 다음 조각26을 보여주었다. 이 타겟 위치에 생물 학적 기능 이전에 섭 동 연구 재배 중 적절 하 게 보존 여부를 조사 하는 것이 중요 하는 것을 나타냅니다. 이러한 결과도 불구 하 고 우리는 종양 조각 표적으로 한 치료, 약물 치료 유지 속에 공간 응답을 모델링할 수 있습니다 보였다 (24 시간) 브리핑 및26경작의 발병에서 시작 됩니다. 다음 프로토콜 설립 및 약리 마약 검사에서 그들의 응용 전에 종양 조각 문화의 분석에 관련 된 중요 한 유효성 검사 측면을 설명합니다.
이 연구에서 설명 하는 모든 마우스 실험에서 핀란드 국가 위원회의 동물 실험, 지침에 따라 수행 했다 그리고 헬싱키의 대학, 국가 지방의 실험 동물 위원회에 의해 승인 되었다 남쪽 핀란드 (면허 번호 ESAVI/9752/04.10.07/2015)의 사무실.
1입니다. 슬라이스 이전 준비
2입니다. 폐 종양-베어링의 수집
3. 정밀 컷 폐 종양 조각 생성
4. 치료 종양의 작은 분자 억제제와 조각
5. 고정 및 조직 조각 처리
6. 처리 및 분석의 포 르 말린 고정 파라핀 포함 (FFPE) 조직
7. 조직의 생존 및 Biomarker 식의 분석
그림 1 세대, 재배 및 정밀 컷 조직 조각 murine NSCLC 종양에서 파생 된의 분석에 대 한 워크플로 나타냅니다. 이 데모에 대 한 활용 하는 조건부의 활성화 KraG12D Lkb1 (라고 떠들고/트레오닌 키 니 아 제 11)의 손실 함께 라는 은닉 유전자 조작된 마우스 모델 (GEMM)에서 종양 KL 기. 마우스 사육 및 폐 종양 개시26,28에 설명 된 대로 수행 되었다. 그림 2A 조각 회전 외피 단위를 사용 하 여 24 시간에 대 한 교양된의 생존 능력에 조직 슬라이스 두께의 효과 보여 줍니다. 결과 160 µ m 얇게는 조각에 걸쳐 큰 괴 사 성 영역을 포함 하는 보여준다. 또한, 250 µ m 얇게 표시는 괴 그라데이션 200 µ m 얇은 조각에 비해 조각에서. 그것은 얇은 160 µ m의 불 쌍 한 전반적인 생존 능력이 취약 하 고 곱슬 곱슬 하는 경향이, 격자 위에 조각의 위치 하는 동안 기술적인 처리에 의해 발생. 다른 한편으로, 조각이 너무 두께, 그들은 조각에 걸쳐 산소 또는 영양 보급에 부족 하는 경향이 될 수 있습니다 때는 murine NSCLC explants 회 저 성 죽음 그라데이션25로 입증 됩니다. 그러나, 슬라이스 두께와 동일한 vibratome 설정의 사용에도 불구 하 고 한 종양에서 생성 될 수 있습니다 주목 해야한다. 그것은 따라서 다른 종양 샘플에서 여러 복제를 분석 하는 것이 좋습니다. 중요 한 것은, 조직 유형별 조직 질감과 경도 수에 영향을 미칠 산소와 영양소 흐름 슬라이스 두께 최적화를, 최대 생존 능력을 달성 하기 위해 필요 합니다. 그림 2B - 설명 NKX2-1 식의 양적 IHC 분석, 샘플에 잘 차별화 된 폐 선 암 (AC)의 표식 최대 72 h 재배와 일치 하는 0 h 조각. 결과는 NKX2-1 식 0 h 미 조각, 제안 하는 재배 과정 공공연히 미치지 않습니다 AC 종양 조직의 분화 상태에 비해 교양된 조각에서 크게 변경 되지는 표시 됩니다. 그림 2D 대상된 약물의 효과 평가 하기 위한 종양 조직 조각의 유틸리티를 보여 줍니다. 최근 살펴보았습니다 Kra 돌연변이 murine ACs 전시 높은 식 phosphorylated ERK1/2의 (MAPK 통로 활동 증가 표시) adenosquamous (ASC) 종양, (표시 mTOR 활동 phosphorylated 4EBP1의 식 동안에 비교 될 때 ) AC와 ASC 종양에 유사 하 게 표현 된다. 이 경로 조직 조각에 효과적으로 타겟팅 할 수 있습니다 하는 경우를 테스트 하려면 KL AC 조직 조각 DMSO로 치료 했다 또는 화합물, 즉 0.1-1의 금액을 적정 대상 mTOR 통로 또는 0.05-0.5 µ M dactolisib µ M selumetinib MAPK 통로 대상. 결과 표시 1 µ M dactolisib 또는 selumetinib의 0.5 µ M 각각 4EBP1 또는 ERK1/2의 인 산화를 억제에 효과적입니다. 또한, 대상된 phosphoproteins의 복용량 의존 저해 조직 조각 인 산화 특정 항 체를 확인 하기 위해 또한 이용 될 수 있다 나타냅니다.

그림 1: 설립 및 분석 murine NSCLC 종양 파생 슬라이스 explants의 워크플로의 도식 대표. 수집 및 조각화에 대 한 종양 베어링 폐의 준비를 설명 하는 (A) 회로도 마우스에서 폐 엽 수확 하 고 종양 조직을 정상 조직에서 해 부. 블랙 헤드와 별표 나타냅니다 약 4 m m와 1 m m 종양, 각각. 흰색 화살표는 폐 조직을 표본 소유자의 표면에 붙어 나타냅니다. 정상적인 폐의 추가 부분에서 빨간 화살표 포인트 유지 직 립 위치에 종양 조직을 지원 합니다. (B) Vibratome 자국과 조직 조각의 컬렉션. 흰색 화살표는 조각화 방향을 나타냅니다. 차가운 HBSS + P/s.를 포함 하는 24-잘 접시에 순차 조각의 컬렉션 조각이 다른 시간 포인트 (여기, 24-72 h) 재배 (맨 윗줄) 동안 종양 관련 마커 식 평가 대 한 교양 수 또는 약물 치료를 수행 하기 위해 사용할 수 있습니다. C: 차량 제어, t: 약물 치료입니다. (C) 회전 부 화 단위를 사용 하 여 재배에 대 한 조직 슬라이스를 배치. 일부 매체는 격자의 상단 커버를 6 잘 플레이트를 기울기, 매체, 위에 그리드 중간 조직 조각 놓고 집게를 사용 하 여 슬라이스를 확산 합니다. 6 잘 플레이트 부드러운 회전 사이클에 대 한 균형 무게 인지 확인 합니다. X: 나타냅니다 잘못 된, 그리고
: 분할의 정확한 위치를 나타냅니다. (D) 종양 조각의 FFPE 블록의 사진. 파라핀 끼워 넣어진 조직 조각 되며 물에서 화살표 포인트 블랙. (E) 회로도 FFPE 블록; 조각의 단면 순서를 보여주는 이 섹션은 조직 생존 능력 및 종양 관련 바이오 마커 식 평가를 처리할 수 있습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 2: 생존 능력 및 histotype 전용 마커 식, 그리고 NSCLC 조직 조각에 대상된 약물 치료의 평가. 24 h. 200 µ m 얇은 조각에 대 한 양식 표시 두께의 AC NSCLC 조각의 이미지 (A) 대표 H & E 160 µ m 또는 250 µ m 얇은 조각에 비해 더 나은 생존을 유지. 진한 파란색 H & E 가능한 조직, 스테인드 나타내고 핑크 pseudocolored 괴 영역을 나타냅니다. 하늘색 가난한 조직 품질 또는 섬유질 stroma의 존재 중 하나는 분석에서 제외 하는 영역을 나타냅니다. T1 및 T2 두 개의 다른 종양에서 파생 된 생물 복제를 나타냅니다. 눈금 막대 = 500 µ m. (B) 대표 IHC 이미지 표시 시간 포인트에 대 한 교양 AC 조각에 NKX2-1 식의. 화살표는 더 높은 확대에 표시 된 영역을 나타냅니다. 결과 0 h 조각에 비해 교양 조각에서 NKX2-1 식은 수정 되지 않습니다 보여 줍니다. 눈금 막대 = 500 µ m, 50 µ m 낮은 배율에 대 한 각각. (C) (B)에 표시 된 데이터의 정량화. (D) 대표 IHC 이미지 phosphorylated 4EBP1 또는 pERK1/2 식을 0 h에서의 조각, 또는 조각 DMSO로 치료 적정 양의 dactolisib (dact, 맨 위 행) 또는 pERK1/2 식을 0 h 슬라이스나 슬라이스 DMSO로 치료에 phosphorylated 또는 selumetinib (sel, 맨 아래 행)입니다. 검은 사각형 상자 높은 확대에 표시 하는 영역을 나타냅니다. 눈금 막대 = 1 m m 또는 낮은 또는 높은 확대에 대 한 50 µ m 각각. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
다양 한 복잡 한 생체 외에서 종양 모델, 3D 문화 등 organoids, 건축과 비보에 종양 조직29,30의 종양 기능 정리에 개발 되었습니다. 그러나, 조직 분리 및 단일 셀 형식의 선택적 성장 또는 공동 문화는 선택 몇 종류의 세포 인공 환경에서 3D 문화 또는 organoids의 설립 포함 한다. 결과적으로, 같은 모델은 종양이 종양 기질 상호 작용의 복잡 한을 불완전 하 게 캡처합니다. Organotypic 종양 조각, 다른 한편으로, 현장에서 종양의, 광범위 한 조작 없이 조직 아키텍처 및 생물 복잡성을 유지합니다. 그들의 네이티브 microenvironment에 모델 종양 세포 조직 조각의이 능력 특히 전 임상 연구에 대 한 매력적인 그들을 렌더링합니다. 우리는 이전 설립 및 정밀 컷 종양 조각의 분석에 대 한 최적화 된 워크플로 보고와 회전 외피 단위 향상 단기 murine NSCLC 슬라이스 문화25 의 생존 능력을, 지 원하는 필터에 비해, , 그러나 31., 회전 단위에 경작은 기술적으로 도전 하며 지속적인 모니터링. 우리 여기 종양 조직 조각 생성 및 실용화는 그들 문화 외피 단위 회전 뿐 아니라 동반 캡처 원래의 종양 생물학, 약 전에 필수 조각 수를 모니터링 하는 방법에 대 한 프로토콜을 제시 응답 테스트입니다.
프로토콜에 몇 가지 중요 한 단계 조직 무결성 및 종양 조각의 생존 능력을 확인합니다. 정상적인 폐 조직 종양 주변, 경우는 vibratome 일관성 없는 두께 슬라이스를 생성 하거나 조각 텍스처 및 강성 정상 및 종양 조직 간의 차이로 인해 손상 수 있습니다. 따라서 종양 부 러 뜨 리 하기 전에 주변의 정상 폐 조직을 제거 하는 것이 중요입니다. 또 다른 중요 한 단계는 신중 하 게 각 조직 유형에 최적화 해야 슬라이스 두께입니다. 또한, 슬라이스, 일단 그는 슬라이스는 약 중앙 배치 그리드, 정확한 보장 하기 위해 그래서 간헐적으로 문화 매체에 산소 노출을 찍기 긴요 하다. 마지막으로, 그것은 그것의 회전 기간 동안 한 조각의 위치를 따르는 것이 중요 한 조각 수 있습니다 드롭 다운 매체; 이 경우, 추가 작업 반입할 수 있습니다 프로토콜의 3.6 단계에 설명 된 대로.
무결성을 보장 하기 위해서 처리 하는 조직 뿐만 아니라 또한 있다 중요 한 단계 IHC 분석을 어떻게 조각 유사한 기본 조직 해석에서. 우리의 이전 연구 murine NSCLC 종양 종양 신호 활동26발음된 내부 종양 공간이 전시 보였다. 즉 공간 별개 조직의 사용 컨트롤에 대 한 조각 또는 약물 치료 샘플 신뢰할 수 있는 실험 데이터 해석에 영향을 미칠 수 및 따라서 밀접 하 게 인접 한 분할 영역 컨트롤 및 테스트 샘플으로 사용 해야 합니다. 우리 더 확산 하는 동안 보여주었다 또는 갓 잘라 요 0 h 조각에 종양 phosphoprotein 식 현장에서 종양, 유사 했다 교양된 조각 보여주는 변경 된 종양 phosphoprotein 식, 특히 변경 된 p4EBP1 그리고 pSRC, 뿐만 아니라 변경 된 확산 Ki67 IHC 분석. 변경 된 p4EBP1 식 24 h에 감지 마찬가지로 인간의 NSCLC 및 전립선 암 문화 슬라이스 (Narhi 외., 보충 그림 S3B S3C, S5, S7)26. 이러한 연구 결과 그들의 가장 가까운 0 h 미 슬라이스 교양 조각의 비교 교양된 조각에 종양 기능 제자리에 의 보전을 평가 하기 위해 매우 중요 하다 보증.
Organotypic 조각25의 가능성, 개선에 불구 하 고 교 칙에서 회전자 시스템 제한이 있습니다. 티타늄 격자에 조직 조각 배치 이며 삽입, 필터링에 비해 더 도전 회전 외피 단위를 사용할 수 없습니다. 대신, 정체 필터 지원 사용할 수 있습니다, 하지만 그 경우에 공기에 노출 된 조각 측면 분석 해야 합니다, 생존 능력 및 HIF1α 식으로 측정 하는 산소 공기 필터 그라디언트 필터 지원 조각에 빠르게 형성으로 문화 (데이비스 외 알., 그림 5와 그림 7A 7B)25. 우리는 더 변경 된 확산 및 상처 치유 응답 또는 비보 전 에 조각의 변화 적응 가능 하 게 그들의 네이티브 종양26에 비해 종양 신호 활동 종양 조각 문화 전시 수 있습니다 나타났습니다. 32문화. Murine NSCLC 종양의 심한 형태학 상 특징 재배 72 h 동안 유지 되었다, 비록 문화 유도 증식 변화 재배 조각의 정확한 등급 영향을 미칠 수 있습니다. 따라서, 조직 조각 단기 기능 연구만 활용 되어야 합니다.
회전 외피 단위를 사용 하 여 적어도 부분적으로 문화의 첫 24 시간 동안 특히 내부 슬라이스 생존 또는 바이오 마커 식 일정을 구출. 무결성 및 기능에 대 한 유효성을 검사 하는 일단 약물 치료 연구 등 기능 연구에 대 한 조직 자료를 제공 합니다. 마약 프로 파일링을 응답, 뿐만 아니라 약물 치료 다음과 변경된 대상 식 또한 항 체 유효성 검사를 활용할 수 있습니다. 이것은 특히 관련 마우스 단일 클론 항 체와 murine epitopes의 검출에 대 한 이러한 높은 착 색 배경 제공 하는 경향이입니다. 또한, 잘 검증 된 항 체 진단 및 임상 설정에서 안정적이 고 재현 가능한 데이터를 달성 해야 합니다. 따라서, 풍부의 변조 또는 조직 조각에 약물 치료에 따라 관련 epitopes의 인 산화 항 체 확인에 편리한 실용적인 응용 프로그램을 제공 합니다. 종양 조각 문화의 주요 이점은 그들에 게 매력적인 비보 전 모델을 시키는 종양 또는 stromal 세포 종양 신호 활동 또는 약물 응답을 포함 하 여 모델 공간 분산 기능을 기능입니다. 그러나, 재배, 동안 조각을 회전 하 고 경작 과정 더 가장자리에 특히 조직 손상 될 수 있습니다. 그것은 따라서 도전 층 정확 하 게 0 h 조각의 biomarker 스테인드 IHC 이미지 괴 영역 교양된 조각에서 발견는 정확 하 게 약물 응답 공간 biomarker 활동을 연결 하는 기능을 타협. 또한, 종양 내장, 문화 유도 및 약물 유발 괴 응답은 하지 구별할 수 적어도 공간 약물 응답의 정확한 정량 타협 murine NSCLC 조직 조각. 마지막으로, 종양 조각 문화를 사용 하 여 테스트 연구원 여러 화합물에 허용 치료 동물, 따라서 정제, 감소, 및 실험실 동물에 실험을 대체 하는 필요 없이 동일한 종양 합니다.
미래의 응용 프로그램으로 설명된 프로토콜 임상 고체 종양 샘플을 채택 될 수 있다. 또한 조직 유형-종속 수정 또는 최적화 가능성이 필요한 종양 텍스처 또는 강성에 대 한 이러한 최적화를 슬라이스 두께 및 진동 속도 포함 한 vibratome 설정을 조정 시작 있습니다. 또한, 영양소와 성장 인자 요구는 다른 종양 조직에 대 한 달라질 수 있습니다. 예를 들어, 유 방 암 조각 인슐린 중간13,18에 보충으로 경작 되어 있다. 제한 된 조직 소재 수술 또는 생 검 동안 얻은 것입니다, 그 종양 환자에서 파생 된 조각 문화의 최적화 복제 샘플의 충분 한 숫자를 얻기에 있는 어려움 때문에 전하실 수 있습니다. 또한, 데이터 재현성 또한이 환자 환자 샘플이, 괴 사 성 조직 구성 요소 뿐만 아니라 거리 지역 또는 stromal 침투 대 종양 세포의 비율에서 특히 발음에 의해 도전입니다. 마지막으로, 종양 조각 진단 설정에서의 응용 범위는 마약을 전처리 biopsies의 슬라이스 explants 응답 post-treatment에 vivo에서 응답을 일치의 조사를 요구할 것입니다.
저자는 충돌의 관심을 선언합니다.
혁신적인 의약품 사업 공동 사업에서이 연구 작업 받은 재정 지원 부여 계약 no 115188, 의학 장학금 (A.S.N.), 헬싱키의 대학 박사 프로그램 그리고 Sigrid Juselius 및 오리온 Farmos 기초 (E.W.V.) 우리가 진심으 우리의 PREDECT 조직 조각 플랫폼 컨소시엄 회원 감사 (Taija af Hällström와 Siv Knaappila 회전자 시스템 설정에서 지원에 대 한 MATLAB 분석 지원 위한 리 쿠 Turkki. Jouko 시로 그림 1 사진 캡처에 대 한 감사입니다. 우리 조직학 슬라이드, 스캔 FIMM WebMicroscope 팀을 감사 하 고 농업에 대 한 실험실 동물 센터 지원.
| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| 행크' s 평형염 용액(HBSS) | Sigma | H6648 | |
| 페니실린 스트렙토마이신 용액 | Thermo Fischer Scientific | 15140-122 | |
| Ham's F-12 medium | Thermo Fischer Scientific | 21765-037 | |
| Glucose | VWR | 101174Y | |
| FBS | Thermo Fischer Scientific | 10270-106 | |
| 글루타민 200mM | Thermo Fischer Scientific | 25030-024 | |
| 시아노아크릴레이트 접착제(GLUture) | Abbott | 32046-90-1 | |
| Leica VT1200 S 진동 블레이드 마이크로톰 | Leica Biosystems | 14048142066 | |
| 슬라이싱 블레이드 | VWR | PERS60-0138 | |
| 티타늄 그리드 | Albamma Research and Development | MA0036 | |
| 슬라이스 인큐베이션 유닛 | Albamma 연구 및 개발 | MD2500 | |
| 10 cm 조직 배양 플레이트 | Sarstedt | 83.1802 | |
| 24-웰 플레이트 | Sarstedt | 83.1836 | |
| 6-웰 플레이트 | Sarstedt | 83.1839 | |
| Neolus Hypodermic Needles | Terumo Neolus | NN2525R | |
| 50 mL 팔콘 튜브 | Greiner | ||
| PBS | Lonza | BE17-517Q | |
| 포름알데히드 | Fisher | F/1501/PB08 | |
| 삼중 히스토 카세트 종이 | 암 진단 | DX26280 | |
| 히스토 카세트 | VWR | 720-2199 | |
| KOS 마이크로파 다기능 티슈 프로세서 | 마일스톤 SRL | CAT307EN-003 | |
| 마이크로톰 | 테르모 피셔 사이언티픽 | HM355S | |
| 슈퍼프로스트 울트라 플러스 슬라이드 | VWR | 631-0099 | |
| BSA | 시그마 | A2153 | |
| NGS | 테르모 피셔 사이언티픽 | 16210-064 | |
| 구연산 | Sigma | C1909 | |
| PT-Module | Thermo Fischer Scientific | A80400012 | |
| H&용 헤마톡실린; E staining | Merck | 1.09249.0500 | |
| 카운터 염색용 Hematoxylin | Dako | S3309 | |
| Eosin | Sigma | E4382 | |
| NKX2-1 항체 | Abcam | ab133638 | 로트 번호: GR98031-12 |
| pERK 1/2 항체 | Cell Signaling Technologies | CST 4370 | 로트 번호: 17 |
| p4EBP1 항체 | 세포 신호 전달 Technologies | CST 2855 | 로트 번호: 20 |
| BrightVision poly-HRP 염소 안티-토끼 보조 항체 | ImmunoLogic | VWRKDPVR-110HRP | |
| 마운팅 메디쿰 퍼텍스 | VWR | MEDT41-4021-00 | |
| DAB | ImmunoLogic | VWRKBSO4-110 | |
| Dactolisib (NVP BEZ-235) | Selleckchem | S1009 | |
| Selumetinib (AZD2644) | Selleckchem | S1008 | |
| Pannoramic 250 슬라이드 스캐너 | 3DHISTECH | ||
| MATLAB | MathWorks | https://se.mathworks.com/ products/matlab.html | |
| 3디디스텍 판노라믹 뷰어 | 3DHISTECH | https://www.3dhistech.com/pannoramic_viewer | |
| 어도비 포토샵 CS6 | 어도비 | https://www.adobe.com/products/photoshop.html?sdid=KKQIN&mv=search&s_kwcid=AL!3085!3!247821564908!e!!g!!adobe%20photoshop&ef_id=U8T1GwAABVTK3gDR:20180712103259:s | |
| 피지-ImageJ | ImageJ | https://imagej.net/Fiji | |
| CellProfiler | CellProfiler 세포 이미지 분석 소프트웨어 | http://cellprofiler.org/ |
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