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Research Article
Adrianna Kolberg1, Christiane Wenzel1, Thorsten Hugel1,3, Markus Gallei2, Bizan N. Balzer1,3
1Institute of Physical Chemistry,Albert-Ludwigs-Universität Freiburg, 2Chair in Polymer Chemistry,Saarland University, 3Cluster of Excellence livMatS at FIT - Freiburg Center for Interactive Materials and Bioinspired Technologies,University of Freiburg
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
원자력 현미경 검사법 (AFM) 캔틸레버 팁에 프로브 분자의 공유 부착은 물리적 특성의 조사를위한 필수적인 기술입니다. 이를 통해 높은 재현성을 가진 AFM 기반 단일 분자 힘 분광학을 통해 연신력, 탈착력 및 폴리머 길이를 결정할 수 있습니다.
원자력 현미경 검사법 (AFM) 기반 단일 분자 힘 분광법은 단일 폴리머와 표면 사이의 상호 작용을 조사하기위한 이상적인 도구입니다. 진정한 단일 분자 실험을 위해, 프로브 분자의 공유 부착은 그 때 에만 1개의 동일한 단 하나 분자를 가진 힘 연장 추적의 수백을 장악할 수 있기 때문에 필수적입니다. 많은 흔적은 단독으로 단 하나 분자가 탐사된다는 것을 증명하기 위하여 차례로 필요합니다. 또한 단일 프로브 분자와 AFM 캔틸레버 팁, AFM 캔틸레버 팁과 기본 표면 간의 원치 않는 상호 작용을 방지하는 데 패시베이션이 중요합니다. 여기에 제시된 기능화 프로토콜은 신뢰할 수 있고 다양한 폴리머에 쉽게 적용할 수 있습니다. 특징적인 단일 분자 이벤트(즉, 스트레칭 및 고원)는 힘 연장 추적에서 검출됩니다. 이러한 이벤트에서 는 연신력, 탈착력 및 탈착 길이와 같은 물리적 파라미터를 얻을 수 있습니다. 이것은 단 하나 분자 수준에 자극 반응하는 시스템의 정밀한 조사를 위해 특히 중요합니다. 예시적인 시스템인 폴리(에틸렌 글리콜) (PEG), 폴리(N-이소프로필라크릴라미드) (PNiPAM) 및 폴리스티렌(PS)은 SiOx(PEG 및 PNiPAM용) 및 소수성 자가 조립단열 표면(PS용)으로부터 연신 및 탈착된다.N
1980년대1호에발명된 이래, 원자력 현미경(AFM)은 나노미터 이하의 공간 분해능, 서브피코뉴턴 힘 분해능 및 다양한 용매 및 온도 조건에서 측정할 수 있는 가능성을 특징으로 하는 자연과학에서 가장 중요한 이미징 기술 중 하나가되었으며, 2,3,34,,5,46,7.,7
,이미징8,9,AFM은 단일 중합체와 표면 간의 접착제 상호 작용, 단일 중합체의 물리적 특성 및 단백질,7,,7,10,11,,12,,13,14,15,16사이의 점착 작용에 대한 통찰력을 제공하는 단일 분자 힘 분광법 (SMFS)을 수행하는 데 사용됩니다.,, 정기적인 SMFS 실험에서 기능화된 캔틸레버 팁이 표면과 접촉하여 AFM 캔틸레버의 폴리머가 이 표면에 물리를 수 있도록 합니다. 표면에서 AFM 캔틸레버 팁을 후퇴시킴으로써, AFM 캔틸레버의 편향의 변화는 힘 연장곡선(4)으로이어지는 힘으로 변환된다. 연신력, 탈착력 및 탈착 길이와 같은 물리적 파라미터는 당기기 속도, 표면에 거주 시간, 표면에 대한 들여쓰기 깊이, 온도, 용매17,,18 및 고체 기질, 폴리머 필름 또는 지지성 지질 이중층19,20,,,,21, 22와같은 상이한 파라미터에 따라 결정될 수 있다.21 더욱이, 중합체는 상이한 공간 방향으로 조사될 수 있고, 따라서 중합체23,,24,,25,,26의마찰 특성을 조사한다.
조사된 폴리머를 AFM 캔틸레버 팁에 공유 부착하는 것은 이러한 연구에 필수적입니다. 따라서, AFM 캔틸레버 팁에 결합된 하나의 단일 분자 발생물의 높은 수율은 AFM 캔틸레버27,,28,다양한 부착점29 또는 다양한 폴리머(상이한 윤곽 길이)의 보정으로 인한 결과의 어떠한 편향도 방지한다(다양한 윤곽 길이)는 나노피싱 실험의 경우30,,31, 32.,32 또한, 다른 중합체와의 상호 작용뿐만 아니라 평균 효과는 널리 방지 될 수있다18,,28. AFM 캔틸레버 팁에 폴리머를 공유 부착하기 위해 다양한 유형의 화학 적 변형을 적용 할 수 있으며, 그 중 많은 부분이 Hermanson33에의해 책에 요약되어 있습니다. 아민 및 티올 기반 연결 반응뿐만 아니라 클릭 화학은 AFM 캔틸레버 팁 기능화34,,35,,36,,37,38, 39,,39,,40,,41, 42에서가장 일반적으로 사용되는 방법을 나타낸다.41, Becke et al.40은 AFM 캔틸레버 팁에 단백질을 부착하기 위해 1-에틸-3-(3-디메틸아미노프로필)카르보디미드(EDC)/NHS 화학을 사용하는 방법을 보여준다. 그러나, 이러한 작용기는 상호 연결되는 경향이 있어 기능의 손실로 이어진다43,,44. 또한, 카보디마이드는용액(43)에서가수분해가 빠른 경향을 보여준다. 말레미드와 티올 그룹은 일반적으로 더 안정적이며 가교 반응을 보이지 않습니다. 제시된 프로토콜은 참조35,,39에주어진 이전에 게시된 프로토콜의 최적화이다.
여기서, 등고선 길이 또는 소수성등의 성질에 관계없이 많은 수의 상이한 중합체로 용이하게 조절할 수 있는 신뢰할 수 있는 기능화 프로토콜이 제시된다. 3개의 상이한 중합체는 예를 들면: 친수성 폴리에틸렌N글리콜 (PEG) 및 폴리 (N-isopropylacrylamide) (PNiPAM) 뿐만 아니라 높은 몰 질량 소수성 폴리스티렌 (PS). 적절한 링커 분자를 가진 공유 결합 기능을 제공하기 위해, 3개의 중합체는 기능성 말단군으로서 텔레첼릭 티올 모에티를 특징으로 하기 위해 선택되었다. 링커 분자 자체는 전형적으로 2개의 활성 부위를 가진 짧은 PEG 중합체, 한쪽 끝에 실란 군 및 다른 쪽 끝에 있는 말미마이드 그룹이다. 전자는 AFM 캔틸레버 팁에 공유 부착을 가능하게 하고 후자는 기능화된 고몰 질량 중합체의 티올 기와 결합 반응을 가능하게 한다. 또한 비활성 PEG 링커 분자는 프로브 폴리머와 AFM 캔틸레버 팁 뿐만 아니라 AFM 캔틸레버 팁과 기본 표면 사이의 원치 않는 상호 작용을 방지하는 패시베이션 층역할을 합니다.
참고: 회로도 개요는 그림 1을 참조하십시오.
1. 시약 설정
참고 : 이 프로토콜에 사용되는 중합체는 다음과 같습니다 : 말미드 폴리에틸렌 글리콜 트리에톡시실란 (실란 - PEG-말, 5 kDa), 티올 폴리에틸렌 글리콜 티올 (HS-PEG-SH, 35 kDa), 티올 종단 폴리(N-isopropylacrylamide) (PNiPAM-SH, 637 kDa) 및 티올 종단 폴리스티렌 (PS-SH, 1.3 mDa).
2. 장비 설정
참고: 핀셋과 비커는 스테인리스 스틸 또는 유리로 만든 사용주입니다. 안전한 그립을 위해 반전된 핀셋을 사용합니다(예: 낮은 스프링 상수를 갖는 모델 R3 SA).
3. 팁 기능화
참고 : 모든 단계는 유기 증기의 흡입을 피하기 위해 연기 후드에서 수행해야합니다. 또한 장갑, 실험실 코트 및 눈 보호가 필요합니다. 오염을 피하기 위해 모든 단계에 니트릴 또는 라텍스 장갑을 사용하십시오. 톨루엔을 사용할 때는 용매 내성 장갑을 착용하십시오. 달리 명시되지 않는 한 모든 단계는 RT에서 수행됩니다.
4. 표면 준비
5. 데이터 수집
참고: 여기에 표시된 모든 측정은 온도 변화에 대한 가열 및 냉각 샘플 단계를 사용하여 Cypher ES AFM을 사용하여 초순수에서 수행되었습니다. 일반적으로 액체를 측정할 수 있는 기능을 제공하는 모든 AfM을 사용할 수 있습니다.
6. 데이터 평가
참고: 데이터 평가를 위해 Igor Pro를 기반으로 한 맞춤형 소프트웨어가 다음 단계를 수행하는 데 사용되었습니다.
다음 의 예는 중합체 PEG, PNiPAM 및 PS의 단일 분자 스트레칭 및 탈착의 결과를 나타낸다. 모든 AFM 캔틸레버 팁은 위에 제공된 프로토콜로 기능화되었습니다. PEG 및 PNiPAM은 온도 변화와 함께 SiOx에서 측정되었다. PEG 및 PNiPAM에 대한 생성 된 온도 의존 스트레칭 곡선에 대한 자세한 논의를 위해, Kolberg 등18 다른 힘 확장 모티프는 일정한 힘의 고원입니다 (예를 들어, 메틸의 자체 조립 단층에서 PS를 탈지 할 때 물4,,27,,39,,51)에알카네 티올을 종료하였다.
실시예 1: 물 속에서 PEG 및 PNiPAM 스트레칭
물에서의 온도 의존적 연신 거동은 한쪽 끝에 AFM 캔틸레버 팁에 공유결합된 단일 PNiPAM 및 PEG 폴리머를 사용하여 측정하고 다른 쪽 끝에 있는 SiOx 표면에 물리를 묻히게 되었다. 캘리브레이션 및 클린 컨트롤 실험(힘 확장 곡선의 2% 미만이 단일 분자 이벤트를 표시함) 후, 각 AFM 캔틸레버에 대해 적어도 2개의 힘 맵을 기록하였다. 온도 의존적 실험은 각 온도에서 적어도 하나의 힘 맵을 기록함으로써 수행되었다. 몇 개의 스트레칭 이벤트만 나타났을 때, 각각의 AFM 캔틸레버가 폐기되고 칩의 다음 AFM 캔틸레버가 촬영되었습니다(일반적으로 MLCT-Bio-DC의 순서 C, B, D 및 E). PEG의 예시적인 데이터에 대해, 단일 스트레칭 이벤트는 500개의 측정된 힘 연장 곡선 중 95개에서 관찰되었다(19%). PNiPAM의 경우 600개의 힘 연장 곡선 중 252개에서 스트레칭 패턴(42%)이 나타났습니다. 힘 확장 곡선을 더 잘 비교하기 위해 모든 온도에 대해 단일 마스터 곡선이 생성되었습니다. 이를 위해, 형태 변동 및 용매 효과가 무시할 수 있는 500 pN 이상의 스트레이징 이벤트가 있는 곡선만52를선택했다. 최종 스트스트레칭 수는 278K에서 3, 298K에서 7, PEG의 경우 318K에서 4, 278 K에서 3, PNiPAM18의경우 318 K에서 3이었다.
마스터 커브 생성 절차는 그림 3에제공됩니다. 선택한 힘 연장곡선(그림 3A)은길이 L0(500pN의 힘에서 확장)으로 재조정되고 그림 3B를참조하십시오.0 접착 피크는 표면과 AFM 캔틸레버 팁 사이의 비특이적 접착의 큰 변화를 나타내지만 폴리머 연산 거동에 영향을 미치지 는 않습니다. 재스케일링된 힘 확장 곡선을 병합한 후 그림3C에제시된 바와 같이 이노미날 스무딩에 의해 평균화됩니다. 이를 위해 가우시안 필터는 스무딩 매개변수 2053과동일한 수준에서 파스칼의 삼각형에서 파생된 정규화된 계수로 데이터를 컨볼루싱합니다. 마지막으로, 마스터 커브는 도 3D에주어진 바와 같이 모든 온도에 대해 얻어진다. 확대는 힘 확장 동작에 대한 온도 영향이 가장 두드러지는 범위를 표시합니다.
그림 4에서PEG(A)와 PNiPAM(B)의 온도 거동을 비교한 것을 확인할 수 있습니다.AB PEG의 경우 온도가 증가하면서 연이력의 감소가 관찰되었다. 온도를 278에서 318 K로 증가시킬 때 100 pN에서 재스케일링 된 확장의 약 5 %의 증가가 관찰되었다. PNiPAM의 경우 온도에 따라 달라는 반대의 변화가 드러날 수 있습니다. 온도가 278에서 328 K로 증가했을 때 100 pN에서 재스케일링 된 확장의 약 1 %의 감소가 관찰되었다. 또한, 주어진 힘 값에 대한 곡선 아래의 영역을 결정함으로써 힘 연장 마스터 곡선으로부터 스트레칭 자유 에너지를 얻을 수 있었다. 이는 분자 역학(MD) 시뮬레이션18의도움으로 스트레칭 자유 에너지의 에너지 및 엔트로픽 기여를 추출하는 데 사용될 수 있다.
예 2: 물 속에서 SAM 표면에서 PS의 탈착
물 속에서 SAM 표면으로부터 PS의 탈착은 탈착력 및 길이를 결정하고 소수성 상호작용을 정량화하는 데 사용될 수 있다. 보정 후, 적어도 두 개의 힘 맵이 표면의 두 개의 다른 지점에 기록되었다. 폴리머 부착이 성공했을 때, 힘 연장 곡선은 특징적인 특징으로, 그림 5A 및 그림 5C를참조하여 일정한 힘의 고원을 보였다. 고원과 같은 탈착은 프로브 결합의 역학이 AFM 캔틸레버 팁(준평형)의 당기는 속도보다 훨씬 빠를 때 관찰됩니다. 고원과 같은 힘 연장 곡선의 탈착력은 힘 연장 추적54를통합하여 접착 자유 에너지를 직접 제공합니다. 그들은 액체 환경,,,2,,4,23,51,,54,55의표면에 단일 폴리머의 마찰 특성뿐만 아니라 정전기, 분산 및 소수성 상호 작용을 결정하는 데 사용되었습니다.
일정한 힘의 각 고원은 탈착력과 탈착 길이를 결정하기 위해 시그모이드 곡선을 장착한 다음 히스토그램으로 플롯되었습니다. 히스토그램은 최대 값과 표준 편차를 추출하기 위해 가우시안을 장착했다. 더 나은 개요를 위해 그림 5B 및 그림 5D에제공된 대로 탈착력과 길이 값이 분산형 플롯에 함께 표시되었습니다.
물에서 SAM에 폴리스티렌의 경우, 결정된 탈착력은 이전에 얻은 값19,,23에해당합니다. 탈착 길이가 폴리머 윤곽길이(51)와상관관계가 있는 바와 같이, 탈착 길이 분포는 기능성 단부들을 통해 AFM 캔틸레버 팁에 대한 각각의 중합체의 공유 결합의 증거로 사용될 수 있다. 따라서, 탈착 길이는 지문 역할을 한다.
AFM 캔틸레버 팁에 부착된 하나 이상의 폴리머의 경우, 고원(이산 단계)의 캐스케이드는 힘 연장곡선(56)에서관찰될 수 있다. 각 고원은 상이한 연장에서 중합체의 탈착을 나타낸다. 도 5 Figure 5C 및 도 5D에 주어진 실험은 동시에 AFM 캔틸레버 팁에 부착된 두 개의 중합체의 전형적인 사례를 보여주었다. 최종 파열을 피팅함으로써 탈착 길이에 대해 이중 모달 분포를 찾을 수 있었고 탈착력은 좁은 분포를 보였습니다. 이 경우, 더 작은 탈착 길이는 도 5C에제시된 바와 같이 단일 고원 또는 더 긴 고원에 대한 추가 고원으로서 힘 연장 곡선의 90%에서 발견될 수 있다. 더 높은 탈착 길이는 얻어진 힘 연장 곡선의 37%에서 발견되었다. 따라서, 탈착 길이 분포는 AFM 캔틸레버 팁에 부착된 상이한 중합체의 수를 결정하는데 사용될 수 있다. 일반적으로, 탈착 길이 값의 좁은 분포는 하나 및 동일한 단일 중합체가 얻어진 힘 연장 곡선에서 조사되었다는 좋은 표시이다. 동시에, 각각의 힘-확장의 중첩은 하나 및 동일한 단일 중합체가 측정되었는지 여부를 결정하는데 사용될 수 있다.
단일 PS 폴리머의 공유 결합을 입증한 후, 이 PS 폴리머를 위한 추가 실험은 다양한 기판(고체 표면뿐만 아니라 폴리머 필름), 용매 조건, 온도, 당기는 속도 또는 거주 시간을 수행할 수 있다.

그림 1: 팁 기능화 프로세스의 회로도 개요입니다. AFM 캔틸레버 팁의 화학적 변형을 포함(1)플라즈마 활성화(2)실란화/PEGylation 및(3)폴리머 부착. 또한, 사용되는 폴리머, 즉 PEG, PNiPAM 및 PS의 상세한 화학 구조가 도시된다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2: 힘 확장 곡선의 간섭 제거. (A)확장을 따라 정현파 힘 신호 아티팩트를 나타내는 힘 확장 곡선을 찾았지만 단일 분자 스트레칭 이벤트가 없습니다. (B)단일 분자 이벤트가 있는 힘 확장 곡선을 선택하고, 이는 정현파 아티팩트로부터 수정되어야 한다. (C)곡선의 정현파 아티팩트가 실제로 일치하는지 제어하기 위해 곡선을 중첩합니다. (D)(B)에서힘 연장 곡선(A)을빼면 직선 기준선이있는 힘 연장 곡선이 얻어진다. 추가 해석에는 접착 피크를 사용할 수 없지만, 힘 연장 곡선은 이제 단일 분자 이벤트 영역에서 훨씬 더 정확한 힘 값으로 이어지는 아티팩트에 대해 보정됩니다(여기: > 0.2 μm 의 확장). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 3: 298K에서 PEG의 힘 연장 곡선에서 마스터 커브의 결정. (A)7개의 힘 연장 곡선을 사용하여 298K에서 실험 데이터를 사용합니다. 500pN(B)의힘에서 길이L0으로 재스케일링한 후, 힘 연장 곡선은 마스터 커브(C)를 획득하는C바이노미날 스무딩에 의해 병합및 평균화될 수 있다. L 재배선 커브는 점으로 지정되고 마스터 커브는 실선으로 표시됩니다. 마지막으로, 상이한 온도에 대해 얻어진 마스터커브(D)를비교할 수 있다. 확대/축소는 힘 확장 동작에 대한 온도 영향이 가장 두드러지는 범위를 나타냅니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 4: PNiPAM 및 PEG의 온도 의존마스터 곡선비교. PEG의 경우온도(A)를증가시킬 때 100 pN(mid-force range)에서 재스케일링 된 확장의 증가가 관찰되고, PNiPAM의 경우 반대 온도 의존적 변화가 드러난다(B).B 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 5: 물 속에서 SAM에 대한 PS의 힘 연장 곡선 분석. (A)고원의 시그모이달 핏(보라색)을 가진 예시적인 힘 연장 곡선(파란색). 또한 화살표는 고원의 결정된 힘(빨간색)과 길이(녹색)를 표시합니다. sigmoidal 맞춤에 의해 얻어진 탈착력 및 탈착 길이 값이 분산도표에 표시되고 그 결과 히스토그램에는 가우시안이 장착됩니다. (b)결정된 평균 탈착력 및 탈착 길이 값은 (112±6) pN 및 (659±7) nm이며, 여기서 힘 연장 곡선의 93%는 이러한 단일 고원 이벤트를 나타낸다. (C)AFM 캔틸레버 팁에 부착된 2개의 폴리머에 대해 동시에 포스-익스텐션 커브(파란색)를 예로 들 수 있다. 여기서, 탈착력은 (117±5) pN의 평균 힘 값을 가진 단모달 분포를 나타내고, 이중모달 분포는 탈착 길이(656±9) nm 및 (1050±16) nm의 평균 길이 값을 이월하는 동안 발견될 수 있다. (D)샘플링된 힘 연장 곡선의 90%는 단일 고원 이벤트만 표시합니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
저자는 그들이 경쟁 금전적 이익이 없다고 선언합니다.
원자력 현미경 검사법 (AFM) 캔틸레버 팁에 프로브 분자의 공유 부착은 물리적 특성의 조사를위한 필수적인 기술입니다. 이를 통해 높은 재현성을 가진 AFM 기반 단일 분자 힘 분광학을 통해 연신력, 탈착력 및 폴리머 길이를 결정할 수 있습니다.
B.N.B. 및 T.H.는 독일의 우수 전략에 따라 도이치 포르충제마인샤프트(DFG, 독일 연구 재단)의 자금 지원을 인정합니다 – EXC-2193/1 – 390951807, gefördert durch die Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) im Rahmen der Exzellenzstrategie des Bundes und der Länder – EXC-2193/1 – 390951807, 및 부여 HU 997/1-13 (프로젝트 # 420798410). M.G.는 헤센 주 고등 교육, 연구 및 예술부의 LOEWE 프로젝트 iNAPO 의 프레임에서 부분적인 지원을 인정합니다. 우리는 고품질의 금 코팅 실리콘 웨이퍼의 기부에 대한 응용 솔리드 스테이트 물리학 IAF에 대한 프라운 호퍼 연구소에서 박사 볼프강 브로너와 아그네 주카우스카이트 박사에게 감사드립니다.
| 1-도데칸티올 (≥ 98%) | Sigma-Aldrich, 미국 | 417364-500ML | SAM |
| 암모니아 용액에 사용 (30%) | Roth, 독일 | CP17.2 | 청소에 사용 |
| Cypher ES | Asylum Research, an Oxford Instruments company, USA-AFM | ||
| 에탄올 (≥ 99.9%) | Roth, 독일 | PO76.1 | 솔벤트 |
| 골드 코팅 실리콘 웨이퍼 | Fraunhofer Institute for Applied Solid State Physics IAF, 독일 | - | SAM |
| 고해상도 복제 화합물 | Microset Products Ltd, 영국 | 에 사용101RF | 결합제 |
| 과산화수소 용액 | Sigma-Aldrich, 미국 | H1009 | Igor |
| Pro | 청소에 사용Wavemetrics, 미국 | - | 소프트웨어 환경 |
| 테트라 - 30 - LF - PC | Diener 전자, 독일 | - | 플라즈마 챔버 |
| 말레이미드 - 폴리에틸렌 글리콜 - 트리에 톡시 실란 | 크리 에이 티브 PEG 작품, 미국 | PHB - 1923 | 링커 폴리머 |
| MLCT - 바이오 - DC | 브루 커, 미국 | MLCT - 바이오 - DC | AFM 캔틸레버 |
| 프라임 CZ-Si 웨이퍼, n 형 (인광체) TTV < 10 &마이크로; m | MicroChemicals, 독일 | WSA40600250 P1314SNN1 | 실리콘 웨이퍼 |
| Purelab Chorus 1, 18.2 M & Omega; cm | Elga LabWater, 독일 | 10034-540 | 초순수 수원 |
| R3 SA | Vomm GmbH, 독일 | 5803 블랭크 | 핀셋 |
| 티올 종단 폴리 (N- 이소 프로필 아크릴 아미드) | Gallei Group, Saarland University, | Germany-PNiPAM 프로브 폴리머 | |
| 티올 말단 폴리스티렌 | 고분자 소스, 캐나다 | P40722-SSH | PS 프로브 고분자 |
| 티올-폴리에틸렌 글리콜-티올 | 크리에이티브 PEGWorks, 미국 | PSB-615 | PEG 프로브 고분자 |
| 톨루엔(99.99%) | Fisher Chemicals | T324-500 | 용매 |