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Research Article
Razan E. Ahmed*1, Nawin Chanthra*1, Tatsuya Anzai1,2, Keiichiro Koiwai3,4, Tomoki Murakami4, Hiroaki Suzuki4, Yutaka Hanazono1, Hideki Uosaki1
1Division of Regenerative Medicine, Center for Molecular Medicine,Jichi Medical University, 2Department of Pediatrics,Jichi Medical University, 3Institute of Global Innovation Research,Tokyo University of Agriculture and Technology, 4Department of Precision Mechanics, Faculty of Science and Engineering,Chuo University
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
이 방법은 형광 태그 sarcomere 단백질을 가진 다능한 줄기 세포 유래 심근세포를 사용하여 sarcomere 단축을 검사하는 것을 이용할 수 있습니다.
다능성 줄기 세포 유래 심근세포(PSC-CM)는 배아 및 유도된 다능성 줄기(ES/iPS) 세포 모두에서 생성될 수 있다. 이 세포는 심장 질병 모델링을 위한 유망한 근원을 제공합니다. 심근병증의 경우, sarcomere 단축은 성인 심근세포와 함께 질병 표현형을 검사하는 표준 생리학적 평가 중 하나입니다. 그러나, 사용 가능한 방법은 PSC-CM의 수축도 평가하기에 적합하지 않습니다, 이러한 세포는 위상 대비 현미경 검사의 밑에 보이지 않는 저개발 사코메레스가 있기 때문에. 이 문제를 해결하고 PSC-CM을 사용하여 sarcomere 단축을 수행하기 위해 형광 태그 사코레 단백질및 형광 라이브 이미징이 사용되었습니다. 얇은 Z 라인과 M 라인은 각각 사마레의 양쪽 끝과 중앙에 있습니다. Z라인 단백질 -α-액티닌(ACTN2), 텔레토닌(TCAP), 액틴 관련 LIM 단백질(PDLIM3) 및 1개의 M라인 단백질—묘메신-2(Myom2) -는 형광 단백질로 태그하였다. 이러한 태그된 단백질은 내인성 대립구도에서 노크인또는 아데노 관련 바이러스(AAV)에서 발현될 수 있다. 여기서는 마우스와 인간 만능 줄기 세포를 심근세포로 분화하고, AAV를 생산하고, 라이브 이미징을 수행하고 분석하는 방법을 소개합니다. 또한 형광 태그 단백질로 sarcomere 단축의 분석을 용이하게 PSC-CM의 패턴 문화에 대한 폴리디메틸실록산 (PDMS) 우표를 생산하는 방법을 설명합니다. 사컴 단축을 평가하기 위해 박동 세포의 시간 경과 이미지는 전기 자극(0.5-1Hz)에서 높은 프레임레이트(초당 50-100 프레임)로 기록되었다. 셀 수축 과정에서 사코메 길이를 분석하기 위해, 기록된 타임랩스 이미지는 ImageJ/Fiji의 플러그인인 SarcOptiM을 적용하였다. 우리의 전략은 PSC-CM에서 심장 질환 표현형을 조사하기위한 간단한 플랫폼을 제공합니다.
심혈관 질환은 전 세계적으로 사망률의 주요원인이며 심근병증은 심장 관련 사망의 세 번째 원인을 나타낸다2. 심근병증은 심장 근육에 영향을 미치는 질병의 집단 그룹입니다. 유도 된 다능성 줄기 (iPS) 세포와 심근 세포 (PSC-CM)를 향한 iPS 세포의 지시 분화의 최근 개발은 심근병증의 체외 모델로 환자 게놈으로 심근세포를 연구하기위한 문을 열었습니다. 이들 세포는 심장 질환의 병리생리학을 이해하고, 분자 메커니즘을 해명하고, 다른 치료 후보3을테스트하는 데 사용될 수 있다. 이와 같이, 환자 유래 iPS 세포가 생성되었다(예를 들어, 비대성 심근병증 [HCM]4,5,부정맥 우심심근병증 [ARVC]6,확장된 심근병증 [DCM]7,및 미토콘드리아 관련 심근병증,미토콘드리아관련 심근병증이있다. 심근병증의 특성 중 하나는 sarcomeres의 기능 장애 및 중단이기 때문에, 상반신 기능을 균일하게 측정하는 유효한 도구가 필요합니다.
Sarcomere 단축은 동물 모델과 인간에서 파생 된 성인 심근 세포의 sarcomere 기능과 수축을 평가하는 가장 널리 사용되는 기술입니다. 사컴레 단축을 수행하려면 위상 대비하에서 보이는 잘 발달된 사카레가 필요합니다. 그러나, 시험관 내 디스플레이에서 배양된 PSC-CM은 저개발 및 무질서한 사코머를 나타내므로, 따라서, 사르코름단축(10)을제대로 측정하는 데 사용할 수 없다. PSC-CM의 수축성을 제대로 평가하는 이 어려움은 시험관 내심장 기능을 평가하는 플랫폼으로서의 사용을 방해합니다. PSC-CM 수축을 간접적으로 평가하기 위해, 원자력 현미경 검사법, 마이크로 포스트 어레이, 견인력 현미경 검사법 및 임피던스 측정은 이러한 세포가 주변 환경에 가해지는 모션의 효과를 측정하는 데 사용되어 왔다11,12,13. 실제 세포 운동의 보다 정교하고 덜 침습적인 비디오 현미경 기록(예를 들어, 소니로부터 SI8000)은 수축도 를 대안적으로 평가하는 데 사용될 수 있지만, 이 방법은 사르코메어 모션 또는 강제 생성운동학(14)을직접 측정하지 는 않는다.
PSC-CM에서 사코머 운동을 직접 측정하기 위해, 사코머 단백질에 형광 태깅과 같은 새로운 접근이 나타나고 있습니다. 예를 들어 Lifeact는 사마필모션(15,16)을측정하기 위해 필라멘트 액틴(F-actin)에 라벨을 붙이는 데사용된다. 유전자 변형 iPS 세포는 형광단백질17,18,19에의해 사코메르 단백질(예를 들어, α 액틴 [ACTN2] 및 Myomesin-2 [MYOM2])를 태깅하기 위한 또 다른 옵션이다.
이 논문에서는 Myom2-TagRFP(마우스 배아 줄기 [ES] 세포) 및 ACTN2-mCherry(인간 iPS 세포)를 사용하여 sarcomere 단축을 측정하기 위한 타임랩스 이미징을 수행하는 방법을 설명합니다. 우리는 또한 패턴 문화가 사마머 정렬을 용이하게한다는 것을 보여줍니다. 또한, 당사는 환자 유래 iPS 세포에 널리 적용될 수 있는 아데노 관련 바이러스(AAV)를 사용하여 사르메레 라벨링의 대체 방법을 설명합니다.
1. 마우스 다능성 줄기 세포의 분화
2. 인간 만능 줄기 세포의 분화
3. 아데노 관련 바이러스를 사용하여 사혜성 라벨링
4. [선택 사항] PsC-CM의 AAV 기반 정제
5. PDMS 우표 준비
6. 다능성 줄기 세포 유래 심근세포의 패턴 배양
7. 형광 현미경에서 사컴레스의 시간 경과 이미징
8. SarcOptiM을 사용하여 시간 경과 이미징 분석, ImageJ / 피지 플러그인
노크인 PSC-CM 기자 라인을 사용하여 sarcomere 단축 측정. Sarcomere 라벨PSC-CM은 사코름 단축을 측정하는 데 사용되었습니다. 이 라인은 내인성 로시에서 Myom2-RFP 및 ACTN2-mCherry를 표현합니다. TagRFP는 M라인으로 국소화되는 M-단백질을 코딩하는 M-단백질을 코딩하는 Myom2에삽입되었으며, mCherry는 ACTN2에노크하고, 코딩 α-액티닌은 Z라인18,25로국소화되었다. 타임랩스 이미지는 피규어 1과 2및 영화 1-3에제시된 바와 같이 사컴레 단축을 결정하는 데 사용되었다.
PSC-CM의 무질서한 사코머를 극복하기 위해 특정 PDMS 스탬프는 스트라이프 패턴의 PSC-CM을 배양하는 데 사용되었습니다. 이러한 패턴 배양은 비패턴 영역에서 배양된 세포에 비해 길쭉한 세포 형상과 보다 조직화된 사코메어 패턴을 촉진하였다(그림2B 및 2C). 이러한 장점을 바탕으로, 패턴 배양은 세포의 더 나은 수축을 촉진하고 영화 2 및 3 및 도 2D에도시된 것처럼 매끄러운 사레 길이 프로파일을 제공했다.
AAV 벡터를 사용하여 Z 라인 단백질의 형광 태깅. 노크인 iPS 세포를 생성하지 않고 PSC-CM의 Z 라인을 시각화하기 위해 형광 태그Z 라인 단백질은 AAV 트랜스듀션을 사용하여 발현하였다. GFP를 이용한 두 개의 소형 Z라인 단백질인 텔레토닌(TCAP)과 액틴 관련 LIM 단백질(PDLIM3)은 AAV6 캡시드(도3A)를사용하여 태그및 포장하였다. PSC-CM이 분화되고 정제되면 AAV는 PSC-CM(그림3B)으로변환되었습니다. 변형된 PSC-CM은 3일 후 PSC-CM을 따라 육종GFP 신호를 발현하였다(그림3C 및 3D). 전형적으로,105 vg/세포의 MOI에서 AAV의 변환은 형광 태그 사코메르 단백질을 시각화하기에 충분하며, 더 높은 티터는 전체 GFP 강도를 증가하지만 세포질에 GFP의 비특이적 국소화를 유발할 수 있다.
AAV 벡터를 사용하여 PSC-CM의 정화. 현재 방법은 PSC-CM의 게놈에 이미 있는 약물 선택 카세트에 의존합니다, 형질전환 또는 노크 인 라인. 그러나, 환자 유래 iPS 세포로부터 이러한 라인을 생성하는 것은 노동 집약적이다. AAV 벡터는 노크인의 필요 없이 형광 표지 Z라인 단백질의 발현을 유도하는 것으로 입증되었기 때문에, 우리는 노크인(도4)없이정화 방법을 확립하고자 노력했다. 이를 위해, cTNT 프로모터의 통제 하에 블라실시딘 내성 유전자를 인코딩하는 새로운 AAV 벡터가 시공되었다(도4A). AAV(105 vg/셀의 MOI)는 4일째인간 iPS 세포를 분화하도록 유도하였다. 이어서 세포는 7일과 9일(도4B)사이에 블라스팅시딘(각 세포주에 대해 적정염이 필요)의 2.5-10 μg/mL로 처리하였다. 14일째PSC-CM의 순도는 90%(그림4C)를넘었다.

도 1: 묘2-TagRFP 세포주에서 유래된 마우스 PSC-CM의 사코머 단축. A. 마우스 PSC-CM 분화를 위한 타임라인입니다. B. 노란색 막대로 표시된 측정 영역과 다른 시간 지점에서 sarcomere 단축을 위한 대표적인 이미지입니다. 스케일 바 = 10 μm. C. 1Hz에서 전기로 자극된 심근세포의 수축 시 Sarcomere 길이 프로파일. 프레임 레이트는 초당 50 프레임이었습니다. 픽셀 크기는 0.26 μm이었습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2: 비패턴 및 패턴 배양에서 ACTN2-mCherry 세포주에서 유래된 인간 PSC-CM의 사코머 단축을 보여주는 대표적인 데이터. A. 인간 PSC-CM 분화를 위한 타임라인입니다. B. 및 C. 패턴이 없는 배양에서 배양된 심근세포는 무질서한 사르코프레 패턴(B)을 나타내며 패턴화된 배양은 사르코프레(C)의 좋은 정렬을 촉진한다. 노란색 막대가 제시한 측정 영역입니다. D. 0.5Hz의 전기 자극에 의해 유도된 세포 수축 시 얻어진 상응하는 sarcomere 길이 프로파일과 초당 100프레임. 픽셀 크기 = 0.26 μm, 스케일 바 = 10 μm. 여기를 클릭하여 이 그림의 더 큰 버전을 확인하십시오.

그림 3: 3 일 동안 AAV 변환 후 마우스 PSC-CM. A. 사컴 라벨링을 위한 AAV의 회로도 벡터 맵입니다. sarcomere 단백질 (관심의 유전자, GOI)는 글리 글리 글리 -Ser 링커 (L)와 GFP에 연결하고 심장 트로포닌 T (cTNT) 프로모터의 통제하에 표현된다. B. 마우스 PSC-CM 분화 및 AAV 변환에 대한 타임라인입니다. C. 및 D. Myom2-TagRFP 세포주에서 생성된 PSC-C로 3일간의 트랜스퍼배후 TCAP-GFP(C) 및 PDLIM3-GFP(D)의 명확한 사코머 길이 프로파일과 선명한 사코머 길이 프로파일을 보여주는 대표적인 이미지. 스케일 바 = 10 μm. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 4: 노크 -에없이 인간의 PSC -C의 블라스팅 딘 정화.
A. 블라시시딘 저항 유전자 카세트(BSR)가 cTNT 프로모터에 하류로 삽입되는 AAV의 회로도 벡터 맵. B. 인간 PSC-CM 분화, 변환 및 블라시딘 선택의 타임라인입니다. C. 인간 PSC-CM에서 cTNT + 세포의 백분율을 보여주는 대표적인 데이터(4일째에105 vg/셀 AAV6를 변환한 다음 7일과 9일에 2.5 μg/mL 블라실시딘으로 처리). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
동영상 1: Myom2-TagRFP 셀주에서 생성된 마우스 PSC-CM의 형광 시간 경과 비디오. RFP 신호는 28일 동안 PSC-CM 배양 후 사코레 패턴을 보였다. 세포는 1Hz에서 전기로 자극할 때 동기적으로 구타하는 것으로 나타났습니다. 타임랩스 이미지는 100X 렌즈로 20ms마다 획득되었습니다. 스케일 바 = 5 μm. 이 영화를 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
영화 2: 비패턴 문화 접시에 배양 ACTN2-mCherry와 인간의 PSC-C의 형광 시간 경과 비디오. 비패턴 문화 접시에 ACTN2-mCherry를 표현하는 PSC-CM은 사코머의 해체뿐만 아니라 흔들리는 수축을 보였으며, 이는 사코머 단축을 결정하기 가 어렵습니다. 세포는 0.5Hz에서 전기로 자극되었고 이미지는 100X 렌즈로 10ms마다 획득했습니다. 스케일 바 = 10 μm. 이 영화를 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
영화 3: 액트N2-mCherry가 패턴 문화 접시에 배양된 인간 PSC-CM의 형광 시간 경과 비디오. 패턴 배양은 사코메어의 정렬을 촉진하고 막대 모양으로 세포를 강제로. 이 방법을 통해 PSC-CM의 sarcomere 단축을 보다 쉽게 결정할 수 있었습니다. 비디오는 0.5 Hz에서 전기로 세포를 자극하여 획득했습니다. 프레임 레이트는 초당 100 프레임이었습니다. 스케일 바 = 10 μm. 이 영화를 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
추가 CAD 파일. 200 μm 폭의 스트립과 10 μm (Stamp_200x10.dxf), 25 μm (Stamp_200x25.dxf), 50 μm (Stamp_200x50.dxf)의 홈이있는 스탬프를 만들기위한 CAD 파일. 이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
H.U.는 이 원고와 관련된 특허를 출원했습니다.
이 방법은 형광 태그 sarcomere 단백질을 가진 다능한 줄기 세포 유래 심근세포를 사용하여 sarcomere 단축을 검사하는 것을 이용할 수 있습니다.
우리는 도움이 토론및 기술 지원을 위해 지치 의과 대학의 재생 의학 부서의 모든 실험실 구성원을 인정하고 싶습니다. 이 연구는 의학 연구 개발 (AMED)에 대한 일본 기관의 보조금에 의해 지원되었다; JP18bm0704012 및 JP20bm0804018), 일본과학진흥협회(JSPS; JP19KK0219, 일본순환학회(기초연구보조금)
| 1-티오글리세롤 | 시그마-알드리치 | M6145-25 | |
| 2-메르캅토에탄올(55mM) | Thermo Fisher Scientific | 21985-023 | |
| 2-메타크릴로일옥시에틸 포스포릴콜린(MPC) 폴리머, | NOF Corp. | LIPIDURE-CM5206 | |
| 2-프로판올 | 후지필름 wako | 166-04836 | |
| 폴리머 커버슬립이 있는 35mm 이미징 접시(&마이크로;-접시 35mm, 높음) | ibidi | 81156 | |
| AAVproR Helper Free System (AAV6) (벡터; pHelper, pRC6, pAAV-CMV-Vector) | Takara | 6651 | |
| ACTN2-mCherry(AR12, AR21) hiPSC | N.A. | 다른 곳에서 설명한 방법(Anzai, Methods Mol Biol, in press) | |
| B-27 Supplement (50X), 무혈청 | Thermo Fisher Scientific | 17504-044 | |
| B-27 Supplement | (50X), insulinThermo Fisher Scientific | A18956-01 | |
| B27 supplement (50X), minus vitamin A | Thermo Fisher Scientific | 12587-010 | |
| 벤조나제(25 U/&마이크로; L) | Merck Millipore | 70746 | |
| Blasticidin S Hydrochloride | Fujifilm wako | 029-18701 | |
| BMP-4, 인간, 재조합, | R & 주식회사 디 시스템즈 | 314-BP-010 | |
| 소 혈청 알부민 | 시그마-알드리치 | A4503-100g | |
| C59, Wnt 길항제(WntC59) | abcam | ab142216 | |
| CAD 도면 소프트웨어, | Robert McNeel and Associates, WA, USA | 코뿔소 6.0 | |
| 원심 한외여과 장치(100k MWCO), Vivaspin-20 | Sartorius | VS2042 | |
| CHIR99021 | Cayman | 13122 | |
| 크롬 에칭 | Nihon Kagaku Sangyo Co., Ltd., 일본 | N14B | |
| AZP1350 | Clean Surface Technology Co., 일본 | CBL2506Bu-AZP | |
| Dr. GenTLE 침전 캐리어 (20mg / mL 글리코겐, 3M 아세트산 나트륨 (pH 5.2)) | Takara | 9094 | |
| Dulbecco ' 의 변형된 독수리' s 매체 (DMEM) - 고혈당 | Sigma-Aldrich | D6429-500 | |
| Dulbecco' 의 변형된 독수리' s 매체 (DMEM) - 고포도당, 피루브산 나트륨 없음 | Sigma-Aldrich | D5796 | |
| 에탄올 (99.5) | Fujifilm wako | 057-00456 | |
| 소 태아 혈청 | Moregate | 59301104 | |
| FGF-10, 인간, 재조합, | R & 주식회사 디 시스템즈 | 345-FG-025 | |
| 섬유아세포 성장 인자(기본), 인간, 재조합 | 후지필름 wako | 060-04543 | |
| 돼지 피부 분말에서 추출한 젤라틴 | Sigma-Aldrich | G1890-100g | |
| Glasgow Minimum Essential Medium (GMEM) | Sigma-Aldrich | G5154-500 | |
| GLASS BOTTOM culture plates | MatTek | P24G-1.5-13-F/H | |
| Ham& 알스코오; s F-12 | Thermo Fisher Scientific | 11765-062 | |
| Iscove의 변형 둘베코 배지 (IMDM) | Thermo Fisher Scientific | 12440-061 | |
| L-알라닌-L-글루타민 (GlutaMAX 보충제, 200mM) | Thermo Fisher Scientific | 35050-061 | |
| L(+)-아스코르브산 나트륨 염 | 후지필름 와코 | 196-01252 | |
| 라미닌-511 E8 단편 ( LN511-E8, iMatrix-511) | Nippi | 892012 | |
| Mask aligner | Union Optical Co., Ltd., 일본 | PEM-800 | |
| 마스크리스 리소그래피 도구 | NanoSystem Solutions, Inc., 일본 | D-Light DL-1000 | |
| MEM Non-Essential Amino Acids Solution (100X) | Thermo Fisher Scientific | 11140-050 | |
| Millex-HV 주사기 필터 장치, 0.45 µ m, PVDF (0.45-&마이크로; m filter) | Merck Millipore | SLHVR33RS | |
| Myom2-RFP (SMM18) | N.A. | 이전 논문(Chanthra, Sci Rep, 2020)에서 개발 | |
| N-2 Supplement (100X) | Thermo Fisher Scientific | 17502-048 | |
| ORCA-Flash4.0 V3 디지털 CMOS 카메라 | Hamamatsu | C13440-20CU | |
| PD0325901 | Stemgent | 04-0006-10 | |
| Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Thermo Fisher Scientific | 15140-122 | |
| 페트리 접시 | Sansei medical co. Ltd | 01-004 | |
| 페놀/클로로포름/이소아밀 알코올 (25:24:1) | Nippon Gene | 311-90151 | |
| 폴리디메틸실록산(PDMS) 엘라스토머 | 다우코닝 Corp., MI, USA | SILPOT 184 | |
| 폴리에틸렌이민 MAX (MW. 40,000) | 폴리사이언스 | 24765-1 | |
| 포지티브 포토레지스트 현상 | 액Tokyo Ohka Kogyo Co. , Ltd., 일본 | NMD-3 | |
| PowerUp SYBR Green Master Mix | Thermo Fisher Scientific | A25742 | |
| Proteinase K | Takara | 9034 | |
| Puromycin Dihydrochloride | Fujifilm wako | 166-23153 | |
| 재조합 인간/마우스/쥐 Activin A 단백질 | R& 주식회사 디 시스템즈 | 338-AC-050 | |
| 재조합 트립신 유사 프로테아제(rTrypsin; TrypLE express) | Thermo Fisher Scientific | 12604-039 | |
| RPMI1640 Medium | Thermo Fisher Scientific | 11875-119 | |
| 실리콘 웨이퍼 | Matsuzaki Seisakusyo Co., Ltd., Japan | N.A. | |
| 피루브산 나트륨 (100 mM) | Thermo Fisher Scientific | 11360-070 | |
| Spin-coater | Mikasa Co., Ltd., Japan | MS-A100 | |
| Spininng 컨포칼 현미경 옥 | 스포드 기기 | Andor Dragonfly Spinning Disk System | |
| StemSure LIF, 마우스, 재조합, 솔루션 (10 ^ 6U) | Fujifilm wako | 195-16053 | |
| SU-8 3010 | Kayaku Advanced Materials, Inc., MA, USA | SU-8 3010 | |
| SU-8 개발자 | Kayaku Advanced Materials, Inc., MA, USA | SU-8 개발자 | |
| Tris-EDTA | Nippon Gene | 314-90021 | |
| Vascular Endothelial Growth Factor-A165(VEGF), Human, recombinant | Fujifilm wako | 226-01781 |