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Research Article
Delphine M. Depierreux*1,2, Emily Seshadri*1,2, Evgeniya V. Shmeleva*1,2, Jens Kieckbusch1,2, Delia A. Hawkes1, Francesco Colucci1,2
1Department of Obstetrics and Gynaecology, National Institute for Health Research Cambridge Biomedical Research Centre,University of Cambridge School of Clinical Medicine, 2Centre for Trophoblast Research,University of Cambridge
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
이것은 임신과 비 임신 마우스 둘 다에서 자궁 림프세포를 격리하는 방법입니다. 이 방법은 FACS phenotyping, 세포 선별, 기능 적 작용, RNA-seq 및 프로테오믹스와 같은 여러 다운스트림 응용 제품에 사용할 수 있습니다. 여기서 프로토콜은 혈류 세포측정에 의한 표현형 그룹 1 자궁선천성 림프구 세포를 전파한다.
여기에 설명된 간단한 방법은 유동 세포법에 의한 개별 임신 자궁으로부터 1 자궁성 마우스 군 1 자궁선천성 림프구 세포(g1 uILC)를 분리하는 간단한 방법이다. 이 프로토콜은 여러 동기 댐, 임신 한 자궁의 기계적 및 효소 소화, 단일 세포 서스펜션의 염색 및 g1 uILC를 차별하는 FACS 전략을 얻기 위해 시간 결합을 설정하는 방법을 설명합니다. 이 방법은 필연적으로 조직 내의 세포 분포의 공간 정보를 분실하더라도, 프로토콜은 성공적으로 uILC 이질성, 임신에 영향을 미치는 모계 및 태아 요인에 대한 그들의 반응, 그들의 유전자 발현 프로필 및 그들의 기능을 결정하기 위하여 적용되었습니다.
여기에 설명된 간단한 방법은 개별 임신 한 자궁으로부터 자궁 내 임포세포의 높은 수율을 얻는 간단한 방법입니다. 이 방법은 자궁 내 선천성 림프구의 단백질 표면 발현 및 기능을 보존하고 FACS 페노티핑, RNAAeq, 프로테오믹스 또는 기능적 작용과 같은 후속 응용 분야에 적합합니다. 여기서, 초점은 혈류 세포측정에 의한 그룹 1 uILC의 phenotyping에 있습니다.
자궁은 3개의 층으로 이루어지다: 자궁 내막, 근막, 및 perimetrium (도 1). 자궁 내막은 자궁의 루멘을 감싸는 점막입니다. 코퍼스 루테움에 의해 생성 된 프로게스테론, 데시두아로 자궁 내메터를 변환합니다. 근막은 자궁 벽을 구성하는 부드러운 근육의 두 층으로 구성되어 있습니다. 회리메트리움은 자궁을 감싸고 심술관이라고 불리는 넓은 인대를 통해 회막에 연결하는 세로사입니다. 자궁의 단면에서 루멘과 반대되는 부분은 심술문 측이라고 하며, 루멘에 가까운 부분은 항음절 측이라고 합니다. 다양한 모계 백혈구는 내메타리움과 데시두아를 채우고, 여러 종류의 세포를 포함하고, 여기서 선천성 면역 세포는 세포의 대부분을 나타낸다. 선천성 림프구 세포(ILC), 대식세포, 수지상 세포(DC), CD4+ 및 CD8+ T 림프구, 규제 T 세포(Tregs), 및 희귀 B 세포는 모두 임신 1,2에 걸쳐 자궁 환경의 조절에 중요한 역할을 할 수 있다. 자궁에 있는 IlCs는 점막에서 뿐만 아니라, 마우스에 있는 근막에서 또한 있습니다. IlC의 모든 3개의 단을 포함하여, 자궁은 실제로 그룹 1 IlCs에 의해 가장 인구밀도가 높은 기관입니다. 임신 기간 동안 자궁 조직의 구조적 변화와 함께 자궁 백혈구의 수와 비율도 변경됩니다(그룹 1 uILC 하위 집합의 비율에 대한 변동의 예는 그림 2A 참조)3,4.
마우스가 이 논문에서 언급될 때, 근친 실험실 마우스의 C57BL/6 균주는 의미된다. 외종 마우스 (예를 들어, NMRI 마우스)는 종종 그들의 높은 생식 속도 때문에 생식 연구에서 사용 됩니다. 그러나, 근친 긴장의 사용은 일관된 결과를 생성하기 위하여 필요하고, 면역학자의 마음에 드는 유전 배경은 B6로 알려져 있는 C57BL/6입니다.
임신 중반 B6 댐의 자궁 백혈구의 약 30%는 g1 uILC이며, 이는 가능한 CD45+CD3-CD3-CD19-NK1.1+NKp46+ 세포(그림 2B): 친혈관형성 조직 거주자 NK(trNK), IFN-tNK(cNK), IFN-g 생산 형 전자 식 NK(cNK), 기존 GC(CNK4C) 및 기존 GC(CC4) 및 기존 GC(CC4C), IFN-g 생산형 CNK(cNK4C) 및 기존 GC(cNKC4C) 및 기존 GCC(cNKC4C) 및 기존 GC(cNKC4C) 및 기존 GC(cNK)를 생산하는 데 사용 가능한 CD45+CD3-CD19-NK19-Nk19-NKp46+ 세포(그림 2B): IFN-t-g 의 기존 G CC(cNKC)을 생산하는 IFN-g. uNK 세포의 백분율은 첫번째 삼보격6에 있는 대략 70%에 도달하는 인간에서 더 높습니다. 인간과 마우스 uNK와 uILC7,8 사이의 차이보다 더 많은 유사점이 있습니다. 차이점을 염두에 두는 것이 중요하지만 두 종에서 사용할 수있는 정보를 통합하는 것이 유용합니다. 인간과 실험실 설치류에서 uILC를 조사하여 얻은 정보를 결합하면 NK 세포가 동맥 무결성9 및 나선형 동맥 리모델링10의 유지 보수를 포함하여 자궁의 생물학에 필수적인 동종 성 변화를 지원하고 트로피후 블라스트 침공11,12를 지원합니다. 그(것)들은 또한 병원체에 대하여 방어에 있는 특정 역할을 13,14. 마우스와 쥐에서, 이식 부위 주위의 데시두아를 채우는 것 외에도, NK 세포는 과거에 메심선으로 알려진 임신 림프구 골재(MLAp)15(도 1B)로 알려진 과도 구조에서 댐의 근막의 두 근육 층 사이에 축적되며, 그 기능은 아직 발견되지 않고 있다.
여기에 기술된 기계적 분리및 효소 소화의 조합을 사용하여 임신한 마우스의 자궁으로부터 림프구를 분리하는 실험실에서 사용되는 방법의 상세한 프로토콜이다. 전체 자궁이 이 방법으로 사용되기 때문에 임신 중 자궁으로부터 분리된 림프구는 데시및 심근세포의 혼합물이다. 자궁 벽과 MLAp로부터 데시두아의 추가 해부가 가능하고, 16 전에 설명되었다. 여기에 설명된 방법은 단백질 표면 발현, 세포 기능 성 및 생존가능성을 유지하면서 자궁 림프구를 얻기 위해 개발되었다. 결과는 임신한 자궁을 위한 중간 임신 (10.5 일)에 있는 1-5 백만 세포에서 전형적으로 구역 수색하는 최소한의 잔류 세포 파편 및 수율을 가진 단 하나 세포 현탁액입니다. 이 방법의 응용 프로그램은 흐름 세포측정에 의한 페노티핑, 후속 전사 또는 프로테오믹 연구를 위한 세포 분류, 세포 내 세포 사화학 생산, 탈과화, ELISPOT 또는 세포 독성 분석과 같은 기능적 연구를 포함한다. 여기에 제시된 프로토콜은 그룹 1 IlCs를 식별하는 데 중점을 두지만 FACS 분석에 사용되는 항체 패널의 사소한 수정을 통해 다른 IlCs, T 세포, B 세포, DC 또는 대식세포와 같은 다른 세포 유형에 적응할 수 있다. 프로토콜은 또한 그밖 조직에서 그리고 풀로 풀이 된 비 임신 자궁에 대한 세포를 격리하기 위하여 이용될 수 있습니다.
이 논문에 설명된 모든 동물 실험은 영국 본사에서 발행한 PP2363781에 따라 동물(과학 절차) 법 1986에 따라 수행되었습니다. 아래 프로토콜은 마우스 축산에서 시작하여 FACS 분석을 위해 염색으로 마무리하는 여러 섹션으로 구성됩니다. 그림 3 은 프로토콜의 주요 단계를 반영합니다. 프로토콜에 사용되는 재료는 재료 표에 나열됩니다.
1. 일반 마우스 축산, 짝짓기 및 해부
2. 자궁의 기계적 및 효소 소화
3. 자궁을 단일 세포 현탁액으로 가공
4.RBC 리시스
5. 패널 설계 전략 및 제어
참고: 본 백서에 기재된 패널은 uILC1, trNK 및 cNK 세포의 차별에 적합하며 5레이저 BD LSRFortessa에 사용되도록 설계되었습니다. 사소한 수정은 다른 세포 인구를 연구하고 대체 형광을 사용하기 위해 이루어질 수 있습니다. 계측기의 구성을 확인하고, 최적의 분리를 위해 적정항체를 사용하고, 제조업체의 밝기 지수를 컨설팅하고, NKp46과 같은 낮은 발현 항원에게 가장 밝은 염료를 사용하고, 일반적인 지침19에 따르는 것이 좋습니다. NKp46에 대한 형광 마이너스 하나(FMO) 제어를 포함하는 것이 좋습니다.
6. FACS 페노티핑을 위한 선천성 림프구 세포 염색
자궁 류코낭의 단일 세포 현탁액을 얻기 위하여 기술되는 방법의 주요 단계는 도 3에 요약된다. 도 2B에서 입증된 것은 B6 마우스에서 g1 IlC의 3개의 하위 집합을 식별하는 데 사용되는 기본 FACS 게이팅 전략입니다: uILC1(CD49a+Eomes-), trNK(CD49a+Eomes+), cNK(CD49a-Eomes+) 셀. 이러한 집단의 추가 분석은 g1 IlC의 다양한 표면 및 세포 내 마커를 연구하기 위해 수행 될 수있다. 예를 들어, IFN-ɣ 및 자가 MHC 수용체의 공동 발현은 항-NK1.1 항체를 통한 자극 후 uILC1, trNK 및 cNK 세포에서 평가될 수 있다(도 7).
연구 질문에 따라 프로토콜(도 3)과 항체 패널을 모두 조정할 수 있다. 중요 한 것은, g1 ILC 게이팅에 대 한 하나의 FACS 패널에 안티-NK1.1 및 안티 NKp46 항체를 모두 사용 하는 것이 좋습니다 (그림 2B 및 표 1). 혈액, 비장 또는 간에서 얻은 g1 ILC는 자궁 대응(도 8)보다 표면에 NKp46의 더 높은 발현을 가지고 있다는 점에 유의해야 한다. NK1.1의 표면 염색은 더 나은 분리를 제공하고 자궁 g1 IlC를 쉽게 게이트할 수 있게 합니다(그림 8). NKp46은 모든 마우스 균주에 의해 표현되지만, 항NK1.1 항체 PK136에 의해 인식되는 NKR-P1C 항원은 C57BL/6(즉, B6), FVB/N 및 NZB를 포함한 일부 마우스 균주에 의해서만 표현되지만 AKR, BALB/c, CBA/J, C3H, DBA/1, DBA/2, NOJ, 1, DBA/2D, NOJ, 1, DBA/2D, 1, DBA/2D, NOJ, 1, DBA/2D, NOJJ, 1, DBA/2D, NOJJ, 1, DBA/2D, 1, DBA/2D, 1, DBA/2D, 1, DBA/2D, 1, DBA/2D, NOJ, SDJ, 또한, 조사자가 MHC 수용체 Ly49와 같은 중요한 NK 세포 수용체를 연구하려는 경우, 인간 킬러 세포 면역글로불린과 같은 수용체(KIR)의 높은 가변성을 회수하는 실험실 마우스 균주의 동종 변이를 인식하는 것이 중요하다. 더욱이, 세포가 기능적 분석을 위해 NK1.1로 자극될 경우, 김, S. 등.20에 기술된 바와 같이, NKR-P1C 항원항이 교차연결 항NK1.1 또는 수용체 조절에 의해 점유될 수 있기 때문에 안티-NK1.1이 아닌 안티-NKp46로 세포를 얼룩지게 하는 것이 바람직할 수 있다. 수용체 점유 또는 다운 규제 중 자극하는 데 사용되는 동일한 항체로 얼룩을 방해할 수 있습니다.
효소 조직 해리의 일반적인 문제는 소화 매체에 사용되는 효소에 의해 세포에 표면 전형의 변경입니다. 예를 들어, MHC CD94:NKG2A 수용체에 대한 염색은 Liberase TM이 사용되는 경우 불량하다. 그러나, Liberase DH를 통한 소화는 16A11 항체 클론에 의한 NKG2A 인식을 보존한다(도 9). FACS 패널의 모든 전형에 효소의 영향을 확인하는 것이 좋습니다. 이를 위해, 기계적 해리에 의해 얻어진 마우스 비장세포의 현탁액을 사용하십시오(70 μm 스트레이너를 통해 전체 비장을 전달). 그 때 견본은 효소의 유무에 관계없이 매체를 가진 잠복식 에 선행된 2개 이상의 부분으로 나뉩니다.
앞에서 언급했듯이, 혈액 유래 세포는 조직 해리샘플에 존재한다. 필요한 경우, 혈액 오염 물질은 마소푸스 실험실에서 개발 된 바와 같이 내트라바스 내 염색 방법을 사용하여 제외 될 수있다21. 도 10 은 임신일 8.5에서 자궁 조직 샘플에 존재하는 g1 IlC의 약 6.5%가 혈액 유래임을 보여줍니다. 내래 염색에 사용되는 항 CD45 항체는 덤프 채널에 사용되는 플루오로크롬으로 공각될 수 있다; 이것은 여분의 형광 채널을 사용하지 않고 혈액 오염 물질을 제외합니다. 가장 일반적인 문제와 해당 솔루션은 표 2에 표시됩니다.

그림 1: 마우스 자궁의 단면. (A) 마우스 자궁 단면 (비 임신) 자궁을 채우는 다양한 모계 백혈구를 나타낸다. (B) 마우스 자궁 단면 (임신 일 8.5). (C) 마우스 자궁 단면 (임신 일 13.5). (D) 배반성 단계에서 인간 태반 형성에 비해 마우스의 비교. BioRender.com 만든 이미지입니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2: 자궁 g1 ILC1. (A) 초기 생활 과 임신 중 마우스에서 자궁 cNK, ILC1 및 trNK의 백분율. W - 주, gd - 임신 일. 필리포비치, I. 외.4에서 수정된 그래프. (B) 유동 세포측정에 의한 자궁군 1 ILC 서브세트를 분석하는 게이팅 전략. 림프구는 임신 일 10.5에서 자궁 조직에서 격리되었다. 조직 소화는 Liberase TM을 함유하는 소화 배지를 사용하여 수행하였다. 세포는 빛을 산란하는 능력에 기초하여 문이 되었습니다. 이중은 FSC-A 대 FSC-H 플롯을 사용하여 제외되었고, CD45+CD3-CD19-실행 가능한 세포만 더 분석하였다. CD45+CD3-CD19-실행 가능한 셀 내에서, 그룹 1 ILC 게이트는 NK1.1+ NKp46+ 셀로 확인되었다. 그룹 1 ILC 내에서 CD49a-Eomes+ 기존 NK 셀(cNK), CD49a+Eomes+ 조직 거주자 NK 셀(trNK), CD49a+Eomes-uILC1 의 세 가지 하위 집합을 식별할 수 있습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 3: 프로토콜의 주요 단계에 대한 시각적 가이드입니다. (1) 임신한 자궁을 심술지방이 없는 해부한다. (2) 태아를 제거; 자궁을 5mL 튜브로 돌려보내 조직을 다진다. 효소 소화 단계를 진행하십시오: 각 샘플에 따뜻한 효소 소화 믹스 3mL를 추가합니다. 교반과 함께 37 °C에서 30 분 동안 5 mL 튜브를 배양합니다. (3) (i) 소화 후, 얼음 차가운 5mM EDTA PBS 용액의 10mL를 사용하여 15mL 튜브에 5mL 튜브의 모든 것을 플러시. (ii) 400 x g에서 10 분 동안 소화 된 조직을 포함하는 원심 분리기 15 mL 튜브. (iii) 상체를 폐기; 펠릿을 부드럽게 쓸어내고 10mL의 따뜻한 (37°C) 5m EDTA PBS 용액으로 재보설한다. (iv) 교반과 함께 37°C에서 15mL 튜브에서 시료를 배양하고, 15분 동안 멸균 1 mL 주사기의 플런저를 사용하여, 70 μm 스트레이너를 통해 소화된 조직을 제대로 라벨이 부착된 50mL 튜브에 강제로 넣고 400x40x00x00에서 10분 동안 회전한다. (5) 스핀 후, 옵션 A (다이어그램에 여기에 표현) 또는 B. 옵션 A : 50 mL 튜브에서 상퍼를 버리고, 파이펫 소년을 사용하여, PBS에서 40 %(v / v) 등소 페르콜의 8 mL에서 각 펠릿을 다시 중단합니다. (6) (i) 옵션 A 계속: 느린 속도로 파이프 보이를 사용하여, 조심스럽게 80 % Percoll 솔루션의 5 mL에 40 % Percoll 용액에 다시 중단 펠릿을 오버레이. 파이펫은 천천히 지속적으로; 15mL 튜브를 45°의 각도로 유지합니다. (ii) 오버레이를 방해하지 않고, 15mL 튜브를 실온에서 20분 동안 850 x g의 원심분리하여 중간 가속과 느린 브레이크를 제공합니다. (7) 스핀 후, 최소량의 Percoll 용액(총 4~5mL)을 빨아들이려고 노력하면서 백혈구의 고리를 조심스럽게 수집한다. (8) 적혈구 리시스 단계를 수행합니다. (9) 트라이판 블루와 노이바우어 챔버를 사용하여 셀카운트. (10) 라운드 하단 96 웰 플레이트로 잘 당 1-2 백만 세포를 전송합니다. (11) 생존성 염료 및 항체 염색을 진행한다. (12) 마지막으로, 라벨이 부착된 FACS 튜브로 샘플을 전송합니다. 24시간 이내에 FACS 분석을 통해 처리될 때까지 튜브를 얼음이나 냉장고에 보관하십시오. BioRender.com 만든 이미지입니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 4: 질 플러그 (A) 및 그것의 부재 (B) C57BL/6 여성에서 0.5 일 포스트 짝짓기.

그림 5: 임신한 마우스로부터 자궁을 추출하기 위해 해부. (A) 댐은 70% 에탄올로 몸을 닦아 부드러운 보드에 바늘로 고정된다. 파란색 점선으로 표시된 두 개의 수직 절개는 만들어집니다. (B) 피부가 들어 올려 내부 장기를 노출합니다. 장 루프는 자궁을 시각화하기 위해 부드럽게 위로 이동됩니다. (C) 자궁은 각각 두 개의 파란색 점선과 파란색 화살표로 표시된 바와 같이 난소 옆과 자궁 경부에서 세 가지 지점에서 절단하여 샘플링됩니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 6: 단일 세포 현탁액의 준비. (A) 이식 부위에서 배아의 기계적 제거. (B) 퍼콜 그라데이션 오버레이; 상단 층에는 Percoll의 40%와 Percoll의 하단 층 80%의 단일 셀 서스펜션이 포함되어 있습니다. (C) 퍼콜링 그라데이션의 원심분리 후 림프구 고리 형성. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 7: 그룹 1 IlC를 가진 기능 분석의 대표적인 FACS 분석. 세포내 IFN-ɣ 및 표면 CD107a 검출은 자기 MHC(Ly49C, Ly49I 및 NKG2A)에 대한 NK 수용체를 발현하는 그룹 1 IlCs에서 검출되며, 그렇지 않은 것과 비교하여, NK1.1을 플레이트 바운드 항체와 교차링크한 후. 세포는 임신 일 9.5에 자궁 조직에서 격리되었습니다. 조직 소화는 Liberase DH를 함유하는 소화 배지를 사용하여 수행하였다. 4개의 사분면(corners)의 원시 값뿐만 아니라 자가 수용체가 없는 자가 및 응답자에 대한 수용체를 표현하는 세포 중 응답자의 상대적 백분율(굵은 숫자)이 도시되어 있다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 8: 안티 NKp46 및 항 NK1.1 항체를 가진 염색 비장 및 자궁 림프구. (A) 임신일 10.5에서 마우스 비장 및 (B) 자궁으로부터 얻은 세포 현탁액은 2개로 분리되었다; 한 부분은 NKp46-APC(빨간색)와 NK1.1-APC(파란색)로 염색되었습니다. 자궁 림프구의 NKp46 염색은 NKp46+ 및 NKp46- 세포를 비장 림프구만큼 깔끔하게 분리하지 않습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

도 9: 소화 배지를 가진 배양에 의한 NKG2A MFI(항체 클론: 16A11)의 감소. C56BL/6 마우스 비장세포의 세포 현탁액은 3부분으로 나뉘었다. 한 부분은 리베라제 DH 소화 매체(0.13 WU/mL Liberase DH 및 DNAse의 30 μg/mL함유 HBS)에서 배양되었고, 또 다른 부분은 Liberase TM 소화 매체(HBSS 함유 0.52 WU/mL Liberase TM 및 30 μg/mL/ML)로 배양되었다. 세 번째 부분은 37°C에서 30분 동안 깔끔한 HBSS로 처리하였다. g1 IlC에 대한 NKG2A 마커의 발현은 유동 세포측정에 의해 평가되었다. 슈리브 N에서 가져온 그래프. 임신 중 자궁 NK 세포 억제의 역할 (테시스); 감독자: 콜루치 F, 2020. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

도 10: 혈액 유래 g1 IlC의 배제를 위한 항 CD45 항체를 가진 인트라바이탈 염색. 임신 일 8.5에서 C57BL/6 댐 마우스는 CD45-AF647의 3 μg와 정맥 주사 후 3 분 컬링되었다. 자궁, 전혈 및 흉부가 FACS 분석을 위해 수확되고 처리되었습니다. X축은 CD45-AF647로 정맥 염색으로부터 의 신호를 나타내고 Y축은 체외 염색 CD45-BUV395로부터 신호를 보여줍니다. 하위 채우기의 백분율은 사분면에 표시됩니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
| 항체/염료 | 클론 | 플루오로크롬 | 레이저 | |
| 1 (덤프 채널) | 좀비 바이올렛 고칠 수 있는 생존 성 염료 | 보라색 | ||
| CD19 | 1D3 | BV421 | ||
| CD3 | 145-2C11 | BV421 | ||
| 2 | CD45 | 30-F11 | FITC | 파랑 |
| 3 | NK1.1 | PK136 | BV605 | 보라색 |
| 4 | NKp46 | 29A1.4 | APC | 빨강 |
| 5 | CD49a | 하31/8 | BUV395 | 자외선 |
| 6 | 에오메스 | 단11마그 | PE | 녹색 |
표 1: 기존의 5레이저 사이토미터용 FACS 패널의 예.
| 문제 | 가능한 원인 | 제안 |
| 셀 링은 두 퍼콜 솔루션의 인터페이스에 표시되지 않습니다. | 퍼콜 용액의 계층화 불량 또는 샘플 처리 중 두 개의 레이어 혼합 | 오버레이 시 80% 퍼콜 쿠션을 깨지 않도록 각별한 주의를 기울이십시오. 샘플 처리 중 주의 사항: 퍼콜 인터페이스를 방해하지 마십시오. |
| 백혈구의 낮은 수 (예를 들어, 비 임신 자궁을 사용하는 경우) | 인터페이스의 셀 번호가 매우 낮은 경우에도 인터페이스를 볼 수 있습니다. 링이 보이지 않더라도 추가 처리를 위한 충분한 셀이 있을 수 있기 때문에 40%에서 80% percoll 솔루션으로 액체를 수집합니다. | |
| 불완전한 RBC 리시스 | 셀은 리스링 버퍼에서 제대로 다시 중단되지 않았습니다. | 파이펫 셀을 위아래로 사용하여 덩어리를 분해하고 리스 버퍼에서 셀을 완전히 다시 일시 중지합니다. |
| 용액은 차갑다 | 사용 전에 용액을 실온에 대고 평형화 | |
| 최대 15분까지 용액으로 잠복의 연장 시간 | ||
| RBC 리시스 단계는 반복될 수 있습니다. | ||
| 낮은 셀 수율 | 불쌍한 효소 소화 | 효소가 오래되지 않고 매뉴얼에 따라 저장되었는지 확인합니다. |
| 세척 단계 중 세포 손실 | 각 세척 단계 후 세포 펠릿을 검사합니다: 스핀 후 우물 의 바닥에 있는 불투명한 펠릿. V-bottom 대신 U-bottom 플레이트, 스윙 로터 원심분리기, 원심분리 시간이 길어지면 세포 손실이 감소할 수 있습니다. | |
| 조직 샘플에는 림프구수가 적습니다(예: 임신하지 않은 자궁을 사용하는 경우) | 분석을 위한 충분한 이벤트를 얻기 위해 여러 자궁을 풀수 있습니다. 셀 격리를 위해 프로토콜의 옵션 B를 사용하는 것이 좋습니다. | |
| 동일한 그룹의 마우스로부터 얻은 절대 백혈구 수의 높은 가변성 | 40%와 80% 퍼콜 솔루션 의 인터페이스에서 일관되지 않은 셀 수집 | percoll 인터페이스에서 전체 셀 분수를 수집해야 합니다. 셀 격리를 위해 프로토콜의 옵션 B를 사용하는 것이 좋습니다. |
| 일부 세포 표면 마커에 대한 예상 림프구 하위 모집단 /마커 또는 비정상적으로 낮은 MFI를 감지 할 수 없습니다 | 효소 소화는 일부 전형의 표면 발현 또는 그들의 저하에 영향을 미칩니다. | 효소(예: 다른 유형의 자유효소 또는 콜라게나아제)와/또는 인큐베이션 및/또는 효소 농도의 길이를 변경하여 효소 소화를 최적화합니다. |
| 유동 사이토미터의 높은 배경 소음 | 세포 이물질 또는 RBC 오염의 높은 비율 | FSC 임계값 매개 변수를 조정합니다. 셀 격리를 위해 프로토콜의 옵션 A를 사용하는 것이 좋습니다. |
표 2: 문제 해결 가이드.
저자는 공개 할 것이 없으며 이해 상충이 없습니다.
이것은 임신과 비 임신 마우스 둘 다에서 자궁 림프세포를 격리하는 방법입니다. 이 방법은 FACS phenotyping, 세포 선별, 기능 적 작용, RNA-seq 및 프로테오믹스와 같은 여러 다운스트림 응용 제품에 사용할 수 있습니다. 여기서 프로토콜은 혈류 세포측정에 의한 표현형 그룹 1 자궁선천성 림프구 세포를 전파한다.
장 마크 도이스네, 노먼 슈리브, 이바 필리포비치, 아니타 퀄스 등 이 방법을 개발하는 데 도움을 준 이전 팀과 현재 의팀원들에게 감사드립니다. 이 연구는 웰컴 신탁 [그랜트 수 200841/Z/16/Z]와 의학 연구 위원회(MR/P001092/1)에 의해 지원되었습니다. 공개 액세스를 위해 저자는 이 제출에서 발생하는 작성자 수락 원고 버전에 CC BY 공용 저작권 라이선스를 적용했습니다.
| 70 &마이크로; m 세포 스트레이너 | Falcon | 352350 | |
| BSA | Sigma | A9647-100G | |
| CD19 항체 | BD | 562701 | |
| CD3 항체 | BD | 562600 | |
| CD45 항체 | BioLegend | 103108 | |
| CD49a 항체 | BD | 740262 | |
| DNase I | Roche (Sigma) | 10104159001 | |
| EOMES 항체 | eBioscience | 12-4875-82 | |
| Fc block Trustain fcx | BioLegend | 101320 | |
| Fetal Bovine Serum | Gibco | 10217-106 | |
| Fix/Perm buffer (part of BD Cytofix/Cytoperm Fixation/Permeabilization Kit) | BD | 554714 | |
| HBSS, 칼슘, 마그네슘, 페놀 레드 | 없음 Gibco | 14025092 | |
| Liberase DH | Roche (Sigma) | 5401089001 | |
| 용해 완충액 Pharmlyse | BD | 555899 | |
| NK1.1 항체 | BioLegend | 108739 | |
| NKp46 항체 | BioLegend | 137608 | |
| Paraformaldehyde 16% 용액 (메탄올 프리) | Agar Scientific | AGR1026 | |
| PBS 10x | Gibco | 14030-048 | |
| PBS 1x (no Ca2+ 또는 Mg2+) | Thermo Scientific | 14190144 | |
| Percoll | VWR international | 17-0891-01 | |
| 인산염 완충 식염수 | Sigma-Aldrich | P5368-10PAK | |
| 사전 분리 필터 | Miltenyi | 130-095-823 | |
| RMPI-1640 배지 + GlutaMAX | Gibco | 61870-010 | |
| 초순수 0.5M EDTA, pH 8.0 | Thermo Scientific | 15575020 | |
| 좀비 바이올렛 고정성 생존도 염료 | BioLegend | 423113 |