녹농균의 항생제 스트레스에 대한 군집 회피 반응 이미징 및 정량화

0 조회수2:47 • September 26th, 2025

덩굴손과 같은 패턴을 형성하는 반고체 표면을 가로지르는 조정된 박테리아 이동인 떼 운동성을 지원하는 떼 한천 플레이트를 가져 가십시오.

플레이트의 중심에 녹농 균 배양액을 접종하고 동일한 배양액과 항생제의 혼합물을 균일한 간격의 위성 위치에 놓습니다.

빛의 반사를 최소화하기 위해 검은색으로 칠해진 뚜껑으로 접시를 덮으십시오.

최적의 습도로 유지되는 인큐베이터 내부의 평판 스캐너에 플레이트를 놓습니다.

부화 중에 중앙 개체군이 번식하고 떼를 지어 다니기 시작합니다.

떼가 항생제 처리된 군집에 접근하면 박테리아가 분비하는 스트레스 신호를 감지하고 이러한 영역을 피하도록 방향을 바꿉니다.

자동화된 소프트웨어로 제어되는 스캐너는 정기적으로 고해상도 이미지를 캡처합니다.

이러한 이미지를 비디오로 컴파일하여 시간 경과에 따른 군집 진행 및 회피를 시각화합니다.

후기 단계 이미지에서 각 위성 군집에서 중앙 군집 가장자리까지의 거리를 측정하여 군집 회피를 정량화합니다.

플레이트를 스캐너에 넣은 후 파일 및 저장 설정을 열어 이미지의 저장 경로를 설정하고 30분 간격으로 스캔 및 확인을 클릭합니다. 이미지 획득을 자동화하려면 스크립팅 소프트웨어를 사용하십시오.

유휴 스캔과 단일 스캔을 모두 선택하고 유휴 스캔을 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭한 다음 활성화를 마우스 왼쪽 버튼으로 클릭합니다. 인큐베이션이 끝나면 스캔한 모든 이미지를 ImageJ로 가져옵니다. 시퀀스 옵션 창에서 이미지 수는 선택한 이미지 수를 나타냅니다.

폴더의 첫 번째 사진부터 시작하려면 이미지를 하나로 유지하고 이미지의 원래 크기를 보존하려면 이미지 크기를 100%로 조정합니다. RGB로 변환을 클릭하여 이미지를 컬러로 유지합니다. 가상 스택 사용을 선택하지 않은 상태로 두고 확인을 클릭하여 이미지를 로드합니다.

파일, 다른 이름으로 저장 및 AVI를 클릭하여 이미지를 AVI 파일로 병합합니다. 압축을 JPEG로 조정하고 프레임 속도를 초당 5프레임으로 조정합니다. 그런 다음 AVI 타임랩스를 적절한 저장소 폴더에 저장합니다.