Name: 내재 대비를 이용한 DNA 분광학적 초해상도 영상 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-03-06T13:25:00.000+00:00
Duration: 9 min 19 s
Description: 배우세요 DNA 분자의 내재 형광을 이용한 분광학적 단일분자 국소화 현미경법으로 라벨 없이 초해상도 영상을 획득하는 방법을. 이 기술은 DNA의 고유 광학 특성을 보존하며 정확한 나노스케일 게놈 시각화를 가능하게 합니다.

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<ol><li>Ellis, R. J., Minton, A. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Join+the+crowd%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Join the crowd.</a> Nature. 425 (6953), 27-28 (2003).</li>
<li>Hell, S. W., Wichmann, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Breaking+the+diffraction+resolution+limit+by+stimulated+emission%3A+stimulated+emission-depletion+fluorescence+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Opt+Lett%22%5BJournal%5D)">Breaking the diffraction resolution limit by stimulated emission: stimulated emission-depletion fluorescence microscopy.</a> Opt Lett. 19 (11), 780(1994).</li>
<li>Rust, M. J., Bates, M., Zhuang, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sub-diffraction-limit+imaging+by+stochastic+optical+reconstruction+microscopy+%28STORM%29%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Sub-diffraction-limit imaging by stochastic optical reconstruction microscopy (STORM).</a> Nat Methods. 3 (10), 793-796 (2006).</li>
<li>Betzig, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Imaging+intracellular+fluorescent+proteins+at+nanometer+resolution%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Imaging intracellular fluorescent proteins at nanometer resolution.</a> Science. 313 (5793), 1642-1645 (2006).</li>
<li>Gustafsson, M. G. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nonlinear+structured-illumination+microscopy%3A+wide-field+fluorescence+imaging+with+theoretically+unlimited+resolution%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Nonlinear structured-illumination microscopy: wide-field fluorescence imaging with theoretically unlimited resolution.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 102 (37), 13081-13086 (2005).</li>
<li>Hell, S. W., Kroug, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ground-state-depletion+fluorescence+microscopy%3A+a+concept+for+breaking+the+diffraction+resolution+limit%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Phys+B%22%5BJournal%5D)">Ground-state-depletion fluorescence microscopy: a concept for breaking the diffraction resolution limit.</a> Appl Phys B. 60 (5), 495-497 (1995).</li>
<li>Fölling, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fluorescence+nanoscopy+by+ground-state+depletion+and+single-molecule+return%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Fluorescence nanoscopy by ground-state depletion and single-molecule return.</a> Nat Methods. 5 (11), 943-945 (2008).</li>
<li>Ricci, M., Manzo, C., García-Parajo, M. F., Lakadamyali, M., Cosma, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromatin+fibers+are+formed+by+heterogeneous+groups+of+nucleosomes+in+vivo%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Chromatin fibers are formed by heterogeneous groups of nucleosomes in vivo.</a> Cell. 160 (6), 1145-1158 (2015).</li>
<li>Bintu, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Super-resolution+chromatin+tracing+reveals+domains+and+cooperative+interactions+in+single+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Super-resolution chromatin tracing reveals domains and cooperative interactions in single cells.</a> Science. 362 (6413), eaau1783(2018).</li>
<li>Matsuda, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Condensed+mitotic+chromosome+structure+at+nanometer+resolution+using+PALM+and+EGFP-histones%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Condensed mitotic chromosome structure at nanometer resolution using PALM and EGFP-histones.</a> PLoS One. 5 (9), e12768(2010).</li>
<li>Bohn, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Localization+microscopy+reveals+expression-dependent+parameters+of+chromatin+nanostructure%5BTitle%5D)+AND+%22Biophys+J%22%5BJournal%5D)">Localization microscopy reveals expression-dependent parameters of chromatin nanostructure.</a> Biophys J. 99 (5), 1358-1367 (2010).</li>
<li>Acosta, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Three-color+single-molecule+localization+microscopy+in+chromatin%5BTitle%5D)+AND+%22Light+Sci+Appl%22%5BJournal%5D)">Three-color single-molecule localization microscopy in chromatin.</a> Light Sci Appl. 14, 7(2025).</li>
<li>Almassalha, L. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Label-free+imaging+of+the+native%2C+living+cellular+nanoarchitecture+using+partial-wave+spectroscopic+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Label-free imaging of the native, living cellular nanoarchitecture using partial-wave spectroscopic microscopy.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 113 (42), E6372-E6381 (2016).</li>
<li>Beerman, T. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effects+of+analogs+of+the+DNA+minor+groove+binder+Hoechst+33258+on+topoisomerase+II+and+I+mediated+activities%5BTitle%5D)+AND+%22Biochim+Biophys+Acta%22%5BJournal%5D)">Effects of analogs of the DNA minor groove binder Hoechst 33258 on topoisomerase II and I mediated activities.</a> Biochim Biophys Acta. 1131 (1), 53-61 (1992).</li>
<li>Cadet, J., Anselmino, C., Douki, T., Voituriez, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((New+trends+in+photobiology%5BTitle%5D)+AND+%22J+Photochem+Photobiol+B%22%5BJournal%5D)">New trends in photobiology.</a> J Photochem Photobiol B. 15 (4), 277-298 (1992).</li>
<li>Dong, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Superresolution+intrinsic+fluorescence+imaging+of+chromatin+utilizing+native%2C+unmodified+nucleic+acids+for+contrast%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Superresolution intrinsic fluorescence imaging of chromatin utilizing native, unmodified nucleic acids for contrast.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 113 (35), 9716-9721 (2016).</li>
<li>Vayá, I., Gustavsson, T., Miannay, F., Douki, T., Markovitsi, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fluorescence+of+natural+DNA%3A+from+the+femtosecond+to+the+nanosecond+time+scales%5BTitle%5D)+AND+%22J+Am+Chem+Soc%22%5BJournal%5D)">Fluorescence of natural DNA: from the femtosecond to the nanosecond time scales.</a> J Am Chem Soc. 132 (34), 11834-11835 (2010).</li>
<li>Anders, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+fluorescence+at+room+temperature+excited+by+means+of+a+dye+laser%5BTitle%5D)+AND+%22Chem+Phys+Lett%22%5BJournal%5D)">DNA fluorescence at room temperature excited by means of a dye laser.</a> Chem Phys Lett. 81 (2), 270-272 (1981).</li>
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<li>Takaya, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((UV+excitation+of+single+DNA+and+RNA+strands+produces+high+yields+of+exciplex+states+between+two+stacked+bases%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">UV excitation of single DNA and RNA strands produces high yields of exciplex states between two stacked bases.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 105 (30), 10285-10290 (2008).</li>
<li>Bancaud, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+fractal+model+for+nuclear+organization%3A+current+evidence+and+biological+implications%5BTitle%5D)+AND+%22Nucleic+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">A fractal model for nuclear organization: current evidence and biological implications.</a> Nucleic Acids Res. 40 (18), 8783-8792 (2012).</li>
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<li>Bohrmann, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Concentration+evaluation+of+chromatin+in+unstained+resin-embedded+sections+by+means+of+low-dose+ratio-contrast+imaging+in+STEM%5BTitle%5D)+AND+%22Ultramicroscopy%22%5BJournal%5D)">Concentration evaluation of chromatin in unstained resin-embedded sections by means of low-dose ratio-contrast imaging in STEM.</a> Ultramicroscopy. 49 (1-4), 235-251 (1993).</li>
<li>Dong, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Stochastic+fluorescence+switching+of+nucleic+acids+under+visible+light+illumination%5BTitle%5D)+AND+%22Opt+Express%22%5BJournal%5D)">Stochastic fluorescence switching of nucleic acids under visible light illumination.</a> Opt Express. 25 (7), 7929-7944 (2017).</li>
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<li>Eshein, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sub-10-nm+imaging+of+nucleic+acids+using+spectroscopic+intrinsic-contrast+photon-localization+optical+nanoscopy+%28SICLON%29%5BTitle%5D)+AND+%22Opt+Lett%22%5BJournal%5D)">Sub-10-nm imaging of nucleic acids using spectroscopic intrinsic-contrast photon-localization optical nanoscopy (SICLON).</a> Opt Lett. 43 (23), 5817-5820 (2018).</li>
<li>Song, K. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Monolithic+dual-wedge+prism-based+spectroscopic+single-molecule+localization+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Nanophotonics%22%5BJournal%5D)">Monolithic dual-wedge prism-based spectroscopic single-molecule localization microscopy.</a> Nanophotonics. 11 (8), 1527-1535 (2022).</li>
<li>Song, K. H., Sun, C., Zhang, H. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Design+strategy+for+a+dual-wedge+prism+imaging+spectrometer+in+spectroscopic+nanoscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Rev+Sci+Instrum%22%5BJournal%5D)">Design strategy for a dual-wedge prism imaging spectrometer in spectroscopic nanoscopy.</a> Rev Sci Instrum. 94 (2), 023702(2023).</li>
<li>Yeo, W. H., Sun, C., Zhang, H. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Physically+informed+Monte+Carlo+simulation+of+dual-wedge+prism-based+spectroscopic+single-molecule+localization+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biomed+Opt%22%5BJournal%5D)">Physically informed Monte Carlo simulation of dual-wedge prism-based spectroscopic single-molecule localization microscopy.</a> J Biomed Opt. 29 (S1), S11501(2023).</li>
<li>Davis, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((RainbowSTORM%3A+an+open-source+ImageJ+plug-in+for+spectroscopic+single-molecule+localization+microscopy+%28sSMLM%29+data+analysis+and+image+reconstruction%5BTitle%5D)+AND+%22Bioinformatics%22%5BJournal%5D)">RainbowSTORM: an open-source ImageJ plug-in for spectroscopic single-molecule localization microscopy (sSMLM) data analysis and image reconstruction.</a> Bioinformatics. 36 (19), 4972-4974 (2020).</li>
<li>Davis, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aDavis%2C+JL+%22RainbowSTORM+v2+%28MATLAB+app%29%22">RainbowSTORM v2 (MATLAB app)</a>. , https://github.com/FOIL-NU/sSMLM-protocol (2020).</li>
<li>Brenner, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Implementation+and+calibration+of+spectroscopic+single-molecule+localization+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Methods%22%5BJournal%5D)">Implementation and calibration of spectroscopic single-molecule localization microscopy.</a> BMC Methods. 2 (1), 2(2025).</li>
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<li>Abdelsayed, V., Boukhatem, H., Olivier, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+optimized+buffer+for+repeatable+multicolor+STORM%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Photonics%22%5BJournal%5D)">An optimized buffer for repeatable multicolor STORM.</a> ACS Photonics. 9 (12), 3926-3934 (2022).</li>
<li>Zumbusch, A., Holtom, G. R., Xie, X. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Three-dimensional+vibrational+imaging+by+coherent+anti-Stokes+Raman+scattering%5BTitle%5D)+AND+%22Phys+Rev+Lett%22%5BJournal%5D)">Three-dimensional vibrational imaging by coherent anti-Stokes Raman scattering.</a> Phys Rev Lett. 82 (20), 4142(1999).</li>
<li>Benninger, R. K. P., Piston, D. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Two%E2%80%90photon+excitation+microscopy+for+the+study+of+living+cells+and+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Protoc+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Two‐photon excitation microscopy for the study of living cells and tissues.</a> Curr Protoc Cell Biol. 59 (1), 4-11 (2013).</li>
<li>Zhang, C., Zhang, D., Cheng, J. X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Coherent+Raman+scattering+microscopy+in+biology+and+medicine%5BTitle%5D)+AND+%22Ann+Rev+Biomed+Eng%22%5BJournal%5D)">Coherent Raman scattering microscopy in biology and medicine.</a> Ann Rev Biomed Eng. 17 (1), 415-445 (2015).</li>
<li>Song, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((SNR+enhanced+high-speed+two-photon+microscopy+using+a+pulse+picker+and+time+gating+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">SNR enhanced high-speed two-photon microscopy using a pulse picker and time gating detection.</a> Sci Rep. 13 (1), 14244(2023).</li>
<li>Luu, P., Fraser, S. E., Schneider, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((More+than+double+the+fun+with+two-photon+excitation+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Comm+Biol%22%5BJournal%5D)">More than double the fun with two-photon excitation microscopy.</a> Comm Biol. 7 (1), 364(2024).</li>
<li>Van de Linde, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Direct+stochastic+optical+reconstruction+microscopy+with+standard+fluorescent+probes%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">Direct stochastic optical reconstruction microscopy with standard fluorescent probes.</a> Nat Protoc. 6 (7), 991-1009 (2011).</li>
<li>Wang, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Research+progress+on+the+luminescence+of+biomacromolecules%5BTitle%5D)+AND+%22J+Mater+Sci+Technol%22%5BJournal%5D)">Research progress on the luminescence of biomacromolecules.</a> J Mater Sci Technol. 76, 60-75 (2021).</li>
<li>Varejão, N., Reverter, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Using+intrinsic+fluorescence+to+measure+protein+stability+upon+thermal+and+chemical+denaturation%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Using intrinsic fluorescence to measure protein stability upon thermal and chemical denaturation.</a> Methods Mol Biol. 2581, 229-241 (2023).</li>
<li>Sindrewicz, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Intrinsic+tryptophan+fluorescence+spectroscopy+reliably+determines+galectin-ligand+interactions%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">Intrinsic tryptophan fluorescence spectroscopy reliably determines galectin-ligand interactions.</a> Sci Rep. 9 (1), 11851(2019).</li>
<li>Ho, C. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+identification+of+pathogenic+bacteria+using+Raman+spectroscopy+and+deep+learning%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Rapid identification of pathogenic bacteria using Raman spectroscopy and deep learning.</a> Nat Commun. 10 (1), 4927(2019).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>영상용 488 nm 방출 필터</td><td>크로마 테크놀로지 코퍼레이션</td><td>ET525/50M</td><td></td></tr><tr><td>보정을 위한 532 nm 밴드패스 필터</td><td>토를랩</td><td>FL532-3</td><td></td></tr><tr><td>영상용 532 nm 방출 필터</td><td>크로마 테크놀로지 코퍼레이션</td><td>ET620/60M</td><td></td></tr><tr><td>보정을 위한 580 nm 밴드패스 필터</td><td>토를랩</td><td>FB580-10</td><td></td></tr><tr><td>보정을 위한 633 nm 밴드패스 필터</td><td>토를랩</td><td>FL632.8-3</td><td></td></tr><tr><td>보정을 위한 680 nm 밴드패스 필터</td><td>토를랩</td><td>FB680-10</td><td></td></tr><tr><td>보정을 위한 750 nm 밴드패스 필터</td><td>토를랩</td><td>FB750-10</td><td></td></tr><tr><td>베타-머캅토에탄올&nbsp;</td><td>시그마</td><td>M6250</td><td></td></tr><tr><td>BME 영상 버퍼</td><td>NA</td><td>NA</td><td>7 & mu; L GLOX, 7 & mu; L 베타-머캅토에탄올과 690 & μ; L 포도당 완충</td></tr><tr><td>소 간에서 나온 카탈라제</td><td>시그마</td><td>C100</td><td></td></tr><tr><td>DABCO (1,4-di-azobicyclo-(2.2.2.)-옥테인)</td><td>시그마</td><td>D27802</td><td></td></tr><tr><td>DABCO 영상 버퍼</td><td>NA</td><td>NA</td><td>65 mM DABCO+30 mM 아황산나트륨 + 30 mM DTT 1 M&nbsp; DNAse에서는 RNAse 자유 탈이온수에 포함됩니다. 황산나트륨은 PBS에 10번 이상 용해되어야 합니다; 이미징 버퍼를 만들기 전에 1 M로 변환했습니다.</td></tr><tr><td>분광 SMLM 용 DNA 디플렉스</td><td>IDT</td><td>NA</td><td>20염기쌍 이중 가닥 GC_alter, GC_conti, AT_alter, AT_conti. 예: GC_alter 두 가닥 모두 5'로 가집니다 - GCGCCGCGGGGGGGCGCG - 3'; GC_conti 5피트 가닥 한 가닥이 있습니다 - 구그그그 다른 하나는 5피트 길이입니다 - CCCCCCCCCCCCCCCCCCCC - 3' 모든 샘플은 HPLC 표준으로 사용되었습니다.</td></tr><tr><td>DNA 올리고뉴클레오타이드/이중 가닥 DNA</td><td>IDT</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>분광 SMLM 용 DNA 올리고</td><td>IDT</td><td>NA</td><td>20 베이스 A, G, C, T; 40베이스 단일 가닥 AC 체인(A1C1, A5C5, A10C10, A20C20); 그리고 nbsp; 단일 가닥 5-, 8-, 12-, 16-염기형 구아닌. 예: A10C10은 5'- AAAAAAAAACCCC CCCCCAAAAAAAAAAA AACCCCCCCC - 3' 모든 샘플은 HPLC 표준입니다.</td></tr><tr><td>DNase/RNase 프리 증류수</td><td>인비트로젠</td><td>10977015</td><td></td></tr><tr><td>DTT (DL-디티오트라이트올)</td><td>시그마</td><td>43816</td><td></td></tr><tr><td>글록스</td><td>NA</td><td>NA</td><td>14 mg 포도당 산화효소, 50 및 μ; L 카탈라아제(17 mg/ml) + 200 & mu; L 버퍼 A는 10 mM Tris(pH 8.0), 50 mM NaCl.&nbsp;</td></tr><tr><td>포도당 완충</td><td>NA</td><td>NA</td><td>50 mM 트리스(pH 8.0), 50 mM NaCl, 10% 포도당.</td></tr><tr><td>포도당 산화효소</td><td>시그마</td><td>G7141</td><td></td></tr><tr><td>포도당, 가루</td><td>써모피셔</td><td>15023021</td><td></td></tr><tr><td>PBS (10X)</td><td>써모피셔</td><td>J62036. K3</td><td></td></tr><tr><td>PBS (1X)</td><td>깁코</td><td>10010023</td><td></td></tr><tr><td>염화나트륨</td><td>써모피셔</td><td>424290010</td><td></td></tr><tr><td>아황산나트륨과 nbsp;</td><td>시그마</td><td>S0505</td><td></td></tr><tr><td>트리스 (1M) pH 8.0</td><td>인비트로젠</td><td>AM9856</td><td></td></tr></tbody></table>

내재 대비를 이용한 dna 분광학적 초해상도 영상

Spectroscopic Super-resolution Imaging of DNA Molecules using Intrinsic Contrast

내재 대비를 이용한 DNA 분광학적 초해상도 영상

Super-resolution imaging has revolutionized biological research by revealing structural details at the nanoscale. Most optical super-resolution methods ...

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Research

연구

JoVE Journal

Bioengineering

생명공학

이 비디오는 단일 분자 이미징을 사용하여 특정 유전자 자리에서 DNA 분자의 융합 단백질 응축물 어셈블리를 시각화하는 방법을 설명합니다. 이러한 응축물은 LCD-LCD 및 LCD-DBD 상호 작용으로 인해 형성되며, 이를 통해 RNA 중합효소 II를 동원하고 유전자 전사를 향상시킬 수 있습니다.

DNA 커튼에서 융합 단백질 응축물 어셈블리를 시각화하기 위한 단일 분자 이미징

우리는 박테리아 FtsZ-링의 구조 조직, 세포 분열에 필수적인 장치에 꼽는 영상 방법 수퍼 해상도를 설명합니다. 이 방법은 photoactivated 현지화 현미경 (PALM) 이미지의 정량 분석​​에 기반을두고 있으며 다른 세균 cytoskeletal 단백질에 적용 할 수 있습니다.

세균 본부 기계의 슈퍼 해상도 이미징

5-methylcytosine (oxi mCs), 5-hydroxymethylcytosine (5hmC), 5-formylcytosine (5 fC)의 산화 형태를 새로 발견 하 고 5-carboxylcytosine (5caC) 독특한 기능 역할을 가진 고유한 DNA 수정 나타낼 수 있습니다. 여기 oxi mCs의 공간 배급, 신호 강도 프로 파일링 및 colocalization의 시각화를 위한 반 정량 워크플로 설명 되어 있습니다.

DNA 수정에 대 한 Immunostaining: 공초점 이미지의 계산 분석

이 방법론의 전반적인 목표는 게 최적의 실험 조건 샘플 준비에서 이미지 수집 및 재건 고정 셀에서 microtubules 및 중간 필 라 멘 트의 2D 듀얼 컬러 dSTORM 이미지를 수행...

중간 필 라 멘 트와 2 차원 직접 확률적 광학 재건 현미경으로 Microtubules 이미징

상세한 지시는 타일 (HIST) 현미경 및 단일 분자 이미징에 대 한 용법을 휩 쓸 높은 경사를 구축 하는 방법에 설명 되어 있습니다.

높은 경사 구축 가이드 확장 된 시야의 단일 분자 이미징 타일 현미경을 휩 쓸

3D 다색 DNA FISH는 3D 보존 핵 내에서 다중 게놈 궤시를 시각화하는 도구를 나타내며, 단일 세포 수준에서 핵 공간 내에서 상호 상호 작용 및 국소화를 명확하게 정의합니다. 여기서, 단계별 프로토콜은 인간 1차 세포의 광범위한 스펙트럼에 대해 기재된다.

인간의 1 차 세포에서 핵 아키텍처를 연구하는 3D 다색 DNA FISH 도구

본 프로토콜은 단일 분자 국소화 현미경 데이터, 알려진 부피, 게놈 크기 및 세포 주기 단계의 보로노이 테셀레이션을 사용하여 부착 세포 핵 내의 절대 DNA 밀도를 측정하는 방법을 설명합니다.

단일 분자 국소화 현미경을 사용한 세포 핵의 절대 DNA 밀도 매핑

이 프로토콜은 CMG helicase에 의한 DNA 풀림의 실시간 시각화를 위한 단일 분자 분석을 수행하는 방법을 보여줍니다. (1) DNA 기질 준비, (2) 형광 표지된 Drosophila melanogaster CMG helicase를 정제하는 방법, (3) 전반사 형광(TIRF) 현미경 검사를 위한 미세유체 플로우 셀을 준비하는 방법, (4) 단일 분자 DNA 풀기 분석에 대해 설명합니다.

CMG Helicase를 이용한 DNA 풀림의 단일 분자 실시간 시각화

이 프로토콜은 광학 광자 재할당이 가능한 회전 디스크 공초점 현미경을 사용하여 심층 전세포 단일 분자 위치 현미경(SMLM)을 수행하는 절차를 설명하여, 맞춤형 광학 장치나 복잡한 조명 없이 DNA-PAINT 이미징을 가능하게 합니다.

광학 광자 재배치가 포함된 회전 디스크 공초점 디스크에 대한 DNA-PAINT를 통한 전세포 초해상도 영상

"E - DNA"센서는 reagentless, 혈액 및 기타 복잡한 매트릭스에서 직접 도전 경우에도 실적이 전기 biosensors은 핵산, 단백질과 작은 분자 analytes 다양한 범위의 감지 적응되었습니다. 여기에는 센서의 제조 및 사용에 대한 일반적인 절차를 제시한다.

핵산, 단백질과 작은 분자의 Reagentless 감지를위한 전기 -의 DNA Biosensors의 제작

배우세요 DNA 분자의 내재 형광을 이용한 분광학적 단일분자 국소화 현미경법으로 라벨 없이 초해상도 영상을 획득하는 방법을. 이 기술은 DNA의 고유 광학 특성을 보존하며 정확한 나노스케일 게놈 시각화를 가능하게 합니다.

내재 대비를 이용한 DNA 분광학적 초해상도 영상

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