Een High-throughput geautomatiseerd platform voor de ontwikkeling van Manufacturing Cell Protein Therapeutics Lines voor

Samenvatting

Een high-throughput, geautomatiseerd platform van de productie cellijn ontwikkeling voor de productie van therapeutische eiwitten is beschreven. Uitvoering van de BD FACS Aria Cell Sorter, heeft CloneSelect Imager en Tecan Freedom EVO liquid handling systeem gedemonstreerd aanzienlijk toegenomen verwerkingscapaciteit in cellijn ontwikkeling met verbeterde cellijn kwaliteit en een hoge reproduceerbaarheid.

Samenvatting

De snel groeiende biofarmaceutische industrie vraagt ​​om een ​​snelle ontwikkeling van zeer efficiënte en betrouwbare productie-systemen om te voldoen aan de toenemende behoefte aan drugs benodigdheden. De generatie van de productie-cellijnen is van oudsher betrokken handmatige handelingen die zijn arbeidsintensief, laag-doorvoer en kwetsbaar voor menselijke fouten. Wij rapporteren hier een geïntegreerde high-throughput en geautomatiseerde platform voor de ontwikkeling van de productie cellijnen voor de productie van therapeutische eiwitten.

De combinatie van de BD FACS Aria ™ Cell Sorter, CloneSelect ™ Imager en Tecan Freedom EVO ® liquid handling-systeem heeft het mogelijk gemaakt een high-throughput en efficiënter cellijn ontwikkelingsproces. In deze operatie worden de productie gastheer cellen eerst getransfecteerd met een expressievector die het gen van belang ^een, gevolgd door de behandeling met een selectie agent. De stabiel-getransfecteerde cellen worden vervolgens gekleurd met fluorescentie-gelabeld anti-humaan IgG-antilichaam, en worden vervolgens onderworpen aan flowcytometrie-analyse ^2-4. Zeer productief cellen worden geselecteerd op basis van fluorescentie-intensiteit en worden geïsoleerd door single-cell sorteren op een BD FACSAria ™. Kolonie de vorming van een-cellig stadium werd microscopisch gedetecteerd en een reeks van tijd-ronden digitale beelden worden genomen door CloneSelect ™ Imager voor de documentatie van de cellijn geschiedenis. Na een enkele klonen hebben gevormd, werden deze klonen gescreend op de productiviteit door ELISA uitgevoerd op een Tecan Freedom EVO ® liquid handling systeem. Ongeveer 2.000 - 10.000 klonen kunnen worden gescreend per bedrijf cyclus met het huidige systeem setup.

Deze geïntegreerde aanpak is gebruikt om een ​​hoge productie van Chinese hamster ovarium (CHO) cel-lijnen voor de productie van therapeutische monoklonale antilichaam (mAb) evenals hun fusie-eiwitten te genereren. Met behulp van verschillende soorten opsporen van sondes, kan de methode worden gebruikt voor het ontwikkelen van andere therapeutische eiwitten of worden toegepast op andere productie-host-systemen. In vergelijking met de traditionele handmatige procedure, deze geautomatiseerde platform aangetoond voordelen van een aanzienlijk verhoogde capaciteit, verzekerd klonaliteit, traceerbaarheid in cellijn geschiedenis met elektronische documentatie en veel lagere kans in een bedieningsfout.

Protocol

1. Gastheercel transfectie

1. Seed 2 x 10 ⁶ CHO-cellen in DXB11 T75 Corning celkweek kolf in 15 ml groeimedium (MEMA met nucleotiden en nucleosiden (Gibco, catalogusnummer 12571), aangevuld met 10% γ-bestraalde gekenmerkt foetaal runderserum (CFBS) (Hyclone, catalogusnummer SH30071.03) en 10 ml / L van 45% glucose-oplossing (Sigma, catalogus nummer G8769)) een dag voor de transfectie.
2. Op het moment van transfectie, voor te bereiden transfectie complexen als volgt:
   1. Verdunnen 8 ug DNA in 800 ul van de groei medium zonder serum in een steriele microcentrifugebuis. Meng voorzichtig.
   2. Verdun 40 pi Lipofectamine ™ (Invitrogen 18324012) in 800 ul van de groei medium zonder serum in een polystyreen buis.
   3. Voeg de verdunde DNA om de verdunde Lipofectamine ™. Meng voorzichtig en incubeer gedurende 30 minuten bij kamertemperatuur.
3. Verwijder het groeimedium van de cellen in T75 en te vervangen door 6,4 ml van de groei medium zonder serum. Voeg de 1,6 ml van transfectie complexen aan de kolf. Meng voorzichtig door het schommelen van de plaat.
4. Incubeer cellen bij 37 ° C in een CO ₂ incubator gedurende 6 uur.
5. Voeg 8 ml groeimedium aan de kolf en incubeer bij 37 ° C in een CO ₂ incubator 's nachts.
6. Verwijder medium door aspiratie en voeg vers groeimedium aan de kolf. Incubeer de cellen bij 37 ° C in een CO ₂ incubator 's nachts.
7. Vervang het groeimedium met selectie medium (MEMA medium zonder nucleotiden of nucleosiden (Gibco, catalogusnummer 12561), aangevuld met 10% γ-bestraalde gedialyseerd foetaal runderserum (dFBS) (Hyclone, catalogusnummer SH30079.03) en 10 ml / L 45 % glucose-oplossing (Sigma, catalogus nummer G8769)).
8. Incubeer de cellen bij 37 ° C in een CO ₂ incubator voor 2-3 weken.

2. Klonen door Flow Cytometry geactiveerde celsortering

1. Verjagen cellen van de kolf en centrifugeer bij 800 rpm gedurende 5 minuten bij 4 ° C.
2. Resuspendeer de cellen in selectie medium aangevuld met 2% boviene serumalbumine en fluorescent gelabeld anti-humaan IgG-antilichaam op 1:20 verdunning.
3. Incubeer op ijs gedurende 15-30 minuten en vervolgens twee keer wassen met koud PBS. Resuspendeer cellen in 1x PBS in een polypropyleen buis.
4. Bereid je voor aseptische sorteren op een BD FACSAria ™. Bereid 96-well celkweek plaat die 200 ul selectie medium in elk putje bevat.
5. Aseptisch belasting van de buis met cellen en analyseren op BD FACSAria ™, de resultaten record voor gekleurd en ongekleurde cellen, respectievelijk.
6. Stel de poorten en instellingen om enkele cellen van het gewenste profiel van fluorescentie vlekken te sorteren in 96-well plaat (s).
   1. Getransfecteerde cellen worden eerst geanalyseerd op basis van voorwaartse verstrooiing versus zijwaartse verstrooiing. Een poort voor de levende cellen is gemaakt op basis van voorwaartse verstrooiing, die een cel grootte en zijwaartse verstrooiing, die een cel complexiteit of granulariteit maatregelen maatregelen.
   2. De cellen die vallen onder deze poort worden vervolgens onderzocht op PE-kleuring. PE negatieve gate is ingesteld voor onbesmet getransfecteerde cellen of gekleurde gastheercellen. Als gekleurde getransfecteerde cellen worden onderzocht door FACS, is de "High PE" poort dan wordt afgebakend in de top 5% van alle cellen die positief zijn voor PE-kleuren omvatten.
7. Incubeer de platen bij 37 ° C incubator voor twee weken.

3. Documentatie van kolonie vorming door CloneSelect ™ Imager

Document kolonie vorming in 96-well platen op CloneSelect imager ™ op dag 0, dag 3, dag 7 en dag 13 na de FACS-sortering. Het beeld documentatie zal zorgen voor de selectie van klonen afgeleid van een enkele cel. Een kritische stap in deze documentatie is het krijgen van de focal plane goed aangepast voor de dag 0 meting, omdat er slechts een cel in elk putje op dat punt. Het is zeer belangrijk dat de beelden van de individuele cellen zijn in focus en een poging om scherp te stellen op hen kan misleidend zijn op zijn best. De focal plane kan aanzienlijk verschillen tussen merken van platen en mogelijk zelfs van veel te veel van hetzelfde merk. Dus een vooraf vastgesteld focal plane moet worden gebruikt. Dit kan worden bereikt door te focussen op testen micro-parels of hoge dichtheid cellen afgezet op platen van dezelfde partij wordt gebruikt. Als alternatief kan volgroeid platen van dezelfde partij worden gebruikt voor dit doel. Na de FACS sorteren, is het ook belangrijk te laten de cellen genoegen nemen met een minimum van 2 uur voor imaging, zodat ze zullen worden 'vaste' in positie op de plaat.

4. Screening en selectie van hoog productieve klonen

1. Document monster positie in de ontvangende 96-well assay platen.
2. Overdracht hoeveelheden van 20 ul supernatans (verdunnen indien nodig) in de 96-well assay platen door de Tecan Freedom EVO ® liquid handling systeem. Deze flexibele en capabele robotic platform is aangepast voor deze en andere geautomatiseerde celcultuur werk. Speciale programma's werden geschreven om de beste te benutten en de Freedom EVO robotische mogelijkheden voor cellijn ontwikkeling te vergroten. Een voorbeeld hiervan is het instellen van de Tecan om CloneSelect ™ Imager gegevens te interpreteren voor de bemonstering putten met enkele kolonies. Andere programma's waren nodig om extra celcultuur taken, zoals uitvoeren om de geschikte verdunningen van de genomen monsters, te interpreteren, catalogus en sample handmatig gemarkeerd platen te maken, indien nodig, op te schalen hoog producerende klonen, enz. Veel van deze programma's eenvoudig worden toegepast op de 384 en platen, alsmede de oorspronkelijke 96 goed formaat.
3. Productie van antilichamen in de monsters wordt geanalyseerd door een sandwich menselijk IgG opsporen van ELISA (Pierce, Rockford, IL) op de Tecan Freedom EVO ® liquid handling systeem.
   1. Monsters en standaard (Humane myeloma IgG1, kappa) (Sigma, St. Louis, MO) werden geladen op de pre-coated Bio Coat anti-humaan IgG testplaten (BD Biosciences, San Jose, CA).
   2. De platen werden geïncubeerd bij kamertemperatuur gedurende twee uur, gevolgd door drie PBS wasbeurten.
   3. ImmunoPure Geit anti-humaan IgG, (Fc-gamma)-HRP (Pierce, Rockford, IL) werd toegevoegd aan de plaat bij een 1:2000 verdunning en geïncubeerd gedurende een uur bij kamertemperatuur.
   4. De platen werden drie keer gewassen met PBS voor het toevoegen van ABTS substraat (Pierce, Rockford, IL) en werden lezen op een bord lezer met behulp van absorptie bij 405 nm voor de detectie.
4. Selecteer zeer productieve klonen en evalueren de productiviteit in suspensie cultuur. Voor de fed-batch cultuur, werden de cellen geïnoculeerd op 0.3X106 cellen / ml in eiwit vrij medium JRH onmiddellijk voordeel 65.578 (SAFC Biosciences, Lenexa, KS), aangevuld met 5 g / L soja hydrolysaat (DMV International, catalogusnummer SE50MAF-UF, veel nummer) en geïncubeerd bij 37 ° C met 7,5% CO _2. De cultuur voortgezet en werden aangevuld met 2 g / L glucose (Sigma, catalogus nummer G8769, lotnummer 098K2329) als glucose-plus lactaat concentratie in de cultuur bereikte minder dan 2 g / L, en gevoed 2 mM glutamine (Gibco, catalogus nummer 25030, lotnummer 568177) als glutamine bereikte onder de 200 mg / L (metabolieten gemeten door YSI Bioanalyzer). Fed-batch culturen werden beëindigd op dag 14 en de productie van antilichamen werd gemeten door omgekeerde fase HPLC.
5. Genetische karakterisering van kandidaat-klonen met behulp van fluorescentie in situ hybridisatie (FISH) ^5.

5. Representatieve resultaten:

Een voorbeeld van de ontwikkeling van antilichamen producerende klonen met de high throughput methode is weergegeven in figuur 1 en figuur 2. Getransfecteerde cel zwembad was gekleurd met fluorescent gelabelde anti-humaan IgG-antilichaam (Figuur 1A), geanalyseerd en gesorteerd op BD FACSAria ™ (Figuur 1B). Kolonie vorming in 96-wells plaat werd in beeld gebracht op CloneSelect Imager ™ (figuur 1C). Celkweeksupernatant werd bemonsterd uit putten die enkele kolonie bevatten en getest door ELISA op de Tecan Freedom EVO ® liquid handling systeem (figuur 1D). Zeer productief klonen werden gevonden van cellen die het oppervlak hoger gehalte aan antilichamen gereflecteerd door kleuring met fluorescerende gelabeld anti-humaan IgG tentoongesteld. Bij het vergelijken van klonen gegenereerd uit twee populaties van de eerste getransfecteerde cel zwembad, een groot verschil in productiviteit in de fed-batch cultuur werd waargenomen (figuur 2). Voor de top twee klonen gegenereerd op basis van de celpopulatie met een hoge oppervlakte-antilichaam expressie (PE hoog), de specifieke productiviteit varieerde 50 tot 70 pg / cel / dag. Overwegende dat het antilichaam de productiviteit was ~ 20 pg / cel / dag voor de top twee klonen gegenereerd op basis van de celpopulatie met een lage oppervlakte antilichaam expressie (PE laag). Bovendien cellijnen ontwikkeld door FACS sorteren zijn meer stabiel ten opzichte van de productie van antilichamen dan die welke werden gekloond door middel van handmatige kalken verdunning (Figuur 3A). De specifieke productiviteit van de top kloon, "Clone 1", gegenereerd door handmatige kalken verwatering daalde van ~ 30 naar ~ 10 PCD pcd na kweken voor 80 cellen verdubbelingen. Aan de andere kant, de bovenkant subkloon gegenereerd door FACS-sortering, "Clone 2", was in staat om de specifieke productiviteit rond de 20 PCD gedurende ten minste 100 cellen verdubbelingen. Door fluorescente in situ hybridisatie (FISH), hebben we aangetoond Clone 1 zien was als een gemengde populatie van fenotype A (85%) en fenotype B (15%). In tegenstelling, FACS gesorteerd kloon (kloon 2) bleek een meer homogene bevolking, met 99,5% van de cellen bleek te zijn fenotype A (Figuur 3B).

Figuur 1. Ontwikkeling van de productie cellijnen voor de productie van monoklonale antilichamen uit CHO-cellen. A) Oppervlakte kleuring van de initiële getransfecteerde cel zwembad met fluorescent gelabelde anti-humaan IgG-antilichaam. B) Het sorteren van de celpopulatie met een hoge fluorescentie-intensiteit (PE hoog) en lage fluorescentie-intensiteit (PE laag) in 96-well plaat. C) documenteren kolonievorming van dag 0 tot dag 13 na het zaaien op CloneSelect Imager ™. D) Screening klonen met behulp van ELISA.

Figuur 2. Surface geassocieerd antilichaamniveau correleert met antilichaam productiviteit van de cel. Klonen met hoge en lage fluorescentiekleuring werden beide ontwikkeld tot cellijnen en geëvalueerd in fed-batch cultuur. Volumetrische titer en specifieke productiviteit werden vergeleken tussen de top twee klonen van elkaar bevolking.

Figuur 3. Klonen gegenereerd op basis van FACS-sortering vertonen een hogere genetische homogeniteit en kloon stabiliteit. A) antilichaam productie van stabiliteit in batch cultuur voor ~ 80 cellen verdubbelingen van de cultuur verstreken tijd. Δ, werd kloon gegenereerd door beperkende verdunning, waar de cellen werden uitgezet bij 2000 cellen / putje, 1000 cellen / putje en 500 cellen / putje. , Werd kloon gegenereerd door middel van FACS op een cel / well. B) Transgene integratie site in CHO-cel chromosoom wordt geïdentificeerd door Fluorescent in situ hybridisatie.

Discussie

Wij presenteerden een geautomatiseerde productie cellijn ontwikkelplatform dat isolatie van zeer productieve klonen mogelijk maakt, en in de tussentijd, terwijl zorgt klonaliteit en kloon stabiliteit. De betrokkenheid van de oppervlakte antilichaam kleuring gevolgd door FACSAria ™ celsortering is de sleutel tot het verkrijgen van enkele klonen met een hoge antilichaam productiviteit. Onze resultaten en andere rapporten ^2-4 suggereren dat het antilichaam niveau tijdelijk wordt weergegeven op het celoppervlak goed gecorreleerd met de productiviteit van de cel. Zo kan een fluoresceïne-geconjugeerd antilichaam gebruikt worden om het membraan bijbehorende product te herkennen en de isolatie van hoge producenten hulp. Als alternatief zijn co-expressie van reportergenen en gel MicroDrop technologie is gebruikt om de selectie van hoog-producerende klonen te vergemakkelijken door FACS ^6-8. Naast het isoleren van hoge productie van klonen via FACS, hebben andere technologieën ontwikkeld om hetzelfde doel te bereiken. Deze omvatten Trellis bio-CellSpot technologie die microspere antilichaam detectie systemen en laser screening technologie gebruikt om zeer productieve klonen te identificeren en ongewenste cellen, Genetix ClonePix FL en StemCell Technologies ClonaCell EasyPick platform dat high throughput screening van de productie-cellijnen met behulp van een fluorescerende antistof detectie systeem uit te voeren te elimineren . We hebben ervoor gekozen om de FACS klonen methode gebaseerd op oppervlakte geassocieerd antilichaam niveau uit te voeren want het combineert het gemak van de werking, selectiviteit op productiviteit en klonaliteit.

De inzet van Tecan Freedom EVO ® liquid handling systeem aanzienlijk toegenomen screening doorvoersnelheid, die de mogelijkheid om te selecteren op high yield klonen van een veel grotere cel zwembad bieden. Andere instrumentatie voor test zoals HTRF, Bioforte Octet, HPLC, etc, worden alle mogelijke middelen te selecteren hoge producenten en uitselecteren van een lage producenten. Door het bijhouden kloon formatie met CloneSelect Imager ™ genereerden wij nodige documentatie om klonaliteit met gedigitaliseerde cellijn de geschiedenis te bewijzen. Klonaliteit wordt verder bevestigd door genetisch enkele transgene integratie plaats karakteriseren op het chromosoom. Een subkloning stap, die meestal wordt genomen om de klonaliteit te waarborgen, kunnen dus worden geëlimineerd. Dit bespaart 4-8 weken de tijd voor cellijn ontwikkeling. Kortom, de kwaliteit van cellijnen gegenereerd door de high-throughput geautomatiseerd platform toonde een hoge productiviteit, de productie stabiliteit en gedocumenteerd cellijn de geschiedenis dat de vraag naar grootschalige productie en de huidige wettelijke eisen moeten voldoen.

Materialen

Lijst van materialen gebruikt in dit artikel

Naam	Bedrijf	Catalogusnummer	Opmerkingen
Naam	Vennootschap
BD FACS Aria ™ Cell Sorter	BD Bioscience
CloneSelect ™ Imager	Genetix
Tecan Freedom EVO ® liquid handling systeem	Tecan Group