$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
De meest voorkomende software-analyse tools beschikbaar voor het meten van fluorescentie beelden zijn voor twee-dimensionale (2D) gegevens die afhankelijk zijn van handmatige instellingen voor in-en uitsluiting van datapunten, en computer-aided patroonherkenning om de interpretatie en bevindingen van de analyse te ondersteunen. Het is steeds belangrijker kunnen fluorescentiebeelden opgebouwd uit driedimensionale (3D) datasets meten om te kunnen de complexiteit van cellulaire dynamiek vangen en de basis van cellulaire plasticiteit in biologische systemen begrijpen. Geavanceerde microscopie instrumenten toegestaan de visualisatie van 3D-fluorescentie beelden door de overname van multispectrale fluorescentie beelden en krachtige analytische software die de beelden reconstrueert van confocale stapels die vervolgens zorgen voor een 3D-weergave van de verzamelde 2D-beelden. Geavanceerd ontwerp op basis van stereologie methoden zijn gevorderd van de harmonisatie en veronderstellingen van de oorsprongl modelmatige stereologie 1 zelfs in complexe weefselcoupes 2. Ondanks deze wetenschappelijke vooruitgang in microscopie, een behoefte bestaan aan een geautomatiseerde analytische methode die volledig gebruik van de intrinsieke 3D data, teneinde de analyse en kwantificering van de complexe veranderingen in celmorfologie, eiwit lokalisatie en receptor handel.
Huidige technieken om fluorescentie te kwantificeren beelden omvatten Meta-Morph (Molecular Devices, Sunnyvale, CA) en Image J (NIH) die handmatige analyse. Imaris (Andor Technology, Belfast, Noord-Ierland)-software biedt de functie MeasurementPro, waarin het handboek creëren van meetpunten die kunnen worden geplaatst in een volume afbeelding of getekend op een reeks van 2D plakken tot een 3D-object te maken mogelijk maakt. Deze methode is bruikbaar voor een klik puntmetingen een lijn tussen twee objecten meten of een veelhoek die een van belang omvat maken, maar het is moeilijk toepasbaar op complex mobiele netwerk structuren. Filament Tracer (Andor) maakt automatische detectie van de 3D neuronale filamentachtig echter deze module is ontwikkeld om gedefinieerde structuren zoals neuronen, die bestaan uit dendrieten, axonen en stekels (boomstructuur) te meten. Deze module ingenieuze is gebruikt om morfologische metingen niet-neuronale cellen 3 te maken, maar de uitvoergegevens informatie van een uitgebreid cellulaire netwerk via een software afhankelijk is van een bepaalde celvorm plaats van een amorfe vorm van cellulaire model. Om het probleem van het analyseren van amorf-vormige cellen en het maken van de software meer geschikt is om een biologische toepassing te overwinnen, Imaris ontwikkeld Imaris Cell. Dit een wetenschappelijke project de Eidgenössische Technische Hochschule, die is ontwikkeld om de relatie tussen cellen en organellen berekenen. Terwijl de software kan de detectie van biologische beperkingen Het dwingt een kern per celen met celmembranen segment cellen kan niet worden gebruikt om fluorescentie gegevens zijn niet permanent omdat idealiter gebaseerd celoppervlak zonder lege ruimten analyseren. Voor zover ons bekend, op dit moment geen door de gebruiker aanpasbaar geautomatiseerde aanpak die morfometrische informatie geeft van 3D fluorescentie beelden ontwikkeld die zorgt voor cellulaire ruimtelijke informatie van een ongedefinieerde vorm (figuur 1).
We hebben een analytische platform met behulp van de Imaris kern software module en Imaris XT gekoppeld aan MATLAB (Mat Works, Inc.) Deze hulpmiddelen kunnen de 3D meting van cellen zonder een vooraf gedefinieerde vorm en inconsistente fluorescentie netwerkcomponenten. Bovendien zal deze methode kunnen de onderzoekers die kennis uitgebreid in biologische systemen, maar niet vertrouwd zijn met computer-toepassingen, voor kwantificering van morfologische veranderingen uit te voeren in cel dynamiek.