De kwaliteit van de resultaten van een proteomische analyse sterk afhankelijk van het uitgangsmateriaal. Met de moderne MS, zijn lichte verontreinigingen in monster voorbereidingen gemakkelijk opgepikt. Daarom is het kritisch, bij zaadcel proteomics, een methode zeer zuivere spermatozoa geeft kiezen. Zoals geïllustreerd in figuur 1, wordt retrograde backflushing gebruikt zaadcellen opvragen via het cauda epididymis. Dit houdt cannulating de zaadleider met PE buis waarmee men langzaam toe te passen luchtdruk uit de spuit bevestigd. Figuur 1A toont de cauda epididymis samen met de zaadleider. Figuur 1B is een close-up shot van hoe de zaadleider wordt vastgebonden, waar de canule wordt ingebracht. Hierbij w, spermatozoa worden vrijgegeven op het uitgesneden einde van een buisje uit de caudale epididymides. Zoals getoond in figuur 2A, worden de spermatozoa geëxtraheerd uit de top gebieden van de caudeen epididymis en opgezogen in een glazen capillair in een rusttoestand (figuur 2B). Dit heeft meerdere voordelen boven traditionele "swim-up" methode, niet de minste daarvan is het vermogen om een phoshoproteomic analyse van spermatozoa uitgevoerd vóór en na de activering van motiliteit. De zaadcellen kunnen dan worden uitgestoten in de media van zijn keuze. Figuur 2C (linkerkant) laat zien hoe het sperma direct kijken na uitzetting naar BWW media. Veel van de cellen samen samengeklonterd. Echter, na 10 min de bevoegdheid van de cellen aangetoond omdat ze te zwemmen om de homogeniteit in de oplossing (figuur 2C, rechterzijde cellen). Aangezien het terugspoelen techniek heeft weinig invloed op de zaadcellen, verkrijgen wij bijna 100% motiliteit en de cellen dispergeren snel in de media zonder externe provocatie. In een typisch backflushing experiment, sperma hersteld van de Zwitsers-muis bevattussen 1-5 x 10 6 cellen. Dit is sterk afhankelijk van de leeftijd van het dier en kan variëren van verschillende muizenstammen. In een Noorse rat, we meestal 200 x 10 6 spermatozoa te verkrijgen ± 20%. Figuur 2D geeft de zuiverheid van spermatozoa verkregen door de rat cauda epididymis.
Naast het monster zelf, een van de belangrijkste kwesties met betrekking tot monstervoorbereiding is het rendement van trypsine spijsvertering. Eiwit neerslag speelt een belangrijke rol, niet alleen in het verwijderen van ongewenste detergentia en zouten, die beide onverenigbaar met MS, maar ook eiwitten denatureren. We hebben de methanol-chloroform neerslag het beste te werken gevonden. Niet alleen is deze procedure gemeld lage overvloedige eiwitten beter dan anderen waaronder TCA precipitatie 19 neerslaan, maar heeft extra voordelen. Na TCA precipitatie, is het vaak noodzakelijk om de pH passen na schorsing van de TCA pellet die vrij kan blijvenzuur. Hoewel de neergeslagen pellet van TCA in hoge organische oplossingen kan worden gewassen om het zuur te verwijderen, dit draagt bij aan proeven hanteren en irreproducibility van de resultaten. Als de zuur neutraliseren zal resulteren in slechte tryptische peptide opbrengsten. Methanol-chloroform neerslag is niet alleen snel, maar zal het monster niet verzuren. Figuur 3 illustreert het eiwit pellet meestal gezien van 100 ug van het monster tussen de onderste en bovenste interfase.
De isolatie van fosfopeptiden kan voorkomen in een aantal opzichten; echter reproduceerbaarheid afhankelijk van het monster is behandeld tot en met deze fase. Een van de meest voorkomende, ontwikkelen methoden TiO 2, oorspronkelijk ontwikkeld door de groep Martin Larsen 18,20,21. Hoewel beschreven als een werkwijze voor gebruik in microkolommen, kunnen we reproduceerbare gegevens te verkrijgen via batch chromatografie. Het succes van het proces is sterk afhankelijk van de elutiebuffer, moet die gek e de juiste samenstelling; anders fosfopeptiden geëlueerd niet helemaal.
De reproduceerbaarheid van het protocol en representatieve gegevens van TiO 2 verrijkte fosfopeptiden van cauda epididymis sperma in een onbeweeglijk (figuur 4 boven) en beweeglijk (figuur 4 onder) toestand van m / z 650-670 zichtbaar. We hebben aangetoond dat dit een zeer reproduceerbaar techniek ook bij gebruik van biologische herhalingen 17. De blauwe strepen verschijnen tijd peptiden elueren uit C18 nano-kolom als de concentratie acetonitril toeneemt. Het spreekt voor zich beweeglijke populatie (n = 3 getoond, n = 8 loopt gewoonlijk), is een peptide cluster, met een mono-isotopische massa rond de 651,5 Da bereik dat volledig afwezig in de niet-beweeglijke range. Tandem massaspectrometrie wordt vervolgens gebruikt om het peptide te identificeren.
546 / 51546fig1highres.jpg "/>
Figuur 1:. Canulatie van de cauda epididymis (A) Foto van de cauda epididymis. De canule zelf is vastgeplakt ongeveer 1-2 cm van de pre-getrokken end bloot. Dit wordt in de zaadleider ingevoegd met behulp van fijne # 5watchmakers tang. (B) De canule wordt op zijn plaats gehouden door koppelverkoop fijne zijde rond een segment met zowel de zaadleider en de canule. Uit de muis, ongeveer 2-3 ul caudale epididymale cellen en vloeistof worden verzameld in een concentratie van 1 x 10 6 / ul. Uit de rat (getoond) ongeveer 30-40 pl vloeistof verkregen bij soortgelijke concentraties.

Figuur 2: Glas capillaire gebruikt om competente epididymaire spermatozoa te verzamelen. (A) Een buisje van de top van de cauda e pididymis is geïsoleerd en gebroken. De geschatte positie van waaruit dit gebeurt wordt getoond. (B) De bovenkant van het beeld toont een leeg glas capillair en de onderste toont één van een eerder teruggespoeld rat. Er is geen bloed besmetting en minimale verontreiniging epitheliale cellen. (C) Aangezien de spermatozoa nog onverdund in de epididymis fluïdum, zijn ze niet beginnen te activeren. Wanneer de spermatozoa in eerste instantie worden uitgestoten in een BWW oplossing, ze komen als een compacte "string" (Linkerkant). De bevoegdheid van de cel wordt eenvoudig ingesteld, want na 10 minuten het grootste deel van de zaadcellen zwemmen in oplossing zonder externe verstoring (aan de rechterkant). (D) Een foto van een monster van caudale epididymaal cellen onmiddellijk nadat ze zijn vertrokken om te zwemmen out toont de zuiverheid van de cellen.
g3highres.jpg "/>
Figuur 3:. Methanol-chloroform precipitatie eenmaal spermatozoa oplosbaar zijn, de oplosbare fractie methanol-chloroform geprecipiteerd denaturatie van de eiwitten en verwijdering van verontreinigende stoffen. De proteïne pellet wordt op het grensvlak tussen de methanol / water en chloroform fase. De bovenste laag wordt voorzichtig verwijderd om niet deze pellet te verstoren. Het is gebruikelijk ongeveer 2-3 mm van de bovenste fase verlaten zodat geen eiwit verloren.

Figuur 4:. Typische TiO 2 verrijkte fosfopeptide profiel met de beschreven protocol werd caudaal epididymale spermatozoa geïsoleerd in beide immotile (top, N = 3) of beweeglijke toestanden (bottom, N = 3). Een peptide cluster met een mono-isotopische massa van ~ 651,5 Deen wordt aangetroffen in de beweeglijke populaties maar volledig afwezig in de onbeweeglijke die (pijl) zijn. Vergelijkingen van deze aard worden aangeduid als "label-free (MS-gebaseerde)". Het peptide massa en retentietijd worden vervolgens gebruikt om de verbinding van tandem-massaspectrometrie richten en identificeren eiwit waaruit het peptide is afgeleid.