Naast de analyse van het TATS-membraannetwerk zijn een aantal veelgebruikte celbiologische technieken, zoals intracellulaire Ca2+-imaging, patch-clamp elektrofysiologie of farmacologische dosis-responsstudies, kritisch afhankelijk van hoogwaardige isolatie van primaire cellen uit de atria, ventricels of specifieke delen van hartweefsel om karakterisering van volgroeide, gedifferentieerde, structureel en fysiologisch intacte cardiomyocyten mogelijk te maken. Daarom zijn de isolatie en kwaliteitsbeoordeling voor AM- en VM-cellen, zoals beschreven in sectie 1, uiteindelijk nuttig voor veel verschillende vraagstukken, waaronder de hier beschreven TATS-netwerkanalyse, die kritisch afhankelijk is van een intact membraan en celintegriteit.
Figuur 1 biedt een stapsgewijze handleiding met afbeeldingen over hoe de dissectie van het hartweefsel moet worden uitgevoerd, beginnend bij de atriale kamers in het muizenhart. Vervolgens worden de ventriculaire kamers en het septum voorbereid en naar behoefte gedissecteerd. Precieze selectie en preparatie van de juiste weefseldelen is essentieel om betrouwbaar AM- en VM-isolaties met voldoende celzuiverheid te verkrijgen. Na collagenase-digestie kan het relatief moeilijk zijn om de juiste dissectielijn tussen het atriale en ventriculaire weefsel te identificeren, maar zodra AM- en VM-cellen ongecontroleerd gemengd zijn in de celsuspensie, is het onmogelijk om de gemengde celpopulatie ongedaan te maken. Daarom zullen anatomische oriëntatie, 3D-weefselvisualisatie, voldoende ervaring met de hantering van gedigesteerd weefsel, correcte identificatie van specifieke weefseldelen en hun dissectielijnen allemaal bijdragen aan het succes van de celisolatie.

Figuur 1. Dissectie van atriumweefsel. (A) Gezien vanuit het anterieure gedeelte van het hart, fixeren twee chirurgische hechtingen de proximale aorta aan het stompende uiteinde van een 21 G stalen canule. (B) Uitzicht richting de basis van het hart laat zien dat resterend longweefsel het zicht op de atriumkamer tijdens de dissectie belemmert. LA, linker atrium; RA, rechter atrium. (C) Resterend longweefsel en de grote vaten werden verwijderd om toegang te krijgen tot de atriumkamers. Gevulde zwarte driehoek, longslagader; gestreepte driehoek, longaders; gevulde witte driehoek, bovenste holle ader; omkaderde driehoek, onderste holle ader. (D) Eerst wordt de wand van het rechter atrium gedisseceerd terwijl de pincet het atriumappendage vasthoudt. (E) Uitzicht in de holte van de rechter atriumkamer. De zwarte driehoek markeert het intacte interatriale septum. (F) De dissectie wordt voortgezet om de holte van de linker atriumkamer te betreden. (G) Na volledige dissectie van de linker en rechter atria worden de atrioventiculaire kleppen zichtbaar. Het vezelige klepapparaat wordt gedisseceerd en weggegooid om vervolgens uitsluitend ventriculaire spierweefsel te oogsten. (H) Posterieur uitzicht van de geïsoleerde linker en rechter atria. LA, linker atrium; RA, rechter atrium.Schaalbalken: 700 µm.
Om de kwaliteit van de celisolaties te bepalen, biedt Figuur 2 typische celvoorbeelden tijdens de beoordeling van de opbrengst en levensvatbaarheid van typische staaf- of baksteenvormige, gestreepte intacte myocyten, zowel voor AM's als VM's. Licht beschadigde, visueel onopvallende cellen alsof zwaar beschadigde cellen met abnormale, overmatig gekromde morfologieën, of abnormale sferisch gevormde cellen kunnen gemakkelijk worden geïdentificeerd, inclusief trypaanblauw-uitsluiting zoals beschreven in sectie 1.11. Terwijl intacte myocyten helder en homogeen gestreept blijven wanneer ze worden blootgesteld aan extracellulair trypaanblauw, vertonen beschadigde cellen doorgaans meerdere membraanblaasjes en/of accumuleren ze snel intracellulair trypaanblauw, wat duidt op membraanschade. Echter, trypaanblauw kan op zichzelf cellen beschadigen door onnodig lange incubatie, waardoor onmiddellijke beoordeling van de celkwaliteit verplicht is. Voorbeelden van meer evidente vormen van celschade, zoals myofilamentcontractuur of grove oppervlakschade die de celintegriteit aantast, worden getoond in Figuren 4C en 4D. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 2.Celkleuring via trypaanblauw-exclusie. Geïsoleerde (A) AM- en (B) VM-cellen zijn in suspensie gemengd met trypaanblauw en gevisualiseerd met een omgekeerde lichtmicroscoop bij een vergroting van 40X. Let op dat abnormale bolvormige cellen in (A) en (B) trypaanblauw opnemen, wat duidt op membraanlekkage en structurele schade. In contrast hiermee sluiten de centrale AM- en VM-cellen met intacte membranen trypaanblauw uit, zoals hier getoond. Let daarnaast op dat intacte AM- en VM-cellen sarcomere striaties vertonen over hun gehele celvolume, geen membraanblaasjes (blebs) hebben en scherpe randen vertonen aan zowel de laterale zijden als beide intercalaire schijven. Schaalbalken: 20 µm.
Na een succesvolle isolatie kan er van een enkele digestie van een muizenhart een celopbrengst van VM's van 5 x 105 tot 106 worden verwacht. De opbrengst van AM's is aanzienlijk lager, in de orde van 3 x 103 tot 3 x 104 staafvormige, trypaanblauw-uitsluitende cellen. In tegenstelling tot VM mislukken AM-isolaties af en toe, zelfs door ervaren handen. Stap 1.11 vat de procedures samen om de opbrengst van geïsoleerde gezonde cellen in suspensie te schatten. Bepaal daarnaast de gemiddelde celafmetingen via stap 1.13, zoals getoond in Figuur 3, voor individuele AM- of VM-celisolaten of om AM- versus VM-celpopulaties naast elkaar te vergelijken (indien nodig). Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 3. Brightfield morfometrische analyse van hartmyocyten. De VM-contour werd gedetecteerd met de beeldanalyse-instrumenten die beschreven zijn onder stap 1.13. Gebruik de polygoon-selectietool om de extracellulaire grens van de cel, gedefinieerd door het buitenste oppervlaktemembraan, visueel te markeren en te definiëren voor analyse. Voeg het geselecteerde interessegebied (ROI) toe aan de ROI-manager, gevolgd door 1D-afstandmetingen. Voor vergelijkende studies van AM- versus VM-afmetingen is het nuttig om de cellengte, breedte en oppervlakte te documenteren en de lengte-breedteverhouding te berekenen.
Om TATS-membranen in zowel AM- als VM-cellen fluorescent te kleuren, wordt de integrale membraankleurstof di-8-ANEPPS gebruikt zoals beschreven in sectie 2, gevolgd door confocale microscopie, wat resulteerde in de representatieve afbeeldingen van TATS-netwerken getoond in Figuren 4A en 4B. Daarnaast toont Figuur 4A de bijbehorende transmissielichtafbeelding van een intacte AM naast de confocale TATS-afbeelding (zie sectie 3 voor beeldacquisitie). Zoals beschreven in stap 1.12, wordt de morfologische en oppervlaktemembraanintegriteit van levende myocyten beoordeeld via de transmissielichtafbeeldingen. Het vergrote gebied van het di-8-ANEPPS-signaal accentueert de onderliggende morfologie van het TATS-netwerk in AM's, gekenmerkt door overvloedige axiale (longitudinale) membraantubuli. In tegenstelling hiermee wordt de TATS-morfologie van gezonde VM's, zoals getoond in Figuur 4B, gekenmerkt door ongeveer gelijke aantallen axiale en transversale componenten. Daarentegen tonen Figuren 4C en 4D voorbeelden van beschadigde hartmyocyten die uit verdere analyse moeten worden uitgesloten. In het bijzonder is de AM-cel in Figuur 4C gecontracteerd, wat blijkt uit een abnormaal korte sarcomeerlengte van 1,2 µm en een onregelmatig, vervormd TATS-netwerk, terwijl de VM-cel in Figuur 4D meerdere membraanblebs vertoont (sommigen gemarkeerd met rode driehoeken), wat wijst op membraanrupturen, die kunnen voorkomen aan het buitenste oppervlaktemembraan maar ook aan de TATS-membranen. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 4. Live membraankleuring van intacte atriale en ventriculaire myocyten. Overeenkomstige doorlaatlicht- en confocale beelden van levende, met di-8-ANEPPS gekleurde intacte (A) AM- en (B) VM-cellen. In contrast wordt in (C) een gedeeltelijk gecontracteerde en potentieel beschadigde AM getoond met een sarcomerlengte van 1,2 µm. Gecontracteerde myocyten vertonen doorgaans abnormaal verkorte en vervormde TATS-structuren en werden daarom uitgesloten van verdere analyse. Een andere belangrijke indicator voor defecten in het celmembraan zijn membraanblebs (rode driehoeken), zoals getoond in een VM in (D). Membraanblebs vertegenwoordigen beschadigde oppervlaktemembraanstructuren; cellen met blebs moeten worden uitgesloten van verdere TATS-analyse. Bovendien vertoont de VM grove schade, waarbij schijnbaar een geheel deel van het linkerondergedeelte ontbreekt (gemarkeerd met een asterisk). Samenvattend wordt door het vergelijken van doorlaatlicht- en confocale beelden de celmorfologie en oppervlakte-integriteit gedocumenteerd en gecombineerd met fluorescentiesignaalinformatie. ‘N’ markeert celkernen die zijn weggelaten uit de analyse van de TATS-membraankleuring. Gele balken geven vergrote ROI's aan uit hetzelfde confocale beeld dat hierboven wordt gepresenteerd. Schaalbalken: 10 µm. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Confocale beelden van TATS-membranen met een voldoende signaal-ruisverhouding, zoals weergegeven in Figuren 4A en 4B, worden geaccepteerd voor verdere kwantitatieve analyse. De analyse van het TATS-membraan is gebaseerd op geskeletiseerde gegevens afgeleid van de fluorescente rectilineaire signaalcomponenten. Figuur 5 toont het workflowdiagram van de individuele bewerkingsstappen van de beelden, die in detail worden beschreven in stappen 4.3 tot 4.5. Deze stappen produceren geskeletiseerde beelden die de rectilineaire TATS-membraannetwerken representeren, zoals getoond voor elke geïsoleerde VM (Figuur 5A) en AM-cellen (Figuur 5B).

Figuur 5. Workflow voor skeletonisatie van fluorescente TATS-beelden. Beeldverwerkingsstappen die leiden tot een geskeletoniseerd beeld van het TATS-netwerk worden weergegeven door individuele stapsgewijze beeldvoorbeelden, zowel voor een di-8-ANEPPS-gekleurde VM (A) als AM (B). Raadpleeg voor elke individuele beeldverwerkingsstap sectie 4. Let op de verschillen in schaalbalken: 20µm (A) en 10µm (B). Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Een cruciale stap tijdens de beeldverwerking is het bepalen van de juiste drempelwaarde voor data-binarisatie, zoals beschreven in sectie 4.5.6. Het resulterende binaire beeld moet uitsluitend echte membraansignalen van het TATS-netwerk bevatten en geen valse structuren die voortkomen uit foutieve drempelwaarde-instellingen van de achtergrondruis. Tegelijkertijd is het belangrijk dat de drempelwaarde laag genoeg is om alle echte TATS-structuren te detecteren, zodat werkelijke TATS-componenten niet onterecht verloren gaan tijdens de beeldanalyse. Figuur 6 illustreert het proces voor het selecteren van de drempelwaarde tijdens de data-binarisatie. Hoewel een drempelwaarde van 40, zoals getoond in Figuren 6B en 6C, geschikt lijkt om alle echte TATS-structuren individueel te detecteren, detecteert het kiezen van een hogere drempelwaarde, bijv. 60, zoals getoond in Figuur 6A, zwakkere axiale membraanstructuren (AT's) niet, zoals aangegeven door de gele driehoeken. Omgekeerd leidt het kiezen van een lagere drempelwaarde, bijv. 20, zoals getoond in Figuur 6D, tot een onjuiste detectie van achtergrondruis als vals-positieve TATS-structuren, zoals aangegeven door de gele driehoeken.

Figuur 6. Bepaling van de signaaldrempelwaarde tijdens het skeletoniseren van TATS-beeldgegevens.De voorbeelden tonen TATS-skeletten die elk zijn gegenereerd voor verschillende drempelwaarden tijdens de binarisatie van gegevens (beschreven in stap 4.5). Bovenste afbeeldingen: tonen de aanpassingen van de drempelwaarde met behulp van Fiji. Onderste afbeeldingen: overlay van geskeletoniseerde beelden met het corresponderende input-fluorescentiebeeld en vergrote regio's zoals aangegeven. Een hoge drempelwaarde, bijv. 60, toegepast in (A), is schijnbaar niet geschikt om alle werkelijke TATS-structuren te detecteren, zoals aangegeven door de gele driehoeken in het vergrote gedeelte. Een drempelwaarde van 40, toegepast in (B) en (C), detecteert alle TATS-structuren en detecteert correct geen achtergrondruis, terwijl een lage drempelwaarde, bijv. 20 in (D), achtergrondruis onterecht identificeert als TATS-structuren en daarmee vals-positieve signalen van niet-bestaande membraanstructuren produceert. Vals-positieve signalen worden aangegeven door gele driehoeken in de vergrote inzet. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
De plugin “Analyze Skeleton (2D/3D)” ondersteunt de gedetailleerde analyse van geskeletiseerde TATS-structuren. Na uitvoering genereert de plugin een datatabel met de volgende skeletparameters: #branches, #junctions, #end-point voxels, gemiddelde taklengte, #triple points, #quadruple points en maximale taklengte. Raadpleeg voor een gedetailleerde beschrijving van alle mogelijke outputparameters http://fiji.sc/wiki/index.php/AnalyzeSkeleton en gerelateerde artikelen29-31. Een typische output van de datatabel is weergegeven in Figuur 7A.
De parameters kunnen verder worden gebruikt om de totale skeletlengte per oppervlakte of het aantal juncties per oppervlakte af te leiden. Een voorbeeldcalculatie waarbij het aantal vertakkingen wordt vermenigvuldigd met de gemiddelde vertakkingslengte geeft de totale lengte van het continue skelet in 2D:
Totale skeletlengte per ROI:
∑ (#takken x gemiddelde taklengte) = 5155 px = 515.5 µm
De totale lengte van het skelet kan worden genormaliseerd naar het beeldoppervlak. Voor het voorbeeld getoond in Figuur 7 zijn de genormaliseerde skeletlengte van 0,64µm/µm2 en de som van alle juncties als volgt berekend:
Genormaliseerde skeletlengte:
515.5 µm / 803.6 µm2= 0.64 µm/µm2
Genormaliseerd aantal juncties:
155 verbindingen / 803,6 µm2= 0,19 verbindingen/µm2

Figuur 7. Geautomatiseerde data-output uit geskeletiseerde beelden. (A) Een typisch dataspreadsheet gegenereerd door de 'Analyze Skeleton (2D/3D)'-plugin van het geskeletiseerde beeld getoond in (B). Raadpleeg voor een gedetailleerde beschrijving van mogelijke outputparameters http://fiji.sc/wiki/index.php/AnalyzeSkeleton. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
De beeldbewerkingsstappen beschreven onder 4.5 en geïllustreerd in Figuur 5 kunnen worden geautomatiseerd met behulp van een Fiji-macro, die is bijgevoegd als Supplementary Code File. De commando's definiëren herhalingen van de beeldbewerking via iteratieve stappen. De macro kan worden toegepast op volledige stacks van inputbeelden die zijn gegenereerd via stappen 4.3 en 4.4. De macro kan voordelig zijn voor de analyse van volledige datasetgroepen, bijvoorbeeld door individuele inputbeeldstacks voor te bereiden voor elke onafhankelijke behandelgroep voor geautomatiseerde analyse met behulp van de macrocommando's.
De beschreven softwarestrategie maakt vervolgens de TATS-netwerkorientatieanalyse voor alle componenten mogelijk. Gebruik hiervoor de “Directionality”-plugin (http://fiji.sc/Directionality)29,31, die histogramgegevens produceert die de orientatieverdeling van alle TATS-componentorientaties tonen. Als de x-as van de invoerafbeelding overeenkomt met de hoofdaxis van een gegeven AM- of VM-cel, worden de axiale (longitudinale) TATS-componenten weergegeven door de 0°-bak, terwijl de transversale componenten worden weergegeven door de 90°-bak. Figuur 8 toont voorbeeldhistogrammen van de directionaliteit uit geskeletiseerde TATS-afbeeldingen voor een VM (8A) versus een AM-cel (8B). Hoewel het directionaliteitshistogram van een typische VM een dubbele piekverdeling vertoont bij 0° en 90°, vertoont het AM-histogram één enkele dominante piek bij 0°. Deze voorbeelden komen overeen met eerdere waarnemingen dat individuele TATS-componenten van VM's bijna gelijkmatig zijn verdeeld tussen T-tubuli en A-tubuli, terwijl de TATS-componenten in AM's voornamelijk uit A-tubuli kunnen bestaan.

Figuur 8. Representatief directionaliteitshistogram van TATS-netwerken van individuele cellen. Directionaliteitshistogrammen werden gegenereerd uit geskeletiseerde beelden van individuele VM (A) versus AM (B) TATS-netwerken. Aangezien de x-as van het geanalyseerde beeld overeenkomt met de hoofd- (longitudinale) as van de myocyt zoals getoond, worden A-tubule componenten weergegeven door de 0°-bin, terwijl T-tubule componenten worden weergegeven door de 90°-bin. Gauss-fits zijn alleen toegepast op de belangrijkste histogrampiek, weergegeven als achtergrondgrafiek. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
| Perfusiebuffer | mM |
| NaCl | 120.4 |
| KCl | 14.7 |
| KH2PO4 | 0.6 |
| Na2HPO4 | 0.6 |
| MgSO4 | 1.2 |
| HEPES | 10 |
| NaHCO3 | 4.6 |
| Taurine | 30 |
| 2,3-butaandioon-monoxime | 10 |
| Glucose | 5.5 |
| pH 7.4 |
| Digestiebuffer | mM (tenzij anders vermeld) |
| NaCl | 120.4 |
| KCl | 14.7 |
| KH2PO4 | 0.6 |
| Na2HPO4 | 0.6 |
| MgSO4 | 1.2 |
| HEPES | 10 |
| NaHCO3 | 4.6 |
| Taurine | 30 |
| 2,3-butaandioon-monoxime | 10 |
| Glucose | 5.5 |
| Collagenase type II | 600 U/ml |
| pH 7.4 |
| Stopbuffer | mM (tenzij anders vermeld) |
| NaCl | 120.4 |
| KCl | 14.7 |
| KH2PO4 | 0.6 |
| Na2HPO4 | 0.6 |
| MgSO4 | 1.2 |
| HEPES | 10 |
| NaHCO3 | 4.6 |
| Taurine | 30 |
| 2,3-butaandioon-monoxime | 10 |
| Glucose | 5.5 |
| CaCl2 | 0.0125 |
| runderkalfserum | 10% |
| pH 7.4 |
Tabel 1. Buffersoplossingen. De samenstelling van drie verschillende fysiologische buffersoplossingen voor celisolatie en imaging is hier samengevat.