De Soft Agar Kolonie Formatie Assay

Samenvatting

De zachte agar-kolonievormingstest is een methode die wordt gebruikt om cellulaire ankeronafhankelijke groei in vitro te bevestigen. Het doel van dit protocol is om een strenge methode te illustreren voor de detectie van het tumorigene potentieel van getransformeerde cellen en de tumoronderdrukkende effecten van eiwitten op getransformeerde cellen.

Samenvatting

Onafhankelijke groei zonder verankering is het vermogen van getransformeerde cellen om onafhankelijk van een vaste oppervlakte te groeien, en wordt beschouwd als een kenmerk van carcinogenese. De zachte agar-kolonievormingstest is een goed gevestigde methode voor het karakteriseren van deze mogelijkheid in vitro en wordt beschouwd als een van de strengste tests voor maligne transformatie in cellen. Deze test maakt ook een semi-kwantitatieve evaluatie van deze mogelijkheid mogelijk in reactie op verschillende behandelingsomstandigheden. Hier zullen we de zachte agar-kolonievormingstest demonstreren met behulp van een muislongcarcinoomcellijn, CMT167, om de tumoronderdrukkende effecten van twee leden van de Wnt-signaleringsroute, Wnt7A en Frizzled-9 (Fzd-9), te demonstreren. Gelijktijdige overexpressie van Wnt7a en Fzd-9 veroorzaakte een remming van kolonievorming in CMT167-cellen. Dit toont aan dat expressie van het Wnt7a-ligand en zijn Frizzled-9-receptor voldoende is om tumorgroei te onderdrukken in een muislongcarcinoommodel.

Inleiding

De zachte agar kolonievorming assay is een techniek veel gebruikt om cellulaire transformatie in vitro evalueren. Historisch andere test de clonogene assay beschreven door Puck et al. In 1956 werd gebruikt om het vermogen van cellen om kolonies te vormen ¹ evalueren. In deze techniek werden cellen gedispergeerd op een kweekplaat en gekweekt in aanwezigheid van feeder-cellen of geconditioneerd medium noodzakelijke groeifactoren verschaffen. De beperking van deze techniek is dat het alleen informatie verstrekt over de vorming van kolonies. Normale cellen verhinderd verankering-onafhankelijke groei, door een bepaald type van apoptotische dood, genaamd anoikis ^2. Echter, getransformeerde cellen hebben het vermogen om te groeien en delen zonder binding aan een substraat. Om te profiteren van dit concept, onderzoekers ontwikkelden de zachte agar kolonievorming assay. De zachte agar kolonieformatie assay is sindsdien gewijzigd, in meer recente jaren, te sp pakkenecifieke behoeften. Eén variatie omvat incorporatie van fluorometrische kleurstof om voor high-throughput kolonie tellen. Een andere variatie omvat het gebruik van gespecialiseerde agar oplossing om voor het ophalen van levensvatbare cellen na kolonievorming bij eiwit of DNA monsters nodig.

In de traditionele zachte agar kolonievorming assay worden cellen gekweekt in een laag zachte agar gemengd met celkweekmedium die rust op een laag zacht agar, ook gemengd met celkweekmedium, maar dat een hogere concentratie van agar. Dit voorkomt dat cellen van het naleven van de cultuur plaat, maar toch maakt getransformeerde cellen tot zichtbare kolonies vormen. De grondgedachte achter deze techniek is dat normale cellen afhankelijk cel extracellulaire matrix contact kunnen groeien en delen. Omgekeerd getransformeerde cellen kunnen groeien en verdeel ongeacht hun omgeving. Daarom cellen in staat zijn om kolonies te vormen in een verankering-onafhankelijke wijze werden considered te transformeren en carcinogeen. Het algemene doel van deze methode is deze mogelijkheid in cellen te meten in een semi-kwantitatief en strikte manier.

De Wnt signaleringsroute is van cruciaal belang in de embryogenese en vaak gedereguleerde in het ontstaan ​​van tumoren ^3-6. Er zijn meerdere routes in verband met Wnt-signalering. De canonieke weg omvat Wnt signalisatie en regulatie van de downstream-gen transcriptie door haar effecten op de transcriptionele coactivator beta-catenine. Wnts signaal ook door verscheidene nietcanonieke trajecten, bijvoorbeeld de planaire celpolariteit signaalweg die elementen voor het cytoskeletstructuur ⁷ regelt, en de Wnt-route calcium, wat afgifte van calcium reguleert van het endoplasmatisch reticulum ^8. Wnt liganden oefenen hun activiteit uit door binding Frizzled receptoren. Hoewel verschillende Wnts is aangetoond opgereguleerd in longkanker, is Wnt7a aangetoond worden down-gereguleerd in niet-small cellige longkanker door promotor methylering ^9. Wnt7a bindt Fzd9 en fungeert als een tumor suppressor via een niet-canonieke route. Herstel van Wnt-7a en VaZuDo-9 remt de groei van niet-kleincellige longkankercellen ^10. De effecten van Wnt7a / Fzd9 worden gemedieerd door de activering van ERK-5, die op zijn beurt, activeert peroxisoom proliferator geactiveerde receptor γ (PPARy) ^11,12. Hier tonen we aan dat overexpressie van Wnt7a en Fzd9 resulteert in de onderdrukking van verankering-onafhankelijke groei van een muizen longcarcinoom cellijn. Murine CMT167 cellen werden afgeleid van een longcarcinoom in C57BL / lcrf muizen ¹³ en werden stabiel getransfecteerd met Wnt7A en Fzd9. Overexpressie van Wnt7A en Fzd9 werden bevestigd door kwantitatieve PCR (Q-PCR) en de functionaliteit van Wnt7A en Fzd9 overexpressie werd bevestigd door stroomafwaartse activering van PPARy.

Protocol

1. Voorbereiding van de materialen en reagentia

1. Label elk putje van een weefselkweek behandelde plaat met 6 putjes adequaat voor elke cellijn of aandoening onderzocht.
2. Bereid 2x celkweekmedium door het oplossen van 1 g poeder medium en 0,2 g natriumbicarbonaat in gedeïoniseerd water tot een eindvolume van 50 ml.
3. Geef dit medium door een 0,2 um filter te steriliseren.
4. Voeg extra componenten nodig voor normale kweek van de cellijn van belang. Zo groeien CMT 167 cellijn in RPMI 1640 medium aangevuld met 10% FBS en 1% penicilline / streptomycine oplossing. Warm medium tot 37 ° C in heet water bad vóór gebruik.
5. Bereid 1x celcultuurmedium afzonderlijk als u zou doen voor een normale cel cultuur van de cellijn van belang.
6. Bereid 1% noble-agar door 1 g nobel agar 100 ml gedeïoniseerd water.
   OPMERKING: Noble agar zal niet volledig oplossen met agitatie alleen.
7. Bereiden0,6% noble-agar door toevoeging van 0,6 g nobel agar 100 ml gedeïoniseerd water. Beide agar oplossingen kunnen worden gemaakt in 100 ml glazen flessen met afsluitbare deksels voor langdurige opslag.
8. Autoclaaf de nobele agar mengsels te steriliseren. Deze mengsels kunnen vooraf worden gemaakt en bewaard bij 4 ° C maar moet zij opnieuw worden verwarmd op het moment van het experiment tot de agar volledig is opgelost.
9. Bereid nitroblauwtetrazolium chloride oplossing door een 1 mg / ml voorraadoplossing in 1x PBS (8 g NaCl, 0,2 g KCl, 1,44 g Na ₂ HPO ₄ en 0,24 g KH ₂ PO ₄ in _H2O eindvolume van 1000 ml ). Dit wordt gebruikt aan het einde van het experiment om de kolonies vlekken.

2. Plating van onderlaag van Agar

1. Draai de dop op de fles van 1% nobel agar en magnetron voor ongeveer 1-2 min. Bij verwarming in een magnetron, toezicht houden op de oplossing dicht om te voorkomen dat overkoken. Verhit, terwijl intermitterend mengen,tot agar volledig is opgelost en de oplossing helder is.
   OPMERKING: Gebruik hittebestendige handschoenen om fles te behandelen na verhitting. Als u dit niet doet, kan brandwonden of ernstig letsel veroorzaken.
2. Plaats gesmolten agar-oplossing en voorverwarmde 2x kweekmedium in een ijs emmer gevuld met warm water uit de kraan (42 ° C). Plaats ook een 50 ml conische buis in een buis houder in het ijs emmer met heet water. Transfer emmer om celcultuur kap voor vervolgstappen.
3. Voor de onderste laag van agar, zult u 1,5 ml van een mix van agar en medium per well van een 6-well plaat nodig.
4. Om een ​​voldoende hoeveelheid van het mengsel te garanderen, stelt een totaal van 12 ml per 6-wells plaat.
5. Begin met het toevoegen 6 ml kweekmedium aan de 50 ml conische buis en vervolgens 6 ml van de 1% noble-agar oplossing.
6. Inverteer de conische buis herhaaldelijk te mengen. Werken in een vlot tempo zal voortijdige verharding van de zachte agar te voorkomen.
7. Opstellen van ongeveer 5,5 ml van het mengsel in een 5 ml serologische pipette.
8. Laat de luchtbellen te stijgen naar de top van de pipet kolom voor het deponeren van 1,5 ml van dit mengsel in elk putje. Wees voorzichtig om afzetting van eventuele luchtbellen te vermijden in de putjes.
9. Bedek de platen en laat agar mengsel stollen bij kamertemperatuur in celkweek kap, gedurende 30 min.

3. Plating de bovenste laag van Agar met cellen

1. Zodra de onderste laag van agar gestold, beginnen bereiding van de bovenlaag.
2. Eerst, oogst cellen door behandeling met trypsine en verdund ze 1: 5 in kweekmedium (bijvoorbeeld voor 1 ml trypsine wordt 4 ml medium) in een 15 ml conische buis.
3. Aantal cellen en bereken het aantal cellen nodig is per putje om een ​​uiteindelijke celsuspensie te bereiden op dit moment. Dit aantal zal variëren afhankelijk van celtype. Gebruik 5000 cellen / putje als uitgangspunt en indien nodig aanpassen. Voor dit aantal cellen, zou je een celsuspensie van 6667 cellen / ml te bereiden (dwz elke WELl wordt 0,75 ml van deze suspensie en 0,75 ml agar voor een totaal volume van 1,5 ml te ontvangen; de concentratie van cellen worden verdund 1: 2 bij een uiteindelijke totale celtelling 5000).
4. Het volume celsuspensie nodig per putje van een 6-wells plaat weer 1,5 ml. Bereid extra celsuspensie in totaal 12 ml per 6-well plaat.
5. Smelt 0,6% agar-oplossing in een magnetron als hierboven en het in een ijsemmer met warm water, samen met een 50 ml conische buis in een buis houder en de uiteindelijke celsuspensie van Stap 3.3.
6. Breng de ijsemmer met gesmolten 0,6% agar aan celkweek kap voor vervolgstappen.
7. Meng 0,6% agar en celsuspensie in een 1: 1 verhouding, het bereiden van een totaal volume van 12 ml per 6-wells plaat. 1.5 ml wordt per putje vereist maar extra moeten zijn zoals hierboven gesteld.
8. Pipetteer 6 ml celsuspensie in de 50 ml conische buis.
9. Vervolgens voegt 6 ml 0,6% agar aan de buis.
   OPMERKING: De temperatuur van dit mengsel moet zijngehouden rond 42 ° C om voortijdige uitharding te voorkomen en celoverleving maximaliseren.
10. Snel werkende, pipet dit mengsel 2-3x om cellen te verdelen, dan is het opstellen van 5,5 ml van het mengsel in een 5 ml serologische pipet.
11. Laat eventuele luchtbellen te laten stijgen naar de top van de pipet kolom voor het deponeren van 1,5 ml van dit mengsel in elk putje. Wees voorzichtig om afzetting van eventuele luchtbellen te vermijden in de putjes.
12. Laat cellen / agar mengsel stollen bij kamertemperatuur in celkweek kap, 30 min alvorens in een 37 ° C bevochtigde celkweek incubator.
13. De tijd vereist voor adequate kolonievorming verschilt voor elke cellijn, typisch rond 21 dagen.
14. Een laag groeimedium te handhaven over de bovenste laag agar aan uitdroging te voorkomen. 100 pl medium tweemaal per week toegevoegd volstaat hiervoor.

4. het kleuren van de platen en Counting Koloniën

1. Stain cellen door toevoeging van 200 _6, l nitroblauwtetrazolium chloride-oplossing per putje en incuberen platen overnacht bij 37 ° C.
2. Zodra kolonies zijn gekleurd, neem foto's van putten met behulp van een imager en tel kolonies met behulp van software voor beeldanalyse.

Resultaten

De expressie van Wnt7A en Fzd9 in CMT167 cellen effectief in tumorsuppressie, zoals blijkt uit onze zachte agar kolonievorming assay. Voorlopig gebruikten we Q-PCR aangetoond dat Wnt7A en Fzd9 mRNA expressie in lage niveaus in CMT167 cellen. CMT167 cellen vertoonden lage niveaus van endogeen Wnt7A en Fzd9 vergelijking met MLE-12 cellen, een met SV40 getransformeerde murine long epitheliale cellijn (Figuur 1). We vervolgens getransfecteerd CMT167 cellen met twee retrovirale overexpressie vectoren die de ...

Discussie

In vitro bevestiging van de tumor onderdrukkende functie van signaaleiwitten is moeilijk. Een van de meest rigoureuze testen waarover deze eigenschap onderzoeken is de zachte agar kolonievorming assay. Hier hebben we de zachte agar kolonieformatie test met behulp van een muizen longcarcinoomcellijn stabiel overexpressie Wnt7a en Fzd9 ten opzichte van zijn ouderlijke CMT167 cellijn geïllustreerd.

Er zijn een aantal belangrijke punten om te overwegen met betrekking tot de zachte agar ...

Materialen

Lijst van materialen gebruikt in dit artikel

Naam	Bedrijf	Catalogusnummer	Opmerkingen
Kankercellijn van belang	Sigma-Aldrich	10032302	CMT-167 Cellen
Gepoederd RPMI 1640 Medium	Gibco	31800-089	Wordt gebruikt om 2x celcultuurmedium voor te bereiden.
Vloeibaar RPMI 1650 Medium	Cellgro	10-040-CV	Wordt aangeduid als 1x celcultuurmedium.
Fetaal Runderserum	HyClone	SH30910.03	Wordt gebruikt om celcultuurmedium aan te vullen.
Penicilline/Streptomycine	CellGro	30-002-Cl	Wordt gebruikt in celcultuurmedium.
Difco Edele Agar	BD Biosciences	214230	Wordt gebruikt om 1,0% en 0,6% agar voor te bereiden.
Natriumbicarbonaat	Fisher	BP-328-1	Wordt gebruikt in 2x celcultuurmedium.
Trypsine	Cellgro	25-050-Cl
Steriele Flessenstopfilters	Fisher	09-761-126	Wordt gebruikt om 2x medium sterieel te filteren.
Lipofectamine Reagens	Invitrogen	18324-020	Wordt gebruikt in PPAR-RE luciferase assay.
6-well Platen, Tissue-cultuurbehandeld
37 °C/5% CO2 Incubator
Chemi-Doc Imager	Bio-Rad		Wordt gebruikt om foto's van kolonies te maken.
Quantity One Software	Bio-Rad		Wordt gebruikt om celkolonies te tellen.
15 ml Conische buizen
50 ml Conische buizen
250 ml Erlenmeyerkolven
Microgolfoven
5 ml Serologische pipetten
Pipettenusher
Micropipet
Hemacytometer met dekglas
Pipettipjes
Omgekeerde Lichtmicroscoop
Centrifuge
Hittebestendige Handschoenen
Saran Wrap
IJsemmer