Een abonnement op JoVE is vereist om deze inhoud te bekijken. Log in of start vandaag met uw gratis proefperiode.

Methodenartikel

Karakteriseren van de Samenstelling van moleculaire motoren op Moving Axonale Cargo Met behulp van "Cargo Mapping" Analyse

9.3K weergaven

⸱

DOI:

10.3791/52029

⸱

30 oktober 2014

* These authors contributed equally

In dit artikel

Samenvatting

Intracellulair transport van ladingen, zoals blaasjes of organellen, wordt uitgevoerd door moleculaire motoreiwitten die op gepolariseerde microtubuli volgen. Dit protocol beschrijft de correlatie van de directionele richting van transport van individuele vrachtdeeltjes die zich binnen neuronen bewegen, naar de relatieve hoeveelheid en het type van geassocieerde motoreiwitten.

Samenvatting

Inzicht in de mechanismen waarmee moleculaire motoren hun activiteiten coördineren om vesiculaire ladingen binnen neuronen vervoeren vereist de kwantitatieve analyse van motor / vracht verenigingen bij de enkele blaasje niveau. Het doel van dit protocol kwantitatieve fluorescentiemicroscopie gebruiken correlatie ("kaart") de positie en richting van de beweging van levende lading van de samenstelling en relatieve hoeveelheden van motoren verbonden met dezelfde lading. "Cargo mapping" bestaat uit levend beeldvorming van fluorescent gelabelde ladingen bewegen axons gekweekt op microfluïdische inrichtingen, gevolgd door chemische fixatie tijdens de opname van levende beweging en daaropvolgende immunofluorescentie (IF) kleuring van exact dezelfde axonale gebieden met antilichamen tegen motoren. Colokalisatie tussen ladingen en hun bijbehorende motoren wordt beoordeeld door het toewijzen van sub-pixel positie coördinaten naar motor en vracht kanalen, door het aanbrengen van Gaussische functies om de diffractie-limited puntspreidingsfuncties vertegenwoordigen individuele fluorescerende puntbronnen. Vaste lading en motorische beelden worden vervolgens gelegd op percelen van vracht-verkeer, tot "kaart" om hun bijgehouden trajecten. De sterkte van dit protocol is de combinatie van levende en IF gegevens aan voor het transport van vesiculaire ladingen in levende cellen opgetekend en motoren gekoppeld aan deze exact dezelfde vesicles te bepalen. Deze techniek overwint eerdere uitdagingen die biochemische methoden gebruiken om de gemiddelde motor samenstelling van gezuiverd heterogene bulk blaasje populatie te bepalen, omdat deze methoden niet composities op enkele bewegende lading onthullen. Bovendien kan dit protocol worden aangepast voor de analyse van andere transport- en / of handel trajecten in andere celtypes om de beweging van afzonderlijke intracellulaire structuren correleren met hun eiwitsamenstelling. Beperkingen van dit protocol zijn de relatief lage omzet hebben vanwege de lage efficiëntie van de transfectie van gekweekteprimaire neuronen en een beperkt gezichtsveld beschikbaar voor hoge-resolutie imaging. Toekomstige toepassingen kan werkwijzen omvatten het aantal neuronen tot expressie fluorescent gelabelde lading verhogen.

Inleiding

Intracellulair transport is essentieel in alle celtypes voor de afgifte van eiwitten, membranen, organellen, en signaalmoleculen verschillende cellulaire domeinen 1. Neuronen zijn zeer gespecialiseerd cellen met lange, gepolariseerde projecties die belangrijke mate afhangen van intracellulaire transport van essentiële goederen voor hun lange afstand levering aan diverse axonale microdomeinen. Dit transport wordt gemedieerd door kinesins en dyneins - twee grote families van de moleculaire motor eiwitten - die binden aan ladingen en spoor langs gepolariseerd microtubuli in anterograde en retrograde richtingen, respectievelijk. Terwijl retrograde beweging wor....

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Protocol

Alle experimenten werden uitgevoerd volgende goedgekeurde protocollen en volgens de institutionele richtlijnen voor de humane zorg van proefdieren. Pasgeborene muizen werden gedood door onthoofding.

1. Voorbereiding van Microfluïdische Inrichtingen voor Cell Culture

  1. Bereid polydimethylsiloxaan (PDMS) microfluïdische inrichtingen voor het kweken van hippocampale neuronen zoals beschreven door Harris en collega's 17-19. Hieronder zijn enkele wijzigingen die werden aangepast aan de lading mapping protocol.
    OPMERKING: microfluïdische inrichtingen zijn ook commercieel verkrijgbaar (Materials List), waardoor toe....

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Resultaten

Figuur 1 toont een overzicht van de microfluïdische inrichting waarmee hippocampale neuronen groeien (Figuur 1A, B). Neuronen worden uitgeplaat in reservoir 1. De grootte van de microkanalen voorkomt de diffusie van cellichamen (soma) in het axonale compartiment terwijl de lengte van de kanalen voorkomt dendritische uitsteeksels vanaf kruising tot aan het axonale compartiment. Na ~ 2-3 dagen in cultuur, beginnen de neuronen een verlenging van hun axonen over microkanalen in het axonale .......

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Discussie

De hier gepresenteerde protocol kan de correlatie van gerichtheid verkeer van individuele fluorescerende microtubule gebaseerde bewegende lading deeltjes met het type en de relatieve hoeveelheid geassocieerde motor eiwitten in levende neuronen. Eerder, de totale motor samenstelling van axonale vesiculaire lading werd getest op heterogene populaties van biochemisch gezuiverd blaasjes en organellen 9,15. Echter kenmerkend motor samenstelling voor één soort lading in cellen uitdagend v.......

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Openbaarmakingen

De auteurs hebben niets te onthullen.

Dankbetuigingen

We danken Ge Yang, Gaudenz Danuser, Khuloud Jaqaman en Daniel Whisler voor hun hulp bij de aanpassing en ontwikkeling van de software voor kwantitatieve cargo-mappinganalyses, en Emily Niederst voor haar hulp bij het maken van de microfluïdische apparaten. Dit werk werd gedeeltelijk ondersteund door NIH-NIA-subsidie AG032180 aan L.S.B.G., en het Howard Hughes Medical Institute. L.S. werd gedeeltelijk ondersteund door een NIH Bioinformatics Training Grant T32 GM008806, S.E.E. werd ondersteund door een Damon Runyon Cancer Research Foundation Fellowship, NIH Neuroplasticity Training Grant AG000216, en door een subsidie van The Ellison Medical Foundation New Scholar in Ag....

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Materialen

Lijst van materialen gebruikt in dit artikel
NaamBedrijfCatalogusnummerOpmerkingen
poly-L-lysineSigmaP5899-20mg
D-MEM (Dulbecco’s Modified Eagle Medium) High Glucose, w/ L-Glutamine, w/o Sodium Pyruvate (1x)Life Technologies11965092
FBS (Fetal Bovine Serum)Life Technologies10082147
Neurobasal-A Medium (1x)Life Technologies10888022
B-27 Serum Free SupplementLife Technologies10888022
GlutaMAX I Supplement (100x)Life Technologies35050061
HBSS (1x) (Hank’s Balanced Salt Solution)Life Technologies24020117
DPBS (Dulbecco’s Phosphate Buffered Saline, no Magnesium, no Calcium (1x)Life Technologies14190250
Penicillin/Streptomycin (100x)Life Technologies15140122
Corning cellgro Water for Cell Culture Fisher ScientificMT46000CM
PapainUSB Corporation19925
DL-cysteine HClSigma-AldrichC9768
BSA (bovine serum albumin)Sigma-AldrichA7906
D-glucoseSigma-AldrichG6152
DNAse I grade IIRoche Applied Sciences10104159001
Lipofectamine 2000Life Technologies 11668027
Formaldehyde Solution 16% EM GradeFisher Scientific50980487Let op: Schadelijk bij inademing, bij contact met de huid en indien ingeslikt. Irriterend voor ogen, ademhalingswegen en huid. Weggooien volgens de officiële voorschriften.
SucroseFisher ScientificS5-500
HEPESSigmaH-3375
Normal Donkey SerumJackson Immuno Research017-000-0121
BSA fatty acid and IgG freeJackson Immuno Research001-000-162
AcetoneFisher ScientificBP2403-4
EthanolFisher ScientificBP2818-100
ProLong Gold antifade reagentLife TechnologiesP36934
Cover Glass 1 1/2. 24 x 40 mmCorning2980-244
Axis microfluidic device, 450 µmMilliporeAX450
Adobe PhotoshopAdobe
Nikon Eclipse TE2000-U Nikon
Coolsnap HQ camera Roper Scientific
60 mm cell culture dishFisher Scientific12-565-95
150 mm cell culture dishFisher Scientific12-565-100
Antibodies Used:
Anti-Kinesin light chain, V-17Santa Cruz sc-13362specificiteit geverifieerd met behulp van KLC1-/- neuronen (Ref. 16), aanbevolen verdunning 1:100.
Anti Dynein Heavy Chain 1, R-325Santa Cruz sc-9115specificiteit geverifieerd met behulp van shRNA tegen DYN1HC1 (Ref. 16), aanbevolen verdunning 1:100
Alexa Fluor 568 Donkey Anti-Rabbit IgG AntibodyLife TechnologiesA10042 aanbevolen verdunning 1:200.
Alexa Fluor 647 Donkey Anti-Rabbit IgG (H+L) AntibodyLife TechnologiesA31573 aanbevolen verdunning 1:200.
Alexa Fluor 568 Donkey Anti-Goat IgG (H+L) Antibody IgG AntibodyLife TechnologiesA11057 aanbevolen verdunning 1:200.
Alexa Fluor 647 Donkey Anti-Goat IgG (H+L) AntibodyLife TechnologiesA21447 aanbevolen verdunning 1:200.
Plugins en Macro's
ImageJ http://imagej.nih.gov/ij/index.html. 
ImageJ Kymograph Pluginhttp://www.embl.de/eamnet/html/body_kymograph.html.

Referenties

  1. Goldstein, A. Y. N., Wang, X., Schwarz, T. L. Axonal transport and the delivery of pre-synaptic components. Curr. Opin. Neurobiol. 18, 495-503 (2008).
  2. Hirokawa, N. Kinesin and dynein superfamily proteins and the mechanism of organelle transport. Science.

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Herprints en machtigingen

Tags

FluorescentiemicroscopieLive ImagingImmunofluorescentiekleuringMicrofluïdische ApparatenSubpixel-colocalisatieGaussische FittingMotorcolocalisatieAxonaal Transport