$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
De extracellulaire matrix (ECM) bestaat uit een complexe reeks van structurele en verknopen van proteïnen zoals collageen, fibronectine en laminine. Hoewel het goed is vastgesteld dat de ECM levert belangrijke structurele steun voor cellulaire weefsels, is er steeds meer bewijs om aan te geven dat cellen actief inspelen op de fysieke veranderingen in hun ECM-omgeving om diverse cellulaire processen zoals overleving van de cel, differentiatie en celmigratie reguleren. Zo kunnen verschillen in stijfheid van de ECM mesenchymale stamcellen rijdt richting verschillende geslachten, met zachte substraten (~ 1 kPa) bevordering neurogene lineages terwijl stijve (~ 25 kPa) substraten te bevorderen osteogene differentiatie 1. Ook is een toename van de stromale matrix stijfheid aangetoond mammaire epitheelcellen tumorigenese en invasie in het omringende weefsel 2,3 promoten.
Een bijzonder interessant aspect van deze mechanosignaling activiteit leidt tot een proces dat durotaxis, waarbij cellen preferentieel migreren naar een stijver substraat 4,5. Cellen constant zin de fysische eigenschappen van de extracellulaire omgeving via integrine receptor binding aan de ECM. Dit bevordert op zijn beurt de ophoping van talrijke structurele en signaaleiwitten hun cytoplasmatische domeinen van de vorming van lijm structuren bekend als focale adhesies of focale contacten 6,7 drijven. Omdat integrinen zijn geen inherente enzymatische activiteit worden signalen doorgegeven vanuit het ECM door deze additionele eiwitten de reactie van de cel om hun veranderende omgeving 8 coördineren. Dienovereenkomstig is de identificatie en karakterisering van de belangrijkste eiwitten die betrokken zijn bij het reguleren mechanosignaling en durotaxis is een belangrijk onderzoeksgebied.
Verschillende modelsystemen ontwikkeld studeren durotaxis in vitro, maar de meeste hebbengebruikt met collageen beklede substraten polyacrylamide 4. Echter, de bereiding van de polyacrylamide substraten technische uitdaging en collageen die in deze testen moeten chemisch verknoopt aan het substraat 9 zijn. Polydimethylsiloxaan (PDMS) substraten bleken vergelijkbare mechanische eigenschappen vertonen om de substraten 10 polyacrylamide. Echter PDMS substraten bereid door eenvoudig mengen van een verhouding van de base om verknopingsmiddel en deze substraten kunnen worden bekleed met ECM eiwitten zonder chemische verknoping, waardoor PDMS makkelijker instrument om de effecten van starheid celgedrag bestuderen. Hierin beschrijven we hoe een eenvoudige durotaxis kamer waarin een zachte PDMS substraat is geïntegreerd met een stijve glazen dekglaasje bereiden.
De test, zoals hieronder wordt uiteengezet, verschaft een snelle en eenvoudige methode om durotaxis bestuderen. Voor deze studie gebruikten we de menselijke U2OS osteosarcoomcellen gecombineerd met siRNA-gemedieerdeknockdown van cdGAP om de rol van deze focale adhesie eiwit bestuderen durotaxis 11. Belangrijk is, kan dit protocol gemakkelijk worden aangepast aan de individuele behoeften. Andere celtypen kunnen worden gesubstitueerd voor de U2OS cellen en elk eiwit kan worden neergeslagen of overexpressie gebracht om de effecten op celgedrag tijdens durotaxis bepalen. Bovendien kan dit protocol worden aangepast aan fluorescent gemerkte eiwitten te nemen om hun dynamiek en gedrag met behulp van FRAP of FRET benaderingen te analyseren.