$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Een verandering van eiwit subcellular localisatie is een gemeenschappelijk mechanisme in reactie op interne of externe signalen zoals hittestress, honger, oxidatieve stress, apoptosis, proteïne fosforylatie en anderen. Bijvoorbeeld induceert hittestress een FOXO lid1,2van de nucleaire translocatie van de DAF-16 en de pro-apoptotic BCL-2 eiwit die bod translocates aan de mitochondriën bij ontvangende overlijden signalering van3,4. Verschillende technieken zijn beschikbaar om deze wijzigingen te herkennen. Een combinatie van het westelijke bevlekken en biochemically isoleren subcellular structuren (bv, mitochondriën of de kernen) konden goed het bereiken van de doelstelling3. Het vereist echter een specifiek antilichaam tegen het eiwit van belang. Zo wordt een gevestigde antilichaam de sleutel tot het succes. Een alternatieve benadering is etikettering van verschillende subcellular structuren of organellen met verschillende markeringen zoals groene fluorescentie proteïne (GFP), rode fluorescentie eiwit (RFP), gele fluorescentie eiwit (YFP) en mCherry, en ondertussen de proteïne van label belang met andere markeringen. Dan, om hen onder een confocal microscoop te lokaliseren de doelstellingen5,6te observeren. Radioactieve isotopen zijn een alternatieve keuze voor het benoemen van doel eiwitten en vervolgens hun subcellular localisatie7opsporen. Echter, deze methode vereist een goede opleiding en de behandeling van radioactief afval. Omstandigheden zoals het gebrek aan een specifiek antilichaam, het ontbreken van een goede marker, of de schaarste van apparatuur, zoals een confocal microscoop moet een alternatieve aanpak worden overwogen. Ter identificatie van een nucleaire translocatie van eiwit, is het aantrekkelijk label alleen de doel-eiwitten met een marker en vlek kernen met het chemisch reagens 4', 6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) omdat dit alleen een regelmatige fluorescentie Microscoop vereist.
Immunolabeling, C. elegans met antilichamen is uitdagend vanwege de lage permeabiliteit van de "eggshell" of de collagene cuticle rondom het dier. Ondertussen, aangezien C. elegans eiwitten beduidend verschillend van hun gewervelde orthologs zijn, een paar commerciële bedrijven voorzien van C. elegans specifieke producten. Het is moeilijk voor een klein laboratorium voor het genereren van C. elegans antilichamen voor zichzelf. Onderzoekers in de Gemeenschap gebruiken vaak tagged eiwitten als markers om aan te tonen van een eiwit lokalisatie of gen-expressie. In dit artikel gebruikt EXL-1::GFP als voorbeeld voor het bijhouden van een nucleaire translocatie van eiwit onder hitte stress8. Een geïntegreerde translationeel exl-1::gfp in het genoom van dieren wordt gebruikt om het stabiel express het gen met gfp fusie. Onderzoek heeft uitgewezen dat exl-1 wordt uitgedrukt in de darm, lichaam muur spier en andere subcellular structuren8. Dit protocol laat zien hoe om te synchroniseren van wormen naar de vierde larvale fase (L4), voert u een hitte stress experiment, en gedrag DAPI kleuring, ethanol fixatie, aceton fixatie en beeldvorming onder een regelmatige fluorescentie Microscoop.