$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Transgene anophelinemuggen die worden gegenereerd om niet-gene drive of autonome gene-drive modificaties te dragen, worden opgezet voor kooiproeven zoals beschreven in de sectie Protocollen. De representatieve resultaten die hier worden getoond, tonen de fenotypedynamiek van de best presterende replicaties van elk van de kooiproeven uitgevoerd door Pham et al. (2019) 2 voor Anopheles stephensi muggen. De drie onderzoeken (respectievelijk 1 - 3: inundatieve niet-gene drive, overlappende gene-drive en niet-overlappende gene-drive) varieerden in verschillende parameters, zoals de grootte van de kooi (0,216 m3 versus 0,005 m3), of de doelpopulatie al dan niet leeftijdsgestructureerd was, bron van bloedmeel (muizen of kunstmatige feeder) en afgifteverhoudingen. Als representatiemiddel toont figuur 6 de waargenomen gegevens die zijn geselecteerd uit dezelfde afgifteverhouding (1:1) voor alle drie de gebruikte protocollen, in de loop van zeven generaties.
De 1:1 non-drive release bereikt >80% transgen introductie binnen 6-7 generaties. Voor transgene kooiproeven met gene-drive bereiken de 1:1-releases in zowel de niet-overlappende als overlappende protocollen dit niveau binnen 3-4 generaties, waardoor de verwachting wordt gevalideerd dat een enkele release van een gene drive-systeem efficiënter kan zijn dan niet-drive inundatieve releases voor transgene introductie. Het snellere traject kan ook worden bevestigd door de helling van de trendlijnen. Beide gene-drive protocollen, ondanks verschillende opstellingen, presenteren vergelijkbare hoeken en hellingstrends. Aan het einde van de observatie bereiken niet-aangedreven kooien ~ 80% van de individuen die het transgen dragen, terwijl kooien met gene-drive individuen volledige (of bijna volledige) introductie bereiken. Volledige gegevens en verwerkingsdetails over individuele experimentresultaten met behulp van de hier beschreven protocollen zijn te vinden in figuren 1-3 van Pham et al. (2019) 2, Figuren 2-3 van Carballar-Lejarazú et al. (2020) 3 en figuur 3 van Adolfi et al. (2020) 4.

Figuur 1. Niet-drive inundative release trial schematisch. Negen kooien van 0,216 m3 zijn opgezet met 60 wild-type second-instar (gemengde geslachten) larven toegevoegd aan elk. Vanaf week 3 krijgen vrouwtjes wekelijks een bloedmaal en worden eieren verzameld en uitgebroed. Tot week 8 worden wekelijks 60 larven willekeurig geselecteerd en teruggebracht naar hun respectievelijke kooien om een leeftijdsgestructureerde populatie in de kooien te creëren (beginfase). Vanaf week 9 worden de negen kooien willekeurig toegewezen in drievoud op basis van hun transgene: wild-type mannelijke afgifteverhoudingen (experimentele fase). Kooien A (Control) hebben geen transgene poppen toegevoegd. Vrouwtjes krijgen wekelijks een bloedmaal en eieren worden verzameld, uitgebroed en grootgebracht om poppen te krijgen. 30 mannelijke en 30 vrouwelijke wilde poppen worden weer aan hun kooien toegevoegd. Kooien 1:1 hebben nog eens 30 transgene mannelijke poppen toegevoegd. Kooien 1:0.1 hebben nog eens 300 transgene mannelijke poppen toegevoegd. 300 larven uit elk van de 9 kooien worden willekeurig geselecteerd en gescreend op de fluorescerende marker. Deze procedure werd wekelijks herhaald tot transgene fixatie (gestabiliseerde verhouding van transgeen-wildtype muggen na een paar generaties). Aangepast van Pham et al. (2019) 2. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 2. Bloedtoevoer van kooipopulaties. (A) Verdoofde muizen of (B) Hemotek-bloedvoeders worden aangeboden voor bloedvoedende vrouwelijke muggen op respectievelijk de kooien van 0,216 m3 of de kleine kooien van 0,005 m3 . Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 3. Screening van fenotypes op niet-drive, overlappende gene-drive en niet-overlappende gene-drive cage trials. Fluorescerende beelden van een larve, pop en volwassene van transgene of wild-type fenotypes. In dit voorbeeld werden An. stephensi-individuen gescreend op de DsRed-marker aangedreven door de 3xP3-promotor in de ogen (DsRed + of DsRed-), zichtbaar in alle drie de stadia, en volwassenen werden gescreend op seks ( ♀ of ♂ ). Let op de achtergrondfluorescentie in wild-type larven geassocieerd met de voedselbolus in het midgut. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 4. Overlappend schema van de gene-drive kooiproef. Zes kooien van 0,216 m3 zijn in drievoud opgesteld volgens hun gene-drive:wild-type mannelijke afgifteverhoudingen. Aan elke kooi werden 120 wildtype mannetjes en 120 wildtype vrouwtjes toegevoegd. Kooien met een 1: 1 gene-drive mannelijke release ratio hadden nog eens 120 transgene mannetjes toegevoegd. Kooien met een 1:10 mannelijke release ratio hadden nog eens 12 transgene mannetjes toegevoegd. Tot volledige introductie van het transgen, elke 3 weken, worden volwassen vrouwtjes voorzien van bloedmeel en worden eieren verzameld en uitgebroed. In totaal werden 240 larven willekeurig geselecteerd en teruggebracht naar hun respectievelijke kooien. Driehonderd (300) larven worden willekeurig geselecteerd en gescreend op de dominante marker. Ze worden later gescreend als poppen en volwassenen voor oogkleur en seks. Er worden geen extra transgene mannetjes toegevoegd aan de oorspronkelijke kooien. Aangepast van Pham et al. (2019) 2. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 5. Niet-overlappend gene-drive kooi trial schema. Negen kleine kooien van 0,005 m3 zijn in drievoud opgesteld op basis van hun gene-drive:wild-type mannelijke afgifteverhoudingen. Kooien met een 1: 1 mannelijke release ratio hebben 100 wild-type vrouwtjes, 50 wild-type mannetjes en 50 gene-drive mannetjes toegevoegd. Kooien met een 1: 3 mannelijke release ratio hebben 100 wild-type vrouwtjes, 75 wild-type mannetjes en 25 gene-drive mannetjes toegevoegd. Kooien 1:10 mannelijke release ratio hebben 100 wild-type vrouwtjes, 90 wild-type mannetjes en 9 gene-drive mannetjes toegevoegd. Vrouwtjes krijgen een bloedmaaltijd en eieren verzameld en uitgebroed. Voor 1:1 en 1:3 kooien worden 200 larven willekeurig geselecteerd en gebruikt om nieuwe kooien te bevolken, gescheiden van die van hun ouders, voor de volgende generatie. Nog eens 500 larven worden willekeurig geselecteerd en opgevoed tot poppen, wanneer ze worden gescreend op het dominante markergen. De 500 poppen worden vervolgens opgevoed tot volwassenen en gescoord op geslacht. Alle resterende larven worden gescreend op de marker. Voor de 1:10 kooien worden alle larven gescoord in generaties 1-12 en 200 larven die de bestaande transgenfrequentie weerspiegelen, worden gebruikt om nieuwe kooien te bevolken. Vanaf generatie 13 zijn deze kooien identiek opgesteld als de 1:1 en 1:3 kooien. Aangepast van Pham et al. (2019) 2 en Carballar-Lejarazú et al. (2020) 3. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 6. Voorspelde transgene fixatiedynamiek voor de verschillende populatievervangende kooiproeven. Weergave van de verwachte fenotypedynamiek van de best presterende replicaties voor elk van de kooiproeven uitgevoerd door Pham et al. (2019) 2, gemonitord over 7 generaties. Het instellen van experimenten wordt beschreven in de protocollen. De voorspellingen zijn gebaseerd op gegevens van alle 9 experimenten op de 1:1 release modellen (drievoudige replicaties voor elk van de drie verschillende kooiproefprotocollen). De X-as is het generatienummer na de eerste introductie en de Y-as is het aandeel larven dat het DsRed-markerfenotype (DsRed+) in de loop van de tijd vertoont. Stippellijnen vertegenwoordigen lineaire trendlijnen van de gegevens. Het DsRed+ fenotype is het gevolg van het hebben van ten minste één kopie van het gemodificeerde allel. Vandaar dat de resultaten de verspreiding van het transgen weerspiegelen, versneld in het gene drive-systeem, en aan het einde van de observatie (bijna) volledige introductie bereikt. Voor de variabiliteit tussen replicaties en volledige gedetailleerde gegevens over de experimenten, verwijzen wij u naar Pham et al. (2019) 2, Carballar-Lejarazú R et al. (2020)3 en Adolfi A et al. (2020)4. Afbeeldingen aangepast van Pham TB et al. (2019) Experimentele populatiemodificatie van de malariavectormug, Anopheles stephensi. PLOS Genet 15(12): e1008440. doi: 10.1371/journal.pgen.1008440, Adolfi A et al. (2020) Efficient population modification gene-drive rescue system in the malaria mosquito Anopheles stephensi. Nat Commun 11(1): 5553. doi: 10.1038/s41467-020-19426-0 en Carballar-Lejarazú R et al. (2020) Next-generation gene drive for population modification of the malaria vector mosquito, Anopheles gambiae. Proc Natl Acad Sci USA 117(37):22805-22814. DOI: 10.1073/pnas.2010214117. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Aanvullend dossier: De bouw van de koloniekooi van 0,005 m3. Klik hier om dit bestand te downloaden.