Dit protocol beschrijft het gebruik van commerciële, celvrije eiwitexpressiekits om membraaneiwitten te produceren die worden ondersteund in nanodisc die kunnen worden gebruikt als antigenen in subunitvaccins.
Methodenartikel
* These authors contributed equally
Dit protocol beschrijft het gebruik van commerciële, celvrije eiwitexpressiekits om membraaneiwitten te produceren die worden ondersteund in nanodisc die kunnen worden gebruikt als antigenen in subunitvaccins.
Subunitvaccins bieden voordelen ten opzichte van meer traditionele geïnactiveerde of verzwakte van hele cellen afgeleide vaccins op het gebied van veiligheid, stabiliteit en standaardproductie. Om een effectief op eiwitten gebaseerd subunitvaccin te bereiken, moet het eiwitantigeen vaak een inheems-achtige conformatie aannemen. Dit is vooral belangrijk voor pathogeen-oppervlakte-antigenen die membraangebonden eiwitten zijn. Celvrije methoden zijn met succes gebruikt om correct gevouwen functioneel membraaneiwit te produceren door de co-translatie van nanolipoproteïnedeeltjes (NLP's), algemeen bekend als nanodiscs.
Deze strategie kan worden gebruikt om subunitvaccins te produceren die bestaan uit membraaneiwitten in een lipidegebonden omgeving. De celvrije eiwitproductie is echter vaak beperkt tot kleinschaligheid (<1 ml). De hoeveelheid eiwit die in kleinschalige productieruns wordt geproduceerd, is meestal voldoende voor biochemische en biofysische studies. Het celvrije proces moet echter worden opgeschaald, geoptimaliseerd en zorgvuldig worden getest om voldoende eiwit te verkrijgen voor vaccinstudies in diermodellen. Andere processen die betrokken zijn bij de productie van vaccins, zoals zuivering, adjuvante toevoeging en lyofilisatie, moeten parallel worden geoptimaliseerd. Dit artikel rapporteert de ontwikkeling van een opgeschaald protocol om een membraangebonden eiwitsubeenheidvaccin tot expressie te brengen, te zuiveren en te formuleren.
Geschaalde celvrije reacties vereisen optimalisatie van plasmideconcentraties en -verhoudingen bij gebruik van meerdere plasmide-expressievectoren, lipidenselectie en adjuvante toevoeging voor productie op hoog niveau van geformuleerde nanolipoproteïnedeeltjes. De methode wordt hier gedemonstreerd met de expressie van een chlamydiaal major outer membrane protein (MOMP), maar kan op grote schaal worden toegepast op andere membraaneiwitantigenen. De effectiviteit van antigeen kan in vivo worden geëvalueerd door middel van immunisatiestudies om de productie van antilichamen te meten, zoals hier wordt aangetoond.
Prokaryote of eukaryote lysaten voor celvrije expressie van eiwitten zijn gemakkelijk verkrijgbaar als commerciële producten voor het synthetiseren van eiwitten van belang (voor een volledig overzicht, zie 1). Deze expressiesystemen zijn beschikbaar op verschillende schalen en maken gebruik van lysaten van verschillende organismen, waaronder E. coli, tabaksplanten en zoogdierculturen. Celvrije lysaten bieden meerdere voordelen ten opzichte van traditionele recombinante eiwitproductiebenaderingen, waaronder gebruiksgemak en robuuste, snelle eiwitproductie. Hoewel deze benaderingen voornamelijk worden gebruikt om oplosbare eiwitten te produceren, heeft deze groep een baanbrekende aanpak ontwikkeld voor het gebruik ervan om membraaneiwitten tot expressie te brengen.
Deze nieuwe benadering brengt kleine wijzigingen aan in bestaande celvrije expressiesystemen door DNA op te nemen dat codeert voor twee eiwitproducten voor expressie, een apolipoproteïne en het membraaneiwit van belang. Het tot expressie gebrachte apolipoproteïne (derivaten van ApoA1 of ApoE4) interageert met lipiden die aan het celvrije lysaat worden toegevoegd om spontaan (~ 20 nm) NLP's samen te stellen. Wanneer het membraaneiwit wordt gecombineerd met een membraaneiwit van belang, vormen het NLP- en membraaneiwit een oplosbaar nanodeeltjescomplex waarin het membraaneiwit is ingebed in de NLP-lipidebilaag. Het membraaneiwit is dus toegankelijker voor downstream-toepassingen, omdat het zich in oplosbare, discrete deeltjes bevindt. Deze aanpak kan functionele oligomere eiwitcomplexen produceren binnen de NLP bilayer2 en kan de antigeencomponent van een subunitvaccin produceren, die vervolgens wordt gemengd met lipofiele adjuvantia om een nanodeeltjesvaccin te vormen met co-gelokaliseerd antigeen en adjuvans dat geschikt is voor in vivo beoordeling.
Deze huidige methode is aangepast van een eerder gepubliceerd protocol3. Belangrijke modificaties zijn gericht op de opschaling van de celvrije reactie en de daaropvolgende zuivering van het eiwit-NLP-complex. Een verdere wijziging omvat de toevoeging van een amfifiel polymeer dat bekend staat als een telodendrimeer, dat eerst wordt gemengd met de lipiden voordat het wordt toegevoegd aan de celvrije reactie. Co-translatie van de plasmiden in aanwezigheid van de telodendrimer en de lipiden levert een telodendrimer NLP (tNLP) op. De toevoeging van de telodendrimer helpt ook bij het moduleren van de grootte en monodispersiteit van de resulterende tNLP nanodeeltjes4. Dit protocol is specifiek geoptimaliseerd voor grootschalige vaccinstudies om een membraangebonden subeenheidsantigeeneiwit te produceren, chlamydiaal MOMP 5,6. De methode produceert recombinant MOMP geassocieerd met tNLP om een zeer oplosbaar MOMP-tNLP-complex te vormen dat MOMP-oligomerisatie behoudt. Een typische opschalingsproductie van 3 ml levert >1,5 mg gezuiverde MOMP op. De celvrij geproduceerde MOMP-tNLP is vatbaar voor snelle adjuvante toevoeging voor in vivo immunogeniciteitstests.
Alle dierstudies werden uitgevoerd aan de Universiteit van Californië, Irvine, in public health service (PHS) -verzekerde faciliteiten in overeenstemming met de richtlijnen van de Institutional Animal Care and Use Committee.
1. Glaswerk voorbereiding
OPMERKING: Alle materialen die worden gebruikt bij het produceren van vaccinformuleringen voor dieren zijn endotoxinevrij.
2. Buffervoorbereiding
3. Reactie voorbereiding
4. Celvrije productie van MOMP-tNLP's voor subunitvaccinformuleringen
5. MOMP-tNLP zuivering
6. Analyse door SDS-PAGE
OPMERKING: Alle elutiefracties moeten worden geanalyseerd door SDS-PAGE om te screenen op hoeveelheid en zuiverheid van het eiwit van belang.
7. Western en dot blots en opslag
8. Beoordeling van endotoxine
9. Lyofilisatie
10. Adjuvante toevoeging
OPMERKING: Deze en andere soortgelijke op NLP gebaseerde sub-unit vaccinformuleringen kunnen gemakkelijk lipofiele adjuvantia zoals CpG-ODN1826 en FSL-1 bevatten. CpG-ODN1826 is een gemodificeerd klasse B CpG-oligonucleotide (5'-tccatgacgttcctgacgtt-3') met een volledige fosforothioaatruggegraat met een 5' cholesterolgroep (5'-chol-C6). De conjugatie van CpG-ODN1826 aan tNLP's wordt gemedieerd door de hydrofobe interacties tussen de cholesterolgroep en de fosfolipide bilaag van de tNLP en is aangetoond en goed gekarakteriseerd, zoals eerder gemeld 9,10.
11. Serum testen
Het SDS-PAGE-profiel van de Ni-affiniteitszuivering van MOMP-tNLP uit een celvrije reactie van 1 ml is weergegeven in figuur 1B. De reactie resulteerde in hoge expressieniveaus voor zowel het MOMP- als het Δ49ApoA1-eiwit. Eerdere resultaten toonden aan dat de celvrije expressie van Δ49ApoA1 in aanwezigheid van DMPC en telodendrimer resulteerde in de vorming van telodendrimer nanolipoproteïnedeeltjes (tNLPs)4. De co-elutie van MOMP met Δ49ApoA1 gaf aan dat MOMP geassocieerd is met tNLPs, omdat de His-tag alleen aanwezig is op de tNLP-steiger Δ49ApoA1 en niet op MOMP. MOMP is een zeer onoplosbaar eiwit dat alleen kan worden geëlueerd door complexering met tNLPs, waarvan is aangetoond dat het de oplosbaarheid van membraaneiwitten vergemakkelijkt.
De elutiefracties die MOMP-tNLP's bevatten, werden samengevoegd en de totale eiwitconcentratie werd bepaald met behulp van een op fluorescentie gebaseerd kwantificeringsapparaat, of een apparaat dat de concentratie meet door absorptie bij 280 nm, volgens de instructies van de fabrikant voor eiwitkwantificering. Om een nauwkeurige dosering van het MOMP-vaccin mogelijk te maken, is het ook belangrijk om de concentratie MOMP in de gezuiverde complexen te bepalen. We ontwikkelden een methode om MOMP te kwantificeren op basis van geldensitometrie (figuur 2) waarbij een gezuiverde recombinant MOMP met bekende concentratie als standaard werd gebruikt. Door de standaardcurve vast te stellen en te vergelijken met het MOMP-tNLP-monster, kan de MOMP-concentratie nauwkeurig worden gekwantificeerd. Aan de hand van de bepaling van de MOMP-concentratie in het gezuiverde monster kon de opbrengst van MOMP in celvrije reacties op verschillende schalen worden geschat, wat belangrijk is voor het plannen van de reactieopstelling die geschikt is voor downstreamstudies (tabel 3).
MOMP moet oligomeren vormen om een robuuste immuunrespons op te wekken11. Om de oligomere toestand van MOMP te testen, werd MOMP-tNLP geanalyseerd in de aan- en afwezigheid van zowel warmte als het reductiemiddel dithiothreitol (DTT, 50 mM, figuur 3A). Hogere orde oligomeren van MOMP werden geïdentificeerd via SDS-PAGE wanneer monsters niet werden behandeld met warmte en DTT. Ter vergelijking: monsters die met warmte werden behandeld in aanwezigheid van DTT vertoonden voornamelijk twee verschillende banden op de gel, overeenkomend met MOMP en Δ49ApoA1 (respectievelijk ongeveer 40 kDa en 22 kDa). Deze resultaten lijken sterk op het gelbandpatroon dat wordt toegeschreven aan oligomeervorming van MOMP, wat van cruciaal belang is voor de effectiviteit ervan.
Verdere western blot-analyse met MAb40, een antilichaam tegen het lineaire epitoop op het variabele domein van MOMP-eiwit, toonde een vergelijkbaar bandingpatroon, wat de oligomeervorming door MOMP-eiwit in niet-gedenatureerde toestand bevestigde (figuur 3B). Een belangrijke factor die de vorming van MOMP-oligomeren beïnvloedt, is de verhouding tussen het MOMP-plasmide en het Δ49ApoA1-plasmide tijdens de celvrije reactie-opstelling. Tabel 4 geeft een overzicht van de verhouding van plasmiden en de resulterende insertiesnelheid van MOMP in tNLPs. Eerdere studies gaven aan dat chlamydia MOMP en andere buitenmembraaneiwitten voornamelijk als trimers kunnen bestaan12. Om de trimervorming in de celvrije reactie te maximaliseren, is het wenselijk om de insertiesnelheid dicht bij drie MOMP-eiwitten per NLP te hebben, wat overeenkomt met een ~25:1 MOMP-to-Δ49ApoA1 plasmideverhouding.
Een dot blot assay werd gebruikt als een meer gestroomlijnde methode om de aanwezigheid van MOMP en tNLP te detecteren. Het MAb40-antilichaam werd gebruikt om totale MOMP te detecteren. Het MAbHIS-antilichaam gericht op de His-tag op de Δ49ApoA1-steiger van de tNLP werd gebruikt om de aanwezigheid van tNLP te beoordelen. De co-signalering van MAb40- en MAbHIS-antilichamen duidde op MOMP-tNLP-vorming. De controlereactie produceerde lege tNLP, die alleen een positief signaal van MAbHIS liet zien (figuur 3C). Om de immunogeniciteit van MOMP-tNLPs geproduceerd in de celvrije reactie te testen, hebben we MOMP-tNLP geadjuveerd met CpG + FSL-1 en intramusculair (i.m.) geïnjecteerd in muizen in een prime-boost regime zoals hierboven beschreven. Sera werden verzameld van de geïmmuniseerde muizen en MOMP-specifiek IgG-antilichaam werd gemeten met behulp van een western blot-test (figuur 4). De sera van muizen geïnjecteerd met geadjuveerde MOMP-tNLP vertoonden een sterke MOMP-binding, wat aangeeft dat MOMP-tNLP in vivo een immuunrespons kon uitlokken.

Figuur 1: Expressie en zuivering van MOMP-tNLP. (A) Afbeelding van buisjes met kleine aliquots van een celvrije reactie die met succes GFP-controles tot expressie bracht die lumineren onder UV-lichtbron (rechts) in vergelijking met lysaten zonder GFP-plasmide (links). (B) Protein Gel gekleurd met SYPRO Ruby na SDS-PAGE toont het zuiveringsprofiel van MOMP-tNLP. MOMP migreert met 40 kDa en de 49ApoA1 migreert met 22 kDa. Afkortingen: MOMP = chlamydia major outer membrane protein; tNLP = telodendrimer nanolipoproteïne deeltje; MOMP-tNLP = MOMP-tNLP complex; GFP = groen fluorescerend eiwitcoderend plasmide; MW = Molecuulgewichtsmarker; T = totaal celvrij lysaat; FT = doorstroming; R1-R3 = celvrije reactie-aliquots; W1, W6 = Wast 1 en 6; E1-E7 = Elutions 1 tot en met 7; Δ49ApoA1 = His-tagged muis ApoA1 afgeleide. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 2: Kwantificering van MOMP in MOMP-tNLP monsters. (A) SDS-PAGE gel gekleurd met SYPRO Ruby voor de kwantificering van MOMP. Recombinant MOMP met bekende concentratie werd op de gel geladen om de standaardcurve te verkrijgen. Elke baan bevatte 0,1 μg, 0,5 μg, 1,0 μg, 2,0 μg en 4,0 μg MOMP. MOMP-tNLP-monsters die werden gekwantificeerd, werden op dezelfde gel geladen. (B) De MOMP-concentratiestandaardcurve werd gegenereerd met behulp van densitometrie. Er werd een vergelijking gemaakt met betrekking tot de genormaliseerde banddichtheid en de hoeveelheid MOMP. De vergelijking werd gebruikt om het MOMP-gehalte in de onbekende monsters te berekenen. Afkortingen: MOMP = chlamydia major outer membrane protein; tNLP = telodendrimer nanolipoproteïne deeltje; MOMP-tNLP = MOMP-tNLP complex; SDS-PAGE = natriumdodecylsulfaat polyacrylamide gel elektroforese. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 3: Celvrij geproduceerde MOMP-tNLP stelt MOMP in staat om hogere-orde structuren te vormen. (A) SDS-PAGE gel van MOMP-tNLP met en zonder behandeling van warmte en reductiemiddel DTT, gekleurd met SYPRO Ruby. Met warmte en DTT verscheen MOMP voornamelijk als een monomeerband bij ~ 40 kDa, omdat warmte en het reductiemiddel de meerderheid van de MOMP-structuur van de hogere orde afbraken. Bij afwezigheid van warmte en DTT waren de hogere-ordebanden aanwezig, wat wijst op MOMP-oligomeerconformatie. B) Western blot van MOMP-tNLP en MOMP alleen, onbehandeld en behandeld met warmte en DTT. Na overdracht werd het membraan gesondeerd met MAb40 (1:1.000 verdunning). Een bandingpatroon vergelijkbaar met de SYPRO Ruby-gekleurde gel werd waargenomen, wat bevestigt dat de hogere molecuulgewichtsbanden inderdaad MOMP-oligomeren waren. (C) Dot blot van MOMP-tNLP en lege tNLP-monsters (in tweevoud) onderzocht met MAb40 en MAbHIS. Afkortingen: MOMP = chlamydia major outer membrane protein; tNLP = telodendrimer nanolipoproteïne deeltje; MOMP-tNLP = MOMP-tNLP complex; SDS-PAGE = natriumdodecylsulfaat polyacrylamide gel elektroforese; DTT = dithiothreitol. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 4: Celvrij geproduceerde MOMP-tNLP is zeer immunogeen. Serum van geïmmuniseerde muizen vertoonde een sterk anti-MOMP IgG-signaal. MOMP-tNLP adjuvans met CpG + FSL-1 werd gebruikt om muizen te immuniseren. Sera van zes geïmmuniseerde muizen werden verzameld, gepoold en gebruikt om MOMP-tNLP te onderzoeken. Het serum kon binden aan MOMP in een western blotting assay en vertoonde een sterk IgG-signaal (links). De western blot met MAb40 als primair antilichaam (rechts) vertoonde vergelijkbare banden, wat aangeeft dat het serum MOMP-specifiek IgG bevatte. Afkortingen: MOMP = chlamydia major outer membrane protein; tNLP = telodendrimer nanolipoproteïne deeltje; MOMP-tNLP = MOMP-tNLP complex; CpG = cholesterolgemodificeerd CpG-adjuvans; FSL-1 = lipofiel adjuvans. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
| Buffernaam | NaH2PO4 | NaCl | Imidazool | Ph |
| Bindingsbuffer | 50 mM | 300 mM | 10 mM | 8.0 |
| Wasbuffer | 50 mM | 300 mM | 20mM | 8.0 |
| Elutiebuffer 1 | 50 mM | 300 mM | 250mM | 8.0 |
| Elution Buffer 2 | 50 mM | 300 mM | 500 mM | 8.0 |
Tabel 1: Lijst van buffers die nodig zijn voor nikkelaffiniteitszuivering met details over de concentraties van elke component en pH.
| Runtime | 50 min |
| Debiet | 6,0 ml/min |
| Type verloop | Binair |
| Buffer A | 10 mM TEAA in H20 |
| Buffer B | MeCN |
| Gradiënt | % Buffer B |
| 0 min | 25% |
| 30 min | 60% |
| 30,5 min | 100% |
| 40 min | 100% |
| 40,5 min | 25% |
| 50 min | 25% |
Tabel 2: Voorwaarden voor omgekeerde fase HPLC-zuivering van cholesterolgemodificeerd CpG. Afkortingen: TEAA = triethylammoniumacetaat; MeCN = acetonitril.
| Celvrij lysaat (ml) | DMPC lipide (mg) | Telodendrimer (mg) | MOMP plasmide (μg) | Gezuiverde MOMP-opbrengst (mg) |
| 1 | 4 | 0.4 | 15 | 0.5 |
| 2 | 8 | 0.8 | 30 | 1.1 |
| 3 | 12 | 1.2 | 45 | 1.6 |
| 5 | 20 | 2 | 75 | 2.7 |
Tabel 3: De hoeveelheid lipiden, telodendrimeren en plasmiden die worden gebruikt voor verschillend geschaalde celvrije reacties en de bijbehorende opbrengsten. Afkortingen: MOMP = chlamydia major outer membrane protein; DMPC = 1,2-dimyristoyl-sn-glycero-3-fosfocholine.
| Verhoudingen van plasmide-input, MOMP : Δ49ApoA1 | 1:1 | 5:1 | 10:1 | 25:1 | 50:1 | 100:1 | |
| Verhoudingen van de hoeveelheid geproduceerd eiwit, MOMP : Δ49ApoA1 | 0.02 | 0.32 | 0.64 | 3.46 | 6.55 | 20.04 | |
| Geschat aantal MOMP-inserties per tNLP | 0.03 | 0.37 | 0.75 | 4.04 | 7.65 | 23.39 | |
Tabel 4: De plasmideverhoudingen in een celvrije reactie en de resulterende MOMP-inbrengsnelheden. Afkortingen: MOMP = chlamydia major outer membrane protein; tNLP = telodendrimer nanolipoproteïne deeltje; Δ49ApoA1 = His-tagged muis ApoA1 afgeleide.
Chlamydia is de meest voorkomende seksueel overdraagbare aandoening die zowel mannen als vrouwen treft. Hoewel vaccinonderzoek naar Chlamydia tientallen jaren beslaat, is een veilig en effectief vaccin dat kan worden opgeschaald naar massaproductie ongrijpbaar gebleven13. De chlamydia MOMP wordt beschouwd als de belangrijkste kandidaat als een beschermend vaccinantigeen; MOMP is echter zeer hydrofoob en gevoelig voor onjuiste vouwing14,15. Verdere studie heeft aangetoond dat MOMP bestaat in oligomere toestanden die essentieel zijn voor de immunogeniciteit11. Hier wordt een gevalideerde, celvrije co-expressiemethode beschreven die oligomere MOMP produceert die wordt gevormd in tNLP-nanodeeltje als een vaccin, met opbrengsten van ongeveer 1,5 mg gezuiverde MOMP per 3 ml lysaat. Deze volledig gecollifieerde procedure kan verder worden opgeschaald voor industriële productie, waardoor de vooruitzichten als een nuttige benadering voor het genereren van vaccins worden vergroot.
We hebben eerder gepubliceerd over het gebruik van celvrije expressie om membraaneiwitten te produceren die zijn ingebed in NLPs 3,16, evenals expressie in telodendrimer-gestabiliseerde schijven. Deze laatste techniek produceerde echter membraaneiwitdeeltjes met een grotere heterogeniteit en lagere oplosbaarheid. 4 Bovendien is de immunogeniciteit van MOMP-telodendrimer-deeltjes onduidelijk in vergelijking met MOMP-tNLP-deeltjes6.
Deze procedure kan worden aangepast om de expressie van bacteriële membraaneiwitten op te schalen die veelbelovende kandidaten zijn als antigenen voor gebruik in subunitvaccins. Niet alleen produceert deze procedure opgelost bacterieel membraaneiwit, maar de algehele nanodeeltjesstructuur is vatbaar voor verdere modificatie met behulp van een verscheidenheid aan lipofiele vaccinadjuvantia, waaronder, maar niet beperkt tot, CpG geconjugeerd aan een cholesterolgroep of FSL-1. Expressie van andere kandidaat-antigenen uit bacteriën is haalbaar, hoewel parameters zoals expressietemperatuur, lipidenkeuze en type expressiesysteem mogelijk moeten worden onderzocht om optimale opbrengsten te bereiken.
Bovendien zijn plasmidekeuze en -verhouding van cruciaal belang in dit proces. Beide gebruikte plasmiden moeten uit dezelfde ruggengraat worden opgebouwd. Als de inserts ongeveer even lang zijn, kunnen de verhoudingen worden gebaseerd op de massa van het toegevoegde plasmide, zoals hier beschreven. Verhoudingen op basis van moedervlekken zullen echter meer reproduceerbare resultaten opleveren, vooral bij het schalen van de reacties. Verhoudingen die goed werken in reacties op schermschaal (< 0,5 ml) zijn mogelijk niet van toepassing op grotere reacties en vereisen mogelijk extra optimalisatie. Niet-membraaneiwitten kunnen nog steeds tot expressie worden gebracht met behulp van celvrije kits, maar vereisen mogelijk niet dat het lipide nanodeeltje (co-expressie) een oplosbaar product produceert. Bovendien, terwijl dit protocol adjuvanting met CpG en FSL-1 beschrijft, is dit systeem vatbaar voor formulering met andere lipofiele adjuvantia of vermenging met oplosbare adjuvantia naar wens.
Het is essentieel om besmetting te voorkomen bij het opzetten van de celvrije expressiereactie, omdat dit de opbrengst kan beïnvloeden. Alle additieven voor de reactie, inclusief de plasmiden zelf, moeten zeer zuiver zijn. Bovendien mogen de tot expressie gebrachte eiwitten alleen in contact komen met materialen en oplossingen die vrij zijn van endotoxinebesmetting. Endotoxinebesmetting in kandidaatformuleringen kan leiden tot inconsistente en valse resultaten van immunologische testen en kan in voldoende hoeveelheden schadelijk zijn. Hoewel hier niet beschreven, kan aanvullende zuivering na nikkelaffiniteitschromatografie nodig zijn als veel verontreinigingen worden waargenomen in volgende analysestappen, zoals via SDS-PAGE. Dit kan worden bereikt met SEC, hoewel de omstandigheden mogelijk optimalisatie per formulering vereisen.
De auteurs verklaren dat ze geen bekende concurrerende financiële belangen of persoonlijke relaties hebben die van invloed lijken te zijn geweest op het werk dat in dit artikel wordt gerapporteerd.
Dit werk werd ondersteund door de Public Health Service grant R21 AI20925 en U19 AI144184 van het National Institute of Allergy and Infectious Diseases. Dit werk werd uitgevoerd onder auspiciën van het Amerikaanse ministerie van Energie door Lawrence Livermore National Laboratory onder contract DE-AC52-07NA27344 [LLNL-JRNL-822525, LLNL-VIDEO-832788].
| Naam | Bedrijf | Catalogusnummer | Opmerkingen |
|---|---|---|---|
| 1,2-dimyristoyl-sn-glycero-3-fosfocholine (DMPC) als poeder | Avanti Polar Lipids | 850345 | |
| 1,5 mL endotoxinvrije centrifugebuizen | Eppendorf | 2600028 | |
| 1 M Trizma-hydrochlorideoplossing | Millipore Sigma | T2194 | |
| Azijnzuur, glazuur, ACS-reagens, ≥99,7% | Millipore Sigma | 695092 | |
| Bio-Dot-apparaat | Bio-Rad | 1706545 | |
| Buffer Dam voor XCell SureLock | Life Technologies | EI0012 | |
| C24 Incubator shaker | New Brunswick Scientific | ||
| Cel-vrij expressiesysteem: RTS 500 ProteoMaster E. coli HY Kit | BiotechRabbit | BR1400201 | |
| cOmplete His-Tag-zuiveringshars | Roche Molecular Diagnostics | 5893682001 | |
| cOmplete, EDTA-vrije proteaseremmercocktail | Roche Molecular Diagnostics | 4693132001 | |
| CpG-ODN1826 | Biosearch Technologies | T9449 | |
| D-(+)-Trehalose dihydraat | Millipore Sigma | 71509 | |
| Dialysebuizen D-Tube Dialyzer Maxi | Millipore Sigma | 71508-3 | |
| Variabele, polypropyleen fritted kolommen 10 mL capaciteit | Bio-Rad | 7311550EDU | |
| Dulbecco’s fosfaatgebufferde zoutoplossing (PBS) | Millipore Sigma | D8537 | |
| Elektroforese-voeding | |||
| Endosafe PTS-cartridge | Thermo Fisher Scientific | NC9594798 | |
| Endosafe-PTS-testsysteem | Charles River | ||
| Gelwasoplossing: 10% methanol, 7% azijnzuur | |||
| HCl en NaOH-oplossingen voor pH-aanpassing | |||
| HPLC met UV-vis-diodearraydetector | Shimadzu | ||
| HyClone HyPure cultuurkwaliteit water | VWR | 82007-328 | |
| iBlot 2 Dry Blotting System | Life Technologies | ||
| iBlot 2 Transfer Stacks, PVDF | Life Technologies | IB24001 | |
| Image Studio V2.0-software | Li-COR Biiosciences | ||
| Imidazolaat | Millipore Sigma | I5513 | |
| Immun-Blot PVDF-membraan | Bio-Rad | 1620177 | |
| LI-COR Odyssey Fc imager | Li-COR Biiosciences | ||
| Lyofiliseerder | Labconco | ||
| Methanol (≥99,9%) | Millipore Sigma | 34860 | |
| Microcentrifuge | |||
| Microgolfoven | |||
| NanoDrop One/OneC Microvolume UV-Vis Spectrofotometer | Thermo Fisher Scientific | ND-ONE-W | |
| NuPAGE 4 tot 12%, Bis-Tris, 1,0 mm | Life Technologies | NP0321 | |
| NuPAGE LDS-monsterbuffer (4x) | Life Technologies | NP0007 | |
| NuPAGE MES SDS-runbuffer (20x) | Life Technologies | NP000202 | |
| NuPAGE-monsterreducerend middel (10x) | Life Technologies | NP0009 | |
| Odyssey-blokkadebuffer in TBS met 0,2% Tween 20 | Li-COR Biosciences | 927-50000 | |
| Orbitale shaker | |||
| PBS-T (1x PBS, 0,2% Tween 20, pH 7,4) | |||
| PEG5K-CA8 Telodendrimer (op maat gemaakt syntheseproduct) | |||
| pIVEX2.4d vector | Roche Molecular Diagnostics | ||
| Plasmid Maxi Kit | Qiagen | 12162 | |
| Primaire antilichaam: MAb40 (monoklonaal antilichaam voor het variabele domein 1 (VD1) van C. muridarum MOMP, de la Maza laboratorium)4 | |||
| Primair antilichaam: MAbHIS, Penta-His-antilichaam | Qiagen | 34660 | |
| Probe sonicator | |||
| Qubit 3.0 Fluorometer | Life Technologies | Q33216 | |
| Qubit Protein Assay Kit | Life Technologies | Q33212 | |
| Rainin Pipette tips: LTS 1000 µL | Rainin | 17002428 | |
| Rainin Pipette tips: LTS 20 µL | Rainin | 17002429 | |
| Rainin Pipette tips: LTS 200 µL | Rainin | 17002426 | |
| Rainin Pipettes | Rainin | ||
| Secundair antilichaam: IRDye 800CW geit (polyklonaal) anti-muis IgG (zwaar en licht) | Li-COR Biosciences | 926-32210 | |
| SeeBlue Plus2 Pre-stained Protein Standard | Life Technologies | LC5925 | |
| Natriumchloride NaCl | Millipore Sigma | S7653 | |
| Natriumfosfaatmonohydraat NaH2PO4 | Millipore Sigma | S0751 | |
| Superdex 200, 5/150 GL-kolom | Cytiva | GE28-9909-45 | |
| Synthetisch gediacyleerde lipoproteïne-TLR2/6 FSL-1 | Invivogen | tlrl-fsl | |
| SYPRO Ruby Protein Gel Stain | Life Technologies | S12001 | |
| TWEEN 20 | Millipore Sigma | P1379 | |
| UV-lichtbron | |||
| Vacufuge Bench Top Centrifuge | Eppendorf | ||
| Vortexer | |||
| VWR 15 mL kegelbuisjes (89039-666) | VWR | ||
| VWR 50 mL kegelbuisjes (89039-656) | VWR | ||
| XCell SureLock Mini-Cell (Life Technologies ) | Life Technologies | EI0001 |