In dit werk werden 2D- en 3D-celexperimenten uitgevoerd om de IC50 te bepalen voor "ring-gesloten" en "ring-open" vormen van LMB002 (zie figuur 1) op verschillende incubatietijden. Deze waarden werden vergeleken met die verkregen voor het prototype peptide, gramicidin S (gebruikt als positieve controle). Een typische reeks afbeeldingen van de incubatie in 2D-gekweekte LLC-cultuur na kleuring wordt weergegeven in figuur 5. Co-kleuring met Hoechst 33342 (blauw) en propidiumjodide (rood) resulterend in verschillende tinten paars in een groter deel van de cellen in het geval van behandeling met "ring-open" vorm in vergelijking met "ring-gesloten" duidt op een merkbaar verschil in cytotoxiciteit tussen twee vormen die gemakkelijk kunnen worden gekwantificeerd. Het gedemonstreerde voorbeeld van een succesvol experiment is gebaseerd op de gegevens die zijn verzameld met behulp van het 96-well plaatformaat, waarbij de peptidevarianten in verschillende concentraties werden toegevoegd, zoals weergegeven in figuur 2. Vergelijkbare gegevens kunnen worden verkregen met platen met 384 putten en hoge dichtheid. Aangezien echter de volumes per put worden verminderd, zullen technische en systematische fouten en als gevolg daarvan de nauwkeurigheid van de IC50-bepaling afnemen met toenemende putdichtheid.

Figuur 5: Representatieve beelden van de cytotoxiciteitstest in de monolayer-grown LLC. Cellen werden gekleurd met Hoechst 33342 (blauw) en propidiumjodide (rood). De getoonde tijden: 10 min, 60 min, 24 h en 72 h zijn incubatietijden met verbindingen. Schaalbalken = 50 μm. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
De fotoconversie van LMB002 door laserlichtbestraling in een modelweefsel - vers varkensgehakt - werd bepaald met behulp van een monster bestaande uit gehakt gemengd met LMB002 "ringgesloten" (inactieve) vorm opgelost in PBS en het meten van de omzetting van deze inactieve vorm in de LMB002 "ring-open" (geactiveerde) vorm in de richting van stralingsvoortplanting. Het monster werd in een spuit geplaatst en van één kant bestraald met een platte straal laserstraling gedurende de blootstellingstijd van ~ 10 minuten (meestal gebruikt in in vivo experimenten), zoals weergegeven in figuur 3. Na de blootstelling werd de monstercilinder in delen verdeeld door op de zuiger van de spuit te drukken en de plakjes van dezelfde hoogte met een scalpel te snijden. De concentratie LMB002 "ring-open" in de extracten van de plakjes werd bepaald met behulp van RP HPLC.
Figuur 6 illustreert de dosis-effectcurven Figuur 6A-D verkregen uit data-analyse. Om het percentage dode cellen met nucleaire co-kleuring van Hoechst 33342 en PI-kleurstoffen te identificeren, gebruikten we een ingebouwde classificatortool die numerieke drempels instelt op geselecteerde gemeten parameters om alle celtellingen in verschillende categorieën te splitsen. Wanneer bijvoorbeeld het rode kanaal (propidiumjodide) signaal in de controle op de drempel was (ongeveer 110-130 eenheden), konden de cellen worden geclassificeerd als PI-positief, beschouwd als dood, of PI-negatief, beschouwd als niet-beïnvloed door de verbindingen. Voor LMB002 kunnen sigmoïdale afhankelijkheid van het percentage propidiumjodide-positieve cellen op de concentratieverbinding worden gezien. Uit deze gegevens kunnen de IC50-waarden worden bepaald.

Figuur 6: Analyse van cytotoxiciteit in 2D-cultuur. Sigmoïde past zoals verkregen in de LLC-cultuur voor (A) 10 min, (B) 60 min, (C) 24 h en (D) 72 h-tijdsintervallen genomen voor incubatie met verbindingen. Montage maakt de nauwkeurige bepaling van IC50-waarden mogelijk (niet weergegeven). Foutbalken zijn SEM. Afkortingen: LLC = Lewis longcarcinoom; PI = propidiumjodide. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Gezien de verkregen IC50-waarden kunnen we concluderen dat de toxiciteit van alle drie de verbindingen toenam met de incubatietijd. Ons experiment onthulde dat de "ring-open" vorm van LMB002 ongeveer één verdunningsstap minder toxisch is dan het prototype peptide, gramicidin S. Terwijl de "ring-gesloten" vorm drie tot vier verdunningsstappen lagere toxiciteit vertoont, die toeneemt met de incubatietijd. Het verschil tussen de twee verdunningsstappen wordt niet beïnvloed door de toename van de incubatietijd en kan numeriek worden gebruikt als een experimenteel bepaald fototherapeutisch venster6 voor vergelijking met andere verbindingen in een potentiële bibliotheekscreening. De IC50-waarde voor gramicidin S werd ingesteld als referentiepunt om experimentele fouten of differentiële outputs in biologische replicaties te corrigeren.
De 3D-celexperimenten produceerden hetzelfde type onbewerkte gegevens - de single cell-resolved one-per-well sferoïde beelden. De opname van calceïne als derde kleurstof maakt de kwantificering van de fractie metabolisch actieve cellen (waargenomen in het groene kanaal) mogelijk. Door 384-putplaten te gebruiken, het aantal technische replicaties te verhogen, redundante co-incubatietijdpunten uit te sluiten en de verdunningsplooi te veranderen, konden we verschillende verbindingen direct vergelijken in een enkele testrun (met behulp van één plaat) zoals geïllustreerd in de plaatkaart in figuur 7.

Figuur 7: Plaatkaart voor het 3D-cultuurexperiment met twee verbindingen. Kleurcodes voor de verbindingen en controle worden aangegeven. Getallen in putten zijn concentraties in μM. 10 min, 24 h en 72 h zijn incubatietijden. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Figuur 8 toont de afbeeldingen van geselecteerde technische replicaties van LLC-sferoïden gekweekt met een dichtheid van 1 sferoïde / put in de aanwezigheid van geteste verbindingen en controlesferoïden die zijn vastgelegd na kleuring.

Figuur 8: Representatieve beelden van 3D-cultuur cytotoxiciteitstest. Afbeeldingen tonen 48-h-oude LLC-sferoïden gekleurd met Hoechst 33342 (blauw), calceïne AM (groen) en propidiumjodide (rood) na 10 min, 24 uur en 72 uur co-incubatie met zowel LMB002-fotovormen als gramicidin S. Schaalbalken = 100 μm. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Met behulp van de instrumentsoftware werden de dosis-effectcurven, zoals die in het 2D-experiment, verkregen uit de z-gestapelde stapels afbeeldingen (figuur 9A). Bovendien kunnen compacte en niet-vervormde sferoïden in de 3D-culturen worden gekenmerkt door de diameter van de hele sferoïde (figuur 9B). Er werd ook opgemerkt dat de totale sferoïde diameter varieert met de concentratie van de verbinding.

Figuur 9: Cytotoxiciteitsevaluatie met 3D-culturen. (A) Concentratieafhankelijke cytotoxiciteitsaanpassingscurven en (B) concentratieafhankelijke sferoïdediameterplots verkregen in de 3D-culturen van LLC co-geïncubeerd met gramicidin S gedurende 10 minuten, 24 uur en 72 uur en vastgelegd vóór kleuring. Foutbalken zijn SEM. Klik hier om een grotere versie van deze afbeelding te bekijken.
Het experiment voor stap 2 maakt het mogelijk om LMB002-concentraties in beide fotovormen te bepalen met behulp van UV-gedetecteerde high-performance vloeistofchromatografie. De efficiëntie van fotoconversie in modelweefsels kon eenvoudig worden beoordeeld en gekwantificeerd met behulp van deze opstelling (figuur 3). De gegevens werden verkregen uit de kwantitatieve analyse van de chromatogrammen van de monsterextracten. In deze testexperimenten werden LMB002-chromatogrammen spectroscopisch gedetecteerd bij 270 nm en 570 nm. Bij 270 nm werden veel extra signalen waargenomen en toegeschreven aan de verbindingen die samen uit het modelweefsel werden geëxtraheerd (geverifieerd uit het controle-extract zonder de verbinding). Beide fotovormen waren voldoende verschillend in retentietijden en absorptie. Het LMB002 "ring-open"-signaal was echter baseline-gescheiden van deze achtergrondsignalen (zie een representatief chromatogram in figuur 10A). Daarom kan dit signaal zonder problemen worden geïntegreerd. Bij 570 nm bevatten de chromatogrammen alleen LMB002 "ring-gesloten" vormsignaal (figuur 10B). Hier hebben we concentratiebepaling uitgevoerd met behulp van RP HPLC. Niettemin kunnen nog hogere nauwkeurigheid en lagere detectiegrenzen worden bereikt met LC/MS als analysemethode.

Figuur 10: Representatieve chromatogrammen van LMB002 geëxtraheerd uit modelweefsels. (A) Monster op 2 mm van het bestraalde oppervlak, geregistreerd bij 270 nm (LMB002 "ring-open"-vorm is geïntegreerd); B) monster op 38 mm van het bestraalde oppervlak, geregistreerd bij 570 nm (de piek van LMB002 "ringgesloten" is geïntegreerd). Retentietijdwaarden (aangegeven) bevestigden bovendien de identiteit van de verbinding. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
De gegevens die werden verkregen na integratie van de overeenkomstige signalen van alle verzamelde monsters werden gebruikt om de concentratiedieptegrafieken te maken, zoals weergegeven in figuur 11. Op basis van deze grafieken kon de efficiëntie van fotoconversie op verschillende diepten van het modelweefsel eenvoudig worden beoordeeld. Het bevestigt dat onze rode lichtbron de "ring-gesloten" LMB002-fotoconversie induceert op een diepte van maximaal 1 c, in het weefsel surrogaat, gehakt (bij ongeveer 103 mW / cm2).

Figuur 11: Evaluatie van de efficiëntie van de fotoconversie. Concentratie (A, mg/kg) van LMB002 "ring-gesloten" (niet-geactiveerde, blauwe stippen) en "ring-open" vormen (geactiveerde, oranje stippen) op verschillende afstanden van het bestraalde oppervlak van het modelweefsel (L, mm). Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
De resultaten van het in vivo experiment - stap 3 van onze methodologie uitgevoerd volgens het schema in figuur 4 - werden weergegeven door grafieken met tumorgroei als functie van de tijd (figuur 12) en Kaplan-Meier-overlevingscurven (figuur 13).

Figuur 12: Tumorgroeidynamiek bij dieren. Dieren behandeld met LMB002 in vergelijking met de met het medium behandelde dieren (subcutaan LLC allograftmodel in C57BL/6NCrl muizen, samengestelde dosis 7 mg/kg, IV, 2 h 40 min incubatie, vervolgens bestraling bij 650 nm, 100 mW/cm2, 20 min). Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 13: Sterftecurven voor dieren. Dieren behandeld met LMB002 in vergelijking met de met het medium behandelde dieren (subcutaan LLC allograftmodel in C57BL/6NCrl muizen, samengestelde dosis 7 mg/kg, IV, 2 h 40 min incubatie, vervolgens bestraling bij 650 nm, 100 mW/cm2, 20 min). Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.