10 oktober 2019
Deze methode omvat het gebruik van klinische diagnostische gegevens voor patiënten met prostaatkanker om bemonsteringsprocedures te begeleiden, wanneer biobankingen weefsel na radicale prostatectomie. Dit overkomt problemen met eerder gepubliceerde methoden rond efficiëntie en beschikbaarheid van vers weefsel voor een breder scala van downstream toepassingen.
De betekenis van dit protocol ten opzichte van eerdere prostaat bemonsteringsmethoden is dat het geeft ons een hoger vertrouwen van het richten van verse tumor weefsel voor onderzoek. Daarom kunnen we het verse weefsel direct terug naar het lab brengen en het gebruiken voor cultuur of beeldvorming, omdat we een groot vertrouwen hebben waarvan monsters tumor zijn en die goedaardig zijn. Mijn belangrijkste advies bij het leren van de techniek is om te werken met uw lokale patholoog, zodat de uiteindelijke weefsel diagnose en rapport niet in het gedrang komen.
Om de tumorlocatie te targeten, bekijkt u de MRI-beelden om de locatie boven de tumor te meten en de sequentie te vinden waarbij de tumor het meest zichtbaar is in het axiale vlak. Blader door de axiale beelden om het beeld te identificeren waarin de tumor de grootste is en print de afbeelding ter referentie. Meet in het overeenkomstige coronale beeld de afstand van de basis van de prostaat tot de geselecteerde axiale positie en meet de volledige lengte van de prostaat van de top naar de basis in millimeters.
Druk deze metingen vervolgens af en markeer de locaties van de tumor ter referentie. Nadat het monster is verzameld, steriliseren de laminaire stroomkap en prostaat snijden apparaat met 70% ethanol en weeg de prostaat op een standaard schaal in grammen. Schilder vervolgens de rechterkant met blauwe inkt en de linkerkant van het monster met zwarte inkt die de volledige capsule en zaadblasels bedekt met inkt om discriminatie van de chirurgische marges mogelijk te maken.
Om de prostaat te snijden, plaats het weefsel met de basis en top tegenover tegenover de wanden van het apparaat met de achterste kant naar beneden en de voorste kant omhoog. Plaats gouden pinnen rond het weefselmonster dat de prostaat licht naar binnen duwt indien nodig om een goede pasvorm te bereiken en meet de prostaatlengte van de basis tot de top om deze meting te vergelijken met de prostaatlengte die wordt gemeten door MRI. Als de prostaat is gekrompen, past u de verwachte snijpositie aan met het juiste percentage van de vermindering.
Meet vervolgens vanaf de basis naar het gewenste dwarssegment en selecteer de pin die het dichtst bij deze meting zit om rond te snijden. Het dragen van kettingpost handschoenen om letsel te voorkomen, plaats de messen van het snijapparaat aan weerszijden van de geïdentificeerde pin en gebruik de spacer om de messen vijf millimeter uit elkaar te houden. Om het segment te verkrijgen, gebruikt u lange slagen om de messen langzaam maar stevig naar beneden, naar voren en naar achteren te bewegen en te bevestigen dat een volledig segment is gescheiden voordat het apparaat wordt gedemonteerd.
Verwijder vervolgens de muren en pennen en gebruik handschoenen om het plakje voorzichtig over te brengen op een steriel stuk kurkenplank. Na het verkrijgen van het monster, visueel inspecteren van de dwarse segment voor vergelijking met de axiale MRI-beeld. In sommige gevallen kan het tumorgebied bleker lijken dan het omringende weefsel.
Palpate de dwarse plak zachtjes. De tumor kan steviger aanvoelen dan het omringende weefsel. Met behulp van de axiale MRI-beeld als een gids, selecteer een of meer gebieden voor bemonstering en gebruik een zes millimeter punch naar beneden te duwen op het weefsel gebied van belang.
Draai de weefselpunch ter plaatse en tegen de kurk om een volledige scheiding te garanderen met behulp van een scherpe scalpel om het biopsiemonster zo nodig van het monster te scheiden. Wanneer het monster is verkregen, verwijdert u de stoot en gebruikt u de zuiger om het monster in de juiste container te werpen voor de daaropvolgende downstream-analyse. Dan inkt de gaten waar de stoten werden genomen in het rood en let op de locatie van elke punch samen met het gewicht van de prostaat en eventuele opmerkingen over het weefsel kleur en stevigheid.
Pin de prostaatcapsule aan de kurk om bilging tijdens fixatie te voorkomen. Dompel de prostaat en kurk onder in fixatief ervoor dat het monster volledig onder water staat. In deze representatieve analyse, van de eerste 92 gevallen bemonsterd zoals aangetoond, 64% van de monsters bevatte ten minste 40%tumor en werden voorgelegd aan de 100,000 Genomen Project zonder microdissection.
DNA werd geëxtraheerd en was in alle gevallen van voldoende opbrengst en kwaliteit en een eerste subset van 59 van deze monsters is gepubliceerd ter vergelijking met een eerdere monsterbemonsteringsmethode. Na deze procedure, de verse tumor monsters kunnen worden gebruikt voor live imaging of cultuur waardoor we nieuwe biomarkers, drugs te testen, en meer te weten komen over tumorbiologie. Nu we deze methode routinematig gebruiken, heb ik een project kunnen voorstellen met behulp van dit weefsel voor ex vivo-cultuur om te kijken naar nieuwe combinaties van preklinische therapieën voor prostaatkanker.
Dit protocol verhoogt de efficiëntie van het bemonsteren van prostaatkankerweefsel door gebruik te maken van klinische diagnostische gegevens om het bemonsteringsproces te sturen. Dit maakt de winning van vers tumorweefsel mogelijk, dat direct kan worden gebruikt voor diverse downstream-applicaties.
Gerichte monstername van prostaatweefsel met behulp van MRI- en biopsiegegevens beantwoordt aan een kritische behoefte aan tumorsidentificatie met een hoge betrouwbaarheid in biobanking-workflows. Deze aanpak verhoogt de voorspellende zekerheid voor downstream-toepassingen, wat betrouwbaarder translationaal onderzoek en de ontwikkeling van preklinische modellen mogelijk maakt. Door het aandeel tumorrijke monsters te vergroten, ondersteunt deze methode een robuuste besluitvorming over de portfolio en een risico-gecorrigeerde voortgang in oncologisch R&D.
Deze MRI- en biopsie-gestuurde bemonsteringsmethode integreert op het grensvlak van weefselwinning en daaropvolgende moleculaire analyse, waardoor een brug wordt geslagen tussen vroege ontdekking en translationeel en preklinisch onderzoek.