Name: Snelle en specifieke detectie van Acinetobacter baumannii-infecties met behulp van een op recombinasepolymeraseamplificatie/Cas12a gebaseerd systeem (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-04-25T13:10:00.000+00:00
Duration: 7 min 59 s
Description: Leer een snelle detectiemethode voor Acinetobacter baumannii-infecties met behulp van recombinasepolymeraseamplificatie en CRISPR-Cas12a. Dit protocol biedt hoge specificiteit en gevoeligheid tot één kopie per microliter.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Lenie, D., Alexandr, N., Harald, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+increasing+threat+in+hospitals%3A+Multidrug-resistant+Acinetobacter+baumannii%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Microbiol%22%5BJournal%5D)">An increasing threat in hospitals: Multidrug-resistant Acinetobacter baumannii.</a> Nat Rev Microbiol. 5 (12), 939-951 (2007).</li>
<li>Li, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+detection+of+Acinetobacter+baumannii+and+molecular+epidemiology+of+carbapenem-resistant+A.+baumannii+in+two+comprehensive+hospitals+of+Beijing%2C+China%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Rapid detection of Acinetobacter baumannii and molecular epidemiology of carbapenem-resistant A. baumannii in two comprehensive hospitals of Beijing, China.</a> Front Microbiol. 6, 997(2015).</li>
<li>Wu, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+diagnostic+test+that+uses+isothermal+amplification+and+lateral+flow+detection+sdaA+can+detect+tuberculosis+in+60+min%5BTitle%5D)+AND+%22J+Appl+Microbiol%22%5BJournal%5D)">A diagnostic test that uses isothermal amplification and lateral flow detection sdaA can detect tuberculosis in 60 min.</a> J Appl Microbiol. 130 (6), 2102-2110 (2020).</li>
<li>Huang, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+cas12a-based+fluorescent+microfluidic+system+for+rapid+on-site+human+papillomavirus+diagnostics%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Microbiol+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">A cas12a-based fluorescent microfluidic system for rapid on-site human papillomavirus diagnostics.</a> Appl Microbiol Biotechnol. 107 (20), 6287-6297 (2023).</li>
<li>Piepenburg, O., Williams, C. H., Stemple, D. L., Armes, N. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+detection+using+recombination+proteins%5BTitle%5D)+AND+%22Plos+Biology%22%5BJournal%5D)">DNA detection using recombination proteins.</a> Plos Biology. 4 (7), 1115-1121 (2006).</li>
<li>Abudayyeh, O. O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((C2c2+is+a+single-component+programmable+RNA-guided+RNA-targeting+CRISPR+effector%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">C2c2 is a single-component programmable RNA-guided RNA-targeting CRISPR effector.</a> Science. 353 (6299), aaf5573(2016).</li>
<li>Chen, J. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas12a+target+binding+unleashes+indiscriminate+single-stranded+DNase+activity%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas12a target binding unleashes indiscriminate single-stranded DNase activity.</a> Science. 360 (6387), eaar6245(2018).</li>
<li>Xiong, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+detection+of+SARS-CoV-2+with+CRISPR-Cas12a%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Biol%22%5BJournal%5D)">Rapid detection of SARS-CoV-2 with CRISPR-Cas12a.</a> PLoS Biol. 18 (12), e3000978(2020).</li>
<li>Gootenberg, J. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nucleic+acid+detection+with+crispr-Cas13a%2FC2C2%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Nucleic acid detection with crispr-Cas13a/C2C2.</a> Science. 356 (6336), 438-442 (2017).</li>
<li>Harrington, L. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Programmed+DNA+destruction+by+miniature+CRISPR-Cas14+enzymes%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Programmed DNA destruction by miniature CRISPR-Cas14 enzymes.</a> Science. 362 (6416), 839-842 (2018).</li>
<li>Li, S. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas12a+has+both+cis-+and+trans-cleavage+activities+on+single-stranded+DNA%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Res%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas12a has both cis- and trans-cleavage activities on single-stranded DNA.</a> Cell Res. 28 (4), 491-493 (2018).</li>
<li>Wang, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cas12aVDet%3A+A+CRISPR%2FCas12a-based+platform+for+rapid+and+visual+nucleic+acid+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Cas12aVDet: A CRISPR/Cas12a-based platform for rapid and visual nucleic acid detection.</a> Anal Chem. 91 (19), 12156-12161 (2019).</li>
<li>Huang, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ultra-sensitive+and+high-throughput+crispr-p+owered+COVID-19+diagnosis%5BTitle%5D)+AND+%22Biosens+Bioelectron%22%5BJournal%5D)">Ultra-sensitive and high-throughput crispr-p owered COVID-19 diagnosis.</a> Biosens Bioelectron. 164, 112316(2020).</li>
<li>Zhang, W. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reverse+transcription+recombinase+polymerase+amplification+coupled+with+CRISPR-Cas12a+for+facile+and+highly+sensitive+colorimetric+SARS-CoV-2+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Reverse transcription recombinase polymerase amplification coupled with CRISPR-Cas12a for facile and highly sensitive colorimetric SARS-CoV-2 detection.</a> Anal Chem. 93 (8), 4126-4133 (2021).</li>
<li>Marraffini Luciano, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas+immunity+in+prokaryotes%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas immunity in prokaryotes.</a> Nature. 526 (7571), 55-61 (2015).</li>
<li>Mohanraju, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Diverse+evolutionary+roots+and+mechanistic+variations+of+the+CRISPR-Cas+systems%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Diverse evolutionary roots and mechanistic variations of the CRISPR-Cas systems.</a> Science. 353 (6299), aad5147(2016).</li>
<li>Makarova, K. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+updated+evolutionary+classification+of+CRISPR-Cas+systems%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Microbiol%22%5BJournal%5D)">An updated evolutionary classification of CRISPR-Cas systems.</a> Nat Rev Microbiol. 13 (11), 722-736 (2015).</li>
<li>Li, S. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas12a-assisted+nucleic+acid+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Discovery%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas12a-assisted nucleic acid detection.</a> Cell Discovery. 4 (1), 20(2018).</li>
<li>Li, L., Li, S., Wu, N., Wu, J., Wang, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Holmesv2%3A+A+CRISPR-Cas12b-assisted+platform+for+nucleic+acid+detection+and+DNA+methylation+quantitation%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Synth+Biol%22%5BJournal%5D)">Holmesv2: A CRISPR-Cas12b-assisted platform for nucleic acid detection and DNA methylation quantitation.</a> ACS Synth Biol. 8 (10), 2228-2237 (2019).</li>
<li>Liang, M., Li, Z., Wang, W., Liu, J., Zhang, L. X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+CRISPR-Cas12a-derived+biosensing+platform+for+the+highly+sensitive+detection+of+diverse+small+molecules%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Communications%22%5BJournal%5D)">A CRISPR-Cas12a-derived biosensing platform for the highly sensitive detection of diverse small molecules.</a> Nat Communications. 10 (1), 3672(2019).</li>
<li>Aquino-Jarquin, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas14+is+now+part+of+the+artillery+for+gene+editing+and+molecular+diagnostic%5BTitle%5D)+AND+%22Nanomedicine%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas14 is now part of the artillery for gene editing and molecular diagnostic.</a> Nanomedicine. 18, 428-431 (2019).</li>
<li>Zetsche, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cpf1+is+a+single+RNA-guided+endonuclease+of+a+class+2+CRISPR-Cas+system%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Cpf1 is a single RNA-guided endonuclease of a class 2 CRISPR-Cas system.</a> Cell. 163 (3), 759-771 (2015).</li>
<li>Fonfara, I., Richter, H., Bratovic, M., Le Rhun, A., Charpentier, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+CRISPR-associated+DNA-cleaving+enzyme+Cpf1+also+processes+precursor+CRISPR+RNA%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">The CRISPR-associated DNA-cleaving enzyme Cpf1 also processes precursor CRISPR RNA.</a> Nature. 532 (7600), 517-521 (2016).</li>
<li>Swarts, D. C., John, V. D. O., Jinek, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Structural+basis+for+guide+RNA+processing+and+seed-dependent+DNA+targeting+by+CRISPR-Cas12a%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell%22%5BJournal%5D)">Structural basis for guide RNA processing and seed-dependent DNA targeting by CRISPR-Cas12a.</a> Mol Cell. 66 (2), 221-233 (2017).</li>
<li>Jiang, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cpf1+assisted+genome+editing+of+Corynebacterium+glutamicum%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cpf1 assisted genome editing of Corynebacterium glutamicum.</a> Nat Commun. 8, 15179(2017).</li>
<li>Yan, M. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas12a-assisted+recombineering+in+bacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas12a-assisted recombineering in bacteria.</a> Appl Environ Microbiol. 83 (17), e00947-e01017 (2017).</li>
<li>Ashraf, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+novel+multiplex+pcr+assay+for+simultaneous+detection+of+nine+clinically+significant+bacterial+pathogens+associated+with+bovine+mastitis%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell+Probes%22%5BJournal%5D)">A novel multiplex pcr assay for simultaneous detection of nine clinically significant bacterial pathogens associated with bovine mastitis.</a> Mol Cell Probes. 33, 57-64 (2017).</li>
<li>Zhu, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+rapid+on-site+visualization+platform+based+on+RPA+coupled+with+CRISPR-Cas12a+for+the+detection+of+genetically+modified+papaya+%27huanong+no.1%27%5BTitle%5D)+AND+%22Talanta%22%5BJournal%5D)">A rapid on-site visualization platform based on RPA coupled with CRISPR-Cas12a for the detection of genetically modified papaya 'huanong no.1'.</a> Talanta. 277, 126437(2024).</li>
<li>Zheng, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+developments+in+lateral+flow+immunoassay+for+nucleic+acid+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Analyst%22%5BJournal%5D)">Rapid developments in lateral flow immunoassay for nucleic acid detection.</a> Analyst. 146 (5), 1514-1528 (2021).</li>
<li>Wang, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Establishment+and+clinical+application+of+a+RPA-LFS+assay+for+detection+of+capsulated+and+non-capsulated+Haemophilus+influenzae%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Cell+Infect+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Establishment and clinical application of a RPA-LFS assay for detection of capsulated and non-capsulated Haemophilus influenzae.</a> Front Cell Infect Microbiol. 12, 878813(2022).</li>
<li>Wang, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+and+sensitive+recombinase+polymerase+amplification+combined+with+lateral+flow+strips+for+detecting+Candida+albicans%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Biochem%22%5BJournal%5D)">Rapid and sensitive recombinase polymerase amplification combined with lateral flow strips for detecting Candida albicans.</a> Anal Biochem. 633, 114428(2021).</li>
<li>Ma, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+simple+and+efficient+method+for+potential+point-of-care+diagnosis+of+human+papillomavirus+genotypes%3A+Combination+of+isothermal+recombinase+polymerase+amplification+with+lateral+flow+dipstick+and+reverse+dot+blot%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Bioanal+Chem%22%5BJournal%5D)">A simple and efficient method for potential point-of-care diagnosis of human papillomavirus genotypes: Combination of isothermal recombinase polymerase amplification with lateral flow dipstick and reverse dot blot.</a> Anal Bioanal Chem. 411 (28), 7451-7460 (2019).</li>
<li>Sun, Y., Yu, L., Liu, C., Ye, S., Huang, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((One-tube+SARS-CoV-2+detection+platform+based+on+RT-RPA+and+CRISPR%2FCas12a%5BTitle%5D)+AND+%22J+Transl+Med%22%5BJournal%5D)">One-tube SARS-CoV-2 detection platform based on RT-RPA and CRISPR/Cas12a.</a> J Transl Med. 19 (1), 74(2021).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>&nbsp;-20 &deg;C Freezer</td><td>Haier</td><td>HYCD-290</td><td>China</td></tr><tr><td>Agarose Basic</td><td>BioFroxx</td><td>1110GR100</td><td>China</td></tr><tr><td>All oligonucleotides and crRNA were synthesized by company</td><td>www.comatebio.com</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Cas12a cutting substrate - ssDNA - fluorescent type</td><td>EZassay Biotech. Co. Ltd.</td><td>DNA-FAM-BHQ</td><td>China</td></tr><tr><td>Cas12a cutting substrate - ssDNA - test paper type</td><td>EZassay Biotech. Co. Ltd.</td><td>DNA-FAM-BIO</td><td>China</td></tr><tr><td>Electrophoresis apparatus</td><td>BIO-RAD</td><td>POWER PAC1000</td><td>USA</td></tr><tr><td>Fluorescence quantitative PCR instrument</td><td>BIO-RAD</td><td>CFX Connect</td><td>USA</td></tr><tr><td>Gel Imaging System</td><td>BIO-RAD</td><td>Gel Doc 2000</td><td>USA</td></tr><tr><td>https://ezassay.com/rna</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>https://www.ezassay.com/primer&nbsp;&nbsp;</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Lateral flow paper strip (Biotin/FAM)</td><td>EZassay Biotech. Co. Ltd.</td><td>HD-FMBO</td><td>China</td></tr><tr><td>LbaCas12a (Cpf1) enhanced protein</td><td>EZassay Biotech. Co. Ltd.</td><td>CAS-12E-001</td><td>China</td></tr><tr><td>LED Transilluminator</td><td>LABGIC</td><td>BL-20</td><td>China</td></tr><tr><td>Magnesium acetate, MgOAc</td><td>TwistDx</td><td>TABAS03KIT</td><td>UK</td></tr><tr><td>Microcentrifuge</td><td>allsheng</td><td>Mini-6k</td><td>China</td></tr><tr><td>PCR strip tubes</td><td>PCR strip tubes</td><td>PST-0208-FT-C</td><td>China</td></tr><tr><td>TGrade Dry Bath Incubator</td><td>Tiangen biochemical technology&nbsp;</td><td>OSE-DB-01</td><td>China</td></tr><tr><td>Tianamp Bacteria DNA Kit</td><td>Tiangen biochemical technology&nbsp;</td><td>DP302-02</td><td>China</td></tr><tr><td>TIANamp Bacteria DNA Kit&nbsp;</td><td>TIANGEN BIOTECH&nbsp;(BEIJING) CO.; LTD.</td><td>DP302</td><td>&nbsp;China&nbsp;</td></tr><tr><td>TransStart&nbsp;FastPfu&nbsp;DNA Polymerase&nbsp;</td><td>TransGen Biotech. Co. Ltd.</td><td>AP221</td><td>&nbsp;China&nbsp;</td></tr><tr><td>TwistAmp Basic Kit</td><td>TwistDX</td><td>TABAS03KIT</td><td>UK</td></tr><tr><td>Universal DNA Purification Kit</td><td>Tiangen biochemical technology&nbsp;</td><td>DP214-03</td><td>China</td></tr></tbody></table>

snelle en specifieke detectie van acinetobacter baumannii-infecties met behulp van een op recombinasepolymeraseamplificatie/cas12a gebaseerd systeem

Rapid and Specific Detection of Acinetobacter baumannii Infections Using a Recombinase Polymerase Amplification/Cas12a-based System

Snelle en specifieke detectie van Acinetobacter baumannii-infecties met behulp van een op recombinasepolymeraseamplificatie/Cas12a gebaseerd systeem

Acinetobacter baumannii, a gram-negative bacterium, is notorious for causing severe infections with high mortality rates. Rapid and accurate detection of ...

rapid-specific-detection-acinetobacter-baumannii-infections-using

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Immunologie en Infectie

We hebben onlangs melding gemaakt van een nieuwe benadering voor het genereren van fluorogene DNAzyme probes die kan worden toegepast op het opzetten van een eenvoudige, "mix-and-lezen" TL-test voor bacteriële detectie. Deze speciale DNA probes katalyseren de splitsing van een chromofoor gemodificeerde DNA-RNA chimère substraat in aanwezigheid van ruwe extracellulaire mengsel (CEM) door een bepaald bacterie, waardoor vertaling bacteriële detectie in fluorescentiesignaal generatie. In dit...

Detectie van bacteriën met behulp van fluorogene DNAzymes

Er is een protocol gegeven voor het ontwikkelen van een real-time recombinase polymerase-amplificatietest om de initiële concentratie van DNA-monsters te kwantificeren met behulp van een thermische cycler of een microscoop en een stage-heater. Ook beschreven is de ontwikkeling van een interne positieve controle. Scripts zijn gegeven voor het verwerken van ruwe real-time fluorescentiegegevens.

Ontwikkeling van een kwantitatieve Recombinase Polymerase Amplificatie test met een interne positieve controle

Dit protocol beschrijft hoe je een continuous-flow-polymeraseketensysteem bouwt op basis van een microfluïdische chip en hoe je een capillair elektroforesesysteem bouwt in het lab. Het presenteert een eenvoudige methode voor de analyse van nucleïnezuren in het laboratorium.

Amplificatie van Escherichia coli in een Continuous-Flow-PCR microfluïdische chip en de detectie ervan met een capillair elektroforesesysteem

In dit werk werd een snelle, gevoelige en draagbare detectiemethode voor Candidatus Liberibacter asiaticus ontwikkeld op basis van recombinasepolymeraseversterking in combinatie met CRISPR-Cas12a.

In het veld inzetbare Candidatus Liberibacter asiaticus detectie met behulp van recombinase polymerase amplificatie in combinatie met CRISPR-Cas12a

We presenteren een protocol dat recombinasepolymeraseamplificatie combineert met een CRISPR/Cas12a-systeem voor sporendetectie van DNA-virussen en draagbare smartphonemicroscopie bouwt met een door kunstmatige intelligentie ondersteunde classificatie voor point-of-care DNA-virusdetectie.

DNA-virusdetectiesysteem op basis van RPA-CRISPR/Cas12a-SPM en deep learning

We beschrijven een eenvoudige procedure voor de single-copy chromosomale complementatie van een effluxpompgen met behulp van een mini-Tn7-gebaseerd expressiesysteem in een gemanipuleerde efflux-deficiënte stam van Acinetobacter baumannii. Dit nauwkeurige genetische hulpmiddel maakt gecontroleerde genexpressie mogelijk, wat essentieel is voor de karakterisering van effluxpompen in multiresistente pathogenen.

Karakterisering van multidrug effluxsystemen in Acinetobacter baumannii met behulp van een efflux-deficiënte bacteriestam en een single-copy genexpressiesysteem

Verschillende bacteriële ziekteverwekkers kunnen luchtweginfecties veroorzaken en tot ernstige gezondheidsproblemen leiden als ze niet nauwkeurig worden gedetecteerd en onmiddellijk worden behandeld. Snelle en nauwkeurige detectie van deze ziekteverwekkers via lusgemedieerde isotherme amplificatie zorgt voor een effectief beheer en controle van luchtweginfecties in klinische omgevingen.

Snelle detectie van bacteriële pathogenen die infecties van de onderste luchtwegen veroorzaken via op microfluïdische-chips gebaseerde lus-gemedieerde isotherme amplificatie

Hier presenteren we de stapsgewijze voorbereiding van voorgemengde, gevriesdroogde recombinase-gebaseerde isotherme amplificatie en geclusterde regelmatig interspaced korte palindromische herhalingen (CRISPR)-gebaseerde reacties, die kunnen worden gebruikt voor de detectie van nucleïnezuurbiomarkers van infectieziekteverwekkers of andere genetische markers van belang.

Point-of-care diagnostiek op basis van CRISPR met voorgemengde en gevriesdroogde reagentia

In dit protocol wordt een gecombineerde recombinasepolymeraseamplificatie CRISPR/Cas12a-assay geïllustreerd voor de detectie van de invasieve plantpathogeen Fusarium oxysporum f. sp. cubense tropical race 4.

Gecombineerde recombinasepolymeraseamplificatie CRISPR/Cas12a-test voor het detecteren van Fusarium oxysporum f. sp. cubense Tropical Race 4

Hier beschrijven we een eenvoudige en snelle procedure voor het detecteren van DNA van bijenpathogenen, zoals Lotmaria passim en Nosema ceranae, met behulp van een amplificatie-ready cellysis, recombinasepolymeraseamplificatie en CRISPR/Cas12a-assays.

On-site DNA-detectie van trypanosomatide parasieten en Nosema ceranae door middel van alkalische lysis gekoppeld aan RPA/CRISPR/Cas12a-systeem

Leer een snelle detectiemethode voor Acinetobacter baumannii-infecties met behulp van recombinasepolymeraseamplificatie en CRISPR-Cas12a. Dit protocol biedt hoge specificiteit en gevoeligheid tot één kopie per microliter.

Snelle en specifieke detectie van Acinetobacter baumannii-infecties met behulp van een op recombinasepolymeraseamplificatie/Cas12a gebaseerd systeem (Video) | JoVE Journal

Snelle en specifieke detectie van Acinetobacter baumannii-infecties met behulp van een op recombinasepolymeraseamplificatie/Cas12a gebaseerd systeem

Meer video's verkennen