RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
pl_PL
Menu
Menu
Menu
Menu
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Opisana jest dokładna metoda oceny śmierci komórki. Protokół ten jest lepszy od konwencjonalnych protokołów aneksyny V / jodku propidyny (PI), które wyświetlają do 40% zdarzeń fałszywie dodatnich w liniach komórkowych i komórkach pierwotnych z szerokiej gamy modeli zwierzęcych.
Badania nad apoptozą komórkową zostały znacząco zmienione od czasu wprowadzenia metod opartych na cytometrii przepływowej. Jodek propidyny (PI) jest szeroko stosowany w połączeniu z aneksyną V w celu określenia, czy komórki są żywotne, apoptotyczne lub nekrotyczne poprzez różnice w integralności błony komórkowej i przepuszczalności1,2. Protokół Aneksyny V / PI jest powszechnie stosowanym podejściem do badania komórek apoptotycznych3. PI jest stosowany częściej niż inne barwienia jądrowe, ponieważ jest ekonomiczny, stabilny i jest dobrym wskaźnikiem żywotności komórek, w oparciu o jego zdolność do wykluczania barwnika w żywych komórkach 4,5. Zdolność PI do wnikania do komórki zależy od przepuszczalności błony; PI nie barwi żywych lub wczesnych komórek apoptotycznych ze względu na obecność nienaruszonej błony plazmatycznej 1,2,6. W komórkach późnoapoptotycznych i martwiczych integralność błon plazmatycznych i jądrowych zmniejsza sięo 7,8, co pozwala PI przejść przez błony, interkalować w kwasy nukleinowe i wykazywać czerwoną fluorescencję 1,2,9. Niestety, okazuje się, że konwencjonalne protokoły Aneksyny V / PI prowadzą do znacznej liczby zdarzeń fałszywie dodatnich (do 40%), które są związane z barwieniem PI RNA w przedziale cytoplazmatycznym10. Dotyczy to komórek pierwotnych i linii komórkowych w szerokim zakresie modeli zwierzęcych, przy czym duże komórki (stosunek jądrowo-cytoplazmatyczny <0,5) wykazują najwyższą częstość występowania10. W niniejszym artykule demonstrujemy zmodyfikowaną metodę Aneksyny V / PI, która zapewnia znaczną poprawę oceny śmierci komórki w porównaniu z metodami konwencjonalnymi. Protokół ten wykorzystuje zmiany w przepuszczalności komórkowej podczas utrwalania komórek, aby promować wnikanie RNazy A do komórek po barwieniu. Zarówno czas, jak i stężenie RNazy A zostały zoptymalizowane pod kątem usuwania cytoplazmatycznego RNA. Rezultatem jest znaczna poprawa w porównaniu z konwencjonalnymi protokołami Aneksyny V/PI (< 5% zdarzeń z cytoplazmatycznym barwieniem PI).
Ta procedura może być wykonana w probówkach silikonowanych o pojemności 500 μl lub probówkach FACS z polistyrenu o okrągłym dnie 6 ml. Ta ostatnia metoda jest zwykle stosowana podczas przeprowadzania analizy rentowności w połączeniu z innymi procedurami. Wszystkie podane objętości dotyczą okrągłodennych probówek FACS z polistyrenu o pojemności 6 ml. W przypadku probówek silikonowanych o pojemności 500 μl zmniejsz wszystkie objętości o 1/5.
Optymalnym stężeniem do analizy cytometrii przepływowej jest 2-4 x 106 komórek na 200 μL objętości. W wyniku tej procedury może dojść do utraty komórek, dlatego zalecamy, aby każda próbka składała się z 4 x 106 komórek na początku procedury.
1. Przygotowanie komórek
2. Zastosowanie załącznika V/ Bejca PI
3. Reprezentatywne wyniki:
Przykłady typów komórek i linii komórkowych, które mają różne stopnie fałszywie dodatniego zabarwienia PI, są pokazane na rysunku 1. Aby uwzględnić zdarzenia fałszywie dodatnie, komórki unieruchomiono, a następnie potraktowano RNazą A. Powoduje to znaczny spadek liczby zdarzeń fałszywie dodatnich w porównaniu z komórkami, które nie zostały poddane leczeniu RNazą (Figura 2B). Rycina 2C przedstawia reprezentatywne obrazy komórek, które zostały poddane leczeniu RNazą, w porównaniu z komórkami, które nie były leczone RNazą. Rycina 3 pokazuje, w jaki sposób zmodyfikowany protokół Aneksyny V/PI, z etapami fiksacji i leczenia RNazą, poprawia się w stosunku do konwencjonalnych protokołów, ograniczając liczbę fałszywie dodatnich zdarzeń barwienia.

Rysunek 1. Konwencjonalne protokoły barwienia jodkiem propidyny prowadzą do znacznej liczby zdarzeń fałszywie dodatnich. Wcześniej oceniliśmy zakres fałszywie dodatniego barwienia w komórkach pierwotnych w szerokim zakresie modeli zwierzęcych, a także w różnych liniach komórkowych 10. Reprezentatywne obrazy pokazują zakres fałszywie dodatniego barwienia w trzech unikalnych populacjach komórek (jedna powszechnie stosowana linia komórkowa - makrofagi RAW i dwie komórki pierwotne - makrofagi szpiku kostnego myszy (BMM) i pierwotne makrofagi nerkowe złotej rybki (PKM)). Zdarzenia prawdziwie dodatnie pokazują oczekiwaną kolokalizację między PI i DRAQ5 w przedziale jądrowym (żółte obszary przedstawiają kolokalizację między PI i DRAQ5). DRAQ5 jest barwnikiem o wysokiej przepuszczalności błony, który dokładnie barwi przedział jądrowy zarówno w żywych, jak i martwych komórkach 10,11,12. Dla łatwiejszego wizualnego określenia kolokalizacji, barwie DRAQ5 nadano zielony pseudokolor.

Rysunek 2. Poprawa dokładności barwienia jądrowego PI. (A) Oceniliśmy dokładność barwienia jądrowego PI na podstawie stopnia podobieństwa wielu dobrze scharakteryzowanych barwień jądrowych (BrdU, 7-AAD i DAPI) do DRAQ5. BrdU jest syntetycznym nukleozydem, który jest wbudowany w DNA proliferujących komórek i jako taki plami się tylko w przedziale jądrowym. 7-AAD ma wysokie powinowactwo do DNA i, podobnie jak PI, nie może przekroczyć nienaruszonej błony plazmatycznej. DAPI ma również silne powinowactwo do DNA i jest najczęściej stosowanym barwnikiem jądrowym w mikroskopii fluorescencyjnej. Stopień podobieństwa wynosił >99% między BrdU, 7-AAD, DAPI i DRAQ5, co podkreśla ich zdolność do dokładnego barwienia jądra komórkowego w makrofagach RAW 264,7. W przeciwieństwie do tego, cytoplazmatyczne barwienie PI oparte na konwencjonalnych protokołach prowadzi do wyraźnego spadku procentowego podobieństwa barwienia w stosunku do DRAQ5. (B) Podobne wyniki obserwuje się w dwóch badanych komórkach pierwotnych: makrofagach szpiku kostnego myszy (BMM) i pierwotnych makrofagach nerkowych złotej rybki (PKM). Włączenie 50 μg/ml RNazy A na określonym etapie procedury barwienia usuwa niejądrowe barwienie PI i znacznie zwiększa stopień podobieństwa w stosunku do barwienia DRAQ5. (C) Reprezentatywne obrazy pierwotnych makrofagów nerkowych pokazują stopień podobieństwa komórek z leczeniem RNazą i bez niej. Dla łatwiejszego wizualnego określenia różnic między zabiegami, DRAQ5 otrzymał kolor zielony. Żółte obszary przedstawiają kolokalizację między BrdU i DRAQ5 oraz PI i DRAQ5.

Rysunek 3. Zmodyfikowana Aneksyna V/PI znacznie zmniejsza liczbę fałszywych zdarzeń apoptozy/martwicy. Pierwotne makrofagi nerkowe złotej rybki (PKM) barwiono konwencjonalnymi i zmodyfikowanymi protokołami Ancyny V/PI. Wykresy rozrzutu przedstawiają plamę Annexin V/PI w złotej rybce PKM. Wykres rozrzutu po lewej stronie pokazuje konwencjonalne barwienie aneksyną V / PI (bez RNazy) komórek PKM. Wykres rozrzutu po prawej stronie pokazuje komórki PKM wybarwione zmodyfikowanym protokołem Annexin V/PI (z RNazą). Dodanie RNazy powoduje wyraźne zmniejszenie barwienia PI w wyniku usunięcia fałszywie dodatnich barwień. Komórki PKM zostały następnie przeanalizowane w oparciu o odrębne populacje w obrębie kultur - wczesnych prekursorów (EP), monocytów (Mono) i dojrzałych makrofagów (Mat mac). Zmniejszenie liczby dodatnich zdarzeń PI, spowodowane usunięciem zdarzeń fałszywie dodatnich, jest bardziej wyraźne w dużych dojrzałych komórkach makrofagów niż w mniejszych wczesnych komórkach progenitorowych. Wnioski oparte na konwencjonalnych protokołach błędnie sugerowałyby dodatnią korelację w śmierci komórkowej dla bardziej dojrzałych podzbiorów makrofagów.
Nie stwierdzono konfliktu interesów.
Opisana jest dokładna metoda oceny śmierci komórki. Protokół ten jest lepszy od konwencjonalnych protokołów aneksyny V / jodku propidyny (PI), które wyświetlają do 40% zdarzeń fałszywie dodatnich w liniach komórkowych i komórkach pierwotnych z szerokiej gamy modeli zwierzęcych.
To badanie było wspierane przez grant badawczy Kanadyjskiej Rady Nauk Przyrodniczych i Inżynierii (NSERC) oraz grant Konsorcjum Finansowania Rolnictwa Alberty dla DRB. AMR jest wspierany przez stypendium NSERC Vanier Canadian Graduate Scholarship, asystenturę dydaktyczną University of Alberta oraz stypendium dla absolwentów Queen Elizabeth II.
| 1 x PBS-/- | |||
| 1 x bufor wiążący aneksynę V | BD Biosciences | 556454 | |
| Aneksyna V-Alexa Fluor 488 | Sondy molekularne, Life Technologies | A13201 | |
| Jodek propidyny (PI) | Sigma-Aldrich | P4864 | 1 mg / ml w H2O |
| 2% Formaldehyd | Sigma-Aldrich | F1268 | |
| RNaza A z trzustki bydlęcej | Sigma-Aldrich | R4642 | |
| DRAQ5 | Biostatus DR50050 | Rozcieńczyć 1:60 w 1 x PBS-/- |