1. Montaż bioreaktora
Szczegółowe schematy konstrukcji i montażu bioreaktora, zarówno do decelularyzacji, jak i hodowli, przedstawiono odpowiednio na rysunkach 1 i 2. Wszystkie komponenty muszą zostać wysterylizowane przed montażem bioreaktora. Należy zwrócić uwagę na następujące kwestie:
POŁĄCZENIA:
- Kaniula tętnicza składa się z złącza Luer-lock połączonego z rozdzielaczem w kształcie litery Y krótkim odcinkiem rurki. Złącze Luer-lock jest przymocowane do rurki perfuzyjnej, a odgałęzienie rozdzielacza Y, które nie jest przyszyte do tętnicy płucnej, jest połączone z zaworem jednokierunkowym. Zawór jednokierunkowy jest zorientowany w taki sposób, aby ciecz mogła być zasysana do rurki (w kierunku przeciwnym do perfuzji), natomiast podczas perfuzji narządu całe medium przepływa do płuca.
- Kaniula tchawicza również składa się ze złącza Luer-lock połączonego rurką z rozdzielaczem w kształcie litery Y. Złącze Luer-lock łączy się z pętlą oddechową między rezerwuarem tchawiczym a komorą główną. Odgałęzienie rozdzielacza Y, które nie jest przyszyte do tchawicy, jest również połączone z zaworem jednokierunkowym. Zawór jednokierunkowy jest zorientowany w ten sam sposób, co w przypadku kaniuli tętniczej.
FUNKCJE:
- Zawory jednokierunkowe w kaniulach tętniczych i tchawiczych służą do usuwania pęcherzyków powietrza z przewodów poprzez umożliwienie odwrócenia kierunku przepływu, co pozwala na ich usunięcie.
- „Pętla oddechowa” zawiera dwa zawory jednokierunkowe, rozmieszczone w taki sposób, aby medium wpływało do płuca i wypływało z niego różnymi drogami. Bardziej szczegółowy opis tej funkcji znajduje się w poprzedniej publikacji naszego laboratorium2.
- Perfuzja naczyniowa jest realizowana za pomocą pompy perystaltycznej. Medium jest wprowadzane do tętnicy płucnej poprzez dołączoną kaniulę, przepływa przez unaczynienie płuca i wypływa żyłą płucną bezpośrednio do głównego bioreaktora, z którego medium jest pobierane do ponownej perfuzji.
2. Pobranie narządu
- Uśmiercić dorosłe (3-6 miesięczne) szczury Fischer 344 poprzez przedawkowanie pentobarbitalu sodowego, zgodnie z wytycznymi American Veterinary Medical Association (60 mg/kg IP). Uwaga: roztwór pentobarbitalu zawiera heparynę w stężeniu 100 units/ml w celu przeciwprzekrzepowego działania.
- Spryskać lub przetrzeć klatkę piersiową i brzuch 70% etanolem.
- Otworzyć jamę klatki piersiowej, odsłaniając serce i płuca, uważając, aby nie uszkodzić płuc. Ostrożnie wykonać małe okno w przeponie do jamy klatki piersiowej, co spowoduje cofnięcie się płuc, a następnie poszerzyć to nacięcie poziomo, aby odsłonić podstawy płuc. Wykonać dwa nacięcia pionowo przez żebra i odsunąć klatkę piersiową, aby odsłonić serce i płuca.
- Przygotować system perfuzji grawitacyjnej, np. używając strzykawki bez tłoka, trójdrożnego kurka oraz ok. 20cm drenu z igłą 1,5 cala o rozmiarze 21G. Utrzymywać strzykawkę na wysokości ok. 20cm nad zwierzęciem za pomocą statywu z obejmą. Upewnić się, że z drenu perfuzyjnego usunięto całe powietrze.
- Przeciąć prawy przedsionek, aby odprowadzić krew i zapobiec jej powrotowi do płuc. Pomocne, choć niekoniecznie niezbędne, może być również przecięcie lewego przedsionka, aby umożliwić łatwy odpływ krwi i perfuzatu z płuc.
- Wprowadzić igłę do podstawy prawej komory i otworzyć kurek, aby przeprowadzić perfuzję płuc roztworem heparyny i nitroprusydu sodu (odpowiednio 50U/ml i 1ug/ml) w PBS. Potwierdzić, że tętnica płucna wypełnia się płynem perfuzyjnym, a krew jest wypłukiwana z płuc. W razie potrzeby doppełnić strzykawkę perfuzyjną dodatkowym płynem. Zazwyczaj wymagane jest jedynie ok. 10ml.
- Kontynuować perfuzję do momentu, aż płuca zostaną oczyszczone z krwi, a następnie przerwać proces.
- Wypreparować tchawicę, prowadząc ją w górę szyi tak daleko, jak to możliwe. Upewnić się, że tchawica jest oddzielona od przełyku. Przeciąć wszystkie pozostałe połączenia z sercem, płucami i tchawicą, a następnie usunąć je en bloc.
- Za pomocą skalpela lub ostrych nożyczek odciąć wierzchołek serca, odsłaniając prawą i lewą komorę.
- Zakanulować pień płucny poprzez prawą komorę i przymocować szwem. Usunąć nadmiar tkanki lewej komory.
- Zakanulować tchawicę i przymocować szwem. Upewnić się, że zarówno kanula tchawicy, jak i kanula tętnicy płucnej są rozmieszczone w taki sposób, aby nie występowały naprężenia skrętne tchawicy, płuc lub dużych naczyń (Rysunek 1).
- Upewnić się, że w kanuli tętniczej nie ma pęcherzyków powietrza, ponieważ uwięzione w systemie powietrze może uniemożliwić stały przepływ przez narząd. W niektórych przypadkach pęcherzyk powietrza może całkowicie zatrzymać przepływ płynu. Aby to osiągnąć, umieścić blok serce/płuca w słoiku z PBS. Użyć strzykawki z igłą, aby wstrzyknąć niewielką ilość PBS do kanuli serca w celu wypchnięcia pęcherzyków powietrza.
- Przepłukać drogi oddechowe PBS 4-5 razy, aby usunąć z płuc jak najwięcej powietrza.
- Po zakończeniu etapów płukania, wypełnić płuca PBS zawierającym nitroprusyd sodu (SNP) w stężeniu 1ug/ml. Zamknąć kanulę tchawicy korkiem, aby roztwór pozostał w płucach. Pozostawić płuca do inkubacji do 30 minut, podczas gdy ten sam roztwór przepływa przez naczynia krwionośne przez tętnicę płucną, aby umożliwić wazodylatację.
- Połączyć serce/płuca z nakrętką bioreaktora za pomocą złączy luer-lock połączonych z kanulami w kształcie litery Y, opisanych powyżej w sekcji „Montaż bioreaktora” (Rysunek 1).
3. Decelularyzacja organu
- Podłącz nakrętkę (z przymocowanymi płucami) do aparatury do decelularyzacji (Rysunek 1). Kanula tętnicy płucnej powinna być podłączona do linii perfuzyjnej, a kanula tchawicy powinna pozostawać wolna. Upewnij się, że we wszystkich liniach nie ma powietrza. Jak opisano powyżej, powietrze w liniach może być przyczyną nieprawidłowej decelularyzacji poprzez blokowanie przepływu płynu do decelularyzacji. Powietrze uwięzione w układzie może również utrzymywać się podczas hodowli, co może negatywnie wpłynąć na przeżywalność komórek3.
- Napompuj płuco PBS/SNP, aż będą one pełne, ale nie nadmiernie rozprężone. Natychmiast zamknij kanulę tchawicy, aby płuco pozostało napompowane.
- Perfunduj płuco PBS/SNP przez co najmniej 15 min przy ciśnieniu ~15 mmHg (ciśnienie 20cm H2O). Po 15 min lub dłużej usuń korek z kanuli tchawicy, aby umożliwić zapadnięcie się płuca.
- Kontynuuj perfuzję PBS/SNP przez 30 min. W razie potrzeby uzupełnij PBS/SNP, aby zapewnić utrzymanie ciśnienia perfuzji na poziomie 10-15 mmHg.
- Rozpocznij perfuzję roztworem do decelularyzacji (8mM CHAPS, 1M NaCl, 25mM EDTA w 1X PBS). Zadbaj o to, aby we wszystkich liniach nie było powietrza. System próżniowy może być pomocny w celu zapewnienia ssania.
Przeprowadź perfuzję roztworem do decelularyzacji, aż przez płuco przepłynie 500ml roztworu. Optymalne ciśnienie wynosi <15 mmHg (~20 cm H2O). Proces ten zazwyczaj trwa 2,5 godziny. Szybkość przepływu jest początkowo bardzo niska (0,2-0,5ml/minutę), a w drugiej godzinie gwałtownie wzrasta do około 1ml/minutę lub więcej. Okresowo usuwaj zużyty płyn do decelularyzacji z bioreaktora, dbając o to, aby pozostało wystarczająco dużo płynu do utrzymania płuca i kaniuli tchawiczej.
4. Płukanie i sterylizacja organu
- Przenieś płuca i bioreaktor do komory z laminarnym przepływem powietrza. Rozpocznij płukanie sterylnym PBS, usuwając słoik 500 ml zawierający płyn do decelularyzacji i zastępując go sterylnym słoikiem zawierającym do 1 L sterylnego PBS. Użyj ssania próżniowego, aby upewnić się, że przewody są wolne od powietrza.
- Przeprowadź perfuzję PBS przez układ naczyniowy przy ciśnieniu 10-15 mmHg, w ten sam sposób, co w przypadku decelularyzacji. Okresowo usuwaj zużyty PBS z bioreaktora i wymieniaj i/lub uzupełniaj słoik PBS świeżym, sterylnym roztworem PBS. Zaleca się stosowanie technik sterylnych.
- Kontynuuj płukanie, aż przez płuca zostanie przepuszczone co najmniej 2,5 L sterylnego PBS.
- Przenieś płuca do nowego, sterylnego systemu bioreaktora zawierającego świeży PBS. Upewnij się, że zarówno cały obieg perfuzyjny, jak i wszystkie linie dróg oddechowych są wypełnione płynem. We wszystkich kolejnych krokach należy użyć pompy pulsacyjnej do perfuzji płuc z prędkością 5 ml/min.
- Sterylizuj rusztowanie (scaffold) albo poprzez nocną perfuzję roztworem PBS + 10% FBS + 10% pen-strep, albo przez 3 godziny kwasem nadoctowym 0,1% w PBS. Ta druga metoda będzie wymagać płukania płuc przy trzech wymianach 250 ml PBS w ciągu kilku godzin w celu usunięcia pozostałości kwasu. Podczas każdego płukania płuca powinny być zarówno wentylowane, jak i perfundowane, aby zapewnić dokładne wypłukanie wszystkich części tkanki.
- Przenieś płuca do inkubatora w temperaturze 37°C i perfunduj PBS z dodatkiem 10% FBS i 10% penicyliny/streptomycyny przez ok. 1 h lub do wyrównania temperatury, w przygotowaniu do traktowania benzonukleazą.
- Potraktuj płuca benzonukleazą w celu usunięcia pozostałości DNA:
- Podgrzej bufor do benzonukleazy (patrz Tabela Odczynników) do 37°C.
- Dla każdych płuc napełnij jedną strzykawkę 10 ml samym buforem do benzonukleazy i jedną strzykawkę 10 ml roztworem benzonukleazy w buforze o stężeniu 90 U/ml.
- Zatrzymaj perfuzję płuc.
- Wypełnij drogi oddechowe buforem do benzonukleazy.
- Pozwól płucom się opróżnić (przez ok. 1 minutę). Następnie wypełnij płuca roztworem benzonukleazy. Podczas wprowadzania buforu do benzonukleazy i samej benzonukleazy staraj się nie wprowadzać powietrza do płuc.
- Pozostaw płuca bez perfuzji i wentylacji w temperaturze 37°C przez 1 godzinę po wprowadzeniu benzonukleazy.
- Wznów perfuzję roztworem PBS + 10% FBS, 10% penicyliny/streptomycyny, który znajduje się już w bioreaktorze, i kontynuuj przez noc. Następnego dnia płuca mogą być przechowywane w temperaturze 4°C (do 3 miesięcy) lub przygotowane do zasiewu komórek.
- Aby przygotować rusztowanie do ponownego zasiedlenia komórkami, zastąp roztwór PBS/FBS/benzonukleaza ok. 250 ml pożywki hodowlanej. Przeprowadź perfuzję przez co najmniej jedną godzinę przed wprowadzeniem komórek, a bezpośrednio przed ich zasiewem wymień pożywkę na świeżą.
5. Recelularyzacja
Wybór źródła komórek do ponownego zasiedlania organu pozostaje w gestii poszczególnych badaczy. Można wykorzystać wiele źródeł komórek, w tym populacje dostępne komercyjnie, świeżo izolowane komórki płucne noworodkowe lub płodowe, embrionalne komórki macierzyste lub inne komercyjne źródła komórek. Specyficzne protokoły izolacji dla tych populacji komórek można znaleźć w innych opracowaniach4,5,6. W niniejszej pracy przedstawiamy instrukcje dotyczące wysiewu populacji komórek śródbłonka oraz nabłonka.
Obsiewanie komórkami śródbłonka:
- Przygotuj zawiesinę wybranej populacji komórek śródbłonka w odpowiednim medium hodowlanym. Przefiltruj zawiesinę komórkową przez sito komórkowe o oczkach 40um, aby usunąć skupiska komórek. Typowe zasiewanie komórek śródbłonka w naszym laboratorium wykorzystuje około 30 milionów komórek śródbłonka mikrokrążenia płuc szczura w 60ml medium hodowlanego.
- Przenieś zawiesinę komórkową do niewielkiego zbiornika tymczasowo włączonego do pętli perfuzyjnej bioreaktora (Rysunek 2). Upewnij się, że w przewodach wychodzących z tego zbiornika oraz w całej pętli perfuzyjnej nie ma pęcherzyków powietrza.
- Wprowadź komórki do tętnicy płucnej z przepływem 3ml/min, używając pompy perystaltycznej.
- Po infuzji komórek kontynuuj perfuzję medium recyrkulowanym z głównego bioreaktora z żądaną prędkością.
- Codziennie sprawdzaj, czy w przewodach perfuzyjnych nie ma pęcherzyków powietrza.
- Medium należy regularnie wymieniać na świeże; zazwyczaj odbywa się to co 3-4 dni.
Wysiew komórek nabłonka:
- Przygotować zawiesinę komórkową pożądanej populacji komórek nabłonkowych. W naszym laboratorium zazwyczaj składa się ona z około 50-100 milionów neonatalnych komórek płuc szczura. Przefiltrować populację przez sito komórkowe 40um i zawiesić w 15ml pożywki hodowlanej w strzykawce. Napełnić zbiornik dróg oddechowych 80ml pożywki hodowlanej.
- Umieścić bioreaktor w inkubatorze do hodowli tkanek w temperaturze 37°C i podłączyć pompę strzykawkową do wentylacji. Upewnić się, że we wszystkich liniach wentylacyjnych nie ma pęcherzyków powietrza.
- Zasiać komórki do płuc, wstrzykując 15ml zawiesiny komórkowej w formie pojedynczego bolusa do kaniuli tchawiczej.
- Natychmiast rozpocząć jeden powolny wdech za pomocą pompy strzykawkowej. Wdech ten jest realizowany poprzez odessanie 60ml powietrza z głównego bioreaktora z prędkością 3ml/minutę, co trwa około 20 minut. Należy upewnić się, że filtry powietrza w głównym bioreaktorze zostały zamknięte bezpośrednio po wstrzyknięciu zawiesiny komórkowej i przed rozpoczęciem powolnego wdechu.
- Pozostawić płuca w spoczynku przez około 18h, a następnie rozpocząć powolną perfuzję naczyniową (około 0,5 ml/min).
6. Hodowla organów
Chociaż szczegóły perfuzji i wentylacji będą się różnić w zależności od projektu eksperymentalnego, należy zwrócić uwagę na następujące kwestie:
- Podczas hodowli śródbłonka perfuzję wykonuje się zazwyczaj z prędkością 1-3 ml/min przy użyciu pompy perystaltycznej. W przypadku hodowli nabłonka wentylację zapewnia się zazwyczaj w stałym tempie 1 oddechu na minutę przy użyciu pompy strzykawkowej. Aby uzyskać wentylację płuc z normalną objętością pływową, zazwyczaj wymagane jest odessanie 5-10 ml powietrza z głównego bioreaktora. Ze względu na konieczność utrzymania szczelności bioreaktora podczas wentylacji, należy codziennie przerywać wentylację i wymieniać powietrze w głównej komorze. Całe powietrze w systemie to powietrze pokojowe, które zawiera około 21% tlenu w ciśnieniu parcjalnym. Odessanie 5-10 ml powietrza z bioreaktora (co indukuje wdech 5-10 ml płynu przez płuco) zależy od wielkości płuca oraz liczby hodowanych płatów (płaty mogą być wiązane w celu analizy, podczas gdy pozostałe płaty pozostają w hodowli). Ilość powietrza odsysanego przez pompę strzykawkową dobiera się tak, aby odpowiadała „objętości pływowej” hodowanego płuca.
- Pożywkę należy wymieniać mniej więcej co 3-4 dni w trakcie hodowli.
- Podczas kokultury nabłonka i śródbłonka, w eksperymentach prowadzonych w naszym laboratorium w pierwszej kolejności wysiewa się nabłonek na 4-8 dni, podczas których tkanka inżynieryjna jest wentylowana. Następnie śródbłonek jest wysiewany poprzez perfuzję, po czym tkanka jest poddawana zarówno perfuzji, jak i wentylacji.
7. Reprezentatywne wyniki:
Decelularyzacja
Przy prawidłowym wykonaniu protokołu, świeżo wyekstrahowane płuca powinny utrzymywać powietrze bez przecieków. Można to sprawdzić, napowietrzając je podczas zanurzenia w cieczy – nie powinny pojawić się pęcherzyki wskazujące na wycieki powietrza. Następująca po tym decelularyzacja powinna umożliwić przepływ ~500ml płynu do decelularyzacji przez płuca w czasie od 2,5 do 3 godzin w temperaturze 37°C, a pod koniec płukania PBS powinien być w stanie przepływać przez płuca z prędkością około 10 ml/min (pod ciśnieniem hydrostatycznym ~15 mm Hg). Po traktowaniu 0,1% kwasem nadoctowym oraz benzonukleazą, płuca mogą być przechowywane w temperaturze 4°C do 3 miesięcy i nadal pozostawać odpowiednie do recelularyzacji.
Końcowa odkomórkowiona macierz zewnątrzkomórkowa powinna być całkowicie pozbawiona materiału komórkowego i zachowywać cechy makroskopowe, mikroskopowe oraz ultrastrukturalne natywnego płuca. Niewystarczająca odkomórkowanie lub płukanie może spowodować „przywieranie” pozostałości DNA do rusztowania, co można zwizualizować za pomocą standardowego barwienia hematoksyliną i eozyną (por. Rycina 3).
Repopulacja macierzy acelularnej i hodowla tkanki płucnej
Jeśli komórki zostały niedawno wyizolowane z 7-dniowych noworodków szczurów, zgodnie z opisem w uzupełnieniu online towarzyszącym pracy Petersena i współpracowników4, można spodziewać się uzyskania 120-150 milionów komórek z miotu 10 szczurząt (nieco ponad 10 milionów komórek z jednego noworodka).
Optymalne warunki wysiewania komórek i ich późniejszej hodowli płuc w bioreaktorze powinny zapewnić równomierne rozmieszczenie komórek we wszystkich 5 płatach płuc oraz pokrycie około 70% rusztowania z macierzy pozakomórkowej (Rycina 3). Hodowana populacja komórek powinna wykazywać pozytywną ekspresję kluczowych markerów komórek układu oddechowego, takich jak prosekretoryjne białko C (SPC), białko sekrecyjne komórek Clary (CCSP) oraz akwaporyna-5 (AQP), w kolejności malejącej liczebności (Rycina 4).

Rycina 1. Położenie kaniul i bioreaktor do decelularyzacji

Rycina 2. Bioreaktor wykorzystywany do zasiewu i hodowli inżynieryjnej tkanki płucnej

Rysunek 3. Histologia płuc natywnych, decelularyzowanych i repopulowanych

Rycina 4. Barwienie immunofluorescencyjne dla kluczowych markerów płuc