1. Disekcja przewodu pokarmowego myszy
- Eutanazja myszy zgodnie z lokalnymi wytycznymi IUCAC
- Przytwierdzenie każdej kończyny do powierzchni styropianowej i opłukanie brzucha 70% ethanolem. Otwarcie jamy brzusznej poprzez długie cięcie wzdłuż linii środkowej od przepony do spojenia łonowego. Wykonanie jednego cięcia w obrębie dystalnej części przełyku oraz drugiego cięcia w obrębie dystalnej części jelita grubego i usunięcie całego odcinka przewodu pokarmowego od żołądka do odbytu en bloc, uważnie przecinając więzadła w okolicy dwunastnicy i kątnicy za pomocą małych nożyczek. Umieszczenie przewodu pokarmowego w szalce Petriego z PBS. Usunięcie krezki za pomocą pęsety (Rysunek 1). W celu oddzielenia żołądka, jelita cienkiego i jelita grubego, należy przeciąć je w obrębie odźwiernika oraz połączenia żołądkowo-kątniczego. Przepłukanie światła każdej części przewodu pokarmowego PBS przy użyciu strzykawki 5ml z przymocowaną igłą do karmienia (starsze myszy) lub igłą tępą (młodsze myszy).
- Otwarcie żołądka, jelita cienkiego i jelita grubego wzdłuż krawędzi krezkowej. Wycięcie dwóch fragmentów z każdej części przewodu pokarmowego: jednego do wizualizacji całego preparatu (whole mount) i jednego do kriosekcji.
2. Przygotowanie próbek do całego preparatu oraz immunobarwienie
- Każdy fragment przewodu pokarmowego umieścić w probówce mikrocentryfugi o pojemności 1,5 ml wypełnionej 1,0 ml lodowatego acetonu i utrwalać próbki przez co najmniej 1 godzinę w temperaturze 4°C. Próbki można przechowywać do 1 tygodnia w temperaturze -20 °C. Zazwyczaj przechowujemy próbki w acetonie i przystępujemy do przygotowania skrawków mrożonych.
- Próbkę przemyć 2X w PBS. Umieścić próbkę w szalce Petriego z PBS. Pod mikroskopem stereotypowym ostrożnie zeskrobać warstwę śluzówki skalpelem, trzymając jeden koniec pęsetą, pozostawiając warstwę mięśniową.
- Mięsień można pociąć na 5mm fragmenty w celu barwienia różnymi przeciwciałami. Nie przechowywać w PBS dłużej niż 2 dni przed barwieniem.
- Etapy blokowania i inkubacji można przeprowadzić w jednej studience płytki 24-dołkowej lub w probówce mikrocentryfugi 1,5ml. Blokować za pomocą 0,5 ml buforu blokującego (5% surowicy koziej, 0,1% Triton X-100 w PBS przez 1 godzinę w 4 °C).
- Inkubować z przeciwciałem pierwszorzędowym rozcieńczonym w buforze blokującym i rotować przez noc w 4 °C. Do immunobarwienia całych preparatów (whole mount) pomyślnie zastosowaliśmy przeciwciała: szczurze przeciwko Kit (ACK-2), królicze przeciwko Ano1 oraz królicze przeciwko Pgp9.5.
- Przemywać przez 5 min 2X w PBS na rotatorze w temperaturze pokojowej.
- Inkubować z przeciwciałem wtórnym rozcieńczonym w buforze blokującym przez 2 godziny w temperaturze pokojowej na rotatorze. Zazwyczaj stosujemy przeciwciała Alexa Fluor 488 anty-królicze oraz Alexa Fluor 594 anty-szczurze.
- Przemywać przez 15 min 3X w PBS na rotatorze w temperaturze pokojowej.
- Zamontować na szkiełku, stroną surowiczą do góry, aby zapewnić odpowiednią orientację tkanki podczas mikroskopii. Taka orientacja sprawi, że strona surowicza będzie przylegać do szkiełka nakrywkowego i zostanie napotkana jako pierwsza podczas ustawiania ostrości preparatu pod mikroskopem. Czynność tę wykonujemy pod mikroskopem stereotypowym. Czasami krótko badamy tkankę pod mikroskopem fluorescencyjnym w celu prawidłowej orientacji. Podczas wizualizacji Kit lub Ano1 pod mikroskopem fluorescencyjnym, sieć ICC-MY powinna być widoczna jako pierwsza od strony szkiełka nakrywkowego. Następnie odessać jak najwięcej PBS, nie doprowadzając do całkowitego wyschnięcia. Dodać 50 μl utwardzającego medium montażowego (stosujemy Prolong Gold) i delikatnie nałożyć szkiełko nakrywkowe na tkankę. Pozostawić medium do utwardzenia przez noc w temperaturze pokojowej i przechowywać szkiełka w -80 °C.
- Do badania mikroskopowego wykorzystaliśmy mikroskop szerokopolowy z napędem Z (Z-drive). Użyliśmy obiektywu powietrznego 20X (NA 0,75, plan apochromat) lub obiektywu olejowego 60X (NA 1,4, plan apochromat) i wykonaliśmy sekcje Z o grubości 2 μm lub 1 μm obejmujące całą warstwę mięśniową. Obrazy zostały następnie poddane dekonwolucji przy użyciu oprogramowania Autoquant. Alternatywnie, wielu innych badaczy stosowało mikroskopię konfokalną, uzyskując podobne wyniki.
3. Przygotowanie kryptostyków i immunostainig
- Każdy odcinek przewodu pokarmowego należy położyć płasko na papierze filtracyjnym, stroną sierozy do dołu. Wyciąć papier filtracyjny wokół tkanki. Tkankę na papierze filtracyjnym umieścić w 4% paraformaldehydzie (PFA) w PBS (32% paraformaldehyd z zamkniętej fiolki rozcieńczamy w PBS bezpośrednio przed użyciem) na 2 godziny w temperaturze pokojowej. Fixację można przeprowadzić w płytce 6- lub 12-dołkowej, zależnie od wielkości tkanki, lub w probówce do mikrocentrifugowania o pojemności 1,5 ml. W przypadku użycia płytki, należy zastosować parafilm, aby zminimalizować ekspozycję na PFA. Dłuższy czas fixacji może prowadzić do maskowania antygenów, w szczególności w przypadku przeciwciała ACK-2 anty-Kit.
- Wyjąć tkankę z PFA i umieścić w 30% sacharozie w PBS. Pozostawić tkankę do całkowitego zatonięcia przez noc w temperaturze 4 °C.
- Równoważyć tkankę w stosunku 1:1 sacharozy 30% i O.C.T. przez 1 godzinę. Następnie zamontować tkankę pionowo w formie do kriostatu wypełnionej O.C.T. Oś podłużna przewodu pokarmowego powinna być równoległa do płaszczyzn cięcia krioszek. Przy badaniu myszy o różnych genotypach lub poddanych różnym zabiegom, pomocne może być umieszczenie tkanek od różnych zwierząt w tej samej formie, aby zapewnić równoległe przetwarzanie. Zamrozić na suchem lodzie i przechowywać w zamrażarce w temperaturze -80 °C.
- Przygotować krioskrawki o grubości 10 μm na szkiełkach i przechowywać w zamrażarce w temperaturze -80 °C. Zazwyczaj wykonujemy dwa skrawki na jedno szkiełko. Zazwyczaj wykonujemy również barwienie H&E jednego skrawka.
- W przypadku immunofluorescencji, najpierw doprowadzić szkiełko do temperatury pokojowej przez 15 minut. Następnie obrysować tkankę kółkiem za pomocą pisaka PAP.
- Blokować 150 μl buforu blokującego (takiego samego, jak do immunobarwienia całych preparatów) przez 1 godzinę.
- Odssać bufor blokujący, dodać 150 μl przeciwciała pierwszorzędowego rozcieńczonego w buforze blokującym i inkubować przez noc w temperaturze 4 °C w komorze wilgotnej.
- Przemywać PBS przez 5 min (2X).
- Inkubować z przeciwciałem wtórnym rozcieńczonym w buforze blokującym przez 2 godziny w temperaturze pokojowej. Typowo stosujemy przeciwciała Alexa 488 anty-rabbit i Alexa 594 anty-rat.
- Przemywać PBS przez 15 min (3X).
- Odssać nadmiar cieczy ze szkiełka, nie wysuszając całkowicie tkanki. Dodać kroplę twardniejącego medium montażowego z DAPI (stosujemy Prolong Gold) i nałożyć szkiełko zakrywające #1.5. Pozostawić szkiełko w temperaturze pokojowej na noc do utwardzenia, a następnie przechowywać w zamrażarce w temperaturze -80 °C.
- Pozyskać obrazy potrójnej fluorescencji, korzystając z zestawów filtrów DAPI, FITC i Texas Red.
4. Reprezentatywne wyniki:
W niniejszym przypadku jako przykład wykorzystano jelito grube. Barwienie H&E zamrożonego przekroju utrwalonego z ochroną sacharozą, użytego do immunofluorescencji, wykazuje pewne artefakty w porównaniu z referencyjnym przekrojem parafinowym (Rycina 2), gdzie żółta linia wyznacza sploty mienteryczne między okrężną a podłużną warstwą mięśniową, a zielona linia wyznacza granicę między błoną śluzową a warstwą mięśniową. Analizując krioprzekrój, od błony surowiczej do błony śluzowej, najpierw napotykamy cieńszą warstwę mięśni podłużnych (LM), a następnie grubszą warstwę mięśni okrężnych (CM). Przekrój powinien być równoległy do mięśni podłużnych, zatem jądra LM powinny być nieco wydłużone, podczas gdy jądra CM powinny być małe i okrągłe. Pomiędzy LM a CM znajdują się sploty mienteryczne złożone z neuronów barwionych markerem Pgp9.5. Pgp9.5 barwi również wypustki neuronalne w obrębie CM. Sieć komórek ICC mienterycznych (ICC-MY) otacza splot mienteryczny i składa się z komórek multipolarnych. W warstwie mięśni podłużnych występują rzadkie ICC domięśniowe (ICC-IMs), które są komórkami bipolarnymi biegnącymi równolegle do mięśnia. W warstwie mięśni okrężnych występuje liczne ICC-IM, które również są komórkami bipolarnymi biegnącymi równolegle do mięśni okrężnych i są przekrojone w poprzek w tym preparacie. Na połączeniu warstwy mięśniowej i błony podśluzowej znajduje się podśluzowa sieć ICC składająca się z ICC-SMP, która jest płaską siecią multipolarnych ICC. Analizując immunostaining Kit w preparatach całych fragmentów (whole mount) jelita grubego, należy spodziewać się, że w miarę ustawiania ostrości od szkiełka podstawowego (Rycina 3), najpierw napotka się sieć ICC-MY, a następnie ICC-IM warstwy CM oraz sieci ICC-SMP. Opisano pomiary wolumetryczne sieci ICC z wykorzystaniem rekonstrukcji 3D obrazów whole-mount10. Przy użyciu mikroskopu szerokopolowego w surowych obrazach występuje znaczna fluorescencja poza płaszczyzną ostrości, którą można usunąć po dekonwolucji (Rycina 3). Niepełne usunięcie błony śluzowej spowoduje wysoką fluorescencję tła. ANO1 jest innym markerem ICC, a wspólne barwienie immunochemiczne KIT i ANO1 wykazuje całkowitą zgodność barwienia ICC (Rycina 4).

Rysunek 1. Reprezentatywny preparat rozsektowanego przewodu pokarmowego myszy, przedrukowany za zgodą13.

Rysunek 2. A) Reprezentatywne barwienie H&E jelita grubego myszy w mrożonych przekrojach przygotowanych zgodnie z opisem oraz referencyjny przekrój zatopiony w parafinie, wykazujący pewne artefakty kurczenia się w przypadku mrożonych przekrojów. Żółta linia wyznacza splot mięśniowy, a niebieska linia oddziela błonę śluzową od warstwy mięśniowej. B) Reprezentacyjna podwójna immunofluorescencja Kit (czerwony, ACK-2) i Pgp9.5 (zielony) z przeciwbarwieniem DAPI (niebieski) w jelicie grubym myszy. LM: mięsień podłużny, CM: mięsień okrężny. Pasek skali 20 μm.

Rysunek 3. Reprezentatywna immunofluorescencja całego preparatu (whole-mount) z użyciem przeciwciał przeciwko Kit (czerwony, ACK-2) tego samego pola w trzech płaszczyznach ogniskowych: płaszczyzna ICC-MY na granicy LM/CM, płaszczyzna ICC-IM w obrębie CM oraz płaszczyzna ICC-SMP na granicy CM/podśluzówki. Przedstawiono obrazy surowe oraz obrazy po dekonwolucji. Pasek skali 20 μm.

Rysunek 4. Reprezentatywna podwójna immunofluorescencja białek Ano1 (zielony) i Kit (czerwony, ACK-2) w jelicie grubym. Pasek skali 20 μm.