1. Fixacja mózgu in situ
*Przygotować strzykawkę 10 ml (igła 28 G) wypełnioną solą fizjologiczną z buforem fosforanowym (PBS).
*Przygotować strzykawkę 10 ml (igła 28 G) wypełnioną 4% paraformaldehydem (PFA) w PBS. Odstawić dodatkowe 5-10 ml PFA/PBS do późniejszej fiksacji.
- Wstrzyknij myszy doświadczalnej dootrzewnowo dawkę śmiertelną Avertinu lub Nembutalu.
- Po uśpieniu myszy zwilż brzuch etanolem i przymocuj zwierzę do dna tacy wyłożonej korkiem, woskiem lub elastomerem silikonowym za pomocą szpilek sekcyjnych. Ustawiając brzuch do góry, przymocuj cztery łapy do powierzchni, rozsuwając je najszerzej jak to możliwe.
- Chwyć skórę pęsetą na wysokości mostka i przetnij ją w poprzek, aby odsłonić wątrobę. Przetnij tkankę bocznie, a następnie w górę przez żebra i przeponę. Usuń płat tkanki żebrowej i kontynuuj cięcie, aż serce stanie się dostępne.
- Przebij lub przetnij prawy przedsionek, aby odprowadzić krew z krwiobiegu.
- Wypłucz pozostałą krew z układu krążenia poprzez perfuzję PBS przez lewą komorę.
- Korzystając z tego samego otworu po igle, utrwal całą mysz poprzez następczą perfuzję PBS/PFA przez lewą komorę.
2. Disekcja i wyodrębnianie mózgu
- Usuń skórę z głowy, szyi i czaszki, przecinając tkankę wokół kanału słuchowego i oczodołów, a następnie odsuń skórę w kierunku przednim, aby odsłonić czaszkę.
*Ilustrację kroków od 2.2) do 2.5) przedstawiono na Rysunku 2
- Za pomocą nożyczek do kości wykonaj cięcie poprzeczne od oczodołu przez małżowiny nosowe. Powtórz tę czynność po obu stronach. Cięcie poprzeczne powinno znajdować się przed oczami i opuszki węchowymi.
- Wykonaj cięcia wzdłużne od każdego kanału słuchowego do oczodołu.
- Za pomocą małych nożyczek do sekcji przetnij płytkę kości potylicznej nad móżdżkiem, prowadząc cięcie od jednego kanału słuchowego do drugiego.
- Tymi samymi nożyczkami do sekcji przetnij tkankę w kierunku przednim wzdłuż linii środkowej do poziomu opuszek węchowych.
- Za pomocą pęsety usuń każdą płytkę kostną z mózgu, uważając, aby usunąć wszelką tkankę łączną, tak aby mózg pozostał nienaruszony podczas zdejmowania kości.
- Przetnij nerwy wzrokowe i czaszkowe, przetnij górne kręgi szyjne i przełóż mózg do utrwalacza.
- Przeprowadź do-utrwalanie przez 1-2 hrs w 4° C. Przemyj 3 razy po 15 min w PBS.
3. Osadzanie w agarozie
- Roztopić 2% agarozę typu I-B o wysokiej wytrzymałości i niskim punkcie żelowania (numer katalogowy Sigma: A0576) w soli PBS za pomocą kuchenki mikrofalowej.
- Przenieść roztopioną agarozę do probówki. Umieścić probówkę w ciepłym inkubatorze lub łaźni wodnej (40°-41° C) do momentu wyrównania temperatury.
- Przykleić utrwaloną tkankę mózgu do tłoka strzykawki do próbek za pomocą kleju cyjanoakrylowego (Rysunek 3A). Nanieść pędzlem cienką warstwę nasyconego roztworu sacharozy w PBS na powierzchnię tkanki mózgu, aby ułatwić późniejsze oddzielenie pierścienia agarozy od skrawków mózgu.
- Wcisnąć tłok z tkanką mózgu do obudowy tłoka (Rysunek 3B).
- Pipetować lub wlać ciepłą agarozę do obudowy tłoka, zakrywając tkankę mózgu. Unikać zamykania pęcherzyków powietrza w agarozie. Pęcherzyki powietrza w agarozie pogorszą jakość skrawków.
- Zacisnąć strzykawkę do próbek w zimnym (0° do -25° C) bloku chłodzącym na 1 minutę w celu utwardzenia agarozy (Rysunek 3C).
4. Sekcjonowanie skrawka mózgu za pomocą urządzenia Compresstome
- Zamontuj strzykawkę z próbką zawierającą tkankę mózgu w urządzeniu Compresstome (Rycina 3D).
- Ustaw krawędź żyletki w bliskiej odległości od wylotu strzykawki z próbką (Rycina 3E).
- Napełnij zbiornik buforowy roztworem PBS.
- Obróć mikrometr o wartość odpowiadającą grubości jednego przekroju, aby wysunąć blok tkanki mózgu w agarozie ze strzykawki z próbką.
- Naciśnij przycisk „start” na jednostce sterującej urządzenia Compresstome, aby rozpocząć proces sekcjonowania.
- Powtarzaj kroki 4.4) i 4.5), aż do uzyskania pożądanej liczby przekrojów o określonej grubości.
- Zbierz przekroje mózgu za pomocą pędzelka lub pipety i przenieś je do probówek lub dołków do barwienia wypełnionych PBS (Rycina 3F).
5. Przejaśnianie optyczne
- Przygotować roztwór glicerolu i PBS w stężeniu 75% obj.
- Odlać (lub odpipetować) połowę objętości buforu PBS użytego do płukania zebranych skrawków mózgu.
- Uzupełnić usuniętą objętość roztworem glicerolu/PBS.
- Pozostawić do osiągnięcia równowagi, delikatnie mieszając w temperaturze 4° C, aż skrawki opadną na dno.
- Powtarzać kroki od 6.2) do 6.4), aż końcowe stężenie glicerolu osiągnie 75%.
- Wymienić roztwór na 90% glicerol w PBS i pozostawić do osiągnięcia równowagi.
*Uwaga: Należy uważać, aby nie wprowadzić pęcherzyków powietrza podczas dodawania roztworów glicerolu. Roztwory należy wlewać powoli i delikatnie mieszać, ponieważ pęcherzyki powietrza będą zakłócać równomierną równowagę i przeniosą się na etap montowania preparatów na szkiełkach.
6. Montowanie skrawków do obrazowania
- Wytnij dwustronną taśmę uszczelniającą (SA-S-1L, Grace Bio-Labs) w kształcie otwartego prostokąta, dopasowanego do pola widzenia preparatu mikroskopowego (Superfrost Plus, 25 X 75 X 1 mm, kat. # 48311-703, VWR), z krawędziami o szerokości 2-3 mm.
- Za pomocą pipety lub pędzelka umieść skrawki mózgu w centrum prostokąta z taśmy klejącej. Nadmiar glicerolu usuń delikatnie poprzez aspirację.
- Ułóż skrawki mózgu na preparacie w pożądanej kolejności, używając pędzelka.
- Ostrożnie nałóż szkiełko nakrywkowe (24 X 60 mm, kat. # 48383-139, VWR) na taśmę klejącą, dbając o to, aby nie wprowadzić pęcherzyków powietrza. Delikatnie dociśnij szkiełko nakrywkowe, aby zapewnić kontakt z taśmą klejącą.
- Odsącz nadmiar glicerolu z krawędzi między preparatem a szkiełkiem nakrywowym.
- Uszczelnij krawędzie preparatu i szkiełka nakrywkowego za pomocą bezbarwnego laku do paznokci.
- Pozostaw do wyschnięcia przed obrazowaniem lub przechowuj długoterminowo w kasetkach do preparatów w temperaturze 4° C.
7. Reprezentatywne wyniki:
Obróbka, obrazowanie i analiza tkanki mózgowej znakowanej fluorescencyjnie stały się niezbędne w badaniach nad neurobiologią. Wiele z tych analiz wymaga zaawansowanych manipulacji genetycznych w celu uzyskania ekspresji reportera w ukierunkowanych podzbiorach neuronów, a następnie przeprowadzenia analiz obrazowych w niskiej i wysokiej rozdzielczości. Często ograniczenia eksperymentalne i techniczne uniemożliwiają uzyskanie tego typu danych z tego samego zwierzęcia lub w krótkim czasie. Przygotowanie optycznie przejaśnionych, półgrubych skrawków mózgu do obrazowania fluorescencyjnego pomaga rozwiązać ten problem. Przykład nienaruszonego grubego skrawka mózgu znakowanego genetycznie zmodyfikowanym wirusem wścieklizny zaprojektowanym do ekspresji EGFP, obrazowanego przy użyciu mikroskopii epifluorescencyjnej oraz konfokalnej, przedstawiono odpowiednio na Rysunku 4 i Rysunku 5. Do obrazowania epifluorescencyjnego wykorzystano mikroskop Leica M205 FA, a do akwizycji obrazów konfokalnych mikroskop Zeiss LSM 510. Ze względu na względną prostotę załączonego protokołu, metoda ta pozwala na uzyskanie użytecznych danych obrazowych z tkanki wykazującej ekspresję reporterów fluorescencyjnych w czasie krótszym niż jeden dzień i jest kompatybilna z mikroskopią świetlną w niskiej i wysokiej rozdzielczości.
Jeśli badacz zdecyduje się na włączenie dodatkowych metod znakowania pośmiertnego, barwienia immunohistochemicznego lub wykonania cieńszych skrawków, protokół ulega odpowiedniemu wydłużeniu. Opisana powyżej metoda stanowi jednak prosty i stosunkowo wysokoprzepustowy sposób przesiewania wzorców ekspresji białek reporterowych in vivo w nienaruszonym mózgu.

Rycina 1. Schemat blokowy przedstawiający procedurę fiksacji, sekcji, krojenia, klarowania i montażu półgrubych skrawków mózgu.

Rysunek 2. Schemat sekwencyjnych etapów cięcia w celu wyizolowania nienaruszonego mózgu myszy.

Rycina 3. Etapy montowania i krojenia tkanki mózgowej przy użyciu urządzenia Compresstome. A) Mocowanie tkanki mózgowej do tłoka tnącego za pomocą superglue. B) Wciąganie zamocowanej tkanki mózgowej do tłoka w celu zatopienia w agarozie. C) Utwardzanie wtyczki mózgowej z agarozy przy użyciu schłodzonego bloku kompresyjnego. D) Wprowadzenie wtyczki mózgowej z agarozy i tłoka do komory tnącej Compresstome. E) Wyrównanie żyletki względem urządzenia z tłokiem. F) Krojenie i zbieranie skrawków mózgu do komory z buforem Compresstome.

Rycina 4. Obrazy mikroskopii świetlnej grubego skrawka tkanki mózgowej oczyszczonej glicerolem, przechodzące przez korę czołową wykazującą ekspresję wzmocnionego zielonego białka fluorescencyjnego (EGFP). A) Przekrój czołowy mózgu myszy (grubość 200 um) oznakowany wektorem wirusowym ekspresującym EGFP i obrazowany w niskiej rozdzielczości za pomocą stereoskopu epifluorescencyjnego. Pasek skali, 2 mm.

Rysunek 5. Obraz przy dużym powiększeniu fluorescencyjnie znakowanych neuronów kory warstwy 5/6 w utransparentnionym grubym skrawku mózgu. A) Konfokalny obraz o wysokiej rozdzielczości z maksymalnej projekcji stosu Z (grubości 150 um) przez obszar zaznaczony na (Rysunku 4). Pasek skali, 25 um.