UWAGA: Dla tego protokołu musi być użyty odpowiedni wektor ekspresji ssaków. W tym przypadku używana jest pojedyncza konstrukcja zawierająca dwie kasety wyrażeń (tj. wyrażenie o ciężkim i lekkim łańcuchu jest sterowane przez oddzielne promotory). Ciężkie i lekkie łańcuchy trastuzumabu były wcześniej klonowane do wektora. Wektor ten był prezentem od Andrew Beavil, uzyskanym za pośrednictwem repozytorium plazmidów non-profit.
1. Odzyskiwanie i zwiększanie skali DNA wektora
UWAGA: DNA wektora zostało odebrane jako miękka kultura ukłucia agarem w szczepie Escherichia coli XL-1 Blue; wektor jest odporny na higromycynę.
- Włożyć sterylny zastrzyk lub pętelkę do miękkiego agaru kultury kłującej, a następnie przetrzeć płytkę z agarem Luria Bertani (LB) przygotowaną z 75 μg/ml higromycyny dla izolowanych kolonii. Inkubować płytkę w temperaturze 37 °C przez 18-24 godziny.
- Zaszczepić pojedynczą kolonię w 5 ml Terrific bulion (TB) zawierający 75 μg/ml higromycyny. Inkubować kulturę w temperaturze 37 °C przez 18-24 godziny, wytrząsając przy 225 obr./min.
- Użyć kultury przez noc, aby przygotować zapas glicerolu z DNA wektora, delikatnie mieszając 800 μl kultury z 200 μl 80% glicerolu w kriowiale i zamrażając w temperaturze -80 °C.
- Dodać 100 μl nocnej kultury do 100 ml gruźlicy zawierającej 75 μg/ml higromycyny w przegrodzie wytrząsającej (tj. rozcieńczenie 1:1 000). Inkubować kulturę w temperaturze 37 °C przez 18-24 godziny z wytrząsaniem 225 obr./min.
- Po całonocnej hodowli wyekstrahować i oczyścić kwas nukleinowy (DNA) dezoksyrybozy zgodnie z instrukcjami producenta dla zestawu do przygotowania midi/maxi, z następującym wyjątkiem: podczas ostatniego etapu wymyć lub ponownie zawiesić DNA wodą (pH 7,0-8,5).
- Sprawdzić stężenie i czystość DNA za pomocą odczytów absorbancji przy 260 i 280 nm, a następnie przechowywać DNA w temperaturze -20 °C.
UWAGA: Opcjonalnie (wysoce zalecane): Sekwencjonuj DNA przy użyciu starterów specyficznych dla wektora, aby potwierdzić tożsamość.
2. Stabilna transfekcja komórek HEK-293
- Hoduj i utrzymuj komórki HEK-293 (komórki zawiesinowe) zgodnie ze standardowymi protokołami w pożywkach bez surowicy uzupełnionych 0,1% niejonowym środkiem powierzchniowo czynnym w kolbach Erlenmeyera. Utrzymywać w dawce 2 x 105 komórek/ml i subkulturować co czwarty dzień. Komórki hodowlane w temperaturze 37 °C z 5% dwutlenkiem węgla (CO2 ) i obrotem 120 obr./min.
UWAGA: Komórki powinny znajdować się w hodowli nie krócej niż 4 dni i nie dłużej niż 4 tygodnie przed transfekcją. Komórki HEK-293 hodowane jako monowarstwy w pożywkach zawierających surowicę mogą być również używane do tej procedury.
- W dniu poprzedzającym transfekcję, wysiewaj komórki HEK-293 w ilości 3 x 105 komórek/ml w dołkach 12-dołkowej płytki w 2 ml zmodyfikowanego podłoża Eagle (DMEM) firmy Dulbecco, uzupełnionego 10% inaktywowaną termicznie płodową surowicą bydlęcą (FBS). W dniu transfekcji sprawdź, czy komórki osiągnęły 80-90% zbiegu
- Rozcieńczyć DNA i polietylenininę (PEI) oddzielnie w pożywce transfekcyjnej, a następnie wymieszać je ze sobą.
- Rozcieńczyć 1,25 μg wektora DNA na studzienkę (15 μg na 12 dołków) w 300 μl pożywki transfekcyjnej. Inkubować w temperaturze pokojowej przez 5 minut.
- Rozcieńczyć 2,5 μl roztworu PEI o stężeniu 1 mg/ml (30 μl na 12 dołków, tj. stosunek 1:2 DNA do PEI) w 300 μl pożywki do transfekcji. Inkubować w temperaturze pokojowej przez 5 minut.
- Dodaj rozcieńczone DNA do rozcieńczonego PEI, delikatnie wymieszaj i inkubuj w temperaturze pokojowej przez 15 minut.
- Dodawać kroplami 50 μl mieszaniny DNA/PEI do każdego dołka płytki. Delikatnie kołysz płytką, aby rozprowadzić mieszaninę transfekcji, a następnie umieść płytkę w temperaturze 37 °C, 5% CO2 na 24 godziny.
- Dodać 50 μg/ml higromycyny B na studzienkę i przywrócić płytkę do temperatury 37 °C, 5% CO2 na 10 dni.
UWAGA: Do 10 dnia nietransfekowane komórki obumrą i oderwą się od powierzchni płytki, podczas gdy stabilnie transfekowane komórki będą żywotne i przyczepione do płytki.
- Zastąp pożywkę w studzienkach pożywką bez surowicy o objętości 1/4 i DMEM o objętości 3/4 objętości uzupełnioną 10% FBS (tj. 0,5 ml pożywki bez surowicy + 1,5 ml DMEM = 7,5% końcowego stężenia w surowicy) i inkubuj przez 4 dni.
- Zastąp pożywkę w studzienkach pożywką bez surowicy o objętości 1/2 i DMEM o objętości 1/2 objętości uzupełnioną 10% FBS (tj. 1 ml pożywki bez surowicy + 1 ml DMEM = 5% końcowe stężenie w surowicy) i inkubuj przez 4 dni.
- Zastąp pożywkę w studzienkach pożywką bez surowicy o objętości 3/4 i DMEM o objętości 1/4 uzupełnioną 10% FBS (tj. 1,5 ml pożywki bez surowicy + 0,5 ml DMEM = 2,5% końcowego stężenia w surowicy) i inkubuj przez 4 dni.
- Zastąp pożywkę w studzienkach 2 ml pożywki bez surowicy uzupełnionej 0,1% niejonowym środkiem powierzchniowo czynnym (tj. 0% końcowym stężeniem surowicy) i inkubuj przez 4 dni.
UWAGA: Utrzymuj selektywny nacisk 50 μg/ml higromycyny B na komórki podczas adaptacji bez surowicy. Komórki przystosowane do pożywek bezsurowicowych odrywają się od powierzchni studzienek i mogą gromadzić się w zawiesinie. Patrz krok 2.1, aby zapoznać się z warunkami hodowli z dodatkowym dodatkiem 50 μg/ml higromycyny B.
- Za pomocą pipety delikatnie wymieszać kultury zawiesinowe na płytce 12-dołkowej i komórki puli w osobnej probówce.
- Za pomocą hemocytometru zliczyć połączone komórki i nasiona w 30 ml pożywki bez surowicy w kolbie Erlenmeyera przy 2 x 105 komórek/ml. Hodowla komórek w temperaturze 37 °C przy 5% CO2 i rotacji 120 obr./min. Subkultura i rozwijaj się co czwarty dzień.
- Kontynuuj zwiększanie wielkości hodowli do wymaganej gęstości komórek, aby uzyskać 10 fiolek o wymiarach 1 x 107 komórek/fiolkę do kriokonserwacji w ciekłym azocie. Zamrozić komórki w pożywce bez surowicy zawierającej 10% dimetylosulfotlenku (DMSO).
UWAGA: Kondycjonowane pożywki zawierające przeciwciała mogą być zbierane w każdej subkulturze w celu potwierdzenia produkcji białka lub wykorzystane do optymalizacji warunków oczyszczania. Aby zebrać kondycjonowaną pożywkę i utrzymać komórki do subkultury, odwiruj kulturę przy 300 x g przez 5 minut, a następnie przefiltruj i wysterylizuj supernatant przez filtr 0,22 μm. Przefiltrowany supernatant może być przechowywany w temperaturze 4 °C przez 1–2 tygodnie lub -20 °C w przypadku dłuższego przechowywania.
3. Produkcja przeciwciał na dużą skalę z hodowli nadmiernej
UWAGA: Produkcja przeciwciał może być kontynuowana od kroku 2.11, gdzie istniejące komórki są rozszerzane do wymaganej gęstości komórek w oparciu o objętość hodowli przerostu partii, która ma być ustawiona. W przeciwnym razie komórki, które zostały rozmrożone w wyniku kriokonserwacji, rozpoczynają się na tym etapie, gdy zostaną rozszerzone do odpowiedniej gęstości i objętości komórek. W celu optymalizacji produkcji przeciwciał można stosować różne suplementy hodowlane; W protokole tym wykazano zastosowanie tryptonu w celu zwiększenia wydajności przeciwciał.
- Komórki nasienne w ilości 2 x 10 5 komórek/ml w 100 ml pożywki bez surowicy w dwóch kolbach Erlenmeyera (w celu porównania wydajności przeciwciał z kultur niesuplementowanych i uzupełniających składniki odżywcze). Kultura w temperaturze 37 °C, 5% CO2 i 120 obr./min.
- Po 24 godzinach dodaj trypton do końcowego stężenia 0,5% do kultury wzbogaconej składnikami odżywczymi. Wyrównaj objętość nieuzupełnionej kultury za pomocą pożywki bez surowicy.
- Od 8 dnia codziennie wykonuj zliczanie komórek w kulturach za pomocą hemocytometru w celu monitorowania żywotności komórek. Zebrać supernatanty hodowlane, gdy żywotność komórek jest mniejsza niż 80%.
- Zebrać supernatant przez odwirowanie kultur przy 3 000 x g przez 15 minut, a następnie przefiltrować i wysterylizować supernatant (zawierający przeciwciało) przez filtr 0,22 μm. Przechowywać supernatanty w temperaturze 4 °C (krótkotrwale) lub zamrażać w temperaturze -20 °C (długotrwale).