$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Nasz obwód przepływu i komora przepływowa pozwalają nam poddawać przylegające ogniwa, np. EPC, określonym naprężeniom ścinającym płynu. Ponieważ górna i dolna część komory są przezroczyste, adhezja i morfologia komórek mogą być oceniane w czasie rzeczywistym, przez samą komorę lub po eksperymencie przepływu i demontażu komory przepływowej. W tym momencie komórki mogą być pobierane w sterylnych warunkach i albo ponownie powlekane, albo używane do zbierania ich DNA lub RNA itp., w celu dalszej analizy.
Aby uzyskać przepływ laminarny, konstrukcja komory musi być taka, aby spełnionych było kilka warunków.
Po pierwsze, przepływ musi być laminarny, co można zweryfikować, obliczając jego liczbę Reynoldsa (Re), która jest stosunkiem sił bezwładności do sił lepkości. (Jeśli przeważają siły lepkościowe, Re jest małe, a przepływ jest laminarny lub "w pełni rozwinięty" - zwykle dla Re < 2300. Jeśli przeważają siły bezwładności, przepływ staje się coraz bardziej przypadkowy, aż stanie się turbulentny, jak ma to miejsce w przypadku Re > 4000). Możemy obliczyć Re zgodnie z równaniem 3 8,

Gdzie ρ jest gęstością płynu, Q jest natężeniem przepływu, μ jest lepkością, w i h są odpowiednio szerokością i wysokością komory, a Dh jest średnicą hydrauliczną, zdefiniowaną zgodnie z równaniem 48,

Liczba Reynoldsa naszych trzech komór przepływowych, o wysokościach od 166 do 267 μm, waha się od 13,9 do 34,6 przy natężeniach przepływu obliczonych w celu uzyskania naprężenia ścinającego 15 dyn / cm2. Przy natężeniach przepływu obliczonych dla naprężenia ścinającego 100 dyn/cm2, liczba komór Reynoldsa wahała się od 90,4 do 234. Wszystkie te liczby Reynoldsa są znacznie niższe niż 2300 i spełniają kryterium przepływu laminarnego.
Po drugie, aby pole prędkości i naprężenie ścinające były niezależne od odległości wzdłuż kanału przepływowego (tj. w pełni rozwinięte), odległość od wlotu płynu do ślizgu musi być większa niż długość wlotu, Le. Można to spełnić, obliczając długość wejścia, zgodnie z równaniem 59.

Dla wartości podanych powyżej długość wejścia wynosi od 0,01 do 0,25 cm.
Po trzecie, aby zapewnić, że prędkość i naprężenie ścinające w kierunku poprzecznym nie różnią się znacząco od wartości dla jednowymiarowego przepływu kanałowego (ΔPh/2L), stosunek h/w musi być znacznie mniejszy niż 1. Aby średnie naprężenie ścinające ściany w warunkach przepływu dwuwymiarowego wynosiło 95% naprężenia ścinającego ściany przy przepływie jednowymiarowym, h/w musi być równe 0,10, a aby naprężenie ścinające ściany w warunkach przepływu dwuwymiarowego wynosiło 97,5% naprężenia ścinającego ściany przy przepływie jednowymiarowym, h/w musi być równe 0,05. Dzięki zaprojektowanym przez nas wymiarom komory przepływowej wynoszącym 1,7 cm szerokości i 166 - 267 μm wysokości, kryteria te są spełnione.
Ciśnienie będzie się zmieniać tylko w kierunku przepływu, jeśli na wejściu nie ma bocznych gradientów ciśnienia. Można to ocenić za pomocą barwników lub cząstek na ścieżce przepływu. Ponadto, w przypadku eksperymentów ze stałym przepływem, do obwodu przepływu wkładany jest tłumik impulsów. Tłumik impulsów eliminuje większość pulsacyjności powodowanej przez pompę rolkową w obwodzie i pozwala nam w przybliżeniu przyjąć założenie stałego przepływu. Należy zauważyć, że zastosowany tłumik impulsów powinien być kompatybilny z pompą i rurkami zastosowanymi w obwodzie, aby mógł skutecznie eliminować pulsacje w przepływie wyjściowym dla określonych częstotliwości pompy rolkowej. W naszej demonstracji tłumik impulsów Masterflex L/S osiąga przepływ laminarny, gdy jest używany na linii tłocznej z dowolną pompą Masterflex serii L/S (0 - 600 obr./min) i przewodami I/P 26. W przypadku przepływu pulsacyjnego można użyć programowalnej pompy do generowania różnych przebiegów.
W przypadku przepływu pulsacyjnego można użyć programowalnej pompy do generowania różnych przebiegów.
Co więcej, obwód został zaprojektowany w taki sposób, że próbki perfuzatu można łatwo zbierać w różnych punktach czasowych bez ryzyka zanieczyszczenia ogniw lub przepływu. W naszym przykładzie stężenie NO2- mierzono metodą chemiluminescencji za pomocą analizatora tlenku azotu Ionics/Sievers (NOA 280, Sievers Instruments, Boulder, CO), jak opisano wcześniej10. Reduktorem stosowanym do analizy azotynów był jodek potasu w kwasie octowym (14,5 M kwas octowy i 0,05 M KI), który ma potencjał redukcyjny do przekształcania azotynów w NO, ale jest niewystarczający do redukcji wyższych tlenków azotu, takich jak azotany, a zatem jest stosunkowo specyficzny dla azotynów. Całkowitą ilość wytworzonego azotynu obliczono jako iloczyn wytworzonego stężenia i całkowitej objętości obwodu, po skorygowaniu o objętość utraconą podczas pobierania próbek6.
Następujące kroki mają kluczowe znaczenie dla pomyślnego wykonania eksperymentów przepływu:
- Pożądane jest unikanie tworzenia się pęcherzyków podczas ustawiania przepływu, ponieważ pęcherzyki mogą odrywać komórki od ich powierzchni. Można tego uniknąć, zachowując ostrożność podczas umieszczania górnej części komory przepływowej na dolnej części, co najlepiej osiągnąć poprzez trzymanie obu równolegle do siebie i opuszczanie górnej części na dno jednym ruchem bez ponownej regulacji. W ten sposób małe pęcherzyki powietrza, które mogą być obecne i/lub unosić się w kanale przepływowym, zostaną przekierowane do pułapek pęcherzykowych na obu końcach aluminiowej obudowy.
- Ważne jest, aby upewnić się, że rurka odpływowa w zbiorniku sięga do dna zbiornika. W przeciwnym razie powietrze może zostać zassane do rurki prowadzącej ze zbiornika do komory, jeśli poziom perfuzatu spadnie nieco poniżej końca rurki.
- Badacz powinien być zaznajomiony z kierunkiem przepływu pompy, aby pompa nie pracowała przypadkowo w przeciwnym kierunku po rozpoczęciu przepływu, co skutkowałoby zasysaniem powietrza do obwodu i komory.
- Aby uniknąć tworzenia się piany (z powodu zdenaturowanych białek zawartych w surowicy), zalecamy obniżenie rurki prowadzącej z komory do zbiornika do około jednego cala powyżej poziomu perfuzatu wewnątrz zbiornika. Jednak utrzymanie go powyżej poziomu medium przepływowego pozwala na weryfikację przepływu do zbiornika podczas eksperymentu.
- Podczas skręcania ze sobą części komory ważne jest, aby jedną ręką mocno chwycić obudowę, a drugą obsługiwać śrubokręt elektryczny. Należy pamiętać, że ruch śrubokręta elektrycznego zostanie przekształcony w moment obrotowy, który może "rozrzucić komorę" po dokręceniu.
- Aby uniknąć tworzenia się fal ciśnienia w obwodzie i podnoszenia ogniw z ich powierzchni, przed rozpoczęciem przepływu upewnij się, że wszystkie krany są otwarte.
- Szczególnie w przypadku długoterminowych badań przepływu (> 48 godzin) zalecamy stosowanie twardszych i bardziej sprężystych przewodów, które należy włożyć do głowicy pompy, aby zapobiec pękaniu przewodów.
- Możliwe jest, że rurka "migruje" wewnątrz głowicy pompy z powodu źle wyregulowanych zębów głowicy pompy. Dlatego sugerujemy zwrócenie szczególnej uwagi na to, jak rurka jest zamocowana w głowicy pompy i oznaczenie każdego końca rurki pisakiem do znakowania, tak aby można było łatwo zauważyć, czy rurka jest "wciągnięta" lub przemieszczona podczas eksperymentu.
- Zawsze dokładnie sprawdzaj każde złącze obwodu i komory przed rozpoczęciem perfuzji, aby zapobiec wyciekowi perfuzatu podczas eksperymentu z powodu wadliwego połączenia. Jest to szczególnie ważne w przypadku króćców dopływowych i odpływowych tłumików impulsów!
- Pamiętaj o ograniczeniu ekspozycji na światło, jeśli używasz etykiet fluorescencyjnych.
Możliwym ograniczeniem naszej studzienki przepływowej jest to, że wysokość jest ustalana na podstawie wysokości kanału obrobionego w aluminium. Ma to jednak tę zaletę, że nie trzeba sprawdzać i regulować wysokości kanału przed każdym eksperymentem, a tym samym upraszcza obliczenia naprężeń ścinających, dostosowując przepływ pompy do żądanej wartości. W zależności od celów badawczych może być pożądane zwiększenie naprężeń ścinających bez zwiększania prędkości pompy. W takim przypadku zalecamy zwiększenie lepkości perfuzatu, np. dodanie dekstranu do podłoża11.
Możliwym ograniczeniem obwodu przepływu jest duża objętość użytego podłoża, co może być problematyczne przy próbie ilościowego określenia bardzo małych stężeń metabolitów komórkowych. Chociaż nie pokazano tutaj, możliwe jest znaczne zmniejszenie objętości obwodu poprzez zastosowanie mniejszego zbiornika i tłumika impulsów oraz zmniejszenie długości i średnicy przewodów.
Ponadto istnieje kilka innych dostępnych na rynku systemów, które można wykorzystać do zastosowania naprężeń ścinających płynu do komórek w hodowli. Systemy mikroprzepływowe, np. system BioFlux firmy Fluxion, umożliwiają jednoczesną analizę komórek w różnych kanałach przepływu mikroprzepływowego załadowanych roztworem do płytek studzienkowych pełniących rolę zbiorników wejściowych i wyjściowych dla tych kanałów12,13,14. Jednak te i inne systemy mikroprzepływowe nie są kompatybilne ze standardowymi szkiełkami mikroskopowymi i nie pozwalają na odzyskanie wystarczająco dużej liczby komórek do dalszych eksperymentów, takich jak RT-PCR lub Western Blot. Co więcej, są mniej przyjazne dla użytkownika, kosztują co najmniej 40 000 USD i mogą osiągnąć łącznie ponad 100 000 USD, w zależności od wyposażenia dodatkowego.
Dwa systemy makroprzepływowe dostępne w firmie Flexcell International Corporation, Flexcell Streamer i FlexFlow, zostały z powodzeniem wykorzystane do badania komórek śródbłonka15,16,17, ludzkich komórekpierścieniowych18 i fibroblastów19 w warunkach przepływu płynu. Trzeci system, dostępny za pośrednictwem GlycoTech, został wykorzystany do badania adhezji komórek nowotworowych20 i adhezji leukocytów21 do monowarstw śródbłonka.
System Streamer pozwala na jednoczesne uruchamianie kilku suwaków w tych samych warunkach naprężenia ścinającego, ale brakuje mu okienka podglądu i - w przeciwieństwie do naszej konstrukcji - nie pozwala na wizualizację przepływających komórek w czasie rzeczywistym.
System FlexFlow ma okienko obserwacyjne, ale wymaga mikroskopu pionowego, który może nie być standardowym mikroskopem używanym w większości laboratoriów. Ponadto system FlexFlow wymaga odwrócenia szkiełka nakrywkowego pokrytego komórkami po umieszczeniu w komorze przepływowej. Wyklucza to wizualizację komórek fluorescencyjnych na nieprzezroczystej powierzchni, takiej jak szkło pokryte tytanem, co demonstrujemy w naszym badaniu. Wreszcie, specjalistyczne szkiełka nakrywkowe należy zakupić specjalnie dla systemu FlexFlow, który mieści się w wielotysięcznym przedziale cenowym, podobnie jak system Flexcell Streamer.
GlycoTech oferuje okrągłe i prostokątne komory przepływowe z równoległymi płytkami, które są znacznie tańsze, ale wykonane z odlewanego akrylu, którego nie można wygodnie sterylizować w autoklawie, jak nasza komora. Warto zauważyć, że inne komory przepływowe, które zostały opisane jako autoklawowalne, wydają się niepraktyczne, ponieważ wymagają specjalnych soczewek mikroskopowych22,23. System GlycoTech wykorzystuje uszczelki z kauczuku silikonowego umieszczone pomiędzy górną i dolną płytą, które przy wielokrotnym użyciu będą zmieniać swoją grubość, a tym samym zmieniać wysokość komory w czasie (producent zaleca zakup nowych po każdych dziesięciu użyciach). Nasza aluminiowa komora z wbudowanymi O-ringami pozwala na całkowite przeciwstawienie górnej i dolnej płyty oraz zapewnia stałą wysokość komory między eksperymentami. Wreszcie, pompy próżniowe są niezbędne do uzyskania szczelnego uszczelnienia w wielu konstrukcjach komór przepływowych, w tym w komorach GlycoTech, które nie są konieczne w naszym projekcie.
Chociaż nie pokazano tutaj, komora przepływowa może być przechowywana pod mikroskopem podczas całego eksperymentu przepływu w celu obrazowania w czasie rzeczywistym adhezji i / lub zachowania komórek. Jeśli jest to pożądane, zalecamy użycie lamp grzewczych lub podgrzewanej podkładki pod komorą, aby utrzymać temperaturę perfuzatu na poziomie 37 °C. Ponadto pompę rolkową można zastąpić pompą strzykawkową, jeśli nie jest pożądana "recyrkulacja" komórek lub metabolitów lub badanych leków lub środków24.
Możliwe jest również przepływanie inaczej znakowanych komórek przez przylegające komórki, np. fluorescencyjne płytki krwi po warstwie zbiegających się EPC (przy użyciu testu płytek krwi opisanego przez Achnecka i wsp.6,25) w celu oceny interakcji między komórkami pod wpływem naprężenia ścinającego płynu. Nasza komora przepływowa łączy w sobie cenne cechy innych dostępnych komór przepływowych, takich jak port do pobierania próbek perfuzatu i okienko podglądu, a jej ważną zaletą jest kompatybilność z mikroskopem odwróconym lub pionowym. Jest w pełni autoklawowalny i pozwala na wielokrotne eksperymenty na stałej wysokości komory i bez konieczności stosowania pomp próżniowych w celu uzyskania szczelnego uszczelnienia.