Zarodek danio pręgowanego stał się popularnym modelem kręgowca in vivo do badania rozwoju serca oraz ludzkich chorób serca ze względu na korzystną embriologię i genetykę 1,2. Każdego tygodnia od jednej pary dorosłych ryb można łatwo uzyskać około 100-200 zarodków. Przezroczyste zarodki rozwijające się ex utero sprawiają, że są one idealne do oceny wad serca 3. Ekspresję dowolnego genu można manipulować za pomocą technologii morfolino lub wstrzykiwania RNA 4. Ponadto, badania genetyki forward doprowadziły już do stworzenia listy mutantów, które wpływają na różne aspekty kardiogenezy 5.
Immunobarwienie całego preparatu (whole mount immunostaining) jest ważną techniką w tym modelu zwierzęcym, pozwalającą na ujawnienie wzorca ekspresji docelowego białka w konkretnej tkance 6. Jednakże uzyskanie obrazów o wysokiej rozdzielczości, które mogłyby ukazać struktury komórkowe lub podkomórkowe, było trudne, głównie ze względu na fizyczne położenie serca oraz słabą penetrację przeciwciał.
W niniejszej pracy przedstawiamy metodę rozwiązania tych ograniczeń poprzez wstępne rozcięcie serca, a następnie przeprowadzenie procesu barwienia na powierzchni szkiełka przedmiotowego. Aby zapobiec utracie małych próbek serca i ułatwić manipulację roztworami, próbki serca ograniczono do obszaru koła narysowanego na powierzchni szkiełek przedmiotowych za pomocą pisaka immEdge. Po barwieniu sygnały fluorescencyjne można bezpośrednio obserwować za pomocą mikroskopu złożonego.
Nasza nowa metoda znacznie poprawia penetrację przeciwciał, ponieważ serce zarodka ryby składa się tylko z kilku warstw komórek. Wysokiej jakości obrazy z nienaruszonych serc można uzyskać w znacznie krótszym czasie przetwarzania dla embrionów zebrafish w wieku od 2. do 6. dnia. Naszą metodę można potencjalnie rozszerzyć na barwienie innych narządów wyizolowanych z zebrafish lub innych małych zwierząt.