Zaadaptowano z wcześniejszej publikacji1.
1. Koniugacja Anneksyny V do SPIO
- Utlenić cząsteczki SPIO (Ocean Nanotech Inc., 5 mg/mL) przez 1 hr w temperaturze 20 °C w ciemności w roztworze 0,15 M nadjodynianu sodu (NaIO4) (stosunek masy do masy 4:1)2.
- Inkubować utlenione SPIO przez 12 hr z oczyszczonym białkiem ANX (stosunek masy do masy 1:1) w 0,15 M boranie sodu (Na2B4O7 10H2O) w temperaturze 20 °C.
- Dalej redukować mieszaninę przez 1 hr za pomocą borowodorku sodu (NaBH4) pod dygestorium, a następnie zatrzymać reakcję za pomocą 0,15 M Tris-HCl.
- Oddzielić wolne ANX od ANX-SPIO poprzez wirowanie przy 14 000 x g (filtr Microcon z porami 75 μm, Millipore, Billerica, MA).
- Dalej oczyszczać kompleks poprzez usunięcie niezwiązanych zanieczyszczeń za pomocą urządzenia Magnetic Separator (Ocean Nanotech, Inc.).
- Oznaczyć poziom białka w retentacie z filtra (ANX-SPIO) metodą oznaczenia białka Bradforda i przechowywać w temperaturze -80 °C w stężeniu 2 mg/mL w 0,1 M Tris-HCl z 1% albuminą surowiczą i inhibitorami proteaz (Halt Protease Inhibitor, Thermo Scientific, 1-50 mg/mg ANX).
2. Dynamiczne rozpraszanie światła
- SPIO oraz ANX-SPIO należy oddzielnie rozcieńczyć w PBS do gęstości optycznej 0,1 i przeanalizować za pomocą dynamicznego rozpraszania światła w urządzeniu Zetasizer Nano DLS (Malvern Inc., Worcestershire, UK)3.
- (Idealnie) należy uzyskać piki monomodalne dla związku, określając średnią wielkość cząstek Z-average oraz indeks polidyspersyjności (PDI). Wielkość tę należy porównać z wielkością samych nanocząstek tlenku żelaza zmierzoną metodą DLS. Wyniki DLS dla ANX-SPIO wykazały średnicę hydrodynamiczną cząstek koniugatu wynoszącą 78 nm przy PDI równym 0,131, co świadczy o homogeniczności gatunku ANX-SPIO3.
3. Hodowla komórek, indukcja apoptozy w hodowli i MRI hodowanych komórek
- Kulturować mezenchymalne komórki macierzyste szpiku kostnego dorosłych myszy (mMSCs) w pożywce DMEM uzupełnionej o 10% FBS i 1% penicyliny-streptomycyny (Invitrogen, Inc.), najlepiej w pasażach 20-304.
- Indukować apoptozę w hodowlach komórkowych poprzez inkubację w temperaturze 37 °C przez różny czas z dodatkiem DOX (Sigma, 1 mM w 0,9% soli fizjologicznej, stężenie w pożywce 1 μM)12.
- Ilościowo określić poziom apoptozy w kulturze, wykorzystując MRI z ANX-SPIO (opisane w punkcie 3.4 poniżej) lub mikroskopię po barwieniu TUNEL (APO-BrdUTM TUNEL Assay Kit, Molecular Probes/Invitrogen, Eugene, OR) bądź barwieniu ANX-FITC (Roche, Szwajcaria).
- Znakować komórki ANX-SPIO (10 mg białka/mL pożywki, chyba że zaznaczono inaczej) lub równoważną masą wolnych SPIO (5 mg) przez 15 min w temperaturze 37 °C. Przemyć 4 razy PBS i przykryć 1 mL 1% agarozy, aby zapobiec dyfuzji nanocząstek SPIO. Wykonać MRI szalek (opisane poniżej). Alternatywnie, po znakowaniu DOX i ANX-SPIO, przemyć komórki i poddać je trypsynizacji, a następnie pozwolić komórkom sformować osad w probówkach Eppendorf.
4. MRI in vitro
- Do analizy MRI in vitro należy użyć skanera GE Signa EXCITE o indukcji 1,5 lub 3 Tesla ze standardową cewką odbiorczą do kolana.
- Szalki hodowlane lub probówki należy umieścić w fantomie agarowym i obrazować przy użyciu sekwencji gradient-echo ze zniszczonym gradientem: czas powtórzenia (TR) 550 ms, czas echa (TE) 10 ms, kąt odchylenia 15°, macierz 256 x 256, pole widzenia 3 cm x 3 cm, grubość warstwy 1,3 mm, liczba uśrednień (NEX) 2, odstęp 0 mm5. Obrazowanie należy przeprowadzić w płaszczyźnie osiowej przez warstwę komórek na płytce w celu oceny utraty sygnału T2*, wykorzystując obszary zainteresowania (ROI) o stałej powierzchni (na przykład 0,8 mm2). Tło należy skorygować, korzystając z sygnału ROI kontrolnego z fantomu agarowego. Szum tła należy zmierzyć na podstawie sygnału powietrza otaczającego fantom.
- Dla każdej szalki hodowlanej obliczono stosunek kontrastu do szumu MRI (CNR: [SI próbki ROI-SI kontroli ROI]/[SD SI szumu tła], gdzie SI to intensywność sygnału, a SD to odchylenie standardowe).
5. Reprezentatywne wyniki
Pomiar spadku sygnału T2* in vitro wymaga zastosowania homogenicznego fantoma agarowego oraz braku pęcherzyków powietrza, które powodują powstanie artefaktu pustki sygnałowej. Artefakt ten jest trudny do odróżnienia od rzeczywistego spadku sygnału T2* wywołanego przez SPIO, co ma kluczowe znaczenie dla interpretacji wyników. Przykład artefaktu powietrznego oraz rzeczywistego spadku sygnału T2* tlenku żelaza przedstawiono na Rysunku 1.
W przypadku obrazowania naczyń hodowlanych in vitro, należy nanieść do każdego naczynia odpowiednią objętość żelu agarowego, aby można było wykonać wystarczającą liczbę osiowych przekrojów MRI o grubości około 1 mm, co pozwoli na właściwe zobrazowanie całego naczynia. Rysunek 2 przedstawia oczekiwany sygnał MRI z poszczególnych płytek hodowlanych w agarze. Na krawędziach płytek zazwyczaj występuje pewna zmienność sygnału, dlatego podczas analizy obszarów zainteresowania należy unikać tych nierównomiernych stref.

Rysunek 1. ANX-SPIO wykrywa apoptozę w hodowlach kardiomiocytów noworodka szczura. Rysunek 1A przedstawia zdjęcie odwirowanych kardiomiocytów noworodka traktowanych roztworem kontrolnym (lewa probówka), ANX-SPIO (środkowa probówka) oraz DOX+ANX-SPIO (prawa probówka). Należy zwrócić uwagę na brązowy kolor komórek traktowanych DOX+ANX-SPIO, co odzwierciedla zwiększoną retencję związku ANX-SPIO w komórkach apoptotycznych. Rysunek 1B obrazy MRI in vitro wykazują intensywną utratę sygnału T2* w komórkach DOX+ANX-SPIO. Widoczny jest również pęcherzyk powietrza między 4th a 5th probówką Eppendorf (mały czarny ubytek sygnału), który jest podobny do ubytku sygnału ANX-SPIO i może wpływać na analizę CNR.

Rycina 2. Wiązanie ANX-SPIO jest specyficzne dla komórek apoptotycznych w hodowli. Rycina 2A przedstawia apoptotyczne kardiomiocyty noworodka szczura na szalkach hodowlanych, poddane barwieniu ANX-FLUOS lub barwieniu ANX-SPIO, z zastosowaniem niskich i wysokich stężeń (odpowiednio po lewej i prawej stronie) ANX-SPIO. Zwróć uwagę na różnice w utracie sygnału T2* (sygnał czarny) w komórkach apoptotycznych traktowanych fluorescencyjnym ANX (ANX-FLUOS) oraz niskimi i wysokimi stężeniami ANX-SPIO. Zwiększona utrata sygnału T2* po prawej stronie wiąże się z wyraźnie zredukowanym sygnałem ANX-FLUOS, który został wyparty przez wyższe stężenia ASX-SPIO. Rycina 2B ilustruje konkurencyjne wiązanie ANX-SPIO względem sygnału ANX-FLUOS oraz stałą dysocjacji, Ki. Oś X oznacza stężenie białka Aneksyny w skali logarytmicznej.
Film 1. Kliknij tutaj, aby obejrzeć dodatkowy film.