Mitochondrialny por przejścia przepuszczalności (mtPTP) jest niespecyficznym kanałem tworzącym się w wewnętrznej błonie mitochondrialnej, służącym do transportu substancji o masie cząsteczkowej mniejszej niż 1,5 kDa. Chociaż ostateczna tożsamość molekularna poru jest wciąż przedmiotem dyskusji, w jego tworzeniu uczestniczą białka takie jak cyklofilina D, VDAC i ANT. Podczas gdy zaangażowanie otwarcia mtPTP w śmierć komórek jest dobrze udokumentowane1, narastające dowody wskazują, że mtPTP pełni funkcję fizjologiczną podczas homeostazy Ca2+ w mitochondriach2, bioenergetyki oraz sygnalizacji redoks 3.
Otwarcie mtPTP jest wyzwalane przez Ca2+ w macierzy, lecz jego aktywność może być modulowana przez szereg innych czynników, takich jak stres oksydacyjny, wyczerpanie nukleotydów adeninowych, wysokie stężenia Pi, depolaryzacja lub rozprzęganie błony mitochondrialnej oraz długołańcuchowe kwasy tłuszczowe4. In vitro otwarcie mtPTP można osiągnąć poprzez zwiększenie stężenia Ca2+ wewnątrz macierzy mitochondrialnej za pomocą egzogennego dodawania Ca2+ (pojemność zatrzymywania wapnia). Gdy poziomy Ca2+ w mitochondriach osiągną określony próg, mtPTP otwiera się, co ułatwia uwalnianie Ca2+, rozproszenie siły protonomotorycznej, zapadnięcie się potencjału błonowego oraz zwiększenie objętości macierzy mitochondrialnej (obrzęk), co w konsekwencji prowadzi do przerwania zewnętrznej błony mitochondrialnej i nieodwracalnej utraty funkcji organellum.
W niniejszym opracowaniu opisujemy test fluorometryczny, który umożliwia kompleksową charakterystykę otwierania mtPTP w izolowanych mitochondriach serca myszy. Test polega na jednoczesnym pomiarze 3 parametrów mitochondrialnych, które ulegają zmianie podczas otwierania mtPTP: gospodarki mitochondrialnej Ca2+ (wychwytu i uwalniania, mierzonego na podstawie stężenia Ca2+ w medium testowym), potencjału błony mitochondrialnej oraz objętości mitochondriów. Barwnikami zastosowanymi do pomiaru Ca2+ w medium testowym oraz potencjału błony mitochondrialnej są Fura FF, nieprzenikający przez błony ratiometryczny wskaźnik, u którego w obecności Ca2+ następuje przesunięcie długości fali wzbudzenia, oraz JC-1, kationowy wskaźnik ratiometryczny, który tworzy zielone monomery lub czerwone agregaty odpowiednio przy niskim i wysokim potencjale błonowym. Zmiany objętości mitochondriów mierzy się poprzez rejestrację rozpraszania światła przez zawiesinę mitochondrialną. Ponieważ do testu otwierania mtPTP wymagane są wysokiej jakości, funkcjonalne mitochondria, opisujemy również kroki niezbędne do uzyskania nienaruszonych, silnie sprzężonych i funkcjonalnych izolowanych mitochondriów serca.