Po infuzji z pompy lub w wyznaczonym czasie po wstrzyknięciu bolusa do komór mózgu (ICV) (rutynowo stosujemy okres czterech tygodni), ważne jest przetestowanie skuteczności ASO. Zalecamy pobranie różnych obszarów mózgu i rdzenia kręgowego w celu pomiaru poziomów/izoform genu docelowego, zarówno na poziomie mRNA przy użyciu ilościowego PCR w czasie rzeczywistym, jak i na poziomie białka przy użyciu Western Blot lub testu ELISA (Rysunek 4 jako opublikowany przykład). Pomoże to określić skuteczność ASO w różnych obszarach OUN. Jeśli okres półtrwania docelowego białka jest długi, zalecamy dłuższy czas oczekiwania po infuzji ASO, aby ocenić maksymalne wyciszenie białka lub splicing.
Ważne jest również przetestowanie rozkładu oligonukleotydów. Infuzje za pomocą pompy prowadzą do rozprzestrzenienia się substancji w obu półkulach, ipsilateralnej i kontralateralnej, choć wyższe stężenie ASO często obserwuje się w obszarach położonych bliżej układu komorowego 16. Iniekcje bolusowe do komór mózgu (ICV) zapewniają bardziej jednolity rozkład oligonukleotydów w całym OUN 16, choć ich efekty mogą być krótsze. W celu zapoznania się z bezpośrednim porównaniem rozkładu oligonukleotydów przy zastosowaniu pompy i metody bolusowej odsyłamy czytelnika do pracy Southwell et al. 16.
Zalecamy również testowanie wielu dawek, a także czasu działania ASO, ponieważ każde ASO będzie zachowywać się nieco inaczej in vivo. ASO zazwyczaj charakteryzują się stosunkowo długim czasem działania, przy czym wyciszenie docelowego genu lub zmiana splicingu utrzymują się przez kilka miesięcy po podaniu ASO. Ponadto niektóre ASO będą działać lepiej niż inne, a niektóre geny docelowe będą łatwiejsze do wyciszenia. Z tego powodu, podczas przesiewania ASO w celu wyłonienia głównego kandydata, zalecamy w pierwszym etapie przetestowanie co najmniej 3-5 ASO in vivo, z grupą n = 4-6 dorosłych myszy na każde ASO.
W przypadku stosowania leku innego niż ASO, istotne będzie również przeprowadzenie badań pilotażowych w celu ustalenia optymalnego stężenia leku, czasu jego działania oraz rozkładu leku w OUN dla konkretnego związku.

Tabela 1. Współrzędne chirurgiczne. Współrzędne wykorzystywane do trafienia w prawą komorę boczną u myszy i szczurów podczas implantacji pomp osmotycznych, a także przy podawaniu bolusa dopracerebrowentrykularnego (ICV). Oba zestawy współrzędnych, zarówno dla pomp, jak i dla bolusa ICV, celują w prawą komorę boczną. Stosujemy dwa różne zestawy, ponieważ posiadamy z nimi największe doświadczenie i wiemy, że zapewniają one doskonałą dystrybucję ASO.

Figura 1. Układ stereotaktyczny. (A) Niezbędny sprzęt stereotaktyczny do zabiegów wszczepienia pompy Alzet oraz iniekcji bolusa. i) Sterylizator szklanych kulek. ii) Cyfrowy wyświetlacz odczytu. iii) Podstawa stereotaktyczna z ruchomymi ramionami. iv) Podgrzewacz z kontrolą temperatury. v) System izofluran/tlen. vi) Komora izofluranowa. (B) Zbliżenie na stożek nosowy i pręty uszne. (C) Dwa wymagane akcesoria. Lewo: uchwyt strzykawki/igły do wewnątrzkomorowych (ICV) iniekcji bolusa. Prawo: prowadnica kaniuli do implantacji pompy osmotycznej.

Rysunek 2. Implantacja pompy osmotycznej Alzet. (A) Opcje pomp osmotycznych Alzet dla myszy. Pompy 14-dniowe (0,25 μl/hr), pompy 28-dniowe (0,25 μl/hr), pompy 42-dniowe (0,15 μl/hr). (B) Współrzędne implantacji pompy względem bregmy: -0,5 mm Posterior (tylnie), -1,1 mm Lateral (bocznie, prawa strona) oraz -2,5 mm Ventral (brzusznie, długość cewnika). (C) Po wprowadzeniu cewnika przez czaszkę i przyklejeniu kaniuli, przez cewnik przepływany jest barwnik w celu oceny prawidłowego umiejscowienia cewnika w komorze bocznej. (D) Perfuzowany mózg bezpośrednio po podaniu barwnika, zgodnie z opisem w punkcie (C). Jeśli cewnik został pomyślnie umieszczony w komorze, barwnik rozprowadzi się w całym układzie komorowym myszy.

Rycina 3. Bolusowa iniekcja dokomorowa. (A) Współrzędne dla iniekcji bolusowej względem bregmy: +0.3 mm przednio, -1.0 mm bocznie (prawo) oraz -3.0 mm brzuchowo. (B) Po wprowadzeniu igły przez czaszkę na głębokość -3.0 mm brzuchowo, przez strzykawkę podaje się barwnik, aby ocenić prawidłowe umiejscowienie igły w komorze bocznej. (C) Perfuzjowany mózg krótko po podaniu barwnika zgodnie z opisem w (B). Jeśli igła została prawidłowo umieszczona w komorze, barwnik rozprowadzi się w całym systemie komorowym myszy.

Rycina 4. Oligonukleotydy antysensowne redukują poziom SOD1 u szczurów in vivo (rycina pochodzi bezpośrednio z publikacji Smith et al. 7). (A-D) Antysensowne oligonukleotydy SOD1 SODr146192 lub SODscrambled wprowadzano w ilości 100 μg/dobę przez 28 dni do prawego brzuszka bocznego u prawidłowych szczurów. (A) Poziomy endogennego mRNA SOD1 w mózgu i rdzeniu kręgowym zmierzone za pomocą qRT-PCR. (B) Poziomy białka SOD1 i α-tubuliny po infuzji ASO. (C i D) Ilościowe oznaczenia poziomów białka tubuliny i SOD1 dla różnych obszarów mózgu po infuzji. (E) ASO przeciwko presenilinie 1 lub GSK-3β wprowadzano przez 2 tygodnie do prawego brzuszka bocznego u myszy nietransgenicznych, a poziomy mRNA oceniano w prawej korze czołowej/skroniowej. Powielone za zgodą American Society for Clinical Investigation. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną rycinę.

Rycina 5. Ciągły szew poziomy na materac. Nić nylonowa 5-0 jest prowadzona przeplatany przez skórę, zaczynając od strony przedniej i kierując się ku tylnej, z większym zagęszczeniem nad kaniulą. Po dotarciu do najbardziej tylnego punktu, nić jest prowadzona z powrotem w górę i ponownie przeplatana nad kaniulą. Zapewnia to prawidłowe zamknięcie rany i zapobiega przemieszczaniu się kaniuli/rurki przez skórę.