Skóra jest bardzo niejednorodną tkanką. Struktury śródskórne obejmują mieszki włosowe, mięśnie arrector pili, specjalizacje naskórka (takie jak klastry komórek Merkla), gruczoły łojowe, nerwy i zakończenia nerwowe oraz naczynia włosowate. Przestrzenne rozmieszczenie tych struktur jest ściśle kontrolowane w skali mikroskopowej - co widać na przykład w uporządkowanym układzie typów komórek w obrębie pojedynczego mieszka włosowego - oraz w skali makroskopowej - co widać po prawie identycznej orientacji tysięcy mieszków włosowych w lokalnym obszarze skóry. Wizualizacja tych struktur bez fizycznego cięcia skóry jest możliwa dzięki dwuwymiarowej geometrii tego narządu. W tym protokole pokazujemy, że skóra myszy może być preparowana, utrwalana, przepuszczalna, barwiona i klarowana jako nienaruszony dwuwymiarowy obiekt, płaskie mocowanie. Protokół pozwala na łatwą wizualizację struktur skóry w całości poprzez pełną grubość dużych obszarów skóry poprzez przekrój optyczny i rekonstrukcję. Obrazy tych struktur mogą być również zintegrowane z informacjami o położeniu i orientacji względem osi ciała.