Ostatnio biolodzy zajmujący się infekcjami wykorzystali hodowle pochodzące z komórek macierzystych, aby odpowiedzieć na zapotrzebowanie na nowe i lepsze modele do badania interakcji gospodarz-patogen. Wykorzystano trzy źródła komórkowe: embrionalne komórki macierzyste (ESC), indukowane pluripotencjalne komórki macierzyste (iPSC) lub dorosłe komórki macierzyste. W tym artykule opisano hodowlę mysich i ludzkich organoidów żołądkowych pochodzących z dorosłych komórek macierzystych, które są wykorzystywane do zakażenia patogenem żołądka Helicobacter pylori. Ludzkie gruczoły żołądkowe są izolowane z materiału reekcyjnego, wysiewane w macierzy podstawowej i zatopione w pożywce zawierającej czynniki wzrostu: naskórkowy czynnik wzrostu (EGF), R-spondynę, Noggin, Wnt, czynnik wzrostu fibroblastów (FGF) 10, gastrynę i inhibitor beta transformującego czynnika wzrostu (TGF). W tych warunkach gruczoły żołądkowe rozrastają się w trójwymiarowe organoidy zawierające 4 linie żołądka. Organoidy rozszerzają się w nieskończoność i mogą być zamrażane i rozmrażane podobnie jak linie komórkowe. W badaniach nad infekcjami bakterie są mikrowstrzykiwane do światła organoidów. Zainfekowane organoidy są przetwarzane do obrazowania. Opisane metody można dostosować do innych organoidów i zakażeń innymi bakteriami, wirusami lub pasożytami. Pozwala to na badanie zmian wywołanych infekcją w komórkach pierwotnych.