Niski wskaźnik przeżycia u pacjentów z NSCLC (niedrobnokomórkowym rakiem płuca) wynika głównie z ograniczonej skuteczności leczenia w zaawansowanej chorobie i słabego wczesnego wykrywania1. Wiadomo, że mutacje aktywujące w genie EGFR, które odkryto w subpopulacji pacjentów z niedrobnokomórkowym rakiem płuca, nadają wrażliwość na inhibitory kinazy tyrozynowej (TKI). Niestety, u większości pacjentów z niedrobnokomórkowym rakiem płuca z mutacją EGFR rozwija się opornośćna TKI 2. Szczególnie w tym kontekście prawidłowa diagnoza jest obowiązkowa. Ogólnie rzecz biorąc, ze względu na lokalizację guzów, uzyskanie tkanki biopsyjnej w NSCLC nie zawsze jest możliwe. Dlatego prowadzonych jest kilka badań, które wykorzystują metody nieinwazyjne w celu uzyskania tych danych biologicznych. Egzosomy są opisywane jako płynne składniki biopsji, które można badać w celu uzyskania wartości diagnostycznych i prognostycznych za pomocą technik nieinwazyjnych3.
Egzosomy to nanopęcherzyki (o średnicy 40 - 100 nm) pochodzenia endocytarnego, które są uwalniane przez różne typy komórek, zarówno w warunkach fizjologicznych, jak i patologicznych4. Mogą przenosić białka, lipidy, mRNA i mikroRNA. Co więcej, kilka badań sugeruje plejotropową rolę egzosomów pochodzących z guza, które mogą wpływać na wzrost i przeżycie komórek nowotworowych, angiogenezę, przebudowę zrębu i macierzy zewnątrzkomórkowej oraz opornośćna leki 5.
MicroRNA (miRNA) to krótkie, niekodujące RNA, które biorą udział w regulacji potranskrypcyjnej, wiążąc 3′-UTR docelowych mRNA i prowadząc mRNA do degradacji lub do braku translacji6. Opisano selektywne sortowanie miRNA na egzosomy. W tym kontekście, niedawno wykazano, in vitro i in vivo, selektywne pakowanie miR-21 (dobrze znanego miRNA o działaniu onkogennym) w egzosomy uwalniane przez linie komórkowe przewlekłej białaczki szpikowej po leczeniu kurkuminą7.
Egzosomalny profil miRNA jest podobny do profilu miRNA pierwotnego nowotworu i ta cecha może być wykorzystana we wczesnej diagnostyce i rokowaniu3. W szczególności istnieje możliwość scharakteryzowania, za pomocą real-time PCR, wybranych miRNA skorelowanych z profilem molekularnym choroby, np. mutacji EGFRm.in. 8.
Tutaj opisana jest analiza wybranego panelu korelowanych z NSCLC miRNA8-9, które zostały wyizolowane z egzosomów uwolnionych we krwi pacjentów z NSCLC. Po uzyskaniu raportu o świadomej zgodzie od pacjentów, przeanalizowano osocze 12 pacjentów z niedrobnokomórkowym rakiem płuca i 6 zdrowych osób z grupy kontrolnej. Izolację egzosomu wykonano za pomocą komercyjnego zestawu zgodnie z protokołem producenta. Przed izolacją egzosomów próbki osocza potraktowano RNAzą w celu degradacji krążących zanieczyszczeń miRNA. Zdecydowaliśmy się na wykonanie tej analizy za pomocą komercyjnego zestawu ze względu na ograniczoną standaryzację innych technik (np. ultrawirowania), co jest szczególnie ważne podczas pracy z próbkami klinicznymi. Ten zestaw zawiera leczenie proteinazą K, która degraduje RNAzę, a tym samym zmniejsza ryzyko degradacji egzosomalnych miRNA po lizie egzosomalów. Analizę mikroRNA przeprowadzono za pomocą czułej i specyficznej analizy Real-Time PCR; mir-1228-3p zastosowano jako kontrolę endogenną, a dane znormalizowano zgodnie ze wzorem 2-ΔΔct. Wartości kontrolne są używane jako linia bazowa, a wyniki są przedstawiane w skali logarytmicznej.