$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Aby uzyskać optymalny sukces w odtwarzaniu tego modelu infekcji, należy rozważyć następujące dodatkowe sugestie. Zjadliwość nowych izolatów można zwiększyć poprzez pasażowanie 2-3 razy in vivo przed zastosowaniem w badaniu. Zamrożone szczepy bakteryjne powinny być zawsze przygotowywane z pierwotnego źródła uzyskanego in vivo, z jak najmniejszą liczbą pasaży od oryginału, a ponowne zamrażanie lub ponowne użycie rozmrożonego wywaru jest odradzane. Wykorzystanie najnowszych izolatów klinicznych odzyskanych od pacjentów z zapaleniem płuc i/lub przygotowanie kultur w fazie logarytmicznej wzrostu może również pomóc w lepszym ustaleniu infekcji. Pięciokrotne rozcieńczenie do agaru (np. 2 ml zawiesiny soli dodanej do 8 ml agaru) może być użyte zamiast dziesięciokrotnego w celu zwiększenia inokulum bakteryjnego, a objętość inokulum można dostosować w zależności od wielkości zwierzęcia (np. 200 μl / zwierzę jest zwykle inokulowane u 250 g szczurów). Przed dodaniem zawiesiny bakteryjnej soli fizjologicznej do agaru (tj. na kroku 2.3), gęstość bakterii można przewidzieć lub oszacować za pomocą oględzin, wzorców MacFarlanda lub pomiarów gęstości optycznej. Pomocne jest zapoznanie się z charakterystyką wzrostu in vitro dla każdego izolatu przed przeprowadzeniem eksperymentów in vivo . Spójność w uprawie i obchodzeniu się z nimi umożliwia najdokładniejsze oszacowanie gęstości bakterii dla danego izolatu. Standardowe metody mikrobiologiczne, które różnią się od opisanych, takie jak alternatywne pożywki i homogenizatory tkankowe, mogą być stosowane odpowiednio do przygotowania inokulacji i liczenia bakterii z zakażonych tkanek.
Zdecydowanie zaleca się przygotowanie lub stopienie agaru dzień przed eksperymentem i przechowywanie go przez noc w oddzielnej łaźni wodnej ustawionej na 50 °C. Uprości to proces i pomoże zabezpieczyć agar przed zbyt wysoką temperaturą w momencie infekcji. Temperatura 41 - 42 °C zapewnia dobrą równowagę między utrzymaniem agaru w stanie ciekłym, bez bycia zbyt gorącym dla krótkotrwałego przetrwania bakterii. Jako możliwa alternatywa dla agaru odżywczego, agar szlachetny był z powodzeniem stosowany w niektórych eksperymentach. Jedna probówka inokulum agarowego jest zwykle wystarczająca na cały eksperyment (i jest zalecana), ale wiele probówek można przygotować do zakażenia dużej liczby zwierząt (np. więcej niż 60) lub gdy proces infekcji trwa dłużej niż 30 - 45 minut Jeśli wymaganych jest wiele probówek z inokulum, dodaj zawiesinę bakteryjną soli fizjologicznej do każdej probówki agaru, zgodnie z potrzebami. Zmniejsza to ryzyko, że długotrwała ekspozycja na podwyższoną temperaturę przed inokulacją wpłynie na przeżywalność i/lub kondycję bakterii. Należy zauważyć, że użycie wielu probówek z inokulum może również wymagać dodatkowych procedur randomizacji zwierząt. Jeśli to możliwe, należy zarazić wszystkie zwierzęta tym samym preparatem inokulum. Zaleca się dostosowanie wielkości eksperymentów do aktualnego poziomu zaawansowania w danej technice.
Wykwalifikowany naukowiec może zaintubować i zaszczepić zwierzę w czasie krótszym niż 30 sekund i zaszczepić do 5 - 6 zwierząt na partię (tj. za pomocą jednej strzykawki pełnej inokulum agarowego). Dla tych, którzy uczą się tej techniki, ważna jest szybkość, ponieważ agar zacznie krzepnąć; Jednak ważniejsze jest dokładne umieszczenie inokulum. Zacznij od 1 lub 2 zwierząt na partię i zwiększaj, gdy technika staje się bardziej znana. Zwierzęta kontynuują oddychanie podczas intubacji; Tak więc okno czasowe na zaszczepienie zależy od tego, jak szybko zwierzę wyzdrowieje po izofluranie, które powinno wynosić około 2 - 3 minut. Zwierzęta, które obudzą się podczas tego procesu, można ponownie znieczulić i spróbować po raz drugi, ale nie zaleca się tego wielokrotnie. Pomyślne zaszczepienie przy pierwszej próbie spodziewane jest u prawie 100% zwierząt po osiągnięciu biegłości. Zauważ, że łatwiej jest nauczyć się tej techniki najpierw na szczurach; Myszy są delikatniejsze, a mniejsze narzędzia są bardziej podatne na zablokowanie zestalonym agarem, jeśli nie są szybko manipulowane. Wstępne rozgrzanie strzykawek, rurki i soli fizjologicznej, a także utrzymywanie urządzenia do intubacji na ciepłej (nie gorącej) powierzchni, takiej jak poduszka grzewcza na niskim ustawieniu, może pomóc w zapobieganiu zestalaniu się agaru. Podczas nauki tej techniki pomocne jest również ćwiczenie prawidłowego umieszczania inokulum przy użyciu ciemnego barwnika (takiego jak skoncentrowany błękit metylenowy) zamiast zawiesiny bakteryjnej w agarze. Wykonaj procedurę zgodnie z opisem, ale poddaj zwierzę eutanazji natychmiast po zaszczepieniu barwnika (nie pozwalając zwierzęciu dojść do siebie między znieczuleniem a eutanazją). Przeanalizuj, aby określić, gdzie został umieszczony barwnik i odpowiednio dostosuj technikę.
Pierwszorzędowym punktem końcowym w tym modelu jest CFU z zakażonych płuc. Przeżywalność nie jest dobrym wskaźnikiem obciążenia bakteryjnego i nie jest zalecanym punktem końcowym. W badaniach skuteczności sugerowane N wynosi 5 - 6 zwierząt na grupę, ponieważ przewiduje się, że wykryje to różnice ≥1 log10 CFU między grupami o co najmniej 90% mocy. Zwierzęta mogą być zarażane w grupach, tak że koledzy z klatki pozostają razem lub można śledzić prawdziwy proces randomizacji. Należy zauważyć, że jeśli grupy są przypisane według klatki, grupy powinny być zakażone w losowej kolejności, przy czym grupa kontrolna wzrostu na końcu badania została zainfekowana jako ostatnia (w celu potwierdzenia, że czas wystawienia na działanie podwyższonej temperatury w łaźni wodnej nie miał wpływu na przeżycie/sprawność bakterii). Nie powinny być konieczne żadne metody cenzurowania danych i nie zaleca się ich stosowania, z wyjątkiem natychmiastowego usunięcia zwierzęcia, które zostało ewidentnie błędnie zaszczepione na początku badania (przed rozpoczęciem jakiegokolwiek leczenia). Zwierzęta, które zostały poddane eutanazji przed zakończeniem badania, powinny zostać poddane próbce, a wyniki powinny zostać włączone do zbioru danych, chyba że prospektywnie zidentyfikowano ważny powód wykluczenia (tj. zdarzenie niezwiązane z zakażeniem lub leczeniem). Przenoszenie leków może mieć wpływ na niektóre próbki i jest ważnym czynnikiem we wszystkich modelach zakażeń in vivo . Jeśli związek jest podawany często, blisko czasu eutanazji lub ma długi okres półtrwania, może być obecny w homogenacie tkankowym w wystarczająco wysokim stężeniu, aby kontynuować zabijanie bakterii ex vivo podczas procesu liczenia bakterii (rozcieńczanie i posiewanie próbek lub na płytkach agarowych podczas inkubacji przez noc). Aby temu zapobiec, przed homogenizacją do próbki można dodać węgiel aktywny i/lub dodatek, który rozkłada cząsteczkę czynną bez uszkadzania komórek bakteryjnych. Inne metody obejmują odwirowanie próbek w celu usunięcia większości związku aktywnego (który powinien pozostać w supernatancie) oraz zastosowanie różnych schematów rozcieńczania i powlekania w celu wystarczającego rozcieńczenia związku czynnego do stężenia niehamującego.
Jak pokazują przykłady przedstawione na rysunku 2, model ten skutecznie indukuje infekcje płuc u gryzoni z szeroką gamą organizmów, w tym takich, które nie rosną dobrze w innych modelach (np. H. influenzae). Infekcje te są spójne i powtarzalne, co zmniejsza prawdopodobieństwo, że eksperymenty będą musiały zostać powtórzone z powodu niepowodzenia modelu i/lub słabej wydajności z danym izolatem. Chociaż zwierzęta są immunokompetentne, nie są w stanie szybko rozwiązać infekcji, jeśli w ogóle. Pozwala to na zwiększenie elastyczności w długości badania, ponieważ wiele izolatów utrzymuje żywotną infekcję przez co najmniej 96 godzin bez konieczności wielokrotnego wstrzykiwania w celu utrzymania neutropenii. Potencjalne korzyści z badania skuteczności przeciwbakteryjnej u zwierząt immunokompetentnych zostały odnotowane wcześniej20, 21 i istnieją dowody na to, że w przypadku niektórych związków (np. oksazolidynonów) dane od gryzoni niebędących neutropenami mogą dokładniej przewidywać docelowe narażenie ludzi w porównaniu z tymi, którzy są neutropeniczni5. Wielofunkcyjna użyteczność modelu została przedstawiona na rysunkach 3 i 4 oraz w tabelach 1 i 2. Badania te są częścią dużego zbioru opublikowanych i niepublikowanych danych, które zostały wygenerowane za pomocą tego modelu w celu wsparcia wysiłków optymalizacyjnych16, 17, 22-24, w celu porównania i potwierdzenia proponowanych schematów dawkowania u ludzi19, 25-29 oraz w celu charakterystyki PK/PD18, 30-32. Chociaż model ten jest początkowo bardziej skomplikowany do przeprowadzenia w porównaniu z metodą inhalacji donosowej, istnieje wiele korzyści, jak opisano powyżej. Wraz z praktyką i rutynowym stosowaniem techniki powinny stać się proste do wykonania.
W niektórych badaniach można zauważyć, że obciążenie bakteryjne na początku badania było niższe niż zwykle docelowe w innych modelach infekcji płuc. Wynika to w dużej mierze z wymaganego rozcieńczenia do agaru i małej objętości prowokacyjnej, szczególnie u myszy. Należy jednak również zauważyć, że wzrost bakterii obserwowano we wszystkich przypadkach, nawet gdy początkowe obciążenie było stosunkowo niskie. Docelowe wyjściowe miano bakteryjne wynosi od 6 do 6,5 log10 CFU/płuca (6,8 do 7,3 log10 CFU/g tkanki u myszy na podstawie średniej masy płuc), co odpowiada gęstości oszacowanej u ludzi z ciężkim zapaleniem płuc33. Wyższe obciążenie wyjściowe można osiągnąć poprzez dalszą koncentrację inokulum bakteryjnego lub opóźnienie rozpoczęcia podawania związku, aby umożliwić dodatkowy wzrost bakterii; Jednak zbyt duże zwiększenie obciążenia prowokacyjnego może prowadzić do nienormalnie ciężkiej i ostrej choroby (tj. zgonu w czasie krótszym niż 24 godziny), która jest oporna na wszystkie leczenie przeciwbakteryjne niezależnie od wrażliwości. Chociaż inokulum jest początkowo umieszczane preferencyjnie w lewym płucu zwierzęcia, infekcja na ogół rozprzestrzenia się w obu płucach. Postępująca choroba płuc, rozprzestrzenianie się bakterii na inne narządy i ostateczna zachorowalność są często obserwowane w przypadku S. pneumoniae, K. pneumoniae i P. aeruginosa. Co ciekawe, zakażenia H. influenzae i A. baumannii są zwykle bardziej ograniczone i rzadko prowadzą do śmierci po podaniu przepisanej inokulacji bakteryjnej.
Wyniki skuteczności uzyskane za pomocą tego modelu dobrze korelowały z profilami wrażliwości in vitro, a także ze zdefiniowanymi celami PK/PD. Zmniejszenie obciążenia bakteryjnego jest rutynowo obserwowane w przypadku izolatów uznanych za podatne na badany czynnik, podczas gdy te uważane za oporne nie wykazują żadnych zmian ani wzrostu bakterii powyżej wartości wyjściowej16, 17, 19, 24-29. Badania na szczurach oceniające dwa chinolony i makrolid przy użyciu tego modelu32 wykazały, że docelowa wartość PK/PD wymagana do zmniejszenia liczby S. pneumoniae o 1 log10 w porównaniu z wartością wyjściową była skorelowana z wartością docelową określoną u myszy z neutropenami i, co ważniejsze, z celami klinicznymi dla bakteryjnego zapalenia płuc nabytego przez społeczność6, 7, 34, 35. Gepotydacyna, antybiotyk o nowym mechanizmie, została przetestowana przeciwko wielu S. pneumoniae i wymagała podobnego celu PK/PD dla zmniejszenia o 1 log10 w tym modelu infekcji płuc31, jak wymaganego dla zmniejszenia o 1 log10 w neutropenicznym modelu uda36, gdy uwzględniono penetrację płuc (dane w aktach). Podobnie, cele PK / PD określone u myszy dla GSK2251052 przeciwko P. aeruginosa były spójne dla zastoju, 1- i 2-log-10 redukcji CFU między tym modelem płuc30 a modelem neutropenicznego zakażenia uda, gdy rozważano penetrację płuc37, 38. Korelacja z modelem neutropenicznego zakażenia płuc przy użyciu inokulacji donosowej była słaba; Jednak w tym badaniu nie wywołało GSK2251052 więcej niż statyczną odpowiedź38. Może to być związane z wyższym poziomem inokulum bakteryjnego, które wynosiło 8 log10 CFU/mysz w porównaniu z 6 log10 CFU/mysz w neutropenicznych udach37 i intubacji dotchawiczej30. Gromadzenie takich danych ma kluczowe znaczenie dla analizy porównawczej, ponieważ umożliwia bezpośrednie porównanie z istniejącymi modelami i korelację z danymi klinicznymi w celu oceny zdolności predykcyjnych translacji. Szersze zastosowanie modelu intubacji dotchawiczej zakażenia płuc dostarczy dodatkowych danych do tego typu analiz.
Istnieje kilka ograniczeń tego immunokompetentnego modelu zapalenia płuc. Po pierwsze, nie nadaje się do oceny pojawienia się spontanicznej oporności, ponieważ wysoki poziom inokulum bakteryjnego zwykle wymagany do takich badań skutkuje zbyt ciężką infekcją. Po próbach osiągnięcia obciążenia bakteryjnego na poziomie 7 lub 8 log10 CFU na początku badania, zaobserwowano szybką zachorowalność (tj. zwierzęta umierające w czasie krótszym niż 24 godziny) pomimo dokładnego mycia inokulacji w celu usunięcia wcześniej istniejących toksyn (dane w aktach). Być może uda się przezwyciężyć ten problem za pomocą większych gryzoni. Szczury, zwłaszcza cięższe (> 250 g), wydają się lepiej tolerować wyższą dawkę szczepionki w porównaniu z myszami i mogą być odpowiednie do tego typu badań. Drugim ograniczeniem jest to, że stosowanie agaru jako wzmacniacza infekcji może wykluczać użycie modelu do oceny niektórych interakcji gospodarz-patogen. Uważa się, że agar zapewnia chroniony punkt ogniskowy do czasu pełnego ustabilizowania się infekcji w płucach. Możliwe jest dostarczenie inokulum w roztworze soli fizjologicznej, a nie w agarze w celu przezwyciężenia tego problemu; Należy jednak zauważyć, że spowoduje to zakażenie tylko niektórymi izolatami. Po trzecie, aby osiągnąć biegłość w tej technice, wymagana jest stroma krzywa uczenia się. Procedura może być delikatna, szczególnie u myszy. Łatwo jest omyłkowo umieścić metalową kaniulę w przełyku, a nadmierna siła może doprowadzić do przebicia przełyku lub tchawicy. Wymagane jest również ostrożne umieszczenie inokulum, w przeciwnym razie zwierzęta mogą albo nie wyzdrowieć, albo nie zostać odpowiednio zainfekowane. Jednak dzięki cierpliwości i wytrwałości można stać się bardzo biegłym i wykonać technikę szybko, płynnie i dokładnie.
Usuwając wymóg neutropenii, zwiększając odporność i odtwarzalność, umożliwiając badaczom badanie większej liczby patogenów i izolatów, poprawiając elastyczność projektu eksperymentalnego i zapewniając trudną infekcję do scharakteryzowania farmakodynamiki zapalenia płuc, ten immunokompetentny model infekcji płuc stanowi istotną wartość dodaną dla społeczności zajmującej się odkrywaniem antybiotyków. Zwiększone wykorzystanie tego modelu przez dodatkowych badaczy pomoże w zapewnieniu niezbędnej analizy porównawczej, aby zyskał on szerszą akceptację i nadal dostarczał informacji pomocniczych dla właściwej interpretacji.