Od pewnego czasu wiadomo, że mięśnie szkieletowe składają się z pojedynczych włókien wielu typów1. Początkowo scharakteryzowano dwie grupy włókien na podstawie ich właściwości kurczliwych i nazwano je odpowiednio wolnokurczliwymi (typ I) i szybkokurczliwymi (typ II). Kategorie te zostały dodatkowo wyróżnione na podstawie metabolizmu błonnika. Ponieważ włókna typu I są bogate w mitochondria i zależne od metabolizmu oksydacyjnego, zostały one wyjaśnione przez silnie dodatnie barwienie dinukleotydu dinukleotydu nikotynamidoadeninowego i reduktazy tetrazolowej (NADH-TR) 2 lub dehydrogenazy bursztynianowej (SDH)3 barwienie. W przeciwieństwie do tego, włókna typu II wykazywały mniejsze i zmienne stopnie diaforazy NADH-TR lub barwienia SDH i zostały podzielone na dwie podgrupy szybkokurczliwe (typ IIA i typ IIB) nieco prymitywnie oparte na ich względnych zdolnościach oksydacyjnych. Te różnice między włóknami zostały skuteczniej uwidocznione przez barwienie miozyną-ATPazą, gdzie włókna typu I barwią się na ciemno po wstępnej inkubacji przy pH 4,0, a włókna typu IIB absorbują osad po wstępnej inkubacji przy pH 10,0 z włóknami typu IIA barwiącymi się pośrednio4.
Ostatnio immunohistochemiczne barwienie izoform ciężkiego łańcucha miozyny (MyHC) okazało się lepszym dyskryminatorem typu włókna5. Włókna typu I, typu IIA i typu IIB można precyzyjnie zidentyfikować na podstawie ich profilu MyHC. Ponadto zidentyfikowano inny szybkokurczliwy typ włókien metabolicznie pośrednich, typ IIX6. Potwierdzono również włókna hybrydowe wyrażające więcej niż jeden MyHC5,7,8. Wiadomo, że niektóre gatunki, takie jak kot i pawian, nie wyrażają MyHCs6. Chociaż barwienie immunologiczne MyHC jest obecnie najnowocześniejszą oceną składu mięśni, analiza danych uzyskanych za pomocą tej techniki jest kłopotliwa i czasochłonna bez automatycznej pomocy. W tym celu opracowano kilka półautomatycznych metod analizy tych danych5,9,10. W tym miejscu przedstawiamy stosunkowo standardowy protokół immunohistochemicznej identyfikacji typu włókien mięśniowych5,7,8,10, wraz z nowatorskim półautomatycznym algorytmem, który przyspiesza analizę typu włókna i morfologii włókien z dokładnością.