Niniejszy artykuł opisuje zastosowanie platformy opartej na chipie (rys. 1) do trójwymiarowej hodowli linii komórkowych, a także komórek pierwotnych. Ponieważ wiele komórek wykazuje funkcje organotypowe wyłącznie w środowisku 3D, opracowaliśmy polimerowy chip, który stanowi rusztowanie, do którego komórki mogą przylegać we wszystkich kierunkach przestrzennych i który może zostać zamontowany w obudowie bioreaktora w celu kontroli przepływu cieczy, ciśnienia tlenu itp. W zależności od projektu eksperymentalnego powierzchnię polimeru można modyfikować za pomocą różnych technik, np. naświetlania UV, PECVD, szczepienia γ lub konwencjonalnej chemii mokrej.

Rycina 01
1. Odpowietrzanie i hydrofilizacja chipa
Przed użyciem chip musi zostać odgazowany i zhydrofilizowany. W tym celu przeprowadza się serię kąpieli alkoholowych. Przygotowuje się roztwory izopropanolu o stężeniach 100%, 70%, 50% i 30% w wodzie traktowanej DMPC, a następnie chip zanurza się w każdym z tych stężeń, zaczynając od roztworu 100%, na czas do 30 s. Ostatnim etapem serii jest zanurzenie w czystej wodzie traktowanej Dimetylopirokarbonianem (DMPC). Od tego momentu kluczowe jest utrzymywanie chipu w stanie zwilżonym.
2. Powlekanie kolagenem I
Po serii kąpieli w alkoholach chip jest zazwyczaj powlekany roztworem kolagenu I pochodzącym z ogona szczura. Z roztworu stokowego kolagenu o stężeniu 2 mg/ml w 0,2% kwasie octowym pobiera się alikwot odpowiadający 30 μg białka kolagenu i rozcieńcza go wodą traktowaną DMPC do końcowej objętości 150 μl. W rezultacie powierzchnia chipu zostaje pokryta warstwą kolagenu o gęstości 10 μg kolagenu I na cm2 powierzchni.
3. Inokulacja komórek raka wątrobowokomórkowego
Komórki raka hepatokomórkowego linii Hep G2 poddaje się trypsynizacji i zliczaniu. W przypadku eksperymentów krótkoterminowych (od 1 do 6 dni) w każdym chipie oraz w odpowiadających im kontrolnych szalkach Petriego o średnicy 6 cm wysiewa się 5*106 komórek. Aby zaszczepić chip, 5*106 komórek resuspenduje się w 150 μl pożywki hodowlanej i nanosi na obszar mikrostrukturalny chipa (ryc. 2). Następnie chip umieszcza się w inkubatorze na 2-3 godziny. W czasie inkubacji komórki sedymentują do mikropojemników i przylegają do rusztowania powleczonego kolagenem I.

Rycina 2
4. Włożenie chipa do obudowy bioreaktora
Po okresie inkubacji chip zostaje wyjęty z inkubatora i zamontowany w obudowie bioreaktora. W tym celu, w komorze z laminarnym przepływem powietrza, wstępnie zmontowany bioreaktor zostaje wyjęty z jałowego opakowania i rozłożony w stopniu umożliwiającym włożenie chipa. Chip jest ostrożnie przenoszony za pomocą jałowej pęsety i umieszczany w rowku zawierającym uszczelkę, która uszczelnia chip, co prowadzi do utworzenia komory górnej i dolnej w bioreaktorze. Następnie bioreaktor zostaje ponownie złożony i przeniesiony do inkubatora, gdzie zostaje podłączony do pompy, zasilania gazem oraz analizatora tlenu.
5. Napełnianie układu
Zaraz po podłączeniu bioreaktora do zbiornika z pożywką, pompy i zasilania gazem, zamknięta pętla cyrkulacyjna zostaje wypełniona pożywką. Odbywa się to poprzez odpowiednie ustawienie złączy trójdrożnych w taki sposób, aby uzyskano superfuzję, definiowaną jako przepływ pożywki nad górną powierzchnią chipa. Prowadzi to do usunięcia zamkniętego powietrza z obiegu bioreaktora bez konieczności usuwania komórek z rusztowania. Po całkowitym wypełnieniu układu pożywką, złącza trójdrożne przełącza się tak, aby uzyskać perfuzję, definiowaną jako przepływ od dołu chipa przez tkankę. W konfiguracji perfuzyjnej przepływ jest dostosowany do potrzeb komórek, co w przypadku hepatocytów zazwyczaj mieści się w zakresie 60-500 μl/min.
6. Pobieranie próbek
W trakcie eksperymentu można pobierać próbki pożywki. W tym celu strzykawki podłącza się do sterylnych portów znajdujących się na górnej części zbiornika z pożywką. Po pobraniu próbek porty sterylizuje się 70% izopropanolem.
7. Izolacja nienaruszonych komórek z chipa do dalszych zastosowań
Po zakończeniu eksperymentu bioreaktory zostają odłączone od zasilania gazem oraz pompy perystaltycznej, przeniesione do komory z laminarnym przepływem powietrza i rozmontowane zgodnie z wcześniejszym opisem. Za pomocą sterylnej pęsety chip zostaje wyjęty z obudowy bioreaktora, umieszczony w szalce Petri o średnicy 3,5 cm i przepłukany PBS. Następnie chip inkubuje się z trypsyną/EDTA (0,25%/0,53mM) przez 5-15 min w inkubatorze, aby odłączyć komórki od obszaru mikrostrukturalnego. Zebrana zawiesina komórkowa jest wirowana przez 5 min przy 600 g. Komórki można następnie wykorzystać w konwencjonalnych zastosowaniach analitycznych, np. do izolacji całkowitego RNA lub białek. Rutynowo izolujemy całkowite RNA (zestaw PARIS, Ambion Inc., Austin, Texas, USA) do analizy mikromacierzy i RT-PCR w czasie rzeczywistym. Ekspresję białek analizuje się za pomocą skaningowego mikroskopu laserowego po barwieniu immunohistochemicznym komórek wewnątrz chipu, ale można ją również badać innymi metodami, np. za pomocą cytometrii przepływowej.