Ten artykuł demonstruje nowe techniki opracowane do doustnego dostarczania dwuniciowego RNA (dsRNA) przez tkanki naczyniowe roślin w celu interferencji RNA (RNAi) u owadów żywiących się sokiem łyka.
Artykuł metodologiczny
Ten artykuł demonstruje nowe techniki opracowane do doustnego dostarczania dwuniciowego RNA (dsRNA) przez tkanki naczyniowe roślin w celu interferencji RNA (RNAi) u owadów żywiących się sokiem łyka.
Owady żywiące się łykiem i sokami roślinnymi atakują integralność upraw i owoców, aby odzyskać składniki odżywcze, uszkadzając przy tym uprawy żywności. Owady pluskwiaka stanowią szereg istotnych ekonomicznie szkodników roślin, które powodują szkody w uprawach, żywiąc się sokiem łyka. Brązowy marmoryzowany pluskwa cuchnąca (BMSB), Halyomorpha halys (Heteroptera: Pentatomidae) i azjatycki psyllid cytrusowy (ACP), Diaphorina citri Kuwayama (Hemiptera: Liviidae) to szkodniki owadów pluskwiakowych wprowadzone do Ameryki Północnej, gdzie są inwazyjnym szkodnikiem rolniczym upraw specjalistycznych, rzędowych i podstawowych o wysokiej wartości oraz owoców cytrusowych, a także uciążliwym szkodnikiem, gdy gromadzą się w pomieszczeniach. Odporność na insektycydy u wielu gatunków doprowadziła do opracowania alternatywnych metod strategii zwalczania szkodników. Interferencja RNA za pośrednictwem dwuniciowego RNA (dsRNAi) to mechanizm wyciszania genów w funkcjonalnych badaniach genomicznych, który ma potencjalne zastosowania jako narzędzie do zwalczania szkodników owadzich. Egzogennie zsyntetyzowane dsRNA lub małe interferujące RNA (siRNA) mogą wywołać wysoce skuteczne wyciszanie genów poprzez degradację endogennego RNA, który jest homologiczny do przedstawionego. Skuteczne i ekologiczne zastosowanie RNAi jako biopestycydów molekularnych do biokontroli owadów pluskwiaka wymaga dostarczania in vivo dsRNA poprzez karmienie. Tutaj pokazujemy metody dostarczania dsRNA owadom: ładowanie dsRNA do zielonej fasolki przez zanurzenie i wchłanianie specyficznego dla genu dsRNA z doustnym podawaniem przez spożycie. Przedstawiliśmy również nietransgeniczne podejścia do dostarczania roślin przy użyciu oprysków dolistnych, zraszania korzeni, iniekcji do pnia, a także granulek gliny, z których wszystkie mogą być niezbędne do trwałego uwalniania dsRNA. Potwierdzono, że skuteczne dostarczanie przez doustnie przyjmowane dsRNA jest skuteczną dawką wywołującą znaczny spadek ekspresji docelowych genów, takich jak kwas juwenilowy O-metylotransferaza (JHAMT) i witellogenina (Vg). Te innowacyjne metody reprezentują strategie dostarczania dsRNA do wykorzystania w ochronie upraw i przezwyciężenia wyzwań środowiskowych związanych z ochroną przed szkodnikami.
Owady Hemipteran stanowią jedne z najbardziej znaczących ekonomicznie szkodników rolnictwa, ze względu na ich zdolność do osiągania wysokiego wzrostu populacji i rozprzestrzeniania chorób w roślinach. BMSB, H. halys Stål, jest inwazyjnym szkodnikiem, który został przypadkowo wprowadzony na półkulę zachodnią w Allentown w Pensylwanii z Azji (Chiny, Tajwan, Korea i Japonia) z pierwszą obserwacją zgłoszoną w 1996 roku1. Od czasu wprowadzenia BMSB został wykryty w 43 stanach, z największymi populacjami na środkowym Atlantyku (DE, MD, PA, NJ, VA i WV), a także w Kanadzie i Europie, i stanowi potencjalne zagrożenie dla rolnictwa2. Jako polifagiczny szkodnik, BMSB może wyrządzić szkody około 300 zidentyfikowanym gospodarzom roślinnym, w tym uprawach o wysokiej wartości, takich jak jabłka, winogrona, rośliny ozdobne, rośliny nasienne, soja i kukurydza. Uszkodzenia są spowodowane przede wszystkim sposobem karmienia znanym jako szarpanie i uderzenie, w którym zwierzę przebija roślinę żywicielską swoim igłowatym stylem, aby uzyskać dostęp do składników odżywczych z tkanek naczyniowych2,3. BMSB jest również szkodnikiem wewnętrznym, ponieważ od jesieni do zimy może zamieszkać w pomieszczeniach mieszkalnych, takich jak szkoły i domy2. Chemikalia i alergeny lotne uwalniane przez BMSB zostały zgłoszone jako nielegalna reakcja alergiczna u pracowników upraw sadowniczych. BMSB może również przyczyniać się do choroby alergicznej prowadzącej do kontaktowego zapalenia skóry, zapalenia spojówek i nieżytu nosa u osób wrażliwych4,5. Inny owad z rodziny pluskwiaków, ACP, D. citri Kuwayama (Hemiptera: Liviidae), jest poważnym szkodnikiem owoców cytrusowych i przenosi bakterie o ograniczonej liczbie łyka (Candidatus Liberibacter asiaticus) powodujące Huanglongbing (HLB), lepiej znane jako choroba zielenienia cytrusów6,7. HLB został po raz pierwszy zgłoszony z południowych Chin i rozprzestrzenił się na 40 różnych krajów Azji, Afryki, Oceanii, Ameryki Południowej i Północnej7. Zazielenianie cytrusów to ogólnoświatowy problem, który wiąże się z grożącymi stratami gospodarczymi i finansowymi z powodu utraty owoców cytrusowych; w związku z tym uważa się, że zarządzanie AKP ma ogromne znaczenie dla zapobiegania HLB i ich kontroli.
Środki skutecznego zwalczania tych szkodników zwykle wymagają stosowania chemicznych pestycydów, które są stosunkowo krótkotrwałe. Strategie kontroli insektycydów chemicznych często nie mają bezpiecznych strategii zarządzania środowiskiem lub mają zmniejszoną podatność ze względu na odporność na pestycydy w populacjach szkodników8,9. W związku z tym biologiczne zwalczanie szkodników za pomocą biopestycydów molekularnych jest potencjalną alternatywą, ale jego stosowanie na całym świecie pozostaje skromne, a różne gatunki parazytoidów (np. Trisolcus japonicus) mogą być również skuteczne jako naturalne środki kontroli biologicznej. RNAi to potencjalnie rozwijająca się technologia zwalczania inwazyjnych szkodników owadzich za pomocą biopestycydów molekularnych10. RNAi jest dobrze opisanym mechanizmem regulacji genów, który ułatwia skuteczne potranskrypcyjne wyciszanie genów endogennych, a także inwazyjnych dsRNA w sposób specyficzny dla sekwencji, co ostatecznie prowadzi do regulacji ekspresji genów na poziomie mRNA11,12. Krótko mówiąc, gdy egzogenne dsRNA jest internalizowane w komórce, jest przetwarzane na siRNA przez członka nadrodziny RNazy III nukleazy dwuzębnej, zwanej Dicer, która jest ewolucyjnie konserwowana u robaków, much, roślin, grzybów i ssaków13,14,15. Te 21-25 dupleksów nukleotydowych siRNA są następnie rozwijane i integrowane z kompleksem wyciszającym indukowanym RNA (RISC) jako przewodnikowe RNA. Ten kompleks RISC-RNA umożliwia parowanie zasad Watsona-Cricka z komplementarnym docelowym mRNA; to ostatecznie prowadzi do rozszczepienia przez białko Argonaute, wielodomenowe białko zawierające domenę podobną do RNazy H, która degraduje odpowiednie mRNA i zmniejsza translację białek, prowadząc w ten sposób do potranskrypcyjnego wyciszenia genów16,17,18.
RNAi do zwalczania szkodników wymaga wprowadzenia dsRNA in vivo, aby wyciszyć interesujący nas gen, aktywując w ten sposób szlak siRNA. Różne metody, które zostały wykorzystane do dostarczania dsRNA owadom i komórkom owadów w celu indukcji ogólnoustrojowego RNAi, obejmują karmienie10,19, soaking20,21, mikroiniekcja22, nośniki, takie jak liposomy23 i inne techniki24. Po raz pierwszy zademonstrowano RNAi u Caenorhabditis elegans w celu wyciszenia ekspresji genu unc-22 przez Fire and Mello25, a następnie obniżenie ekspresji kędzierzawych genów u Drosophila melanogaster26. Początkowe badania funkcjonalne wykorzystywały mikroiniekcję do dostarczania dsRNA owadom, takim jak Apis mellifera22,27, Acyrthosiphon pisum28, Blattella germanica29, H. halys30 oraz owady lepidoptera (sprawdzone przez Terenius et al.31). Mikroiniekcja jest korzystna dla dostarczenia dokładnej i precyzyjnej dawki do miejsca zainteresowania owada. Chociaż takie nakłucia septyczne mogą wywoływać ekspresję genów związanych z odpornością z powodu trauma32, co wyklucza jego praktyczność w rozwoju biopestycydów rolniczych.
Inną metodą dostarczania dsRNA in vivo jest moczenie, które polega na spożyciu lub absorpcji dsRNA przez zawieszenie zwierząt lub komórek zazwyczaj w pożywce zewnątrzkomórkowej zawierającej dsRNA. Moczenie stosowano do skutecznego indukowania RNAi w komórkach hodowli tkankowej Drosophila S2 w celu zahamowania kinazy białkowej aktywowanej mitogenem (MAPKK) Downstream of-Raf1 (DSOR1) 20, a także u C. elegans w celu wyciszenia genu pos-133. Jednak dsRNA dostarczane za pomocą namaczania jest mniej skuteczne w indukowaniu RNAi w porównaniu do mikroiniekcji20. Wyciszanie za pośrednictwem RNAi u owada żującego zostało po raz pierwszy pokazane u zachodniej kukurydzianej stonki korzeniowej (WCR) (Diabrotica virgifera virgifera) poprzez wprowadzenie dsRNA do sztucznej diety agarowej10. Wcześniejsze doniesienia podsumowywały metody dostarczania dsRNA w infuzji w naturalnej diecie specyficznej dla stawonogów34. Ustalono ponadto, że te metody dostarczania są porównywalnie skuteczne ze sztucznymi środkami dostarczania; jak w przypadku muchy tse-tse (Glossina morsitans morsitans), gdzie zaobserwowano równy knockdown genu związanego z odpornością, gdy dsRNA było dostarczane albo przez mączkę z krwi, albo przez mikrowstrzyknięcie35. Podobnie, dostarczanie dsRNA przez kropelki u jasnobrązowej jabłoniowej (Epiphyas postvittana)36, larw diamentowej (Plutella xylostella)37, a także pszczół miodnych38,39 indukowały wydajne RNAi. Najbardziej efektywne eksperymenty RNAi u owadów hemipteran wykorzystywały wstrzyknięcie dsRNA40, ponieważ doustne dostarczanie dsRNA u owadów z pluskwiakami jest żmudne, ponieważ musi być dostarczane przez tkanki naczyniowe rośliny żywicielskiej. Skuteczne RNAi zaobserwowano również u ACP i skoczka wyborowego szklistego (GWSS), Homalodisca vitripennis: dsRNA było dostarczane przez cytrusy i winorośle, które wchłonęły dsRNA do tkanek naczyniowych poprzez zraszanie korzeni, opryskiwanie dolistne, iniekcje do pnia lub wchłanianie przez sadzonki41,42,43,44,45,46. Zaowocowało to również pierwszym patentem na dsRNA przeciwko ACP (2016, US 20170211082 A1). Dostarczanie siRNA i dsRNA za pomocą nośników, takich jak nanocząstki i liposomy, nadaje stabilność i szybko pojawia się wzrost skuteczności dostarczanego dsRNA23,47,48,49,50. Nowa klasa opartych na nanocząstkach nośników kwasów nukleinowych do in vitro i in vivo, która została podsumowana specjalnie do zastosowań terapeutycznych, może wnieść ogromny potencjał jako odpowiednie wektory dostarczania51. Nanocząstki jako nośnik dostarczania dsRNA mogą mieć wady, takie jak rozpuszczalność, hydrofobowość lub ograniczona bioakumulacja52, ale odpowiednie dostarczanie polimeru może zrekompensować te wady. Pojawiają się również prace rozwojowe i zastosowanie samodostarczających się nukleotydów zwanych "oligonukleotydami antysensownymi", które są jednoniciowymi dupleksami RNA/DNA46.
Witellogeneza u stawonogów jest kluczowym procesem kontrolującym reprodukcję i regulowanym przez hormon juweniliczny (JH) lub ekdyzon, które są kluczowymi induktorami syntezy Vg przez tkankę tłuszczową; Vg jest ostatecznie pobierane przez rozwijający się oocyt poprzez endocytozę, w której pośredniczy receptor Vg53. Vg to grupa polipeptydów syntetyzowanych pozajajnikowo, która jest niezbędna do rozwoju głównego białka żółtka jaja, witeliny54,55, a zatem jest ważna w reprodukcji i starzeniu się56. Vg zostało skutecznie wyciszone u nicieni57, a także u pszczół miodnych (Apis mellifera), gdzie zaobserwowano niedobór Vg za pośrednictwem RNAi u dorosłych i jaj22. Przetestowano posttranskrypcyjne wyciszanie genów Vg za pośrednictwem RNAi, ponieważ uważano, że jego wyczerpanie doprowadzi do obserwowalnego efektu fenotypowego, takiego jak zmniejszona płodność i płodność, aby potencjalnie pomóc w kontroli BMSB. Gen JHAMT, który koduje O-metylotransferazę kwasu S-adenozylo-L-metioniny (SAM) zależną od kwasu JH, katalizuje ostatni etap szlaku biosyntezy JH58. W tym szlaku pirofosforan farnezylu (FPP) jest sekwencyjnie przekształcany z farnezolu w kwas farnezoinowy, a następnie przekształcany przez JHAMT w farnezoinian metylu w JH. Szlak ten jest zachowany u owadów i stawonogów specjalnie do metamorfozy, procesu, który jest regulowany rozwojowo przez hormony59,60,61. U B. mori ekspresja genu JHAMT i aktywność biosyntetyczna JH w ciałkach białych sugerują, że supresja transkrypcji genu JHAMT ma kluczowe znaczenie dla zakończenia biosyntezy JH58. W związku z tym geny JHAMT i Vg zostały wybrane do celowego zubożenia za pomocą RNAi. RNAi testowano również na drzewach cytrusowych pod kątem kontroli ACP i GWSS. Drzewa cytrusowe potraktowano dsRNA poprzez zraszanie korzeni, stuknięcie w łodygę (iniekcje do pnia), a także opryskiwanie dolistne dsRNA przeciwko transkryptom kinazy argininowej (AK) specyficznej dla owadów42,44. Miejscowe stosowanie dsRNA wykryto na całym baldachimie drzew cytrusowych, co wskazuje na skuteczne dostarczanie przez tkanki naczyniowe roślin i spowodowało zwiększoną śmiertelność w ACP i GWSS41,42,45.
W obecnym badaniu zidentyfikowaliśmy naturalną metodę dostarczania diety do leczenia takiego jak dsRNA. Ta nowo opracowana technika została następnie wykorzystana do wyciszenia mRNA JHAMT i Vg przy użyciu specyficznych dla genów dsRNA w nimfach BMSB, jak wykazano wcześniej62. Zademonstrowane tutaj nowe protokoły dostarczania zastępują konwencjonalne systemy dostarczania RNA, które wykorzystują miejscowe spraye lub mikroiniekcje. Warzywa i owoce, kran z łodygą, nasiąkanie glebą i absorbenty gliniane mogą być wykorzystywane do dostarczania dsRNA, co ma kluczowe znaczenie dla dalszego rozwoju biopestycydów w zakresie zwalczania szkodników i patogenów.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
1. Hodowla BMSB
2. Wybór regionów genów i synteza in vitro dsRNA
3. Dostarczanie dsRNA za pomocą zielonej fasoli
4. Ilościowa analiza ekspresji genów w czasie rzeczywistym (qPCR) po wyciszeniu za pośrednictwem RNAi w BMSB
5. Opryskiwanie dolistne dużych doniczkowych drzew cytrusowych i sadzonek
Uwaga: Rośliny cytryny odmiany cytrusowej 'Carrizo' (Citrus sinensis XPoncirus trifoliata, Rutaceae) były hodowane w szklarni w naturalnym świetle i temperaturze, uprawiane w pojemnikach o pojemności 1,2 L. Rośliny były stale przycinane, aby pobudzić wzrost nowych pędów liściowych, zwanych "flush". ACP preferuje żerowanie i składanie jaj na nowym wzroście cytrusów64.
6. Stosowanie zraszania gleby/korzeni w dużych lub małych doniczkowych drzewach cytrusowych i sadzonkach
7. Zastosowanie Stem Tap (iniekcja pnia drzewa) w dużych doniczkowych drzewach cytrusowych i sadzonkach
8. Granulki gliny poddane działaniu dsRNA do dostarczania owadom przez glebę
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Dostarczanie dsRNA za pośrednictwem roślin poprzez karmienie w nimfach BMSB 4th instar zostało przetestowane pod kątem rozwoju molekularnych biopestycydów przy użyciu RNAi dla inwazyjnych szkodników owadzich. BMSB żywią się za pomocą igiełkowatych stylów za pomocą mechanizmu znanego jako szarpanie i spłukiwanie, który powoduje znaczne szkody w uprawach. Smukła organiczna fasolka szparagowa, P. vulgaris L., została użyta do sprawdzenia, czy składniki odżywcze lub dsRNA ...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
RNAi okazał się ważnym narzędziem do badania funkcji biologicznych i regulacji genów, z ogromnym potencjałem do wykorzystania w zwalczaniu szkodników owadzich 19,68,69,70,71. Ogromne znaczenie ma zarówno zaprojektowanie i wybór odpowiedniego genu (genów) do wyciszenia u danego gatunku owadów oraz metoda dostarczania odpowiadającego mu dsRNA (genów) owadow. Opt...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Autorzy nie mają nic do ujawnienia.
Autorzy dziękują Donaldowi Weberowi i Megan Herlihy (USDA, ARS Beltsville, MD) za dostarczenie BMSB i HB do eksperymentów i utrzymania kolonii; oraz Marii T. Gonzalez, Salvadorowi P. Lopezowi, (USDA, ARS, Fort Pierce, FL) i Jackie L. Metz (University of Florida, Fort Pierce, FL) za utrzymanie kolonii, przygotowanie próbek i analizy.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| Owady BMSB (H. halys) | USDA | ||
| ACP (D. citri) owady | USDA | ||
| organiczna fasolka szparagowa | Nie dotyczy Rośliny | ||
| cytrusowe | USDA | ||
| roztwór podchlorynu sodu | J.T. Baker | ||
| zielony barwnik spożywczy | McCormick & Co., Inc | ||
| Komory Thermo Forma | Naczynie Thermo Fisher Scientific | ||
| Magenta (Kultura) | Podkłady Sigma | ||
| IDT DNA | |||
| SensiMix SYBR | Bioline | ||
| qPCR ABI 7500 | Applied Biosystems | ||
| Butelka z rozpylaczem | N/A | ||
| Parafilm | American Can Company | ||
| TaKaRa Ex Taq | Clontech | ||
| QIAquick | Qiagen |
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Poproś o pozwolenie na ponowne wykorzystanie tekstu lub ilustracji tego artykułu JoVE
Poproś o pozwolenie