Ten protokół krok po kroku zawiera szczegółowy opis konfiguracji eksperymentu i analizy danych do oceny reakcji zapalnych w hiPSC-EC oraz analizy adhezji leukocytów w przepływie fizjologicznym.
Artykuł metodologiczny
Ten protokół krok po kroku zawiera szczegółowy opis konfiguracji eksperymentu i analizy danych do oceny reakcji zapalnych w hiPSC-EC oraz analizy adhezji leukocytów w przepływie fizjologicznym.
Komórki śródbłonka (EC) są niezbędne do regulacji reakcji zapalnych poprzez ograniczanie lub ułatwianie rekrutacji leukocytów do dotkniętych tkanek poprzez dobrze scharakteryzowaną kaskadę receptorów proadhezyjnych, które są regulowane w górę na powierzchni komórek leukocytów po wyzwalaczu zapalnym. Reakcje zapalne różnią się między osobnikami w populacji, a podłoże genetyczne może przyczyniać się do tych różnic. Wykazano, że ludzkie indukowane pluripotencjalne komórki macierzyste (hiPSC) są wiarygodnym źródłem EC (hiPSC-EC), stanowiąc tym samym nieograniczone źródło komórek, które rejestrują tożsamość genetyczną i wszelkie warianty genetyczne lub mutacje dawcy. hiPSC-EC mogą być zatem wykorzystywane do modelowania reakcji zapalnych w komórkach specyficznych dla dawcy. Reakcje zapalne można modelować, określając adhezję leukocytów do hiPSC-EC pod wpływem przepływu fizjologicznego. Ten protokół krok po kroku zawiera szczegółowy opis konfiguracji eksperymentalnej i analizy danych w celu oceny odpowiedzi zapalnych w hiPSC-EC oraz analizy adhezji leukocytów w przepływie fizjologicznym.
Stan zapalny odgrywa kluczową rolę w wielu stanach patologicznych, w tym w zaburzeniach sercowo-naczyniowych i neurodegeneracyjnych, sepsie i niepożądanych reakcjach na leki (ADR). Komórki śródbłonka (EC) odgrywają istotną rolę w regulacji reakcji zapalnych poprzez indukcję receptorów proadhezyjnych, takich jak E-selektyna, międzykomórkowa cząsteczka adhezyjna-1 (ICAM-1) i cząsteczka adhezyjna komórek naczyniowych-1 (VCAM-1) na ich powierzchni1,2. Wiadomo, że mikronaczyniowe EC w różnych tkankach wykazują niejednorodność w reakcjach zapalnych3,4. Ponadto podłoże genetyczne lub pewne choroby genetyczne mogą powodować różnice w reakcjach zapalnych między osobami; Dlatego ważne jest, aby mieć dostęp do EC od różnych osób. Niedawno wykazano, że ludzkie indukowane pluripotencjalne komórki macierzyste (hiPSCs)5, które mogą pochodzić od praktycznie każdej osoby, służą jako niezawodne i odnawialne źródło ECs6,7,8,9. W związku z tym ocena odpowiedzi zapalnych i rekrutacji leukocytów w hiPSC-EC jest cenna nie tylko dla modelowania niektórych zaburzeń genetycznych, ale także dla dostarczenia wskazówek dotyczących zmienności międzyosobniczej i wykorzystania jako narzędzie medycyny spersonalizowanej w przyszłości.
Testy przepływu dostarczają użytecznego narzędzia do badania interakcji śródbłonka-leukocytów. Postępy w dziedzinie urządzeń mikroprzepływowych umożliwiają odtwarzanie fizjologicznych warunków przepływu płynów z precyzyjną kontrolą poziomów naprężeń ścinających specyficznych dla łożyska naczyniowego. Obrazowanie na żywo umożliwia monitorowanie kaskady zdarzeń wychwytywania, toczenia, pełzania, adhezji i transmigracji leukocytów. Opracowano kilka testów przepływu w celu zbadania interakcji śródbłonek-leukocyty, jednak wszystkie wykorzystują podstawowe ECs10,11,12,13. W tym miejscu szczegółowo opiszemy test do oceny adhezji ludzkich leukocytów do hiPSC-EC w przepływie fizjologicznym. W tej procedurze opisano zoptymalizowane warunki stymulacji hiPSC-EC bodźcami prozapalnymi, takimi jak czynnik martwicy nowotworu alfa (TNFα), dysocjacja, zasiew do chipa mikroprzepływowego z ośmioma równoległymi kanałami. Opisujemy krok po kroku protokół perfuzji hiPSC-EC z zawieszeniem leukocytów znakowanych fluorescencyjnie w chipach mikroprzepływowych, obrazowaniem żywych komórek i automatycznym zliczaniem przylegających leukocytów.
Ten protokół jest przydatny do oceny reakcji zapalnych w hiPSC-EC w badaniach przesiewowych leków, modelowaniu chorób i spersonalizowanej medycynie regeneracyjnej.
1. Przygotowanie roztworów i odczynników
2. Powlekanie chipów mikroprzepływowych
3. Przygotowanie hiPSC-EC
UWAGA: W opisanym tutaj protokole, hiPSC-EC zostały zróżnicowane, oczyszczone, kriokonserwowane i rozmrożone, jak opisano wcześniej8.
4. Dysocjacja hiPSC-EC i zasiewanie do mikroprzepływowego chipa
5. Przygotowanie ludzkich leukocytów
UWAGA: W opisanym tutaj protokole użyto dostępnej na rynku linii komórek monocytowych (THP-1). Alternatywnie można użyć komórek jednojądrzastych krwi obwodowej lub neutrofili. Izolację monocytów krwi obwodowej i neutrofili można przeprowadzić przy użyciu standardowej procedury11. Wykonaj wszystkie czynności opisane w tym paragrafie w kapturze do hodowli komórkowych.
6. Przygotowanie pompy mikroprzepływowej
7. Przygotowanie chipa mikroprzepływowego do obrazowania na żywo
8. Test przyczepności przepływowej i akwizycja obrazu
9. Zakończenie testu i czyszczenie pompy mikroprzepływowej
10. Liczenie przylegających leukocytów
W pierwszej kolejności należy zbadać odpowiedź hiPSC-ECs na stymulację prozapalnym czynnikiem TNFα, zgodnie z wcześniejszym opisem7. Leczenie TNFα przez 12 h wywołuje nadekspresję E-selectiny, z osiągnięciem szczytu w 6 h po rozpoczęciu terapii. Dodatkowo, ICAM-1 ulega nadekspresji w 6 – 12 h po podaniu preparatu. Chociaż nie zaobserwowano oczekiwanej nadekspresji VCAM-1, jest ona zazwyczaj widoczna w pierwotnych ludzkich komórkach śródbłonka żyły pępkowej (HUVECs). Stwierdzono, że nocna (12 h) inkubacja z TNFα jest najwygodniejsza dla testu adhezji leukocytów.
Optymalna dysocjacja hiPSC-EC powinna skutkować uzyskaniem zawiesiny pojedynczych komórek wolnej od skupisk komórkowych. Rysunek 2C przedstawia optymalną gęstość hiPSC-EC bezpośrednio po wstrzyknięciu. Zazwyczaj 15 min po wstrzyknięciu hiPSC-EC przylegają do dna kanału i zaczynają się rozpływać (Rysunek 2D). Po 1 h od wstrzyknięcia hiPSC-EC tworzą dobrze rozpłyniętą monowarstwę wzdłuż kanału i będą gotowe do rozpoczęcia testu przepływowego (Rysunek 2E).
Znakowanie leukocytów fluorescencyjnym znacznikiem jest korzystne dla obrazowania w kontraście fazowym podczas zautomatyzowanej kwantyfikacji obrazów, ponieważ ułatwia etap identyfikacji komórek, szczególnie że leukocyty przylegają do monowarstwy EC i oprogramowaniu często trudno jest rozróżnić poszczególne typy komórek.
Bezpłatne otwartoźródłowe oprogramowanie do przetwarzania obrazów jest bardzo przydatne do zautomatyzowanej kwantyfikacji adherentnych leukocytów. Procedura opisana w niniejszym protokole opiera się na pierwotnej identyfikacji obiektów z wykorzystaniem adaptacyjnego progowania obrazów fluorescencyjnych leukocytów (Rysunek 4A). Filtrowanie zidentyfikowanych obiektów na podstawie minimalnej powierzchni pozwala dodatkowo usunąć błędnie zidentyfikowane elementy, takie jak debris komórkowy, autofluorescencja lub jakikolwiek inny nieswoisty sygnał fluorescencyjny (Rysunek 4C, D).
Jeden chip mikroprzepływowy z ośmioma równoległymi kanałami umożliwia porównanie dwóch niezależnych grup, na przykład komórek śródbłonka (EC) zróżnicowanych z niezależnych hiPSC, takich jak od zdrowych dawców lub pacjentów z zaburzeniami genetycznymi. Można również uwzględnić dodatkowe kontrole, takie jak nieleczone EC lub wstępna obróbka przeciwciałem blokującym ICAM-110,1. Jednorazowo można przetwarzać od dwóch do trzech chipów mikroprzepływowych. Dla zapewnienia wiarygodności wniosków zaleca się przeprowadzenie minimum trzech niezależnych eksperymentów biologicznych w różne dni.

Rysunek 1Przygotowanie hiPSC-EC i leukocytów do analizy przepływowej. (A) Obróbka wstępna hiPSC-EC bodźcem prozapalnym (TNFα). (BSchematyczne przedstawienie enzymatycznej dysocjacji, wirowania i resuspensji hiPSC-ECs.C) Schematyczna reprezentacja powlekania kanałów (C, lewo), wstrzykiwania zawiesiny hiPSC-EC (C, środek) oraz dodawania pożywki do hodowli komórkowej po adhezji hiPSC-EC w chipie mikroprzepływowym. (D) Schematyczny przebieg etapu płukania leukocytów, znakowania barwnikiem fluorescencyjnym DiOC6 oraz resuspensji. Aby wyświetlić większą wersję tego rysunku, kliknij tutaj.

Rycina 2Chip mikrofluidyczny z hiPSC-EC. (A) Chip mikroprzepływowy w 10-centymetrowej płytce Petriego. (B) Komora nawilżana używana do inkubacji. (C, D, E) Reprezentatywne obrazy hiPSC-ECs w kanale mikroprzepływowym w 0 min (C), 15 min (D), 1 h (E) po iniekcji. Pasek skali = 200 µm. Aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny, kliknij tutaj.

Rycina 3Układ doświadczalny obrazowania żywych komórek oraz testu perfuzji leukocytów. (A, B) Zdjęcie (A) i schematyczne przedstawienie (B) układu eksperymentalnego do obrazowania żywych komórek i analizy przepływowej: (1) - odwrócony mikroskop fluorescencyjny z zamontowaną komorą do obrazowania żywych komórek (5% CO2, 37 °C, nawilżone), (2) – pompa mikroprzepływowa, (3) – kolektor 8-kanałowy, (4) – komputer do sterowania mikroskopem i akwizycji obrazu, (5) – komputer do sterowania pompą mikroprzepływową. (C) Chip mikrofluidyczny z włożonymi przewodami 8-kanałowego rozdzielacza, zamocowany w uchwycie na płytki i umieszczony na zmotoryzowanym stoliku mikroskopu. (D) Schematyczne przedstawienie głównych etapów analizy przepływowej. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 4Analiza obrazu i zautomatyzowana detekcja leukocytów adherentnych. (A) Okno dialogowe oprogramowania do przetwarzania obrazów z określonymi ustawieniami służącymi do identyfikacji leukocytów. (B) Okno dialogowe oprogramowania do przetwarzania obrazów z określonymi kryteriami filtrowania zidentyfikowanych obiektów na podstawie minimalnie akceptowalnej powierzchni (SAmin = 70 px). (C) Przykład poprawnej identyfikacji leukocytów i filtrowania obiektów niespecyficznych o małej powierzchni (SA) (typowy średnica w pikselach (Min, Max) = (9, 15); kryteria filtrowania SA)min = 70 px). Obiekty zaakceptowane są przedstawione w kolorze zielonym, a obiekty odrzucone w kolorze fioletowym. (D) Przykład błędnej identyfikacji leukocytów ze względu na nieprawidłowy zakres typowej średnicy (Typowa średnica w pikselach (Min, Max) = (3, 15); Kryteria filtrowania SAmin = 70 px). Obiekty zaakceptowane są przedstawione w kolorze zielonym, a obiekty odrzucone w kolorze fioletowym. Prosimy kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.
Protokół ten opisuje charakterystykę leczenia hiPSC-EC bodźcami prozapalnymi, takimi jak TNFα, funkcjonalną ocenę adhezji leukocytów do hiPSC-EC w teście przepływowym z wykorzystaniem obrazowania na żywo i automatycznego zliczania przylegających leukocytów.
Nocna stymulacja hiPSC-EC za pomocą TNFα powoduje wydłużony wygląd, który zazwyczaj wskazuje na aktywowany fenotyp prozapalny w EC. Na etapie optymalizacji poziomy ekspresji E-selektyny, ICAM-1, VCAM-1 powinny być weryfikowane za pomocą FAC 7,8, a pierwotne EC ludzkiej żyły pępowinowej (HUVEC) zaleca się włączenie jako kontroli dodatniej.
Należy osiągnąć optymalną dysocjację hiPSC-EC i gęstość wysiewu, aby uzyskać zlewającą się monowarstwę bez tworzenia grudek komórkowych i zatorów kanałów. Bardzo ważne jest, aby ponownie zawiesić leukocyty tuż przed perfuzją, aby uniknąć wytrącania się komórek i utrzymać stałe stężenie podczas oznaczania każdego kanału. Można użyć ludzkich leukocytów krwi obwodowej, takich jak monocyty i neutrofile, lub jako alternatywę można zastosować ustalone monocytowe linie komórkowe, takie jak THP-1 lub HL-60.
Podczas montażu zestawu mikroprzepływowego i podczas testu przepływu bardzo ważne jest, aby zapobiec uwięzieniu pęcherzyków powietrza w rurkach i kanałach mikroprzepływowych, ponieważ mogą one spowodować oderwanie się hiPSC-EC i/lub przylegających leukocytów. Interfejs płyn-ciecz lub włączenie dodatkowych etapów mycia podczas przygotowywania zestawu mikroprzepływowego może pomóc w zapobieganiu powstawaniu pęcherzyków powietrza.
Wskazane jest, aby protokół był uruchamiany przez dwóch operatorów, z których jeden przygotowuje komórki, a drugi przygotowuje system mikroprzepływowy i test przepływu. Gwarantuje to, że EC są powlekane w mikroprzepływowych chipach w stałym oknie czasowym przed przetwarzaniem oraz poprawia dokładność i odtwarzalność wyników. Ponadto umożliwia to również ustawienie ślepych eksperymentów, aby uniknąć stronniczości wyników.
Aby skutecznie wykrywać komórki za pomocą zautomatyzowanego potoku przetwarzania obrazu, ważne jest, aby uzyskiwać obrazy w ostrości z wysokim stosunkiem sygnału do szumu i unikać autofluorescencji niespecyficznych obiektów, takich jak grudki komórek. Kluczowe znaczenie ma prawidłowe określenie minimalnych i maksymalnych granic typowej wielkości przylegających leukocytów, które należy zidentyfikować. Typową wielkość leukocytów można oszacować za pomocą narzędzia do pomiaru linii w ImageJ. Na przykład w naszej analizie użyliśmy zakresu 9–15 pikseli, co odpowiada fizycznemu rozmiarowi 10,3–17,1 μm (rysunek 4C). W przypadku użycia niewłaściwego zakresu, np. 3–15 pikseli (3,4–17,1 μm), pojedynczy leukocyt jest identyfikowany nie jako jedna komórka, ale raczej jego podczęści są identyfikowane jako oddzielne obiekty (ryc. 4D). Prowadzi to do fałszywej liczby obiektów, które należy zidentyfikować.
Wiele obiektów o niskiej intensywności i mniejszej powierzchni niż leukocyty można wykryć za pomocą dostarczonej metody progowania adaptacyjnego. Może się to zdarzyć z powodu autofluorescencji lub innych niespecyficznych sygnałów fluorescencyjnych. Niemniej jednak te niespecyficzne obiekty, jeśli ich obszar jest mniejszy niż typowy obszar pojedynczego leukocytu, można filtrować, definiując minimalnie akceptowaną powierzchnię (Figura 4C).
Opisany tutaj test przepływu pozwala na bezpośrednią ocenę adhezji leukocytów do monowarstwy EC, wyjaśniając interakcję tych dwóch typów komórek, ale nie uwzględnia innych typów komórek, takich jak perycyty, które są obecne w ścianie naczyniowej i mogą również uczestniczyć w regulacji wynaczynienia leukocytów15. Zintegrowanie mikrośrodowiska hodowli 3D z innymi typami komórek może poprawić fizjologiczne znaczenie systemu. Pomimo tych ograniczeń, opisany tutaj test przepływu do oceny reakcji zapalnych stanowi cenne narzędzie do podstawowej charakterystyki i zastosowań modelowania choroby hiPSC-EC.
Autorzy nie mają nic do ujawnienia.
Autorzy pragną podziękować następującym grantom: Europejska Rada ds. Badań Naukowych (ERCAdG 323182 STEMCARDIOVASC); Netherlands Organ-on-Chip Initiative, projekt NWO Gravitation finansowany przez Ministerstwo Edukacji, Kultury i Nauki rządu Holandii (024.003.001).
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| Vena8 Endothelial+ biochip | Cellix Ltd | V8EP-800-120-02P10 | |
| Mirus Evo Nanopump | Cellix Ltd | MIRUS-EVO-PUMP | 1 x pompa strzykawkowa; 1 x oprogramowanie do testów VenaFluxAssay; 1 x zestaw przewodów; Zasilacz i . |
| 8-kanałowa płyta wielokanałowa MultiFlow8 | Cellix Ltd | MIRUS-MULTIFLOW8 | |
| Skrzynka nawilżana | Cellix Ltd | HUMID-BOX | |
| System obrazowania fluorescencyjnego Leica AF6000 | Leica Microsystems | ||
| Hamamatsu | C9100 | ||
| Szafa bezpieczeństwa biologicznego/okap z przepływem laminarnym | Cleanair | ||
| CO2 inkubator kultur komórkowych | Panasonic | MCO-170AICUV | |
| Wirówka | Hitachi | himac-CT6EL | |
| Ręczny pipetownik (P-10 (10 mL), P-200 (200 µ L), P-1000 (1,000 &mikro; L) | Gilson międzynarodowy | 4807 (10&mikro; L), 4810 (200&mikro; L), 4809 (1000&mikro; l) | |
| Sterylna pipeta plastikowa | Greiner Bio-One | 606180 (5 ml), 607180 (10 ml) | |
| szalka Petriego | VWR/ Duran Group | 391-0860 | |
| Kolby hodowlane (75 cm2) | CELLSTAR | 658,170 | |
| Probówka wirówkowa (15 mL) | CELLSTAR | 188271 | |
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Uwagi |
| Żelatyna ze skóry wieprzowej, typ A | Sigma-Aldrich | G1890 | |
| Fibronektyna (osocze bydlęce) | Sigma-Aldrich | F1141 | |
| DPBS, bez wapnia, bez magnezu | Life Technologies | 14190-169 | |
| Ludzki śródbłonek-SFM | Życie Technologie | 11111-044 | |
| Ludzki VEGF 165 IS, klasa premium | Miltenyi Biotec | 130-109-386 | |
| Ludzki FGF-2, premium klasa | Miltenyi Biotec | 130-093-842 | |
| Surowica uboga w płytki krwi, bydlęca | Technologie biomedyczne | BT-214 | |
| Rekombinowany ludzki TNF-α | Tebu-bio | 300-01A-A | |
| TrypLE Select | Life Technologies | 12563029 | |
| DiOC6(3) | Sigma-Aldrich | 318426 | |
| RPMI 1640 | Medium Life Technologies | 21875-034 | |
| 2-merkaptoetanol (50 mM) | Life Technologies | 31350010 | |
| FBS | Life Technologies | 10270-106 | |
| L-glutamina | Life Technologies | 25030-024 | |
| Penicylina-Streptomycyna (5,000 U/mL) | Life Technologies | 15070-063 | |
| Woda destylowana | Life Technologies | 15230-089 | |
| Absolut etanolu | Merck | 1.00983.2500 | |
| VCAM-1 | R& Systemy D | FAB5649P | |
| E-Selectin | R& Systemy D | BBA21 | |
| ICAM-1 | R& D systems | BBA20 | |
| Nazwa | Company | Wersja oprogramowania | Komentarze |
| Cellrofiler | CellProfiler | 2.1.1 | |
| VenaFluxAssay Software | Cellix Ltd | 2.3.a |