Opracowaliśmy nową metodę generowania sferoidów 3D z wykorzystaniem in vitro heterotypowego systemu kokultury komórek, który naśladuje in vivo mikrośrodowisko guza. Fibroblasty pochodzą z fibroblastów skóry mysiej. Fibroblasty skóry wygenerowano zgodnie z powyższym opisem i scharakteryzowano jako komórki α-SMA+/Vimentin+/FSP-1+. Ludzkie przerzutowe komórki czerniaka (C8161) hodowano w pożywce W489 zgodnie z opisem32. Aby umożliwić wizualizację i odróżnienie fibroblastów od komórek nowotworowych, przed kokulturą komórek fibroblasty i komórki czerniaka poddano odpowiednio transdukcji GFP/lentiwirusem oraz DsRed/lentiwirusem34,36.
Rysunek 1 przedstawia przykład wielokomórkowych sferoidów 3D powstałych w wyniku kokultury komórek czerniaka i fibroblastów. Komórki czerniaka hodowane bez fibroblastów nie tworzyły typowych sferoidów 3D, choć niektóre z nich tworzyły skupiska/agregaty 2D wraz z przedłużeniem czasu hodowli. Średnia wielkość sferoidów w dniach ~5−7 wynosiła około 170–360 μm średnicy (średnia = 275, SD = 37). Wykorzystując obrazowanie time-lapse, zaobserwowaliśmy, że fibroblasty i komórki nowotworowe w kokulturze wchodziły w interakcje i zaczęły tworzyć sferoidy 3D około 36 h kokultury, co pokazano w Wideo 1. Obrazowanie time-lapse zarejestrowało dynamiczny proces interakcji międzykomórkowych oraz początkową fazę tworzenia sferoidów w czasie ~4–52 h kokultury. Szczyt tworzenia sferoidów 3D wystąpił około 5–7 dnia. Powstałe sferoidy 3D składały się z fibroblastów i komórek czerniaka, przy czym większość (~80%) stanowiły komórki nowotworowe. Wideo 2 pokazuje dynamiczny proces tworzenia skupisk/agregatów komórkowych przez pojedynczo hodowane komórki czerniaka (DsRed+/C8161), rozpoczynający się od ~4–52 h w hodowli pojedynczej. Tworzenie skupisk/agregatów 2D osiągnęło szczyt około 7–10 dnia. Wideo 3 oraz Wideo 4 przedstawiają odpowiednio strukturę sferoidu 3D i skupiska komórek nowotworowych 2D zwizualizowane za pomocą mikroskopii konfokalnej. Sferoid 3D i skupiska komórek nowotworowych 2D zostały zbadane za pomocą mikroskopii konfokalnej w 7 dniu kokultury komórek. Wideo 5 pokazuje, że sferoidy 3D były zawieszone w pożywce hodowlanej i mobilne, podczas gdy Wideo 6 pokazuje, że skupisko komórek nowotworowych 2D było przytwierdzone do płytki hodowlanej i nieruchome. Zawieszenie w pożywce jest cechą sferoidów 3D, która odróżnia je od skupisk 2D. Gdy pożywka w naczyniu lub dołku hodowlanym zostanie poruszona poprzez upuszczenie lub delikatne pipetowanie pożywki, zawieszone sferoidy 3D poruszają się, natomiast skupiska komórkowe 2D pozostają nieruchome. Mobilne są jedynie nieliczne pojedyncze martwe komórki.
Rysunek 2A przedstawia przykład tego modelu 3D, który służy jako unikalna platforma do badania interakcji między guzem a zrębem oraz do wyjaśnienia, w jaki sposób aktywność wewnątrzkomórkowej ścieżki sygnałowej Notch1 w CAF reguluje komórki macierzyste/inicjujące nowotworu oraz tworzenie sferoidów. Wykorzystano dwie pary fibroblastów (Fb) wyizolowanych ze skóry myszy z funkcją wzmocnioną Notch1 (GOFNotch1: Fsp1.Cre+/-;ROSALSL-N1IC+/+) w porównaniu z odpowiadającą im grupą kontrolną (GOFctrl: FSP1.Cre-/-;ROSALSL-N1IC+/+) oraz myszy z funkcją utraconą Notch1 (LOFNotch1: Fsp1.Cre+/-;Notch1LoxP/LoxP+/+) w porównaniu z odpowiadającą im grupą kontrolną (LOFctrl: FSP1.Cre-/-; Notch1LoxP/LoxP+/+)35. Wszystkie fibroblasty zostały przetransdukowane lentiwirusem GFP i współhodowane z komórkami czerniaka C8161 uprzednio przetransdukowanymi lentiwirusem DsRed. Obrazowanie time-lapse wykazuje, że Fb-GOFNotch1 zahamowały tworzenie sferoidów 3D przez komórki czerniaka C8161 w porównaniu do Fb-GOFctrl podczas pierwszych ~4-52 h współhodowli komórek. Przeciwnie, Fb-LOFNotch1 promowały tworzenie sferoidów 3D przez komórki czerniaka C8161 w porównaniu do Fb-LOFctrl. Rysunek 2B, góra, przedstawia reprezentatywne obrazy sferoidów 3D utworzonych w 7. dniu współhodowli komórek z różnymi fibroblastami o zróżnicowanej aktywności ścieżki Notch. Rysunek 2B, dół, przedstawia dane ilościowe dotyczące średniej wielkości sferoidów 3D utworzonych w 7. dniu współhodowli komórek z różnymi fibroblastami o zróżnicowanej aktywności ścieżki Notch.
Rysunek 3 przedstawia przykład wykorzystania tego modelu 3D do badania odpowiedzi komórek macierzystych/inicjujących nowotwór na lek. Wykazano, że komórki macierzyste/inicjujące nowotwór są odpowiedzialne za lekooporność i nawroty nowotworu. Dlatego ocena odpowiedzi na lek z wykorzystaniem tego modelu 3D może lepiej ujawnić potencjalną skuteczność kliniczną leku w leczeniu nowotworów. Komórki czerniaka C8161 polegają na aktywnym sygnałowaniu MAPK w celu wzrostu i inwazji komórek. Wykazują one również wysoki poziom ekspresji CDK4/Kit, ale nie posiadają mutacji BRAF. Aby przetestować odpowiedź komórek macierzystych/inicjujących nowotwór na inhibitor MAPK z wykorzystaniem tego modelu 3D, przeprowadzono kokulturę komórek czerniaka C8161 i fibroblastów w płytkach 24-dołkowych. PD0325901 (patrz Tabela materiałów), inhibitor MAPK, został przygotowany w rozcieńczeniach szeregowych w zakresie stężeń od 1 nM, 2,5 nM, 5 nM, 10 nM do 25 nM. PD0325901 dodawano do kokultur komórek podczas wysiewania mieszanin komórkowych. Jako kontrolę wykorzystano nieleczone komórki w kokulturze. Oceńiono zdolność kokultur komórkowych do tworzenia sferoidów przy różnych stężeniach leku i porównano ją z nieleczoną kontrolą. Rysunek 3A przedstawia reprezentatywne obrazy sferoidów 3D utworzonych w 5. dniu kokultury komórek przy różnych stężeniach leku. Rysunek 3B zawiera dane ilościowe dotyczące średniej wielkości pojedynczego sferoidu oraz liczby utworzonych sferoidów 3D na pole widzenia przy małym powiększeniu (LPF x 4) w 5. dniu kokultury komórek przy różnych stężeniach leku.

Rysunek 1: Formowanie sferoidów 3D i klastrów 2D. (A) Reprezentatywny obraz sferoidów 3D powstałych w wyniku kokultury ludzkich komórek czerniaka C8161 i fibroblastów skóry myszy. Sferoidy 3D sfotografowano w 7. dniu kokultury komórek czerniaka i fibroblastów. Średnia wielkość sferoidów w dniach ~5−7 wynosiła ok. 170–360 μm średnicy (średnia = 275, SD = 37). Średnia liczba sferoidów wynosiła 18–26 (20,5 ± 3,6) na pole widzenia przy małym powiększeniu (LPF x4). (B) Reprezentatywny obraz 2D klastrów komórek nowotworowych powstałych w monokulturze komórek czerniaka C8161. 2D klastry komórek czerniaka sfotografowano w 7. dniu monokultury komórek czerniaka. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 2: Wyjaśnienie roli aktywności wewnątrzkomórkowej ścieżki sygnałowej Notch1 w CAF w regulacji nowotworowych komórek macierzystych/inicjujących z wykorzystaniem modelu sferoidów 3D. (A) Aktywność wewnątrzkomórkowej ścieżki sygnałowej Notch1 w CAF determinowała tworzenie sferoidów przez komórki czerniaka w kokulturze komórkowej. Film time-lapse pokazuje, że Fb-GOFNotch1 zahamował tworzenie sferoidów 3D przez komórki czerniaka C8161, podczas gdy Fb-LOFNotch1 promował tworzenie większej liczby sferoidów 3D przez komórki czerniaka C8161 podczas pierwszych 4–52 h kokultury komórkowej. (B) Góra: Reprezentatywne obrazy sferoidów 3D utworzonych w 7. dniu kokultury komórkowej z różnymi fibroblastami o zróżnicowanych funkcjach ścieżki Notch. Dół: Dane ilościowe dotyczące średniego rozmiaru (średnica [μm]/sferoid) sferoidów 3D utworzonych w 7. dniu kokultury komórkowej z różnymi fibroblastami o zróżnicowanej aktywności ścieżki Notch. Do analizy statystycznej zastosowano dwustronny test t studenta. Dane przedstawiono jako średnia ± odchylenie standardowe (SD). Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 3: Ocena odpowiedzi leku w nowotworowych komórkach macierzystych/inicjujących z wykorzystaniem modelu 3D sferoidów. (A) Reprezentatywne obrazy sferoidów 3D utworzonych w 5. dniu kokultury komórek przy różnych stężeniach leku. (B) Dane ilościowe dotyczące średniej wielkości (średnica [μm]/sferoid) oraz liczby sferoidów 3D na pole widzenia przy małym powiększeniu (LPF x 4) utworzonych w 5. dniu kokultury komórek przy różnych stężeniach leku. Dane ilościowe przedstawiono jako średnia ± odchylenie standardowe (SD). Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Wideo 1: Dynamiczny proces tworzenia się sferoidów 3D we wczesnej fazie kokultury komórek. Obrazowanie time-lapse pokazuje dynamiczne interakcje międzykomórkowe między fibroblastami a komórkami nowotworowymi w kokulturze oraz tworzenie się sferoidów 3D w ciągu pierwszych ~4–52 h kokultury komórek. Komórki zaczęły tworzyć sferoidy 3D około 48 h po rozpoczęciu kokultury. Szczyt tworzenia się sferoidów 3D nastąpił w dniu ~5−7 (nie pokazano tutaj). Sferoidy 3D składały się z fibroblastów i komórek czerniaka, z czego większość (~80%) stanowiły komórki nowotworowe. Kliknij tutaj, aby pobrać to wideo.

Wideo 2: Dynamiczny proces tworzenia się klastrów 2D we wczesnej fazie kokultury komórek. Obrazowanie time-lapse przedstawia dynamiczny proces tworzenia się klastrów 2D przez komórki czerniaka C8161 w kulturze pojedynczej. Tworzenie klastrów 2D nastąpiło około 7–10 dnia. Obrazowanie time-lapse rejestruje okres ~4–52 h w kulturze pojedynczej komórek czerniaka DsRed+/C8161. Kliknij tutaj, aby pobrać to wideo.

Wideo 3: Architektura i rotacja sferoidu 3D w wizualizacji mikroskopii konfokalnej. Architektura i rotacja sferoidu 3D. Do skanowania sferoidów utworzonych w 7. dniu kokultury komórkowej wykorzystano lasery zielony i czerwony. Obszar skanowania określono przy użyciu obiektywu 10x. Skanowanie przebiegało od dołu do góry sferoidu z krokiem z wynoszącym 1 µm. Film przedstawiający rotację sferoidu 3D został utworzony w oprogramowaniu Fiji. Kliknij tutaj, aby pobrać to wideo.

Wideo 4: Architektura i rotacja 2D klastra komórek nowotworowych w obrazowaniu mikroskopem konfokalnym. Architektura i rotacja klastra 2D. Obrazy konfokalne klastrów komórek wykonano w 7. dniu monokultury komórek czerniaka. Obszar skanowania określono przy użyciu obiektywu 10x. Skanowanie rozpoczęto od dołu do góry sferoidu z krokiem z wynoszącym 1 µm. Film z rotacją klastra 2D został stworzony przy użyciu oprogramowania Fiji. Kliknij tutaj, aby pobrać to wideo.

Wideo 5: Ruch sferoidów 3D. Sferoidy 3D pozostawały w zawiesinie w medium hodowlanym i nie przylegały do naczynia/dołka hodowlanego. Po delikatnym pipetowaniu, które zakłóciło spokój medium w dołku hodowlanym, zawieszone sferoidy 3D zaczęły się poruszać. Kliknij tutaj, aby pobrać to wideo.

Wideo 6: Stabilność dwuwymiarowych (2D) skupisk komórek nowotworowych. Skupisko komórek nowotworowych 2D było zakotwiczone do płytki hodowlanej i pozostało nieruchome pomimo zaburzeń w medium hodowlanym. Kilka pojedynczych martwych komórek było ruchomych. Kliknij tutaj, aby pobrać to wideo.