Gryka tatarialna (TB) (Fagopyrum tataricum (L.) Gaertn) to typ dwuliścienny należący do rodzaju Fagopyrum i rodziny Polygonaceae1. Gruźlica, jako rodzaj homologicznego pokarmu medycyny chińskiej, cieszy się dużym zainteresowaniem ze względu na swój charakterystyczny skład chemiczny i różnorodną bioaktywność przeciwko chorobom. Gruźlica jest przede wszystkim bogata w węglowodany, białka, witaminy i karotenoidy, a także w polifenole, takie jak kwasy fenolowe i flawonoidy1. Wykazano różne biologiczne i farmakologiczne działania flawonoidów, w tym przeciwutleniające, przeciwnadciśnieniowe2 oraz przeciwzapalne, przeciwnowotworowe i przeciwcukrzycowe3.
Agrobacterium rhizogenes to bakteria glebowa, która przyczynia się do rozwoju choroby owłosionych korzeni u kilku roślin wyższych, zwłaszcza dwuliściennych, poprzez infekowanie miejsc ran4,5. Proces ten jest inicjowany przez transfer T-DNA w plazmidzie indukującym korzenie (Ri) class5,6 i zwykle towarzyszy mu integracja i ekspresja egzogennego genu z plazmidu Ri oraz kolejne etapy generowania fenotypu owłosionego korzenia7. Transgeniczne korzenie włochate, w których pośredniczy A. rhizogenes, jako potężne narzędzie w dziedzinie biotechnologii roślin, są najczęściej stosowane ze względu na ich stabilną i wysoką produktywność oraz łatwość uzyskania w krótkim czasie. Co więcej, owłosione korzenie indukowane przez A. rhizogenes są skutecznie odróżniane przez plagiotropowy rozwój korzeni i wysoce rozgałęziony wzrost w pożywce wolnej od hormonów8. Mogą być wykorzystywane w kilku dziedzinach badań, w tym w produkcji sztucznych nasion, badaniach nad guzkami korzeniowymi oraz w badaniu interakcji z innymi organizmami, takimi jak grzyby mikoryzowe, nicienie i patogeny korzeni7,9. Ponadto kultury transformacji owłosionych korzeni są szeroko stosowane jako system eksperymentalny do badania szlaków biochemicznych i sygnalizacji chemicznej oraz do produkcji metabolitów wtórnych roślin, które są stosowane jako farmaceutyki, kosmetyki i dodatki do żywności8,10. Cenne metabolity wtórne, w tym alkaloidy indolowe, tojady, alkaloidy tropanowe, terpenoidy i flawonoidy, syntetyzowane w korzeniach owłosionych typu dzikiego są badane od kilkudziesięciu lat u wielu gatunków, takich jak ginsenozyd w żeń-szeniu Panax11, kumaryna w Ammi majus12 oraz związki fenolowe w TB2,13.
Owłosione korzenie zostały wyprodukowane przy użyciu A. rhizogenes w 79 gatunkach roślin z 27 rodzin14. Na przykład transformację owłosionych korzeni za pośrednictwem A. rhizogenes opisano w soi15,16, Salvia17, Plumbago indica18, Lotus japonicus19 i cykorii (Cichorium intybus L.)20. Zbadano również transformację owłosionych korzeni gruźlicy2. Dostępnych jest niewiele szczegółowych protokołów dotyczących rozwoju owłosionych korzeni, w których pośredniczy A. rhizogenes, zarówno przenoszących wektor binarny, jak i nie. Na przykład, Sandra et al.21 wprowadzili metodę wytwarzania transgenicznych owłosionych korzeni ziemniaków utrzymywanych w pędach typu dzikiego. W pełni rozwinięte owłosione korzenie można było uwidocznić 5-6 tygodni po wstrzyknięciu A. rhizogenes przenoszącego gen reporter gus do międzywęźli łodyg roślin ziemniaka. Inne badanie również donosiło o transgenicznym owłosionym systemie korzeniowym indukowanym przez A. rhizogenes zawierającym gen reporterowy gusA w jucie (Corchorus capsularis L.)22. Ponadto, Supaart et al.23 uzyskali transgeniczne owłosione korzenie tytoniu za pomocą A. rhizogenes przekształconych za pomocą wektora ekspresyjnego pBI121 przenoszącego gen Δ1-tetrahydrokannabinolowy (THCA) syntazy do produkcji THCA.
Jednak proces krok po kroku do skutecznego generowania owłosionej transformacji korzeni, szczególnie w gruźlicy, został stosunkowo mniej zademonstrowany. W tym badaniu opisaliśmy szczegółowy protokół z wykorzystaniem A. rhizogenes przenoszącego gen reporterowy (GFP), marker selektywny (Kan) i gen będący przedmiotem zainteresowania (b4, zidentyfikowany z naszej grupy, ale nieopublikowany gen z rodziny podstawowej helisy-pętli-helisy (bHLH)) w celu wygenerowania transformacji genetycznej owłosionego korzenia w gruźlicy. Eksperyment trwał od 5 do 6 tygodni, od zaszczepienia nasion do wytworzenia owłosionych korzeni, obejmujących przygotowanie eksplantatu, infekcję, hodowlę, subkulturację i późniejsze rozmnażanie. Ponadto A. rhizogenes zawierający binarny plazmid przenoszący transgen gruźlicy czynnika transkrypcyjnego mieloblastozy 116 (FtMYB116) wykorzystano do określenia, czy FtMYB116 może sprzyjać akumulacji flawonoidów, zwłaszcza rutyny, w gruźlicy na poziomie genu i metabolizmu poprzez transformację owłosionego korzenia gruźlicy. FtMYB116, który jest czynnikiem transkrypcyjnym indukowanym światłem, reguluje syntezę rutyny w różnych warunkach oświetleniowych5. Syntaza chalkonu (CHS), flawanon-3-hydroksylaza (F3H), flawonoid-3'-hydroksylaza (F3'H) i syntaza flawonolu (FLS)24 są kluczowymi enzymami zaangażowanymi w szlak metaboliczny biosyntezy rutyny. Dlatego badanie to wykazuje nadekspresję FtMYB116 w owłosionych korzeniach gruźlicy i ekspresję kluczowych genów enzymatycznych, a także zawartość rutyny i innych flawonoidów, takich jak kwercetyna.