Tutaj udostępniamy szczegółowe protokoły specyficznego dla miejsca znakowania białek za pomocą leków cytotoksycznych za pomocą reakcji maleimid-tiol i ligacji za pośrednictwem sortazy A.
Subskrypcja JoVE jest wymagana do oglądania tego materiału. Zaloguj się lub rozpocznij bezpłatny okres próbny.
Artykuł metodologiczny
Tutaj udostępniamy szczegółowe protokoły specyficznego dla miejsca znakowania białek za pomocą leków cytotoksycznych za pomocą reakcji maleimid-tiol i ligacji za pośrednictwem sortazy A.
Rak jest obecnie drugą najczęstszą przyczyną zgonów na świecie. Cechą charakterystyczną komórek nowotworowych jest obecność na ich powierzchni specyficznych białek markerowych, takich jak receptory czynnika wzrostu. Ta cecha umożliwia rozwój wysoce selektywnych środków terapeutycznych, biokoniugatów białkowych, składających się z docelowych białek (przeciwciał lub ligandów receptorowych) połączonych z wysoce cytotoksycznymi lekami za pomocą specyficznego łącznika. Ze względu na bardzo wysokie powinowactwo i selektywność białek celujących, biokoniugaty rozpoznają białka markerowe na powierzchni komórek nowotworowych i wykorzystują endocytozę za pośrednictwem receptora, aby dotrzeć do wnętrza komórki. Wewnątrzkomórkowy system transportu pęcherzykowego ostatecznie dostarcza biokoniugaty do lizosomów, gdzie proteoliza oddziela wolne leki cytotoksyczne od białkowego rdzenia biokoniugatów, wywołując lekoniezależną śmierć komórek rakowych. Obecnie istnieje kilka biokoniugatów białkowych zatwierdzonych do leczenia raka, a duża liczba z nich jest w trakcie opracowywania lub badań klinicznych.
Jednym z głównych wyzwań w tworzeniu biokoniugatów jest specyficzne dla miejsca przyłączenie leku cytotoksycznego do białka docelowego. Ostatnie lata przyniosły ogromny postęp w opracowywaniu chemicznych i enzymatycznych strategii modyfikacji białek za pomocą leków cytotoksycznych. W tym miejscu przedstawiamy szczegółowe protokoły specyficznego dla miejsca włączenia głowic cytotoksycznych do białek docelowych przy użyciu metody chemicznej wykorzystującej chemię maleimidowo-tiolową oraz podejście enzymatyczne, które opiera się na ligacji za pośrednictwem sortazy A. Używamy zmodyfikowanego wariantu czynnika wzrostu fibroblastów 2 i fragmentu krystalizującego regionu ludzkiej immunoglobuliny G jako przykładowych białek docelowych oraz monometyloaurystatyny E i metotreksatu jako modelowych leków cytotoksycznych. Wszystkie opisane strategie pozwalają na wysoce efektywne generowanie biologicznie aktywnych koniugatów cytotoksycznych o określonej architekturze molekularnej, z potencjałem do selektywnego leczenia różnych nowotworów.
Dziesięciolecia wysiłków naukowych doprowadziły do ogromnego postępu w naszej wiedzy na temat molekularnych mechanizmów rządzących rozwojem i progresją raka. Jednocześnie możliwości terapeutyczne są nadal w dużej mierze ograniczone ze względu na niekorzystne działanie leków spowodowane ich brakiem selektywności, dużą zmiennością nowotworów oraz lekoopornością rozwijającą się po długotrwałym leczeniu. Celowane terapie przeciwnowotworowe zyskują w ostatnich latach coraz większą uwagę jako nowatorskie i bardzo obiecujące podejścia do leczenia różnych nowotworów. Terapie celowane opierają się na wyrafinowanych systemach dostarczania leków, które precyzyjnie dostarczają ładunek cytotoksyczny do komórek nowotworowych i oszczędzają zdrowe. Należą do nich głównie różnorodne nanocząstki, liposomy i nośniki leków na bazie białek.
Komórki nowotworowe często wykazują podwyższony poziom specyficznych białek markerowych na swojej powierzchni. Przeciwciała konfiugaty leków (ADC) to nowatorskie terapie przeciwnowotworowe oparte na białkach, które łączą w jednej cząsteczce ekstremalną specyficzność przeciwciał monoklonalnych i wysoką siłę cytotoksyczną leków. Po związaniu z powierzchnią komórki rakowej, ADC wykorzystuje endocytozę za pośrednictwem receptora, aby dostać się do komórki. Następnie ADC są transportowane przez przedziały endosomalne do lizosomów, gdzie proteazy rozkładają ADC i uwalniają aktywne leki cytotoksyczne. Obecnie w USA zatwierdzono osiem ADC do leczenia różnych nowotworów, w tym potrójnie ujemnego raka piersi, HER2-dodatniego raka piersi, raka urotelialnego, chłoniaka rozlanego z dużych komórek B, nowotworu hematologicznego, chłoniaka Hodgkina i ostrej białaczki szpikowej. Duża liczba przetworników ADC jest również w fazie rozwoju lub oczekuje na zatwierdzenie1. Warto zauważyć, że podejścia oparte na inżynierii białkowej doprowadziły do opracowania różnorodnych alternatyw dla przeciwciał monoklonalnych: rusztowań białkowych i ich cytotoksycznych koniugatów. Należą do nich różne fragmenty przeciwciał2,3, DARPins4,5, knottins6,7, centyrins8, affibodies9,10, lub inżynierskie ligandy receptorów11,12.
Istnieje kilka krytycznych wymagań, które musi spełnić udany koniugat cytotoksyczny oparty na białku, a mianowicie stabilność koniugatu, niezwykła specyficzność, wysokie powinowactwo koniugatu do markera specyficznego dla raka, szybka internalizacja koniugatu do wnętrza komórki rakowej, jego efektywny transport do lizosomów i skuteczne wewnątrzkomórkowe uwalnianie aktywnego ładunku. Kolejną ważną cechą jest jednorodność koniugatów, która w dużej mierze zależy od zastosowanej strategii przyłączania ładunku do docelowych białek. Dostępnych jest kilka metod koniugacji białek z lekami cytotoksycznymi, takich jak modyfikacja reszt cysteiny lub lizyny w łańcuchu bocznym białka, przyłączenie leku do nienaturalnych aminokwasów włączonych do białek docelowych lub modyfikacje enzymatyczne białek docelowych (np. z transglutaminazą, glikozylotransferazą, enzymem wytwarzającym formyloglicynę, sortazą A). W większości przypadków metody koniugacji specyficznej dla miejsca wymagają modyfikacji cząsteczek docelowych (np. poprzez inżynierię cysteiny lub wprowadzenie krótkich znaczników peptydowych), ale z kolei skutkują wydajną produkcją jednorodnego koniugatu będącego przedmiotem zainteresowania.
Tutaj udostępniamy protokoły wysoce efektywnej koniugacji białek docelowych z lekami cytotoksycznymi. Jako przykładowe białka wykorzystaliśmy dwie różne cząsteczki: fragment krystalizujący (Fc) ludzkiej IgG oraz zmodyfikowany wariant ludzkiego czynnika wzrostu fibroblastów 2 (FGF2). Fragment Fc stanowi integralną część typowych ADC, ale jest również obecny w innych typach koniugatów, takich jak peptyciała cytotoksyczne lub koniugaty fragmentów przeciwciał. FGF2 to ligand naturalnego receptora czynnika wzrostu fibroblastów (FGFR), który został z powodzeniem zmodyfikowany w celu uzyskania selektywnego koniugatu cytotoksycznego ukierunkowanego na nadprodukcję komórek rakowych FGFR.
Prezentujemy dwie różne strategie koniugacji, pozwalające na specyficzne dla danego miejsca wprowadzanie leków cytotoksycznych. Po pierwsze, podano protokół koniugacji z łańcuchami bocznymi cysteiny fragmentu Fc za pomocą chemii maleimidowo-tiolowej w oparciu o protokół Hermansona13 (Rysunek 1A,B). W tym protokole dwa wiązania dwusiarczkowe są początkowo redukowane tris(2-karboksyetylo)fosfiną (TCEP), a powstałe wolne grupy tiolowe są poddawane koniugacji z monometyloaurystatyną E (MMAE) za pomocą chemii maleimidowo-tiolowej (Rysunek 1B). Ze względu na oddziaływanie między stałymi domenami łańcuchów ciężkich 2 i 3 (CH2 i CH3) zachowana jest dimeryczna struktura Fc związanego z lekiem. Po drugie, przedstawiono strategię generowania koniugatu FGF2 z podwójną głowicą bojową, która łączy inżynierię cysteinową i ligację za pośrednictwem sortazy A w celu włączenia dwóch różnych leków do FGF2 w sposób specyficzny dla miejsca (Rysunek 1A,C). Używany jest wariant FGF2 wolny od cysteiny z dodatkowym N-końcowym KCKSGG z pojedynczą odsłoniętą resztą cysteiny i C-końcowym krótkim znacznikiem peptydowym LPETGG 12. Reakcja maleimid-tiol pozwala na koniugację MMAE z cysteiną w łączniku KCKSSG zaprojektowanym przez naszą grupę14,15. Krok zależny od sortazy A (na podstawie Chen i wsp.)16 pośredniczy w ligacji peptydu tetraglicyny GGGG-MTX połączonego z metotreksatem (MTX) do C-końcowej sekwencji LPETGG, dając dwa rodzaje koniugatów pojedynczej głowicy (Rysunek 1C). Sortaza A to proteaza cysteinowa, która katalizuje reakcję transpeptydu między motywami LPETGG i GGGG. Enzym wiąże się z motywem LPETGG na C-końcu białka, a następnie wiązanie amidowe między treoniną a glicyną ulega hydrolizie, tworząc kompleks enzymato-substrat. Kolejnym krokiem jest aminoliza wiązania enzym-substrat tioestr, gdzie donorem pierwszorzędowej grupy aminowej jest reszta glicyny motywu tetraglicyny17. Połączenie tych dwóch podejść pozwala na uzyskanie specyficznych dla danego miejsca koniugatów podwójnych głowic bojowych FGF2 (Rysunek 1C). Zasadniczo, pod warunkiem, że protokoły koniugacji mogą być z powodzeniem stosowane do dowolnego zmodyfikowanego białka docelowego będącego przedmiotem zainteresowania w celu wygenerowania selektywnych koniugatów cytotoksycznych. Co więcej, wszechstronność tego podejścia sprawia, że nadaje się ono do wielu innych celów ligacji białko-białko i białko-peptyd, a także do przyłączania lipidów, polimerów, kwasów nukleinowych i fluoroforów do białek z dostępną grupą sulfhydrylową (lub generowanych przez redukcję natywnych wiązań dwusiarczkowych) i/lub z wprowadzonym małym znacznikiem peptydowym.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
1. Koniugacja domeny FC z MMAE
UWAGA: Przed koniugacjami specyficznymi dla danego miejsca przygotuj kluczowe odczynniki: wysoce czyste białko będące przedmiotem zainteresowania (w tym przypadku fragment Fc i zmodyfikowany wariant FGF2, jako punkt wyjścia 1-5 mg białka rekombinowanego, przygotowane zgodnie z klasą Sokołowska-Wędzina18), alkohol maleimimidocaproyl-Val-Cit-p-aminobenzyl (PABC)-monometyloaurystatyna E (MMAE) (UWAGA, wysoce cytotoksyczny środek, należy obchodzić się z nim ostrożnie), tris(2-karboksyetylo)fosfinę (TCEP) i sortaza A16. Metotreksat połączony z peptydem tetraglicyny (GGGG-MTX) (UWAGA, MTX jest środkiem wysoce cytotoksycznym, należy obchodzić się z nim ostrożnie) może być syntetyzowany w stałej fazie nośnej zgodnie z metodą syntezy peptydów w fazie stałej (SPPS) w strategii Fmoc 19 lub pozyskiwany ze źródeł komercyjnych.
2. Koniugacja zaprojektowanego FGF2
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Przedstawione protokoły opisują dwie odrębne strategie konjugacji różnych leków cytotoksycznych z interesującymi białkami. Ponadto zaprezentowano kombinację poszczególnych strategii, która umożliwia generowanie cytotoksycznych koniugatów z podwójnym ładunkiem w sposób specyficzny dla konkretnego miejsca.
Jak pokazano na żelach SDS-PAGE na Rysunku 2 (ścieżka 2 vs. 3), reakcja maleimid-tiol pozwala na osiągnięcie niemal 100% wydajności sprzęgania MMAE z fragmentem F...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Ze względu na duże zainteresowanie projektowaniem selektywnych terapii przeciwko różnym typom nowotworów, istnieje pilna potrzeba opracowania strategii pozwalających na specyficzne dla miejsca przyłączanie różnych ładunków do docelowych białek. Specyficzna dla miejsca modyfikacja białek docelowych ma kluczowe znaczenie, ponieważ zapewnia jednorodność opracowanych bioaktywnych koniugatów, co jest warunkiem wstępnym dla nowoczesnych terapii. Istnieje kilka metod, zarówno chemicznych, jak i enzymatycznych, które pozwalają n...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Autorzy nie mają nic do ujawnienia.
Ta praca była wspierana przez Pierwszy ZESPÓŁ oraz programy reintegracyjne Fundacji na rzecz Nauki Polskiej (POIR.04.04.00-00-43B2/17-00; POIR.04.04.00-00-5E53/18-00) współfinansowanego przez Unię Europejską w ramach Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego, przyznanego L.O i A.S. M.Z prace były wspierane przez OPUS (2018/31/B/NZ3/01656) i Sonata Bis (2015/18/E/NZ3/00501) z Narodowego Centrum Nauki. Prace A.S.W. były wspierane przez grant Miniatura Narodowego Centrum Nauki (2019/03/X/NZ1/01439).
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| CM-Sepharose kolumna | Sigma-Aldrich, Saint Louis, MO, USA | CCF100 | |
| Heparyna Kolumna Sepharose | GE Healthcare, Chicago, IL, USA | GE17-0407-01 | |
| HiTrap Kolumna odsalająca | GE Healthcare, Chicago, IL, USA | GE17-1408-01 | |
| Kolumna HiTrap MabSelect SuRe | GE Healthcare, Chicago, IL, USA | GE11-0034-93 | |
| maleimidocaproyl-Val-Cit-PABC-monometyloaurystatyna E (MMAE) | MedChemExpress, Monmouth Junction, NJ, USA | HY-100374 | Toksyczny |
| N,N-dimetyloacetamid (DMAc) | Sigma-Aldrich, Saint Louis, MO, USA | 185884 | |
| Tris(2-karboksetylo)fosfina (TCEP) | Sigma-Aldrich, Saint Louis, MO, USA | 646547 |
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Ten artykuł został opublikowany
Film wkrótce dostępny