Haemophilus influenzae (Hi) to normalna bakteria komensalna obecna w gardle większości zdrowych dorosłych. Hi może mieć kapsułkę polisacharydową (typy A-F, np. typ B lub HiB) lub nie mieć kapsułki i być nietypowalny (NTHi)1. Kolonizacja błony śluzowej tą bakterią rozpoczyna się we wczesnym dzieciństwie i następuje rotacja różnych szczepów kolonizujących2. Bakteria ta jest również zdolna do inwazji zarówno górnych, jak i dolnych dróg oddechowych; W tym kontekście może indukować aktywację odpowiedzi immunologicznej i stan zapalny3,4. Ta reakcja zapalna może powodować chorobę kliniczną i przyczyniać się do wielu ważnych chorób układu oddechowego, w tym zapalenia zatok, zapalenia ucha środkowego, zapalenia oskrzeli, mukowiscydozy, zapalenia płuc i przewlekłej obturacyjnej choroby płuc (POChP). Większość z tych warunków jest spowodowana przez szczepy NTHi2. W tym artykule zostaną opisane metody oceny odpowiedzi immunologicznej układu oddechowego na Hi za pomocą cytometrii przepływowej i mikroskopii konfokalnej.
Metody opisane poniżej zostały zaadaptowane z dobrze znanych technik, które zostały zmodyfikowane w celu oceny odpowiedzi zapalnej na Hi. Wybór odpowiedniej formy antygenowej Hi jest kluczowym elementem tej oceny. Preparaty antygenowe obejmują zarówno składniki ściany komórkowej, jak i żywe bakterie. Aby ustalić i ustandaryzować testy, początkowo bardzo pomocne może być użycie próbek krwi obwodowej.
Cytometria przepływowa umożliwia pomiar różnych parametrów i testów funkcjonalnych z jednej próbki na poziomie komórkowym. Technika ta ma tę zaletę, że można ocenić specyficzne odpowiedzi komórkowe (np. produkcję reaktywnych form tlenu (ROS) lub produkcję cytokin wewnątrzkomórkowych) w porównaniu z innymi, bardziej ogólnymi metodami, takimi jak test immunoenzymatyczny (ELISA) lub ELISspot.
Pułapki zewnątrzkomórkowe są wyrażane przez neutrofile (NETs)5,6,7 oraz przez inne komórki, takie jak makrofagi (METs)8. Są one coraz częściej uznawane za kluczową reakcję zapalną, szczególnie w infekcji płuc9. Można je ocenić za pomocą konfokalnej mikroskopii fluorescencyjnej. Technika ta pozwala na ostateczną identyfikację NET/MET i odróżnia ich ekspresję od innych form śmierci komórki6.
Zarówno cytometria przepływowa, jak i mikroskopia konfokalna są testami opartymi na fluorescencji. Ich sukces zależy od optymalnych protokołów naprężania próbek biologicznych. Nauczenie się tych metod zajmuje trochę czasu i wymaga odpowiedniej wiedzy specjalistycznej. Instrumenty, które się z tym wiążą, są również drogie zarówno w zakupie, jak i eksploatacji. Optymalnym miejscem do ich stosowania są duże uniwersytety i szpitale trzeciego stopnia referencji.
Metody użyte w tym protokole można przenieść do badania innych podobnych organizmów związanych z chorobami układu oddechowego (np. Moxarella catarrhalis i Streptococcus pneumoniae). NTHi wchodzi również w interakcje z innymi powszechnymi bakteriami układu oddechowego10.