Ten protokół opisuje łatwą w użyciu metodę badania utleniania substratu poprzez śledzenie produkcji 14CO2 in vitro.
Subskrypcja JoVE jest wymagana do oglądania tego materiału. Zaloguj się lub rozpocznij bezpłatny okres próbny.
Artykuł metodologiczny
Ten protokół opisuje łatwą w użyciu metodę badania utleniania substratu poprzez śledzenie produkcji 14CO2 in vitro.
Mitochondria są gospodarzem maszynerii do cyklu kwasu trikarboksylowego (TCA) i łańcucha transportu elektronów (ETC), które generują adenozynotrójfosforan (ATP) w celu utrzymania homeostazy energetycznej. Glukoza, kwasy tłuszczowe i aminokwasy są głównymi substratami energetycznymi napędzającymi oddychanie mitochondrialne w większości komórek somatycznych. Dowody wskazują, że różne typy komórek mogą mieć wyraźną preferencję dla określonych substratów. Jednak wykorzystanie substratu przez różne komórki w szkielecie nie zostało szczegółowo zbadane. Ponadto, ponieważ metabolizm komórkowy jest dostosowany do zmian fizjologicznych i patofizjologicznych, bezpośrednia ocena zależności od substratu w komórkach szkieletowych może dostarczyć ważnych informacji na temat patogenezy chorób kości.
Poniższy protokół opiera się na zasadzie uwalniania dwutlenku węgla z cząsteczek substratu po fosforylacji oksydacyjnej. Dzięki zastosowaniu substratów zawierających znakowane radioaktywnie atomy węgla (14C), metoda zapewnia czuły i łatwy w użyciu test szybkości utleniania substratu w hodowli komórkowej. Studium przypadku z pierwotnymi preosteoblastami kalwarycznymi w porównaniu z makrofagami pochodzącymi ze szpiku kostnego (BMM) pokazuje różne wykorzystanie głównych substratów między tymi dwoma typami komórek.
Fosforylacja oksydacyjna (OXPHOS) u eukariontów to proces, w którym składniki odżywcze są rozkładane wewnątrz mitochondriów w celu uwolnienia energii chemicznej w postaci ATP poprzez zużycie tlenu. Katabolizm różnych substratów wewnątrz mitochondriów poprzez cykl kwasu trikarboksylowego (TCA) generuje bezpośrednio niewiele cząsteczek ATP, ale raczej magazynuje energię poprzez redukcję nośników elektronów dinukleotydu nikotynamidoadeninowego (NAD+) i dinukleotyd flawinoadeninowy (FAD+). Zredukowane nośniki są następnie utleniane przez ETC znajdujące się na wewnętrznej błonie mitochondriów w celu wytworzenia gradientu stężenia protonów w poprzek błony. Protony ostatecznie spływają w dół swojego gradientu z powrotem do macierzy mitochondrialnej przez syntazę ATP, aby wytworzyć ATP. OXPHOS jest najbardziej wydajnym sposobem produkcji ATP z substratów energetycznych i ogólnie preferowanym w środowisku tlenowym. Wcześniej uważano, że glikoliza tlenowa - produkcja mleczanu z glukozy, gdy obecny jest tlen - jest patofizjologiczna, często jest cechą charakterystyczną komórek rakowych. Coraz częściej odkrywa się, że niektóre normalne typy komórek wykorzystują glikolizę tlenową z powodów, które nie zostały jeszcze w pełni rozszyfrowane.
Elastyczność metaboliczna to zdolność komórek lub organizmów do przystosowania się do zmieniającego się zapotrzebowania na energię i dostępnych źródeł paliwa. Na przykład zapotrzebowanie energetyczne mięśni szkieletowych jest zaspokajane głównie przez OXPHOS w stanie ustalonym, ale przez glikolizę beztlenową podczas ćwiczeń o wysokiej intensywności1. Wraz ze wzrostem czasu trwania ćwiczeń, utlenianie glukozy i kwasów tłuszczowych w większym stopniu przyczynia się do ogólnej produkcji energii2. Wykorzystanie substratu nie zależy jednak tylko od dostępności, ponieważ substraty antagonistycznie konkurują ze sobą podczas utleniania. Przede wszystkim wykazano, że utlenianie kwasów tłuszczowych hamuje wykorzystanie glukozy przez mięśnie szkieletowe w zjawisku znanym jako efekt Randle'a3. Efekt odwrotności wykazano w kolejnych badaniach4,5. Ponadto wiele chorób wiąże się ze zmianą preferencji substratów i rozwojem nieelastyczności metabolicznej w komórkach. Na przykład utlenianie kwasów tłuszczowych jest zmniejszone w mięśniach szkieletowych pacjentów z cukrzycą typu II w porównaniu z normalnymi osobami z grupy kontrolnej6. Zmiany metaboliczne w warunkach chorobowych są przedmiotem intensywnych badań, ponieważ mogą przyczyniać się do patogenezy.
Metabolizm energetyczny w typach komórek szkieletowych jest stosunkowo słabo zbadany, ale zyskał na popularności w ostatnich latach7. Wcześniejsze prace wykazały, że glikoliza tlenowa jest dominującym szlakiem energetycznym w osteoblastach kalwarii, podczas gdy utlenianie glukozy w cyklu TCA odgrywa rolę w tworzeniu osteoklastów8,9. Inni dostarczyli dowodów na to, że kwasy tłuszczowe są źródłem energii dla osteoblastów10. Wykazano również, że katabolizm glutaminy wspiera różnicowanie osteoblastów od progenitorów11,12. Jednak nadal brakuje kompleksowego zrozumienia wykorzystania substratów przez różne typy komórek szkieletowych. Ponadto oczekuje się, że zmiany w metabolizmie komórkowym podczas różnicowania komórek lub w odpowiedzi na sygnały patologiczne zmienią wykorzystanie substratu paliwowego. Poniżej opisano łatwy w użyciu protokół oznaczania utleniania substratu in vitro.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Stosowanie materiałów radioaktywnych (RAM) wymaga uprzedniej zgody wyznaczonego komitetu ds. bezpieczeństwa w każdej instytucji. Materiały RAM użyte w tym protokole zostały zatwierdzone przez Environmental Health & Radiation Safety (EHRS) na Uniwersytecie Pensylwanii. Wykorzystanie zwierząt wymaga uprzedniej zgody Instytucjonalnego Komitetu ds. Opieki i Wykorzystania Zwierząt (IACUC) w macierzystej instytucji. Poniższa analiza została zatwierdzona przez IACUC w The Children's Hospital of Philadelphia.
1. Przygotowanie roztworów zapasowych dla substratów znakowanych 14C
2. Przygotowanie pożywki zawierającej substraty znakowane 14C
UWAGA: Aby zapewnić wiarygodne stężenia substratów energetycznych w pożywce, należy stosować pożywki przygotowane specjalnie do tego celu, z dodatkiem świeżych substratów bezpośrednio przed użyciem. W niniejszej procedurze zastosowano specjalnie przygotowaną pożywkę Minimum Essential Medium (MEMα) bez glukozy, pirogronianu, glutaminy, czerwieni fenolowej oraz wodorowęglanu sodu. Należy jednak dobrać optymalną pożywkę dla każdego rodzaju komórek.
3. Przygotowanie komórek
UWAGA: W niniejszym przykładzie wykorzystano preosteoblasty czaszkowe oraz makrofagi szpiku kostnego. Użytkownicy powinni przygotować wybrany typ komórek zgodnie z odpowiednimi protokołami. Należy zoptymalizować stężenie kolagenazy II stosowanej do trawienia w eksperymentach pilotażowych, ponieważ aktywność enzymatyczna może różnić się w zależności od partii.
4. Test utleniania podłoża z pułapką CO2
UWAGA: Dla każdego typu komórek należy określić odpowiednią gęstość wysiewu, aby uzyskać 80-90% konfluencji przed rozpoczęciem testu. Należy pamiętać, że gęstość komórek może wpływać na ich stan metaboliczny.
5. Analiza danych
UWAGA: Przy założeniu, że każdy substrat ulega pełnemu utlenieniu z wydzieleniem CO2, szybkość utleniania substratu można obliczyć na podstawie radioaktywności uwięzionego CO2.
(1)
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
W tym przykładzie metoda wychwytywania CO2 jest wykorzystywana do porównania utleniania substratu przez pierwotne preosteoblasty czaszkowe w stosunku do BMM, które są często stosowane odpowiednio do różnicowania osteoblastów lub osteoklastów in vitro. Po pasażowaniu pierwotnych komórek i ich inkubacji w cMEMα przez noc, zazwyczaj osiągają one 80-90% konfluencji i wykazują charakterystyczną morfologię. Preosteoblasty czaszkowe są zauważalnie większe niż BMM (Rysunek 2). Ka...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Protokół zapewnia łatwą w użyciu metodę określania szybkości utleniania głównych substratów energetycznych. Jest to prostsza alternatywa dla innych protokołów, które wykorzystują kolby zawierające centralną studzienkę i zakryte gumowymi korkami 14,15,16. Chociaż przykładowe badanie tutaj jest przeprowadzane z hodowlą komórkową, metodę można łatwo dostosować do eksplantatów tkanek lub homogenatów tkankowych zawierających nienarus...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Autorzy deklarują brak konfliktu interesów.
Praca była częściowo wspierana przez grant NIH R01 AR060456 (FL). Dziękujemy dr Michaelowi Robinsonowi i Elizabeth Krizman (The Children's Hospital of Philadelphia) za ich hojną pomoc przy liczniku scyntylacyjnym.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| 0,22 &mikro; m filtry | Sigma-Aldrich | SLGVM33RS | Służy do filtrowania roztworu BSA |
| 0,25% Trypsyna-EDTA | Gibco | 25200056 | Dysocjacja komórek z płytek do hodowli komórkowych |
| 1,5 ml Probówki Eppendorfa | PR1MA | PR MCT17 RB | Używane do inkubacji reakcji |
| Płytki 10 cm | TPP | 93100 | Używane do hodowli komórkowych |
| 10 ml strzykawka | BD | 302995 | Służy do płukania szpiku kostnego z kości długich |
| 10% FBS | Atlanta biologiczne | S11550 | Do przygotowania pożywki do hodowli komórkowych |
| 14C-Glukoza | PerkinElmer | NEC042X050UC | Służy do wytwarzania gorących pożywek |
| 14C-glutamina | PerkinElmer | NEC451050UC | Służy do wytwarzania gorących pożywek |
| 14C-oleate | PerkinElmer | NEC317050UC | Służy do wytwarzania gorących pożywek |
| Igła 23 G | BD | 305120 | Służy do płukania szpiku z kości długich |
| Płytki 24-dołkowe | TPP | 92024 | Służy do hodowli komórkowych |
| 70 μ m sitka komórkowe | MIDSCI | 70CELL | Służy do filtrowania supernatantu podczas trawienia kawarnego |
| Barwnik Acridine Orange/Propidium Jodek (AO/PI) | Nexcelom Biosciences | CS2-0106 | Barwie żywe komórki w celu określenia gęstości nasion |
| Surowica bydlęca Ablumin | Proliant Biologicals | 68700 | Używany do koniugacji kwasów tłuszczowych |
| Celometr Auto 2000 | Nexcelom Biosciences | Określ liczbę żywotnych komórek | |
| Wirówka | Thermo Fisher | Legend Micro 21R | Służy do osadzania komórek |
| Kolagenaza typu II | Worthington | LS004176 | Dysocjacja komórek od tkanki |
| Niestandardowa MEM alfa | GIBCO | SKU: ME 18459P1 | Służy do tworzenia niestandardowych gorących mediów |
| Sól fizjologiczna buforowana fosforanami Dulbecco | Gibco | 10010023 | Służy do rozpuszczania i rozcieńczania odczynników oraz mycia naczyń hodowlanych |
| Bibuła filtracyjna | Millipore-Sigma | WHA1001090 | Pułapki CO2 z wodorotlenkiem sodu |
| Glukoza | Sigma-Aldrich | g7528 | Służy do wytwarzania niestandardowych pożywek |
| HEPES | Gibco | 15630080 | Pułapki CO2 podczas hodowli komórkowej |
| L-karnityna | Sigma-Aldrich | C0283 | Uzupełniony do utleniania kwasów tłuszczowych |
| L-Glutamina | Sigma-Aldrich | g3126 | Używany do wytwarzania niestandardowych pożywek |
| MEM alpha | Thermo | A10490 | Pożywka do hodowli komórkowych |
| Parafilm | Pecheney Plastikowe opakowanie | PM998 | Służy do uszczelniania naczyń do hodowli komórkowych |
| Penicylina-Streptomycyna | Thermo Fisher | 15140122 | Zapobiega zanieczyszczeniu w kulturze komórkowej |
| Kwas nadchlorowy | Sigma-Aldrich | 244252 | Uwalnia CO2 podczas testu metabolicznego |
| Pirogronian | Sigma-Aldrich | p5280 | Służy do wytwarzania niestandardowych mediów |
| Licznik scyntylacyjny | Beckman Coulter | LS6500 | Określa radioaktywność bibuły filtracyjnej |
| Płyn scyntylacyjny | MP Biomedicals | 882453 | Absorbuj energię emitowaną przez pamięci RAM i emituj ją ponownie w postaci błysków światła |
| Fiolka scyntylacyjna | Fisher Scientific | 03-337-1 | Pojemniki reakcyjne na płyn scyntylacyjny |
| Węglan sodu | Sigma-Aldrich | S5761 | Bufor równowagi dla podłoża |
| Wodorotlenek sodu | Sigma-Aldrich | 58045 | Wychwytuje CO2 podczas testu metaboilc |
| Oleinian | soduSANTA CRUZ | SC-215879 | BSA preparat sprzężonych kwasów tłuszczowych Filtracja próżniowa |
| 1000 | TPP | 99950 | Filtr cMEMα |
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.