$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Badanie aktywności neuronalnej w zachowujących się organizmach stanowi kilka wyzwań. Na przykład fizyczny dostęp do tkanki mózgowej jest ograniczony przez konieczność utrzymania jej integralności, więc powierzchowne obszary mózgu są łatwiejsze do rozważenia. Wyizolowanie określonych celów w nienaruszonej tkance jest często trudnym zadaniem, a czasami niemożliwym. Chociaż zdysocjowane jednorodne kultury neuronalne zapewniają wygodny dostęp do właściwości molekularnych, biochemicznych i biofizycznych poszczególnych (sub)komórkowych składników obwodu neuronalnego, realistyczna łączność i anatomiczna organizacja nienaruszonego mózgu zostaje utracona. Te fundamentalne ograniczenia zainspirowały wysiłki badawcze mające na celu osiągnięcie kompromisu, w którym unika się złożoności in vivo, a strukturę można skonstruować in vitro, co jest na żądanie1,2,3,4,5,6,7,8,9. W szczególności modułowe kultury neuronalne były przedmiotem szeroko zakrojonych badań prowadzonych w ciągu ostatnich dziesięcioleci, mających na celu rozwiązanie kluczowych pytań dotyczących fizjologii mózgu, jak opisano poniżej.
Organizacja: Badania in vivo pokazują, że mózg jest zbudowany anatomicznie w warstwach z precyzyjnymi typami komórek i układami projekcji. Testy funkcjonalne ujawniły organizację sieci neuronalnych w zespołach węzłów i modułach, z precyzyjnymi schematami połączeń10,11. Rola połączeń i motywów mikroukładów nie może być jednak odpowiednio zbadana in vivo ze względu na samą liczbę zaangażowanych synaps, a także przeplatające się efekty rozwoju i plastyczności zależnej od aktywności.
Transfer sygnału: W hodowlach in vivo lub losowych in vitro, trudno jest ocenić transfer sygnału. Badanie przewodnictwa aksonalnego i potencjału czynnościowego na całej jego długości wymaga kierowania wzrostem neurytów poprzez funkcjonalizację powierzchni lub wzorcowanie chemiczne, zapewniając wysoki stosunek sygnału do szumu w zewnątrzkomórkowych odczytach aktywności elektrycznej12.
Znaczenie translacyjne: Rozszyfrowanie wyłącznej roli elementów pre- i postsynaptycznych w różnych stanach patologicznych wymaga indywidualnego dostępu do tych elementów. Kultury modularne z ograniczoną łącznością, skutecznie segregujące elementy pre- i postsynaptyczne, są niezbędnymi narzędziami do tego celu13.
Istnieje kilka metod pozwalających na uzyskanie pewnej formy struktury w kulturze neuronalnej. Można je ogólnie podzielić na chemiczne i fizyczne manipulacje powierzchnią9. Poprzednie metody14,15 opierają się na skłonności komórek nerwowych do przyłączania się do pewnych związków (bio)chemicznych. Wymaga to osadzania kleju lub atrakcyjnych cząsteczek na powierzchni z precyzją w skali mikro i podążania za szczegółowym wzorem. Chociaż pozwala to na częściowe pokrycie powierzchni komórek, zgodnie z pożądanym wzorcem, metody chemiczne są z natury ograniczone i mają stosunkowo niski wskaźnik sukcesu w wytycznych dotyczących wzrostu neurytów16. Pełna kontrola nad kierunkowością aksonów wymaga ustanowienia przestrzennego gradientu substancji chemicznych ad hoc w celu kształtowania prowadzenia aksonów17. Te ostatnie metody obejmują fizyczną manipulację powierzchnią i są częściej stosowane do strukturyzacji sieci neuronalnych in vitro. Komórki neuronalne są fizycznie ograniczone w pożądanych miejscach przez geometryczne ograniczenia, takie jak mikroskopijne komory, ściany, kanały itp., kształtując biokompatybilny polimer, taki jak polidimetylosiloksan (PDMS)3,5,6,7,18,19,20 utwardzony i zestalony w urządzenie mikroprzepływowe. De facto metodą wytwarzania mikroprzepływowego PDMS jest miękka fotolitografia21, gdzie dwuwymiarowa maska jest wzorowana w mikroskali i wykorzystywana do selektywnego wytrawiania materiału na bazie krzemu pod wpływem promieniowania UV. Krótko mówiąc, żywica utwardzana promieniami UV (tj. fotorezyst) jest powlekana na płytce krzemowej poprzez powlekanie wirowe, osiągając określoną wysokość określoną przez jej lepkość i prędkość wirowania. Następnie wzorzysta maska jest umieszczana nad fotorezystem i wystawiana na działanie światła UV. Przezroczyste obszary wewnątrz maski, odpowiadające obszarom zainteresowania, pozwolą światłu UV indukować miejscowe sieciowanie cząsteczek fotorezystu. Obszary nienaświetlonego fotorezystu są zmywane za pomocą rozpuszczalnika, co powoduje powstanie pleśni. Jest to wielokrotnie używane do wypalania wybranego elastomeru (tj. PDMS), który jest następnie grawerowany z pożądaną geometrią w dowolnej liczbie replik. Taka metoda produkcji jest najpowszechniejszą metodą wytwarzania urządzeń mikroprzepływowych22. Być może głównymi ograniczeniami miękkiej fotolitografii są warunki wstępne znacznych inwestycji kapitałowych oraz nieznajomość laboratoriów biologicznych z wymaganymi technikami i wiedzą specjalistyczną. Przygotowanie maski i etapy miękkiej fotolitografii wymagane do projektowania złożonych geometrii o wielu wysokościach i wysokim współczynniku proporcji są nietrywialne23 i często wymagają outsourcingu. Mimo że zaproponowano alternatywne i niskobudżetowe metody, nie zawsze spełniają one wysokie wymagania precyzji prototypowania biologicznego24.
Tutaj prezentowana jest alternatywna metoda produkcji, polegająca na polimeryzacji dwufotonowej (2PP) i wytwarzaniu przyrostowym. Jest prosty i sam w sobie nie wymaga zaawansowanej wiedzy z zakresu mikrofabrykacji i mikrofotolitografii. Dziedzina badawcza mikroprodukcji 2PP pojawiła się pod koniec lat 90-tych25 i od tego czasu była świadkiem wykładniczego wzrostu26. Więcej na temat podstawowych zasad tej techniki można znaleźć gdzie indziej26. Krótko mówiąc, skupiając impuls świetlny wzbudzenia w przestrzeni trójwymiarowej, 2PP wykorzystuje nieliniową zależność absorpcji wielofotonowej od intensywności. Daje to zdolność do ograniczonej absorpcji, zapewniając precyzyjne i selektywne wzbudzenie w bardzo zlokalizowanych regionach. Zasadniczo fotorezystor o ujemnym tonie, materiał o zmniejszonej rozpuszczalności po ekspozycji na światło, jest poddawany skupionej wiązce femtosekundowych impulsów laserowych w niskim cyklu pracy27. Pozwala to na otrzymywanie impulsów o dużym natężeniu przy niskich mocach średnich, umożliwiając polimeryzację bez uszkadzania materiału. Oddziaływanie fotoindukowanych monomerów rodnikowych prowadzi do powstania oligomerów rodnikowych, inicjując polimeryzację, która rozciąga się na cały fotorezystor aż do określonej objętości, tj. woksela, którego wielkość zależy od intensywności i czasu trwania impulsów laserowych28.
W tej pracy prezentowane są dwa elementy: A) projekt i szybkie wykonanie formy wydrukowanej w 3D, wielokrotnie wielokrotnego użytku do produkcji jednorazowych polimerowych urządzeń do hodowli komórek neuronalnych (Rysunek 1), oraz B) ich mechaniczne sprzężenie na powierzchni płaskich substratów hodowli komórek neuronalnych, lub nawet zintegrowanych z substratem układów mikroelektrod zdolnych do wielomiejscowego zapisu sygnałów bioelektrycznych.
Komputerowo wspomagane projektowanie modelu mechanicznego 3D jest tutaj bardzo krótko opisane i towarzyszą mu kroki prowadzące do wydrukowanej w 3D formy i produkcji urządzeń PDMS.
Różnorodne aplikacje do projektowania wspomaganego komputerowo mogą być używane do generowania początkowego modelu obiektowego 3D i tworzenia pliku STL do kontrolowania procesu drukowania 2PP. W Tabeli Materiałów pierwsza i ostatnia aplikacja wymienione są bezpłatne lub dostarczane z bezpłatną licencją. Konstruowanie modelu 3D zawsze wymaga stworzenia szkicu 2D, który następnie jest wyciągany w kolejnych krokach modelowania. Aby zademonstrować tę koncepcję, w sekcji protokołu przedstawiono ogólny proces projektowania oprogramowania CAD 3D, co prowadzi do struktury wykonanej z nakładających się na siebie sześcianów. Aby uzyskać bardziej wyczerpujące informacje, dostępnych jest wiele samouczków online i bezpłatnych zasobów szkoleniowych, jak wskazano w Tabeli materiałów.
Wynikowy plik STL jest następnie przekształcany w serię poleceń, które mają być wykonane przez drukarkę 3D (np. procedura krojenia). W przypadku konkretnej używanej drukarki 3D 2PP oprogramowanie DeScribe służy do importowania pliku STL i konwertowania go na zastrzeżony format ogólnego języka pisania (GWL). Sukces procesu drukowania 2PP zależy od różnych parametrów, w szczególności mocy lasera i jego prędkości skanowania, odległości zszywania i kreskowania-krojenia. Dobór tych parametrów, wraz z doborem obiektywu i fotorezystu, zależy od najmniejszych cech konstrukcji, a także od zamierzonego zastosowania. W związku z tym optymalizacja parametrów staje się niezbędna, aby spełnić wymagania różnych scenariuszy projektowych i przypadków użycia. Do tej pracy jako konfigurację parametrów drukowania została uwzględniona zalecana receptura IP-S 25x ITO Shell (3D MF). Ostatecznie stabilna mechanicznie część drukowana jest drukowana z niezbędną rozdzielczością przy jednoczesnej minimalizacji czasu drukowania 3D.
Projekt formy i związany z nim plik STL, zademonstrowany w tej pracy, składa się z kwadratowej ramki do segregacji przestrzeni hodowli komórkowej w dwóch przedziałach: obszarze zewnętrznym (tj. zwanym później Źródłem) i obszarze wewnętrznym (tj. określanym później jako Cel). Te dwa przedziały są połączone zestawami mikrokanałów, z których każdy charakteryzuje się ostrymi krawędziami, zaprojektowanymi tak, aby specjalnie utrudniać wzrost neurytów od Celu do Źródła, ale nie odwrotnie, i jako takie promują kierunkową łączność synaptyczną między neuronami rosnącymi w tych dwóch obszarach.
Wcześniejsze badania wykorzystywały różne geometrie mikrokanałów, aby zachęcić do kierunkowego wzrostu neurytów. Przykładami są kształty trójkątne18, struktury kolczaste kanałów19 i kanały zwężające20. W tym przypadku zastosowano konstrukcję z ostrymi barierami kątowymi na granicach mikrokanału, charakteryzującą się również asymetrycznymi wejściami. Te mikrokanały służą do ustanowienia ciągłości między zamkniętym wnętrzem, przedziałem docelowym, a obszarem zewnętrznym, przedziałem źródłowym. Lejkowaty kształt początkowej części mikrokanałów, od strony Źródła, ma za zadanie sprzyjać tworzeniu się wiązek aksonalnych i ich wzrostowi wzdłuż najkrótszej, tj. w linii prostej, drogi łączącej Źródło z Celem. Trójkątna przestrzeń realizowana przez skierowanie się pod ostrymi kątami ma większą objętość po stronie celu, aby skutecznie opóźnić znajdowanie drogi przez neuryty, jednocześnie sprzyjając szybkiemu strzelaniu wiązek pochodzących ze Źródła i zajęciu dostępnej przestrzeni. Wybór 540 μm dla długości mikrokanalików skutecznie odfiltrowuje ogólnie krótsze wyrostki dendrytyczne39. Ponadto ich wysokość 5 μm zapobiega przenikaniu somatów komórkowych przez mikrokanały. Ogólnie rzecz biorąc, ta konfiguracja okazała się promować jednokierunkową łączność między zewnętrznymi, źródłowymi i wewnętrznymi modułami docelowymi, i jest tutaj przedstawiona jako dowód zasady wśród wielu alternatywnych wyborów.
Podczas gdy urządzenia PDMS, wyprodukowane przez formę 2PP, mogą być przymocowane do powierzchni popularnych substratów do hodowli komórkowych, takich jak szklane szkiełka nakrywkowe lub szalki Petriego, w tej pracy użyto dostępnych na rynku układów mikroelektrod zintegrowanych z substratem. Nie podjęto żadnych wysiłków w celu optymalizacji projektu 3D pod kątem układu mikroelektrod, a mechaniczne sprzężenie zostało wykonane pod nadzorem stereomikroskopii, mając na celu jedynie ustawienie urządzenia w poprzek układu, pozostawiając część mikroelektrody odsłoniętej po obu stronach, źródle i celu. Umożliwia to wstępną ocenę funkcjonalnych konsekwencji ograniczonej łączności w hodowlach komórek neuronalnych.